automatiquement cet ensemble de compos´ es de d´ epart
2.9 R´ ecapitulatif des diff´ erentes optimisations
3.1 Evaluation de l’estimation de la pente lors d’une validation crois´´ ee `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 65536 configurations . . . . 87
3.2 Evaluation de l’estimation de la pente lors d’une autopr´´ ediction `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 65536 configurations . . . . 87
3.3 Evaluation de l’estimation de la pente lors de la phase de validation `´ a partir
du mod`ele g´en´er´e par le set de 65536 configurations . . . . 89
3.4 Evaluation de l’estimation du plateau lors d’une validation crois´´ ee `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 65536 configurations . . . . 90
3.5 Evaluation de l’estimation du plateau lors d’une autopr´´ ediction `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 65536 configurations . . . . 90
3.6 Evaluation de l’estimation du plateau lors de la phase de validation `´ a partir
du mod`ele g´en´er´e par le set de 65536 configurations . . . . 91
3.7 Evaluation de l’estimation de la pente lors d’une validation crois´´ ee `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 80 cas . . . . 93
3.8 Evaluation de l’estimation de la pente lors d’une autopr´´ ediction `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 80 cas . . . . 93
3.9 Evaluation de l’estimation de la pente lors d’une validation crois´´ ee `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 32 cas . . . . 95
3.10 ´Evaluation de l’estimation de la pente lors d’une autopr´ediction `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 32 cas . . . . 95
3.11 ´Evaluation de l’estimation de la pente lors d’une validation crois´ee `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 12 cas . . . . 96
3.12 ´Evaluation de l’estimation de la pente lors d’une autopr´ediction `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 12 cas . . . . 96
3.13 ´Evaluation de l’estimation de la pente lors de la phase de validation `a partir
du mod`ele g´en´er´e par le set de 80 cas . . . . 97
3.14 ´Evaluation de l’estimation de la pente lors de la phase de validation `a partir
du mod`ele g´en´er´e par le set de 32 cas . . . . 98
3.15 ´Evaluation de l’estimation de la pente lors de la phase de validation `a partir
du mod`ele g´en´er´e par le set de 32 cas . . . . 99
3.16 ´Evaluation de l’estimation du plateau lors d’une validation crois´ee `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 80 cas . . . . 100
3.17 ´Evaluation de l’estimation du plateau lors d’une autopr´ediction `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 80 cas . . . . 100
3.18 ´Evaluation de l’estimation du plateau lors d’une validation crois´ee `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 32 cas . . . . 101
3.19 ´Evaluation de l’estimation du plateau lors d’une autopr´ediction `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 32 cas . . . . 101
3.20 ´Evaluation de l’estimation du plateau lors d’une validation crois´ee `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 12 cas . . . . 102
3.21 ´Evaluation de l’estimation du plateau lors d’une autopr´ediction `a partir du
mod`ele g´en´er´e par le set de 12 cas . . . . 102
3.22 ´Evaluation de l’estimation du plateau lors de la phase de validation `a partir
du mod`ele g´en´er´e par le set de 80 cas . . . . 103
3.23 ´Evaluation de l’estimation du plateau lors de la phase de validation `a partir
du mod`ele g´en´er´e par le set de 32 cas . . . . 104
3.24 ´Evaluation de l’estimation du plateau lors de la phase de validation `a partir
du mod`ele g´en´er´e par le set de 12 cas . . . . 105
1.1 La production actuelle d’hydrog`ene . . . . 3
1.2 La production de biohydrog`ene par les microorganismes . . . . 5
1.3 La biophotolyse . . . . 9
1.4 La biophotolyse en mode direct . . . . 10
1.5 La biophotolyse en mode indirect . . . . 10
1.6 Production d’hydrog`ene dans les h´et´erocytes . . . . 11
1.7 La photofermentation . . . . 13
1.8 La darkfermentation . . . . 15
1.9 Synth`ese d’hydrog`ene via des syst`emes bio´electriques . . . . 18
1.10 Syst`eme synth´etique de production d’hydrog`ene `a partir d’amidon . . . . 21
1.11 Int´egration de syst`emes . . . . 22
1.12 Coˆut de production d’hydrog`ene dans les syst`emes synth´etiques . . . . 25
1.13 Modes ´el´ementaires et voies extrˆemes . . . . 29
1.14 Mod`ele syst´emique . . . . 32
1.15 M´ethodologie appliqu´ee pour l’identification d’un mod`ele syst´emique . . . . 34
1.16 Repr´esentation d’un neurone formel . . . . 35
1.17 Assemblage d’un r´eseau de neurone . . . . 36
2.1 Syst`eme synth´etique de production d’hydrog`ene `a partir de cellobiose . . . . 42
2.2 Exemple de loi cin´etique employ´ee dans le mod`ele de production d’hydrog`ene 44
2.3 Comparaison de la vitesse de production de l’hydrog`ene au cours du temps
entre le travail de Ye et al. (2009) et notre mod`ele dans les mˆemes conditions
d’exp´eriences . . . . 51
2.4 Comparaison de la cin´etique des concentrations de diff´erents m´etabolites au
cours du temps entre le mod`ele Ardao and Zeng et notre mod`ele . . . . 52
2.5 Evolution de la concentration de H´ 2 du mod`ele avec les conditions de d´epart
avant optimisation . . . . 54
2.7 R´epartition des valeurs de kcatde la concentration finale en H2 apr`es
optimi-sation . . . . 60
2.8 R´epartition des valeurs deKmde la concentration finale en H2 apr`es
optimi-sation . . . . 63
2.9 Suivi de la concentration de H2 et de la vitesse de production de H2 dans le
temps pour diff´erentes optimisations . . . . 67
2.10 Repr´esentation de la pente et du plateau . . . . 69
2.11 Suivi de la pente en fonction du kcat . . . . 71
2.12 Suivi du plateau en fonction du kcat . . . . 72
2.13 Suivi de la pente en fonction du Km . . . . 73
2.14 Suivi de la pente en fonction du Km, suite . . . . 74
2.15 Suivi du plateau en fonction du Km . . . . 75
2.16 Suivi du plateau en fonction du Km, suite . . . . 76
3.1 Repr´esentation de la pente et du plateau . . . . 81
3.2 Protocole de la mod´elisation par les r´eseaux de neurones . . . . 82
3.3 Exemple d’organisation du r´eseau de neurones pour pr´edire en sortie la pente
`
a t=0. . . . 86
3.4 Autopr´ediction de la pente `a partir du mod`ele g´en´er´e par le set de 65536
configurations . . . . 88
3.5 Validation du mod`ele g´en´er´e par le set de 65536 configurations pour la pr´ediction
de la pente. . . . 89
3.6 Autopr´ediction du plateau g´en´er´e par le set de 65536 configurations . . . . . 90
3.7 Validation du mod`ele g´en´er´e par le set de 65536 configurations pour la pr´ediction
du plateau . . . . 91
3.8 Autopr´ediction de la pente `a partir du mod`ele g´en´er´e par le set de 80
configu-rations . . . . 94
3.9 Autopr´ediction de la pente `a partir du mod`ele g´en´er´e par le set de 32
configu-rations . . . . 95
3.10 Autopr´ediction de la pente `a partir du mod`ele g´en´er´e par le set de 12
configu-rations . . . . 96
3.11 Validation du mod`ele g´en´er´e par la base de 80 configurations pour la pr´ediction
de la pente. . . . 97
3.12 Validation du mod`ele g´en´er´e par la base de 32 configurations pour la pr´ediction
de la pente. . . . 98
3.13 Validation du mod`ele g´en´er´e par la base de 12 configurations pour la pr´ediction
de la pente. . . . 99
3.14 Autopr´ediction du plateau `a partir du mod`ele g´en´er´e par le set de 80
configu-rations . . . . 100
3.15 Autopr´ediction du plateau `a partir du mod`ele g´en´er´e par le set de 32
configu-rations . . . . 101
3.16 Autopr´ediction du plateau `a partir du mod`ele g´en´er´e par le set de 12
configu-rations . . . . 102
3.17 Validation du mod`ele g´en´er´e par la base de 80 configurations pour la pr´ediction
Dans le document
Modélisation de système synthétique pour la production de biohydrogène
(Page 140-146)