Vous devez respecter les méthodes données en travaux dirigés. Vos graphiques doivent comporter toutes les données qui ont été exigées en TD. EXPLIQUEZ CE QUE VOUS FAITES!

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Examen Terminal d'enzymologie 1 (B~2) session 2 Analyse des paramètres cinétiques et d'inhibiteurs de

caspases Juin 2016

Consignes

Vous devez respecter les méthodes données en travaux dirigés. Vos graphiques doivent comporter toutes les données qui ont été exigées en TD. EXPLIQUEZ CE QUE VOUS FAITES!

Rédaction : les abréviations de toute sorte sont interdites (-0,5 par abréviation). Vous devez faire des phrases : sujet/verbe/complément.

Equations de droites : Les données ici sont « parfaites », une vraie droite moyenne

n'est pas exigée. Calculez vos équations de droite en n'utilisant que deux points pour

la pente et un seul pour l'ordonnée à l'origine. Le r

²

de chacune de ces droites est

0,9999999.

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Les caspases sont aes pro ~à cystéine impliquéês ^à la fois dans la mise en place de l'apoptose (mort cellulaire programmée) et dans la production de certains médiateurs de l'inflammation. La caspase 1, par exemple, a été impliquée dans les étapes de production de l'Interleukine lb alors que la caspase-3 est une des caspases initiatrices de l'apoptose. Ces enzymes activent ou inactivent des effecteurs par clivage. Elles sont elles-mêmes produites sous forme de zymogène inactif et s'activent soit par auto-clivage soit par clivage via une autre caspase.(1) Compte-tenu de leur similitude de fonctionnement, il a été possible de créer des substrats synthétiques pouvant être hydolysés par les 11 caspases connues chez l'homme de façon à obtenir les paramètres cinétiques de ces enzymes et pouvoir faire des tests simples d'activité (1). L'obtention d'inhibiteurs de ces caspases permettrait de pouvoir réguler un certain nombre de phénomènes biologiques (2).

N;atUN Rl"riew$ I Mo4ectur CeU Biology

(a) Les caspases apoptotiques

FIGURE 1: Fonctions des caspases (3,4)

(b) cas pase et cytokine

Partie I : Étude cinétique des caspases (1)

Basé sur le motif de reconnaissance optimal pour chaque enzyme, des substrats avec la structure générale Ac-XEXD-AMC ( X désignant n'importe quel résidus d'acide aminé, E glutamate et D aspartate) ont été utilisés pour développer des tests fluorimétriques en continu. Le clivage se fait après l'acide aspartique terminal libérant le produit AMC qui est alors fluorescent. La nature du résidu X dépend de la spécifitè de chaque caspase. Pour la caspase 3, le peptide utilisé est Ac-DEVD- AMC

(1).

Question 1 : Expliquez cette méthode de mesure de la vitesse initiale /1

Question 2 : Expliquez les deux méthodes mathématiques qui permettent de démontrer les équa- tions de Mickaelis et Menten. /2

Question 3 : Définissez kcat et KM /2

Question

4 :

Analysez les données cinétiques de l'enzyme

(1).

(/7)

[Ac-DEVD-AMC] µM 10

I

²⁵

I

⁵⁰

I

¹⁰⁰

Vo

µM/s 0,000042

I

0,00006

I

0,00001

I

0,000016

TABLE 1: Vitesses de modification du substrat synthétique Ac-DEVD-AMC en présence de 6.10-⁶

µM

de caspase 3

2

Partien-: Étude del'effet d'aldênyâe-peptidesinhioileurs sur les caspases(2)

Des peptides inhibiteurs ont été dessinés pour les caspases selon le modèle suivant : une séquence peptidique du type XEXD ( X désignant n'importe quel résidus d'acide aminé, E glutamate et D aspartate) suivi d'une fonction aldéhyde empêchant la coupure du peptide après l'aspartate final

(2).

Question 1 : A partir du graphique 2a, analysez l'effet de l'inhibiteur Ac-DEVD-CHO sur la caspase 3. (2) /6

Question 2 : Le tableau 2b montre les constantes d'inhibition sur différentes caspases pour dif- férents inhibiteurs dont la séquence peptidique varie légèrement. Analysez ces résultats et compte- tenu du mécanisme déterminé précédemment, expliquez le classement des caspases en trois groupes.

/3

Représentation en double inverse de l'action de la caspase 3 sur le substrat synthétique Ac-DEVO-AMP en présence du peptide

inhibiteur Ac-DEVO-CHO

70000 1/(v0) µM¹.s 60000

1=0,00075µM y= 119048x+ 11905

1=0,0005µM v=377847x+11905

Rl = 1 l=0,0002µM y= I 70807x + 11905

R² = 1

0,12

!/(DEVO-AMP) µM·l

(a) graphique primaire

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(b) Aldéhyde-peptides et caspases FIGURE 2: Effets des aldéhyde-peptides sur les caspases(2)

Référence:

(l)Margarita Garcia-Calvo*,l, Erin P. Petersonl, Dita M. Rasper2, John P. Vaillancourt2, Robert Zamboni2, Do- nald W. Nicholson2 and Nancy A. Thornberryl.(1999) Purification and catalytic properties of human caspase family members Cell Death and Differentiation 6, 362 369

(2)Margarita Garcia-Calvo, Erin P. Peterson,Barbara Leiting, Rejean Ruel, Donald W. Nicholson and Nancy A. Thorn- berry (1998)Inhibition of human caspases by peptide-bases and macromolécular inhibitor. J. Biol. Chem. , 273 :32608- 32613.

(3)Carlos López-Otín Tony Hunter(April 2010) The regulatory crosstalk between kinases and proteases in cancer Nature Reviews Cancer 10, 278-292

(4)Walter Nickel Catherine Rabouille (February 2009) Mechanisms of regulated unconventional protein secretion Nature Reviews Molecular Cell Biology 10, 148-155

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li UNIVERSITÉ DE TOULON

Partiel de BIOLOGIE MOLECULAIRE ET CELLULAIRE B33

Université : Université de Toulon, Faculté des Sciences et Techniques Diplôme : Licence 2 Biologie

Date: Partiel - 2016- 2 ième session Durée: 2h00

Enseignant: M. Molmeret

Donnez des réponses aussi complètes et précises que possible.

Question 1 (8 points) : Expliquez les conséquences au cours de la réplication de l'ADN des principales mutations causées par des agents mutagènes (analogues de bases et réaction directe avec l'ADN) en donnant des exemples précis illustrés par des schémas légendés.

Question 2 (5 points) : Quelles sont les grandes classes d'ARN fonctionnels et leur particularité principale par rapport aux ARN informatifs? Choisissez un exemple et expliquez en quoi ils sont fonctionnels.

Question 3 (3 points): Qu'est ce que la règle du tremblement (flottement) et quel est le lien avec la redondance du code génétique ? Donnez un exemple et illustrez d'un schéma légendé.

1/2

Exercice ( 4 points) :

On a isolé un fragment d'ADN codant une protéine et on en a séquencé une petite partie.

l. Sachant que la transcription se fait de gauche à droite, complétez le tableau ci-des- sous en indiquant: a) L'orientation (5'P et 3'0H) des fragments d'acides nucléiques ADN et ARN, b) L'orientation de I' ARNt et la séquence du polypeptide (Nt et Ct) qui correspond (vous pourrez répondre à cette question avec vos connaissances sur la traduction)

2. Le brin transcrit de I' ADN correspond-il à la 1re ou la 2e ligne du tableau ?

e ADN

T G e

u e ^A ARNm

G e A ARNt

Trp Peptide

--

lffiS&ii.

Le code génétique universel

Troisième Première

position

position Deuxième position (extrémité

(extrémité 5') 3')

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GU G Val G CG Ala GAG Glu

2/2

li UNIVERSITÉ DE TOULON Partiel de GENETIQUE B34

Université : Université de Toulon, Faculté des Sciences et Techniques Diplôme : Licence 2 Biologie

Date: Partiel - 2016 2ième session Durée: 2h00

Enseignant: M. Molmeret

Questions de cours (6 points)

Donnez des réponses aussi complètes et précises que possible.

Question Nºl (3 points):

Qu'est-ce que la dominance incomplète? Expliquez en donnant un exemple détaillé en l'illustrant d'un schéma légendé.

Question Nº2 (3 points) :

Qu'est qu'un test d'allélisme? Expliquez en donnant un exemple détaillé en l'illustrant d'un schéma légendé.

1/2

Exercices (14 points)

Exercice Nº1 (7 points)

Chez les bovins. la couleur des individus de la race Shorthorn est, régie par un système d'allèles codominants. Au génotype CRCR correspond un individu brun-rouge. un individu rouan (brun-rouge et blanc) sera ere», tandis qu'un individu blanc aura pour génotype

circ

^11•• (a.)

Si des individus rouans sont croisés entre eux, quels phénotypes et quels génotypes (et avec quelles fréquences) s'attend-on à voir paraître en première génération? (

b)

Si des individus brun-rouge sont croisés avec des rouans, puis les individus de la Fi obtenue croisés

à

leur tour entre eux, quel pourcentage d'individus rouans trouvera-t-on probablement en F~ '?

Exercice Nº2 (7 points) :

On croise des plantes à fleurs rouges et à pétales entiers avec des plantes à fleurs bleues et à pétales découpés. Les graines issues de ce croisement sont semées et on obtient uniquement des plantes

à

fleurs mauves et

à

pétales découpés.

Une plante obtenue précédemment est croisée avec une plante à fleur rouge et pétales entiers. Les graines issues de ce deuxième croisement sont semées et on obtient:

- 194 plantes à fleurs rouges et pétales entiers - 190 plantes à fleurs mauves et à pétales découpés - 8 plantes à fleurs rouges et pétales découpés - 9 plantes

à

fleurs mauves et pétales entiers

A l'aide d'un raisonnement rigoureux, expliquez les résultats obtenus lors de ces 2 croisements successifs en répondant aux questions suivantes :

1) Est-ce du monohybridisme ou du dihybridisme? Quels sont le (s) caractère(s) étudié(s)?

2) La génération Fl est-elle homogène? Que peut-on en déduire? 3) Quel est (sont) l'allèle ou les allèles dominant(s), récessif(s)?

4) Comment a-t-on obtenu la génération F2: Fl x Fl? De quel type de croisement s'agit- i!?

5)

Si plusieurs gènes sont en jeux, les résultats F2 font-ils pencher en faveur de gènes indépendants ou de gènes liés? 6) Que faudrait-il faire pour en être sûr et valider l'hypothèse?

7)

Expliquez rigoureusement les résultats obtenus en Fl et en F2 par une interprétation chromosomique et des échiquiers de croisement.

-10

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UFR des Sciences et Techniques L2 Biologie

Examen (CT) du C 311, Chimie des solutions.

Deuxième session. Vendredi l " juillet 2016.

Durée de l'épreuve: 2 heures.

Les enseignants surveillant l'épreuve se réservent le droit de contrôler et de vider les mémoires des calculatrices.

Les données permettant de résoudre les exercices sont fournies en fin de sujet.

Partie 1. Solutions simples.

Rappel. La densité de l'eau et de toutes les solutions aqueuses sera toujours prise égale à 1, donc correspondant

à

une masse volumique

p

égale

à

1 g.cm' '.

Question l.

Donner la structure électronique de l'atome de sodium à l'état fondamental.

Donner la structure électronique de l'atome de chlore à l'état fondamental.

Donner la formule brute du chlorure de sodium solide.

Donner la composition, en cations et anions, du chlorure de sodium en solution aqueuse. On écrira la réaction de dissolution, dans l'eau, du solide.

Donner la structure électronique, à l'état fondamental, du cation et de l'anion du chlorure de sodium.

Question 2.

On dissout 15 g de chlorure de sodium dans 355 mL d'eau distillée. On admet qu'il n'y a pas de variation de volume de la solution. Soit la solution S 1 obtenue.

Quelle est la concentration, exprimée en g.L" l et en mol.L - l en chlorure de sodium ? Quelle est la concentration, exprimée en g.L-¹ et en mol.L-¹ en anions chlorure ? Quelle est la concentration, exprimée en g.L-¹ et en mol.L-¹ en cations sodium?

1

Quest-iefr-3,-. --- Donner la structure électronique de l'atome de l'élément aluminium.

Donner la formule brute du chlorure d'aluminium solide.

Donner la structure électronique du cation et de l'anion entrant dans la composition du chlorure d'aluminium.

Donner la composition, en anions et cations, du chlorure d'alumini um en solution aqueuse.

On écrira la réaction de dissolution, dans l'eau, du solide.

Question 4.

On dissout 42 g de chlorure d'aluminium dans 865 mL d'eau distillée. On admet qu'il n'y a pas de variation de volume de la solution. Soit la solution S2 obtenue.

Quelle est la concentration, exprimée en g.L-¹ et en mol.L-¹ en chlorure d'aluminium?

Quelle est la concentration, exprimée en g.L - l et en mol.L - I en anions chlorure ? Quelle est la concentration, exprimée en g.L-¹ et en mol.L-¹ en cations aluminium?

Question 5.

On mélange 237

mL

de SI avec 58

mL

de S2. Soit S3 la solution obtenue.

Quels sont les ions, cations et anions, présents dans S3 ?

Quelle est la concentration, exprimée en mol.L-1 et en g.L-1, de chacun de ces trois ions présents dans S3

?

Question 6.

Quel est le pH d'une solution aqueuse d'amm oniac, NH3, à 0,07 mol.L",

à

25ºC? Justifier la réponse. Calculer la concentration, exprimée en mol.L - l, de chacune des espèces chimiques en solution.

Partie 2. Courbes de dosage.

Le carbonate de sodium, Na2C03, est une <libase qui se forme au contact de l'hydroxyde de sodium avec le dioxyde de carbone (voir TP du C 311, alcalimétrie, Na2C03).

Question 7.

On dose une solution de carbonate de sodium par de l'acide chlorhydrique. Voir document

ci-

joint.

b@-ve-lume-d@-J)rise-d~e-ssai--est---d~O-mb.---l,a-oo noontratie-n-de-l.!aGide-chle-r-hJdr:i,1ue-est--égal-e-à- 0,50 moI.L·^1• On trace pH= f (acide versé). On note deux sauts de pH pour V= VI et V= V2.

Question 8.

Ecrire les réactions chimiques qui interviennent entre : V= O et V= VI, puis entre V= VI et V= V2.

On précisera le nom des réactifs et celui des produits à chaque fois.

Question 9.

En déduire la concentration, exprimée en m0I.L·¹, de la solution aqueuse de carbonate de sodium.

Question

10.

Donner la formule, le nom et la concentration, en m0I.L·¹, des espèces chimiques formées à V = VI et V

=

V2. Calculer le pH de la solution lorsque V = O. Justifier.

Question

11.

Que vaut le pH de la solution à V= VI ? Dépend-il de la concentration? Comment s'appelle le composé formé ? A quelle famille chimique appartient-il ?

Question 12.

Comment aurait-on pu déceler, par étude d'une courbe de dosage, qu'on avait affaire à une solution de carbonate de sodium, seul, ou bien à une solution de soude carbonatée? Justifier.

On pourra traiter le cas d'un mélange

(100

mL) d'hydroxyde de sodium à

0,1

mol.L "1 et de carbonate de sodium

à

0,05 mol.L"1, qu'on dosera par de l'acide chlorhydrique

à

0,5 mol.L-1.

Données

Tableau périodique. Extrait.

H He

Li Be B c N o ^{F Ne}

Na Mg Al Si p s ^{Cl Ar}

K Ca

3

Masses-etemiques-en-g.mel=e- ---

H = 1 ; C = 12; O= 16; Na= 23; Al= 27; Cl= 35,5.

+ -

Produit ionique de l'eau : Ke = [H30 ].[OH ] = h.œ = 10-

¹⁴ à

25ºC.

Valeurs de différents pKa, à 25ºC : pKa NH4

+

I NH3 = 9,25.

- 2-

pKa2 HC03 / C03 = 10,3.

()

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Examen B41 Physiologie Végétale Mai 2016 Durée : 2 heures

Calculatrice et téléphone portable non autorisés Documents non autorisés

Partie 1 : Questions à réponses courtes (10 points)

1- Citer 4 exemples d'application de la physiologie végétale en biotechnologie, agriculture ou médecine

2- Etablir la liste des organites communs aux cellules végétales et animales, ainsi que celle des organites spécifiques aux cellules végétales, et décrivez les caractéristiques principales de chacun d'entre eux.

3- Décrire la matrice extracellulaire d'une cellule végétale.

4- Citer les conditions externes requises à la germination de la graine et les différentes phases de la germination.

5- Expliquer la nature des phytochromes, la photoconversion/photoréversion des phytochromes. Qu'est-ce que l'équilibre photostationnaire?

6- Définir les termes croissance, mérèse et auxèse.

7- Quels sont les messagers secondaires des cellules végétales? Décrire leur mode d'action. A quoi sert un messager secondaire.

8- Expliquer le transport polarisé de l'auxine. Vous pouvez faire un schéma.

9- Expliquer la théorie de la croissance par acidification ? Quelle hormone est impliquée, quel est son mécanisme d'action ? Vous pouvez faire un schéma.

10- Compléter ce schéma et expliquer brièvement le rôle de chaque point de la légende. Donner un titre

1 2 3

4

5

6 7

----~~=·e~2~· A~"=ª='lse de documents (10...goints), _ Exercice 1 (3,5 point) :

Fusarium oxysporum est un champignon pathogène qui se développe dans les fruits charnus et en provoque la pourriture. On extrait de ce

champignon une enzyme, la polygalacturonidase qui catalyse l'hydrolyse de composés pectiques. On mesure la concentration du milieu en acide

galacturonique en fonction de la teneur en calcium de ce même milieu (figure 1).

Analyser ce document

Exercice 2 (5 points) :

Document 1 : Schéma d'une coupe longitudinale de graine amylacée.

5,00 ca,centration en adele galacturonique ( échelle logarithmique) 2.00

1,00 0,50

0,20

0,10 0,05 0.02

concentration en Ca'· du milieu (µg.ml'¹ échelle logarithmique)

O 40 100 200 400 Figure 1

1000 2000

1 2

30

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UJ

5

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8 u. 10

o

V)

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Document 2 : Mesure de l'activité a-amylase dans les tissus environnant la couche à aleurone en présence de différentes

hormones: acide gibbérellique (GA3) et/ ou acide abscissique (ABA). None signifie que rien n'est ajouté, c'est un contrôle.

o ^l 8 10 16 20 24

HR AFTER ONSET OF INCUBATION

NONE I ABA I GA3 IGA3+ABA

5 10 15 20 5 10 15 20 5 10 15 20 5 10 15 20

66K-

0t-AMYLASE -

....

Document 3 : Détection de la protéine a-amylase dans les tissus environnant la couche à aleurone.

Les protéines extraites des tissus sont analysées par électrophorèse. La bande correspondant à l'alpha amylase est indiquée. 5, 10, 15 et 20 représentent les temps d'incubation en présence de l'hormone (minutes).

Document 4: Expression de l'alpha-amylase dans la couche à aleurone.

La quantité relative d' AR Nm est exprimée en fonction du temps (heures) après ajout des hormones.

60 Le contrôle représente un

ARNm connu pour ne pas être sous le contrôle des

hormones testées.

o 5 10 15 20 25 30 35

contrôle

Document 5 : Les cellules de la couche à aleurone sont traitées avec différentes hormones, comme indiqué sur le document. Les ARNm présents dans la couche à aleurone sont extraits et par un traitement in vitro (hors de la graine) sont traduits. L'a-amylase est ensuite détectée comme précédemment. NB: tenir uniquement compte des bandes correspondant à l'a-amylase pour interpréter cette expérience.

1

NONE

I

e s ^{10 15 20} s

ABA

I

^GA3

I

^{GA3 + ABA}

10 15 20 5 10 15 20 5 10 15 20

66K-

0<-Amylose- 33k--+-

Ques ti s:

1-Quelle est la nature de I' ABA et de I' AG ? Où sont-ils synthétisés et comment sont-ils transportés?

Dans quels mécanismes sont-ils impliqués?

2-Document 1 : Décrire succinctement les différentes fonctions des constituants de la graine.

3-A quoi sert l'alpha amylase ?

4-lnterprétez les documents 2 et 3 puis les documents 4 et 5. Que pouvez-vous conclure sur le rôle de I' AG et de I' ABA sur l'a-amylase? A quel niveau de régulation interviennent-ils?

5-A partir de vos connaissances et des données des documents faire un schéma récapitulant l'effet de I' ABA et de I' AG sur la germination des graines.

Exercice 3 (1,5 points) :

Analyser les expériences ci-dessous.

Que pouvez-vous en déduire quant à l'action de l'auxine sur l'élongation du coléoptile? Quels organes produisent l'auxine? Comment agit la lumière sur l'élongation du coléoptile? Que pouvez- vous en déduire sur la répartition de l'auxine? Qui capte la lumière et transmet l'information aux cellules cibles? Comment nomme-t-on ce phénomène de répartition de l'auxine sous l'action de la lumière?

Lumière

Sommet Base recouvert entourée

d'un d'un

capuchon anneau transparent opaque

Extrèmrté du coléoptile déposée sur un bloc d'agar ; l'auxine diffuse dam te bloc

(a) Darwin et Darwin (1880) (b) Boysen-Jensen (1913) ^Temom Témoin avec

un bloc sans auxine:

aucun effet (e) Went (1926)

Le bloc Un bloc posé sur d'agar un côté du coléoptile contenant sectionné provoque de l'auxine une courbure stimule

la croissance

Examen Physiologie Végétale Juin 2016 Durée : 2 heures

Calculatrice et téléphone portable non autorisés. Documents non autorisés.

Partie 1 : Questions à réponses courtes (10 points)

Les questions sur 2 points amènent un développement plus important que celles sur 0,5 points.

1-Qu'est-ce qu'une symbiose? A quoi cela sert-il? Donner des exemples.

2-Expliquer le transport polarisé de l'auxine. Vous pouvez faire un schéma.

/1 /1

3- Expliquer le mécanisme de relaxation du stress lors du processus de croissance cellulaire. Quel est l'organite indispensable à ce phénomène? Expliquer le phénomène d'osmose et la pression de turgescence. Quelle doit être la caractéristique de la paroi ? /2 4-Qu'est-ce qu'un méristème en général? Expliquer les 2 grands types de méristèmes, où ils se

trouvent et à quoi ils servent. /0,5

5-Expliquer la théorie de la croissance par acidification ? Quelle hormone est impliquée, quel est son

mécanisme d'action ? Vous pouvez faire un schéma. /2

6-Décrire les tissus vasculaires. Donner le nom des vaisseaux conducteurs, ce qu'ils transportent et

les cellules les constituant. /1

7- Expliquer le rôle de l'acide abscissique dans la fermeture des stomates. Vous pouvez faire un

schéma. /1,5

8-Expliquer la nature des phytochromes. Qu'est-ce que la photoconversion et la photoréversion des phytochromes (vous pouvez faire un schéma). Qu'est-ce que l'équilibre photostationnaire? /1

Partie 2 : Analyse de documents (10 points)

Exercice 1 (6 points) :

On étudie le rôle d'un régulateur transcriptionnel ATAFl sur la germination et la croissance du riz et son rôle dans la tolérance au stress salin.

Question 1 (/0,5) : Les auteurs de cette étude ont construit des plants de riz transgéniques de façon à surproduire la protéine ATAFl. Par quel moyen est-il possible de surproduire une protéine?

Question 2 (/0,5) : Les auteurs ont obtenu 14 plants transgéniques et ont mesuré I' AR Nm d' ATAFl dans 3 de ces plants nommés OX-1, OX-2 et OX-3 (voir document). En contrôle l'ARNm de !'actine est mesuré, Vector est un contrôle dans lequel la construction permettant la surproduction d' ARFl n'a pas été introduite. Ces plants produisent-ils ATAFl?

Figure 1

Vector OX-1 OX-2 OX-3 ATAF1

ACTIN

Question 3 (/1): Les auteurs étudient ensuite le rôle d' ATAFl et la tolérance au sel. Pour cela ils mesurent les taux de germination (A) et la croissance (B) des plants de riz sauvages ou transgéniques en absence ou en présence de sel (150 mM NaCl). Analyser ces documents. Qu'en concluez-vous?

(Ne pas tenir compte de l'absence/présence d'étoiles).

a

100

****

^{Figure 2}

-

^•vector

~ 80 OOX-1 En presence de 150 mM NaCl

•ox-2

41 •ox-2

-

^E 60 e o :.::

cu 40 .5

e

₄₁ ²⁰

(!)

o

1 2 3 4 Days

b Ê25

MS ~ En absence de NaCl

t

_Cl 20 •vector OOX-1 e

~ 15 •ox-2

-

^o

_e

₁₀ ^•ox-3

"C

Root= racine e 5

-

ns ^o o

o

Shoot= tige

Vector OX-1 OX-2 OX-3 ~ Shoot Root 150 mM NaCl Ê25

~ •vector En presence de NaCl

,S 20 OOX-1

Cl •ox-2

.9! e 15 •ox-3

-

^o

_e

₁₀

"C

e ₅

..

ns _o

o

o

Vector OX-1 OX-20X-3 ^.e ti) Shoot Root

Question 4 (/1.5):

Les chercheurs étudient ensuite I' effet de I' Acide abscissique (ABA) sur la croissance des plants de riz sauvages et transgéniques.

Analyser les documents. Quel est le rôle de l'acide abscissique sur la croissance des jeunes plants de riz sauvages ? Quel est le rôle de ATAFl en présence d' ABA ?

Quel lien pouvez-vous faire entre réponse au stress salin et acide abscissique compte tenu de vos connaissances sur l'acide abscissique?

Mock= contrôle sans ABA

a Vector OX-1 OX-2 OX-3

MOCK

41,1M ABA

81,1M ABA

- '· ..

I

..

^{• • ' • l.}

'

---- -

^--

-

b 3.5

** ^• _OOX-1 ^Vector

3.0 •ox-2

•ox-2 Ê 2.5

~ l: 2.0

e,

äi .I:.

e11 1.5

ë .!!!

11. 1.0

0.5

o O µM ABA 4µMABA SµM ABA

Fig. 3 Re ponse to ABA of ATAFI transgenic rice. a Growth perfor- mance of transgenic plants and vector control in water containing O. 4 and 8 µM AßA. b Plant height of transgenic rice and vector control after day . bar = I cm. The data represent the mean ± SE. n ?: 52.

Asterisks indicate significant differences (**P ::: 0.01) between the vector control and transgenic plants

Question 5 (/1,5) : Les auteurs ont ensuite analysé les taux de transcription de 3 gènes OsLEA3 (a), OsPMl (b) et OSSa/Tl (c) connus pour être impliqués dans la réponse au stress salin dans les plants sauvages ou transgéniques cultivés en présence de 250 mM NaCl. Qu'en concluez-vous? Quelle hypothèse pouvez-vous formuler quant au rôle de ATAFl en sachant que la région promotrice des gènes OsLEA3, OsPMl et OSSa/Tl contient un site de liaison pour la protéine ATAFl ?

ª

³⁰

•vector 25 ^oox-1

•ox-2

e: o

¡

²⁰

! a.

>(

., 15

-~

¡;

~ 10

5

Oh 4h 12 h

e 2,500

•Vector OOX-1 2,000 •0x-²

.2 e:

g¡ 1,500

! Q.

)(

..

¡

^1,000

"'

&!

500

*

**

o '----'--'--~---'-

*

**

b 300

e: o ,;; 200 .,

! Q.

~ 150

.~ ¡;

~ 100

50

**

•vector 250 oox-1

•ox-2

12 h

Fig. ~ Expression analysis of salt tolerance-a sociatcd genes by¡

real-time-PCR. Two-weck-old seedlings were treated with 250 mM NaCl for O. 4 and 12 h. Real-time-PCR was performed using OsLEAJ (a). OsPM I (b) and OsSa/TI (e) specific primers. Two independ- ent lines and a vector control line were used. The data represent the mean ± SE. n = ^3. Asterisks indicate significant differences (*P::: 0.05: **P::: 0.01) between the vector control and transgenic plants

Oh 4h 12 h

Question 6 (/1) : Rappeler les résultats principaux de ces expériences. Faire un schéma récapitulatif.

Quel pourrait être l'intérêt de ces plants transgéniques?

Exercice 2 (4 points):

ouche à aleurone Questionl (/0,5) : Décrire succinctement les différentes fonctions des constituants de la graine.

Document 1: Schéma d'une coupe longitudinale de graine amylacée.

;:..__.-ff-Cotylédon ou scutellum

mbryon

Le chercheur étudie la quantité d'eau absorbée ainsi que la consommation d'oxygène impliquée dans la germination de ces graines.

___________

li ^{, r-1 ure}

Tissu. der

I

lii bis

o 12 24 36 48 72 Temps (h)

Document 2: Absorption de l'eau et d'oxygène par un lot de semences puis de plantules (phase lii).

Question 2 (/0,75): Décrire et expliciter les différentes étapes de cette courbe.

Le chercheur souhaite s'attarder sur les mécanismes impliqués dans la phase lii et lii bis. li est intrigué par la diminution de la consommation d'02 et d'eau par les tissus de réserve.

Question 3 (/0,25) : D'après vos connaissances sur le devenir des tissus de réserve d'une graine en germination, quelle hypothèse pouvez-vous émettre sur cette diminution?

Afin de vérifier votre hypothèse, le chercheur prélève les tissus de réserve des graines de la phase 1 et 3 et effectue les expériences suivantes :

Test à la liqueur de Fehling Test à l'eau iodée

(sucres réducteurs) (polysaccharides de réserve)

Graines déshydratées - +

Graines en phase 1 - +

Graines en phase 3 + -

Document 3 : Analyse du contenu des réserves de la graine avant et après germination.

Question 4 (/0,75): Analyser des résultats obtenus. Que révèlent les tests à la liqueur de Fehling et à l'eau iodée? De quelle nature biochimique sont les réserves de la graine? Que deviennent-elles lors de la phase 3 ? Par qui sont-elles utilisées ? Dans quel but ?

Intrigué par cette transformation, notre chercheur désire connaitre le processus mis en jeu. li réalise donc l'expérience suivante: il quantifie le taux d'acide gibbérellique (AG) dans la graine avant et pendant la germination.

N°detu:>e Contero en AG

-

. _Albumen Coucheàaleu"one

....

^,...,.

Graine avant

- -

geimination

+++

Graine pendant la

+ -

⁺⁺⁺

gemiination

Oocunent 4 : Ana tyse mi contenu en AG de la grame avant et penda nt la germmat,on

stricto sensus.

Question 5 (/0,5): Analyser les résultats obtenus, qu'en concluez-vous quant au site de production et au site d'action de l'AG?

Le chercheur s'intéresse ensuite à la couche à aleurone et visualise l'action de I' AG sur cette couche.

r

'°

50

l

'

i.

: 60 '

V

1

' )O •

.\A.Na I w-4111,t,bo

... ^,

^{.. ,...}

...

Documen t 5 : Analyse du contenu en ARNm de la couche à aleurone.

Question 6 (/0,75): Quelle action entraine l'AG sur la couche à aleurone? D'après vos connaissances à quoi servent l'alpha-amylase et les protéases dans la graine en germination ?

Question 7 (/0,5): Faire un schéma récapitulatif.

--- -

Contrôle terminal de microbiologie (B42) session 1 mai 2016

Partie I Sujet de synthèse (/17)

Sujet : Les capacités de croissance des bactéries en font des dangers mais aussi des outils pour l'homme.

Expliquez.

Vous réaliserez une dissertation selon les modalités vues en travaux dirigés sur

le sujet ci-dessus. Une dissertation complète est demandée avec l'introduction, le

plan apparent avec dans chaque sous-partie les schémas correspondants ainsi que le texte associé à la partie, les phrases de transitions, la conclusion. Soignez les titres ainsi que la rédaction et l'orthographe.

Partie II : Exercice (/3)

Un microbiologiste réalise une culture à 37 degrés de bactéries en ensemençant 50 ml de milieu avec 1 ml de la pré-culture. Toutes les 15 min, il réalise une numération sur boîte en effectuant des dilutions étalement ( dilutions séquentielles 10-⁵ à 10-⁷ et étalement de 100 µL par boîte).

Temps (mn)

o

15 30 45 60 75 90 105 120 135 150

Colonies - dilution 10-⁵ 170 172 176 308 > 500

+++ +++ +++ +++ +++ +++

Colonies - dilution 10-⁰ 17 18 22 32 60 120 200 340 460

+++ +++

Colonies - dilution 10-¹ 1 2 2 4 6 12 20 34 46 90 91

TABLE 1 - Croissance d'une souche de Bactéries

Question 1 : Tracer la courbe sur le papier semi-log fourni. Justifier le choix des points et commenter un calcul.

Question 2 : Déterminer le temps de génération (G) par le calcul.

1

ts

Exam en B 47 Repro duction et Développem ent Licence Sciences de la Vie 2ème année

Année Universitaire 2015-2016

Aucun document, ni autre support n'est autorisé - Questions de cours (14 pts)

Question I

Décrire le déroulement de lagastrulation chez !'Oursin.

Question li

Décrire le déroulement de la neurulation chez la Grenouille.

Question lii

Expliquer le principe de la parthénogenèse au travers de l'exemple d'Animaux utilisant ce mode reproduction asexué.

QuestionN

Décrire le déroulement de la spermatogenèse chez l'homme.

Question V

Donner la composition du sperme et le rôle de ses constituants.

Question VI

Expliquer le déroulement du cycle utérin chez la femme.

Exercices (6 pts)

Répondre aux exercices directement sur l'énoncé. Rendre l'énoncé avec les réponses en même temps que la copie!!!

I - Donner un titre à la figure ci - dessous. Compléter la légende ( encadrés gris). Colorier les feuillets germinatifs avec les couleurs appropriées à l'ectoderme, au mésoderme, et à l'endoderme.

Pôle: ^{(B) (CJ}

I l.___,__....,...__.

'-;::=====:I

ll~F-aii:e-correspGnd-i:e-les--terme-s-propGséS-aux-desG-i:-i-ptionS-numé-r--G-tées,~·- - -

A - Hormone FSH B - Epididyme

C - Villosités chorioniques D - Endomètre

E - Fécondation

F - Spermatocyte de ^2ème ordre G - Spermatogonie

H - Testicules

I - Spermatozoïde

J -

Utérus K - Placenta

L - Cordon ombilical M-Zygote

N -Testostérone O - Canal déférent P- Prostate

Q-Amnios

R - Spermatocyte de 1er ordre S - Trompe utérine

T-Scrotum U - Spermatide V - Foetus

W - Glandes bulbo-urétrales X - Vésicules séminales Y - Urètre

1 - Cellule souche primitive 2 - Contiennent 23 chromosomes 3 - Produit de la méiose I

4 - Lieu de production de la testostérone 5 - Sac de peau qui abrite les testicules

6 - Phénomène menant au regroupement des gènes de l'ovule et du spermatozoïde 7 - Organe creux qui abrite l'embryon, puis le fœtus, jusqu'à la naissance

8 - Hormone(s) nécessaire(s) à la production de spermatozoïdes 9 - Quatre organes qui contribuent à la formation du sperme 10 - Produit de la méiose II

11- Projections digitiformes du blastocyste 12 - Gamète mobile fonctionnel

13 - Nom de l'embryon après 8 semaines 14 - Siège habituel de la fécondation

15 - Structure qui attache l'embryon au placenta

16 - Organe qui nourrit le fœtus et le débarrasse de ses déchets 17- Oeuf

18 - Canal qui mène de l'épididyme au conduit éjaculateur 19 - Conduit qui achemine l'urine et le sperme

20 - Conduit sinueux où séjournent les spermatozoïdes

21- Glande qui entoure la partie de l'urètre située sous la vessie, et qui sécrète un liquide laiteux 22 - Glandes qui sécrètent plus de 50% du volume du sperme

23 - Organe qui sécrète des oestrogènes et de la progestérone pour assurer le maintien de la grossesse 24 - Deux structures qui participent à la formation du placenta

25 - Sac rempli de liquide, qui entoure l'embryon et le fœtus pendant son développement

Examen B 4 7 Reproduction et Développement - zèm• session Licence Sciences de la Vie 2ème année

Année Universitaire 2015-2016

Aucun document, ni autre support n'est autorisé - Questions de cours (14 pts)

Question I

Décrire la régulation hormonale des cycles utérin et ovarien chez la femme

Question Il

Expliquer comment se forme et fonctionne le placenta chez la femme enceinte

Question Ill

Nommer et caractériser les différents modes possibles de segmentation rencontrés chez les animaux

Question IV

Décrire le déroulement de lagastrulation chez la Grenouille

Question V

Expliquer la formation des membranes exira-embrfonnuires chez l'embryon de Poulet

Exercices (6 pts)

Répondre aux exercices directement sur l'énoncé: rendre l'énoncé avec les réponses, en même temps que la copie !

I - Donner un titre ^à la figure ci - dessous. Compléter la légende ( encadrés gris). Colorier les feuillets germinatifs avec les couleurs appropriées à l'ectoderme, au mésoderme, et à l'endoderme.

MI-NEL"Rl'l.t\TTON

Bourgeon cuudal

I-I-- Au cours-de-la-grossesse, le-cerps-férni nin-su-bi-t-de-nomb-reux-changementso--P-réeise-r-si--ehaeun-des-énoncés ci- d esso us est vrai ou faux (V ou F).Justifier brièvement votre réponse:

---1. La capacité vitale diminue ---2. Le métabolisme ralentit

---3. La pression artérielle et la fréquence cardiaque diminuent ---4. Le volume des seins diminue

---5. La femme enceinte ressent un fréquent besoin d'uriner et souffre d'incontinence à l'effort ---6. Le volume sanguin et le débit cardiaque augmentent

---7. La descente du diaphragme est entravée

---8. Les nausées, les brûlures d'estomac et la constipation sont fréquentes

3o

Contrôle terminal d'Immunologie (B4S) session 1 2016

Aucun document n'est autorisé

Sujet : Les étapes de la réponse immunitaire adap- tative primaire de la migration des lymphocytes et des cellules présentatrices de l'antigène dans les or- ganes lymphoïdes secondaires à la fin de la réponse et la mise en place d'une mémoire.

Nota bene : Vous devez être précis quant à l'ordre et au lieu des événements. Si deux événements sont simultanés dans un même site ou dans deux sites distincts alors précisez-le. Ne négligez pas les étapes de migration des cellules et les signaux qui permettent ces migrations.

Vous réaliserez une dissertation selon les modalités vues en travaux dirigés sur

le sujet ci-dessus. Une dissertation complète est demandée avec l'introduction, le

plan apparent avec dans chaque sous-partie les schémas correspondants ainsi que

le texte associé à la partie, les phrases de transitions, la conclusion. Soignez les

titres ainsi que la rédaction et l'orthographe.

1