LES EDIFICES CHIMIQUES
LA REPRESENTATION DES MOLECULES
Définition : dans la formule brute d’une molécule chaque élément chimique présent est représenté par son symbole, on indique en indice le nombre d’atomes présent dans la molécule.
Voici une liste de molécules : HCl (chlorure d’hydrogène), H2O (eau), N2 (diazote), CO2 (dioxyde de carbone), C2H6 (éthane), C2H4 (éthène), NH3 (ammoniac), CH4 (méthane).
Pour chaque molécule de la liste faire les tâches listées ci-dessous.
1) En utilisant la méthode vue en cours, donner la structure de Lewis des molécules. On peut présenter ceci sous forme de tableau. Ne pas oublier de vérifier si la règle du duet et celle de l’octet sont respectées.
Nom Formule brute structure
électronique de chaque atome
nombre total d’électrons périphériques
nombre de doublets
nombre de liaisons formées par chaque atome
schéma de Lewis
2) Construire le modèle de la molécule, observer sa géométrie.
3) Vérifier la géométrie à l’aide du logiciel ChemSketch en suivant les instructions ci-dessous.
Prise en main de Chemsketch
Ouvrir Chemsketch. Cliquer une ou deux fois sur :
Par défaut, le carbone est sélectionné dans la barre des éléments chimiques à gauche :
Un clic sur la feuille fait apparaître le groupe : CH4
(les hydrogènes sont placés d’office). Un clic sur l’atome de carbone, puis un glisser sans relâcher, permet de
constituer une molécule comportant 2 atomes de carbone et des hydrogènes. A partir de 3 atomes de carbone, ceux du milieu de la molécule n’apparaissent plus (convention chimie organique).
Pour sélectionner un atome (à supprimer, une molécule à enregistrer…), cliquer avant sur le bouton avec une sphère et une flèche (en haut à gauche) :
Pour obtenir une vue en perspective, sélectionner la molécule choisie, ensuite utiliser : Tools / 3D structure optimization, ou cliquer sur le bouton :
quand s’ouvre une fenêtre « remove hydrogens… » choisir :
A présent, en cliquant sur un atome de carbone de cette molécule, on peut la faire tourner, en faisant glisser la souris.
Ce bouton est sélectionné :
On peut obtenir le nom de la molécule (même si elle n’existe pas) en faisant : Tools / Generate Name from Structure.
Pour obtenir la vue en trois dimensions, on clique sur : , si cette icône n’apparaît pas, cliquer sur ACD/Labs, puis choisir 3D Viewer, ensuite cliquer sur : , pour revenir à l’écran précédent.
On peut ensuite choisir différentes représentations, en cliquant sur : pour obtenir celle correspondant aux modèles utilisés dans le 2). En cliquant sur : on obtient une représentations proche de la réalité. On peut également faire tourner la molécule dans l’espace à l’aide de la souris.
