Mesure in vitro de l'activité de la communauté bactérienne ruminale
2
0
0
Texte intégral
(2)
(3) .
(4)
(5) .
(6) ! " "## ! # $%"&'().
(7) "
(8) *+*, ,-.
(9) $,/0 ,2-3, , 2 4 $,,25-$
(10) ,- !,.63*
(11) , 7 - 8. 0 0 0
(12)
(13) ! 9::)
(14) ,7"9::). ; " !< ! .
(15) MESURE IN VITRO DE L’ACTIVITÉ DE LA COMMUNAUTE BACTERIENNE RUMINALE Annabelle TROEGELER-MEYNADIER, Valérie MONTEILS, Sylvie COMBES, Laurent CAUQUIL, Marie-Luce CHEMIT, Francis ENJALBERT INRA - Université de Toulouse, UMR INRA-ENSAT-ENVT 1289 TANDEM, École Nationale Vétérinaire de Toulouse, 23 chemin des Capelles, BP 87614 Toulouse cedex 3 a.troegeler@envt.fr Introduction : Les techniques modernes de biologie moléculaire permettent une description de la micropopulation ruminale. L’étude de l’activité fermentaire de cette population sur les principaux constituants de la ration est souvent réalisée in vitro. Les conditions in vitro présentent des limites par rapport aux conditions in vivo, elles nécessitent d’être validées. Cette étude a pour objectif de déterminer l’effet du temps d’incubation d’une part sur l’activité fermentaire de la micropopulation ruminale (produits de fermentation et dégradation du substrat), et d’autre part sur la communauté bactérienne (quantité et diversité). Figure 1 : Évolution des paramètres fermentaires. 500. 7,2. 400. 7 6,8. 300. 6,6 200. pH. NH3, C2, C3, AGVtotaux. Matériels et méthodes : - incubations : jus de rumen, filtré sur un tamis de 1,6mm (80ml) tampon bicarbonate + minéraux (80ml) son de blé (3g) huile de pépins de raisin (200mg) Ö 0, 3 ou 6h, en anaérobiose, dans un bain-marie rotatif à 39°C - analyses chimiques : azote ammoniacal (NH3) : méthode de Nessler. amidon et NDF : méthodes officielles (NF V03-606 et V18-122) acides gras volatils (AGV) et acides gras longs : CPG - analyses microbiologiques :communauté bactérienne quantification par qPCR évaluation structure et diversité (indice de Simpson) par CE-SSCP - analyses statistiques : analyse de variance avec la durée d’incubation comme facteur.. 6,4. 100. 6,2. 0. 6 0. 3. NH3 mg/l. 6. AGVtotaux mM C2 mM C3 mM. Temps d'incubation, h. pH. Résultats : • Production NH3 [0-3h] = 9 × production NH3 [3-6h] (Figure 1) • Production AGV totaux [0-3h] = 2 × production AGV totaux [3-6h] ; évolution parallèle des différents AGV (Figure 1) • Dégradation des fibres : -17% à 3h et -26% à 6h (Figure 2) • Dégradation de l’amidon : -38% à 3h et -60% à 6h (Figure 2) • Biohydrogénation des acides gras insaturés : Tableau 1 • Biohydrogénation de l’acide linoléique : apparition des intermédiaires, CLA et C18:1t, et du produit terminal, C18:0 (Figure 2) • La durée d’incubation n’a eu aucune influence sur la densité, la structure et la diversité de la population bactérienne (Tableau 2). 250. 1,8. 200. 1,5 1,2. 150. 0,9 100. 0,6. 50. 0,3. NDF et Amidon, g/pot. Acides gras, mg / pot. Figure 2 : Évolution des teneurs en NDF, en amidon et en acides gras impliqués dans la bio hydrogénation de l’acide linoléique. C18:2. 0. 0 0. 3. 6. CLA totaux. Tableau 1 : Pourcentage de disparation des acides gras insaturés Durée d'incubation, h. 3h. 6h. P. C18:2. -32. -53. <0,01. C18:1c9. -23. -33. <0,01. C18:3. -38. -47. <0,01. Tableau 2 : Effets du temps d’incubation sur la communauté bactérienne Durée d'incubation, h Indice de Simpson. 0. 3. 6. P. 5,60. 5,53. 5,72. 0,725. qPCR 1010copies/µl. 2,88. 3,01. 2,12. 0,953. C18:1t totaux C18:0 NDF. Temps d'incubation, h. Amidon. Conclusion : La communauté bactérienne mise à incuber in vitro n’a pas évolué, ni en quantité, ni en structure ou en diversité. Les conditions de culture ne semble donc pas entrainer de sélection d’espèces au cours des 6 premières heures. La micropopulation est restée active, puisque capable de dégrader les différents substrats : matières azotées, glucides et lipides. Une mesure in vitro de l’activité microbienne peut être envisagée en association aux techniques de biologie moléculaire afin de mieux caractériser la communauté bactérienne d’un prélèvement. 3èmes Journées d'Animation Scientifique du Département PHASE, Tours, octobre 2009.
(16)
Documents relatifs
0 la vitesse de libération des acides gras dans la lumière intestinale, liée elle-même à la struc- ture glycéridique, n’a pas d’influence sur la composition en acides
Le sel de plomb de l’acide vaccénique possède la propriété d’être insoluble dans l’alcool acétique, comme les sels de plomb des acides saturés possédant
Les acides gras polyin- saturés jouent donc un rôle important non seulement dans la mise en place des processus inflammatoires, dans une première phase, mais également dans leur
Les corps cétoniques sont des composés hydrosolubles à potentiel énergétique, produits de façon normale lors du catabolisme des acides gras et certains acides aminés dans
À la suite de la lecture de ces documents quel aliment estimez vous souhaitable de rajouter sur votre « liste de courses » pour la semaine prochaine.. Il semble que
Les acides gras à longue chaîne (nombre de carbones > à 10) l’activation se fait dans l’espace intermembranaire de la mitochondrie par une acyl- CoA synthétase liée à la
On constate pour l'acide gras 18:3n-3 une évolution nettement caractérisée: un minimum vers septembre-octobre et un maximum vers février- mars; cette évolution est opposée à
Via acyl CoA synthétase dans la membrane externe des mitochondries qui capte les acides gras et les lie aux CoA après activation de l’acide gras par l’ATP.. Les acides gras
