Risk Assessment of Chytridiomycosis to European amphibian Biodiversity: RACE
UK FRANCE
GERMANY SPAIN SWITZERLAND
The Chytrid project The Chytrid project The Chytrid project The Chytrid project
Imperial College London, UK
Fisher, Walker, Doddington, Aanensen Informatics backbone
MLST
Mathematical models
Surveillance Spain, Mallorca MNCN, Spain Bosch, Walker
Environmental analyses, climate change models Surveillance Spain
IoZ/ZSL, UK Garner, Bielby, Risk assessment IC Consultancies, UK
Michyo Shima
List of workpackages
Risk assessment
Surveillance Mediterranean islands, UK
CNRS, France Schmeller, Clobert Population dynamics
Surveillance Pyrenees, France University de Savoie, France
Miaud, Dejean, Artois
Invasive species & Bdintroduction Surveillance France
Helmholtz Center for Environmental Research - UFZ Nesshöver, Henle
Policy relevance University of Zurich, Switzerland
Schmidt
Invasive species & Bdintroduction Surveillance Switzerland
The Chytrid project
The Chytrid project The Chytrid project
The Chytrid project
Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011
Frottis cutanés
30 individus de la même espèce par site Extraction ADN
2 qPCR par échantillon avec marqueurs Bd
303 échantillons de 30 individus
ONEMA : 15 échantillons de 30 individus
Pelophylax sp : 12 Bufo bufo : 1
Bufo calamita : 1
Alytes obstetricans : 1
Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011
ONEMA : 15 sites
93 sites Bd+
183 sites Bd-
27 sites en cours d’analyse
(9090 extraction, 18 180 PCR)
Occurrence nationale de 0.34
Prévalence dans les sites de 1/30 à 28/30
Pelophylax sp
Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011
Pelophylax sp 80 populations Bd+ : 54
Occurrence : 0,67
Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011
Bufo bufo
Alytes obstetricans.
Rana temporaria
Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011 Etude 2011
Bombina variegata.
Bufo calamita
Hyla arborea.
Rana dalmatina
Switzerland- Alytes 63/115 = 0,54 Spain – Alytes 31/126 = 0,25
UK – mixed 19/121 = 0,16 Netherlands – mixed 26/85 = 0,30
UK – mixed 19/121 = 0,16 Netherlands – mixed 26/85 = 0,30
The Chytrid project The Chytrid project The Chytrid project
The Chytrid project
Farrer et al., 2011www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.1111915108
Projet 2012 :
- Compléter la carte nationale (volontaire) - Identifier la lignée présente en France
(Alsace, Var, autres ?)
- Précisez la situation pyrénéenne (limite répartition souche GPL
http://www.alerte-amphibien.fr/
répartition souche GPL
- Précisez le rôle des espèces exotiques envahissantes comme réservoirs et/ou propagateurs de Bd.
- Animer la collecte d’information sur les maladies des amphibiens
WP2, task 2.4 Hygiene protocol
Protocole d’hygiène pour limiter la dissémination de la Chytridiomycose lors d’interventions sur le terrain
