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Utilisation d’un bio-réacteur scale-down pour la production de lipase à partir de Yarrowia lipolytica

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Academic year: 2021

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Débit de pompe480 (ml/min) Débit de pompe 360 (ml/min) Débit de pompe 240 (ml/min)

-1 2 3 4 5 6 0:00 12:00 24:00 36:00 48:00 60:00 72:00 10 8 N om br e de c el lu le s/ 1 m l

Deuxième type de FSD ( déterministe) Deuxième type de FSD (stochastique) Premier type de FSD de débit de 480ml/min

.

Les résultats obtenus au niveau de fermenteur de laboratoire et de volume industriel sont souvent différents à cause de la diminution de l’efficacité d’homogénéisation (substrats, oxygène

dissous …etc.) du réacteur lorsque le volume augmente tels que. Dans cette optique, le fermenteur

scale-down

peut être utilisé. Il s’agit d’un système permettant de représenter à petite échelle

les conditions de mélange des réacteurs de taille industrielle.

Les lipases microbiennes sont stables dans de nombreux solvants organiques et ne requièrent pas de co-facteur pour être actives. Leurs domaines d'application sont très vastes et variés. Pour la

production de la lipase, la levure non conventionnelle présente de nombreuses potentialités. A ce propos,

Yarrowia lipolytica

est le microorganisme le plus important vu qu’il produit les lipases à

l’échelle industrielle. Pour des raisons économiques, les conditions de culture (pH, dispersion liquide-liquide, aération, …etc.) lors de la production de la lipase, doivent être optimalisées.

Ce poster présente les résultats de l’effet de l’extrapolation sur la production de lipase à partir de

Yarrowia lipolytica

en mode batch avec un milieu de production optimisé (Destain

et al

., 2005).

Les effets de la concentration en oxygène dissous, la dispersion liquide-liquide et les gradients de pH, qui sont affectés par le mélange du milieu de culture, sont présentés dans ce poster. Dans

cette optique, plusieurs dispositifs

scale-down

ont été utilisés. Ceux-ci permettent de reproduire à l’échelle du laboratoire les hétérogénéités rencontrées à l’échelle industrielle.

Utilisation d’un bio-réacteur

scale-down

pour la production de lipase à partir de

Yarrowia lipolytica

KAR T., DELVIGNE F., DESTIN J. et THONART P.

CENTRE WALLON DE BIOLOGIE INDUSTRIELLE Unité de Bio-industries

FACULTE UNIVERSITAIRE DES SCIENCES AGRONOMIQUES DE GEMBLOUX

Le premier type de

réacteur

scale-down

comprend un

réacteur agité classique 20L,

et un dispositif permettant la recirculation du

milieu de culture

à l’extérieur du réacteur.

La recirculation entre les deux parties du

dispositif est

réalisée grâce à une pompe

péristaltique.

Les

débits de recirculation ont été choisis

de

manière à obtenir des conditions

hydrodynamiques

différentes, trois débits

ont été utilisés (480, 360, 240 ml/min).

Le

premier type de réacteur

scale-down

avec recirculation

Le deuxième type de réacteur

scale-down

avec électrovanne

0 1 2 3 4 5 6 0:00 12:00 24:00 36:00 48:00 60:00 72:00 x 1 0 8 Temps (h) N o m b re d e c e llu le s /1 m l Référence

Débit de pompe 480 (ml/min) Débit de pompe 360 (ml/min) Débit de pompe 240 (ml/min)

0 500 1000 1500 2000 0:00 12:00 24:00 36:00 48:00 60:00 72:00 Temps (h) A c ti v it é d e li p a s e ( U /m l) Référence

Débit de pompe 480 (ml/min) Débit de pompe 360 (ml/min) Débit de pompe 240 (ml/min)

0 200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 1800 0:00 12:00 24:00 36:00 48:00 60:00 72:00 Temps (h) L 'a c ti v it é d e ß -g a la c to s id a s e [ U n it é M ill e r] Référence

Débit de pompe480 (ml/min) Débit de pompe 360 (ml/min) Débit de pompe 240 (ml/min)

Analogie entre les

phénomènes d’exposition des cellules au stress

d’oxygène dans les réacteurs

scale-down

de premier (A et C) et

second type (B et D). Les situations A et B correspondent

à la

rencontre

d’une cellule microbienne avec un environnement riche en

oxygène. Les situations C et D correspondent à la rencontre des

cellules microbiennes avec un environnement pauvre en oxygène.

0 200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 1800 0:00 12:00 24:00 36:00 48:00 60:00 72:00 T emps (h)

De ux iè me type de FSD ( dé te rministe ) De ux iè me type de FSD (stocha stique ) Pre mie r type de FSD de dé bit de 480ml/min

L' ac tiv ité d e ß-ga la ct os id as e [U ni M ille r] -1 2 3 4 5 6 0:00 12:00 24:00 36:00 48:00 60:00 72:00 10 8 Temps (h) N om br e de c el lu le s/ 1 m l.

Deuxième type de FSD ( déterministe) Deuxième type de FSD (stochastique) Premier type de FSD de débit de 480ml/min

0 500 1000 1500 2000 0:00 12:00 24:00 36:00 48:00 60:00 72:00 Temps (h) A ct iv ité d e lip as e (U /m l).

Deuxième type de FSD ( déterministe) Deuxième type de FSD (stochastique) Premier type de FSD de débit de 480ml/min

Dans tous les cas étudiés en réacteur scale-down, le nombre des cellules est inférieur à celui

obtenu avec le réacteur de référence, il est influencé par le débit de recirculation. Ce qui montre déjà l'influence de l'intensité de mélange du réacteur sur la physiologie microbienne.

Évolution du nombre de cellules pour les différents débits de recirculation et pour la référence

Évolution de l'activité de la lipase pour les différents débits de recirculation et la référence

Pour tous les tests réalisés en fermenteur scale-down, l’activité de la lipase obtenue est

inférieure à l'activité de la lipase calculée pour le réacteur de référence. La figure ci-dessus

montre aussi que l'activité de la lipase augmente avec les débits de recirculation.

Évolution de l'activité de la Beta-galactosidase pour les différents débits de recirculation et la référence

Au début de la phase exponentielle, l'activité de la Beta-galactosidase est différente pour tous

les réacteurs (référence et fermenteurs scale-down). Ensuite, en fin de phase exponentielle,

l'activité de Beta-galactosidase atteint le même niveau dans tous les cas sauf celui qui correspond au débit le plus faible.

Les

réacteurs de deuxième type comprennent

un

réacteur agité classique 20L et un dispositif

permettant l'injection

contrôlée d'air dans le

milieu de culture par

l’intermédiaire d‘une

électrovanne. L'électrovanne est connectée à

l'ordinateur, qui donne l'ordre d'ouvrir ou de

fermer la vanne par le logiciel MATLAB.

Il existe deux approches pour commander

l’aération dans le réacteur de second type:

l’approche

déterministe

et

l’approche

stochastique.

Évolution du nombre de cellules pour premier type de fermenteur scale-down de débit 480 ml/min, et le deuxième type de fermenteur scale-down (déterministe et

stochastique)

Dans les études menées en réacteur scale-down de premier type avec un débit de 480ml/min, le

nombre des cellules est supérieur à celui obtenu avec le réacteur scale-down de deuxième type

déterministe, et est égal à celui obtenu avec le réacteur scale-down de deuxième type stochastique.

Évolution de l'activité de la lipase pour les différents fermenteurs scale-down

(premier type et deuxième type soit déterministe soit stochastique).

Evolution de l'activité de la Beta-galactosidase pour les différents fermenteurs

scale-down (premier type et deuxième type soit déterministe soit stochastique).

Pour toute la période de fermentation, l'activité de la Beta-galactosidase est différente pour tous les réacteurs (premier type et deuxième type soit déterministe soit stochastique).

En ce qui concerne le premier type avec un débit de 480ml/min, l'activité de la lipase est supérieure à celle calculée pour les réacteurs de deuxième type, et l'activité de la lipase du modèle stochastique est supérieure à celle obtenue avec le modèle déterministe.

Pour le réacteur scale-down de premier type, le nombre de cellules est toujours plus faible dans le cas d’un fermenteur scale-down par rapport au réacteur de référence. Il a été ainsi prouvé que la réduction du débit de recirculation pour une culture en fermenteur scale-down affecte la physiologie des cellules. L'activité de la Beta-galactosidase (il y a un gène rapporteur LacZ placé sous le contrôle du promoteur LIP2 chez la souche

Yarrowia lipolytica JMY775) a été déterminée pour démontrer l'effet du fermenteur scale-down sur la capacité des cellules à produire de la lipase. Ainsi l'effet du réacteur scale-down sur l'activité de la Beta-galactosidase (

la production métabolique de la lipase) dépend de la phase de croissance, cet effet n'est pas constaté en fin de phase exponentielle, sauf pour le débit le plus faible et doit donc être attribué à une diminution de la capacité des cellules à sécréter la lipase lorsque les conditions hydrodynamiques deviennent limitantes.

Un deuxième type de réacteur scale-down à été mis en oeuvre afin d’isoler l’influence du transfert d’oxygène par rapport à l’effet de la dispersion liquide-liquide (ou plus précisément du méthyloléate dans le milieu de

culture aqueux). Il a été montré que la stratégie de contrôle de la vanne d’air a un impact très important sur la production de lipase. La stratégie de contrôle la plus représentative (par rapport aux résultats obtenus avec le réacteur scale-down de premier type) est la régulation par simulation stochastique qui fait l’analogie avec les probabilités de passage en zone aérée et non aérée. Les tests de culture menés avec cette stratégie (soit l’approche déterministe soit l’approche stochastique) ont montrés l’influence prépondérante du transfert d’oxygène lors de l’extrapolation du procédé de production de la lipase. Le réacteur scale-down de second type peut être amélioré en utilisant une vanne d’admission d’air à ouverture/fermeture graduelle.

Comparaison d'une culture avec la régulation du pH dans la partie agitée (A) où la cellule de levure est normale et d’une culture avec une régulation du pH réalisée au niveau de la partie non agitée (B) où un dimorphisme est observé.

La fluctuation du pH

Le pH est régulé en réacteur industriel par l'ajout de base ou d'acide dans la partie supérieure du réacteur et

l'enregistrement de la valeur de pH avec une sonde dans la partie

inférieure du réacteur. Le temps de

réponse de la sonde et de l'action locale du contrôleur, ainsi que leur séparation physique au niveau du

volume du bio-réacteur, induit un gradient de pH. Pour observer l'effet à petite échelle, le gradient de pH est

généré par injection de base ou d'acide à l'entrée de la partie non mélangée du premier type de réacteur

scale-down

.

Les expériences du premier type de réacteur

scale-down

avec régulation du pH à la partie mélangée ont été

comparées avec la régulation du pH à la partie non mélangée. Aucun changement significatif n’est observé

au niveau du nombre de cellules, de l'expression du gène LIP2, ni au niveau de l'activité de lipase.

Toutefois, une modification morphologique des cellules a

été observée avec la régulation du pH au niveau

non mélangée du le premier type de réacteur

.

Les fluctuations de pH en fermenteur scale-down n’entraînent aucun changement significatif au niveau du nombre de cellules, de l'expression du gène LIP2, ni au niveau de l'activité de lipase. L’effet du pH n’a été observé

Références

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