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Bancarisation des données benthiques

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Academic year: 2022

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Texte intégral

(1)

Quadrige²

Bancarisation des données benthiques

(2)

Au menu…

Présentation de Quadrige

D Définition, organisation

D Fonctionnalités

D Structure des données

D Cycle de vie des données – droits d’accès

Les données benthiques dans Q²

La DCE dans Q²

(3)

Quadrige² : objectifs

Quadrige 1 Quadrige²

1996 2008

> 3 millions de résultats

Séries temporelles sur 35 ans

Données de la surveillance littorale :

D REPHY(PHYtoplancton),

D REMI(Microbiologie),

D RNO(Réseau National d’Observation),

D IGA(Impact des Grands Aménagements),

D REPOM (surveillance des Ports Maritimes)…

D Divers réseaux régionaux (ARCHYD,

> 4 millions de résultats, 64 programmes REFERENTIEL NATIONAL (SIEau) TOUTES LES DONNEES DCE

Intégrer de nouveaux réseaux (REBENT, aquacoles, COREMO, Posidonies…)

Interopérable + compatibilité SANDRE

Ouverture croissante vers l’extérieur (50% des formations 2009 à des organismes non Ifremer)

(4)

Nouvelles fonctionnalités

Composante cartographique (ligne et surface) & interfaces SIG

Référentiel taxinomique ERMS Æ WoRMS Règles de contrôle, préférences utilisateurs

Nouveau type de données (en plus des résultats classiques) :

D Photos

D Fichier de mesure Moratoires

Méta programme Multiprogramme

Format d’échange SANDRE (import et export)

(5)

Quadrige² : missions et objectifs

Banque de données Quadrige

2

Outils de Contrôle Qualité

Outils

d’Analyse & de Synthèse Données interprétées

Saisie

Importation

Réseaux de surveillance //

études terrain Réseaux de surveillance //

études terrain

Observations directes et analyses laboratoires

Mesures par capteurs

Bases de données

« laboratoire » Bases de

données

« laboratoire »

Systèmes automatisés de

mesure Systèmes automatisés de

mesure

Diffusion

(Requêtage, Visualisation, Publication)

Extractions

(Extraction de

données)

Mise en réseau (Services

intégrés)

Sites(s) Web SURVAL Sites(s)

Web SURVAL

Autres systèmes d’information

Autres systèmes d’information Données observées

Référentiel

(6)

Structure des données Quadrige²

Cadre d’acquisition = Programmes et stratégies

9 Lieux de surveillance 9 Code / Libellé

9 Responsable(s) 9 Saisisseur(s)

AUCUNE SAISIE POSSIBLE SANS STRATEGIE

LES STRATEGIES SONT AUSSI UNE AIDE A LA SAISIE

Programme Ex : REPHY, RSLHYD,

RSLFAU, REMIS, ROCCH…

Stratégie

Ex : Surveillance régulière 1998 - 2005

9 Lieux : période de suivi, labo préleveur 9 Paramètres suivis

9 Lieux – Paramètres : laboratoire analyste

(7)

Structure des données Quadrige²

Passage = Lieu + date Prélèvement = engin

Echantillon = support

Résultat

Programme

Lieu de surveillance

(8)

Prélèvement Mesures Dénombrements

Saisie / import dans Quadrige²

* Bonne

* Douteuse

* Mauvaise

Experts

Diffusable par :

• Saisisseur

• Responsable de programme

• Consultation intégrale

Diffusable par tous (sauf si moratoire)

Cycle de vie de la donnée

(9)

Surval: produit de diffusion

1 - Choix d’un produit

2 - Carte

3 – Détails d’un lieu

(10)

Au menu…

Présentation de Quadrige

D Définition, organisation

D Fonctionnalités

D Structure des données

D Cycle de vie des données – droits d’accès

Les données benthiques dans Q²

La DCE dans Q²

(11)

Enjeux de l’intégration des données

Données DCE dans Quadrige²

D Définition / calcul des indicateurs

D Intercalibration

D Evaluation de la qualité des Masses d’Eau Rapportage(s)

D Mise à disposition au S3E

Données publiques Æ Diffusion F Saisie directe des données

F Reprise des données antérieures

(12)

Pluralité thématique et géographique

X X

CREOCEAN

X

X X

Ifremer – LER/LR Sète

X X X CSLHN

X X X GEMEL Normandie

X X GEMEL Picardie

X CARLIT

X POSIDO

X X

Ifremer – LER/AR Arcachon

Ifremer – LER/PAC Toulon

X X

X X Ifremer/CNRS – L’Houmeau

X X Station Marine Arcachon

X X

X X

Ifremer - Anglet

X Station Marine Banyuls

X X X X X IM

X X X X SM

X X X IR

X X X SR

X X X HZN

Biolittoral

Ifremer – LER/MPL Nantes MNHN Concarneau

LEBHAM LEMAR

Station Biologique Roscoff CRESCO Dinard

Station Marine Wimereux

HZM

X

X

1 2 3 4

5 6

7

9

10

11 8

12 13 14

1 3 2 4 6 5

7

9

10

11 8

12 14 15

13

15

16

(13)

Avancement : Intégration données

A préparer

CARLIT

Saisies en cours

Posidonies

Invertébrés : OK, Végétation : à préparer

Maërl

Prêt à saisir Prêt à saisir

Macroalgues

Prêt à saisir

Zostera marina

Saisies Bretagne – Seine-Normandie OK, Saisies Pays de la Loire en cours

Zostera noltii

Saisies en cours

(2007 : frontière belge à la Loire-Atlantique OK, saisie Adour- Garonne en cours)

Invertébrés

(14)

La DCE dans Quadrige²

DCE = métaprogramme

D Composé de plusieurs programmes :

ΠREPHY

ΠRNO РROCCH

ΠREBENT

Œ Divers réseaux régionaux (RSL, SRN…)

D Liste de lieux et de paramètres suivis

Critère d’extraction

(15)

Conclusion : avancées et perspectives

Programmes / stratégies presque tous finalisés (1.5 ETP 2009 / 2010) Effort de saisie

D Bonne familiarisation des saisisseurs

D Passage au routinier à finaliser Effort technique

D Compatibilité Windows 7

D Performances

Intégrer l’historique Æ sous-traiter la saisie ?

Souhait de certains utilisateurs de rester sous Excel

D surcoût

(16)

Contacts

Mail assistance :

D q2suppor@ifremer.fr

Téléphone assistance :

D 8288 ou 02.40.37.42.88

Site cellule d’administration :

D http://w3z.ifremer.fr/quadrige2_support

D http://wwz.ifremer.fr/quadrige2_support

(17)

Pour en savoir plus…

Exemples de structure des données

D Invertébrés

D Macroalgues intertidales

D Macroalgues subtidales

D Herbiers Z. noltii

Exemples de problèmes d’import des données

D Observations non prévues dans les protocoles

D Problèmes d’unités

D Annotations dans les résultats

D Listes taxinomiques

(18)

Arborescence Invertébrés

Intertidal Subtidal

(19)

Arborescence Macroalgues intertidales

(20)

Arborescence Macroalgues subtidales

(21)

Arborescence HZN

(22)

Exemple 1

(23)

Exemple 2

(24)

Exemple 3

(25)

Exemple 4

Références

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