1.3 Le NoC micro-Spider II .1Pr´esentation.1Pr´esentation
1.4.3 Probl` eme de d´ etection de deadlock
Neste trabalho, procedeu-se à caracterização da estirpe bacteriana, isolada previamente do complexo marinho C. viridis, e à caracterização estrutural e espectroscópica da Pv por ela produzida. Estes estudos revelaram algumas propriedades até hoje não documentadas, que poderão ajudar a compreender melhor alguns resultados da literatura e, futuramente, ser um ponto de partida para a compreensão do papel da fluorescência das Pv’s no crescimento e metabolismo das espécies que as produzem.
Para atingir os objectivos deste trabalho foi necessário recorrer a uma multiplicidade de técnicas, desde a sequenciação do 16S rRNA da estirpe, espectroscopias várias, espectrometria de massa, entre outras, mas fundamentalmente à espectroscopia de fluorescência em estado estacionário e resolvida no tempo.
A caracterização da estirpe designada como P. putida NB3L apresenta-se bastante preliminar. A associação de uma P. putida ao complexo C. viridis não tinha sido ainda descrita. Ensaios metabólicos, e mais especificamente, a análise do DNA GyrB e rpoD (Yamamoto and Harayama 1998), poderão definir se a estirpe isolada se trata, de facto, duma estirpe nunca anteriormente identificada.
Estudos anteriores demonstram que a produção de Pv depende da concentração do ião Fe3+ presente no meio de cultura (Meyer and Abdallah 1978; Cody and Gross 1987; Manwar et al. 2004). Assim sendo, e embora tenha sido efectuado o crescimento celular da bactéria, é necessário caracterizá-lo em diferentes concentrações deste ião, acompanhando a produção de Pv por espectroscopia UV-Vis e espectroscopia de fluorescência em estado estacionário. Estes estudos servirão para averiguar se a função ou uma das funções desta molécula é a captação e transporte de ferro e poderão ser úteis para determinar a concentração ideal deste catião para a produção máxima de fluoróforo e para o crescimento celular.
Considerações Finais e Perspectivas Na purificação da Pvpp NB3L descobriu-se um método mais eficaz, rápido e economicamente mais apelativo de purificar estes sideróforos, sendo no entanto de realçar que a precipitação da Pvpp NB3L a valores de pH superiores a 10.5 é uma propriedade que aparentemente ainda não foi documentada, indiciando dificuldades na aplicação deste mesmo método a outras moléculas semelhantes. No entanto, o uso de métodos mais sofisticados de isolamento da Pvpp NB3L poderá ser necessário para esclarecer a produção de duas Pv’s com cadeias de aminoácidos ligeiramente diferentes, ou de uma outra molécula responsável pelo valor de 640 m/z observado no espectro de ESI-MS. Neste campo, a aplicação de colunas de afinidade para o ião Fe3+(processo de purificação com base na solubilidade de complexos de ferro em solventes orgânicos) (Meyer and Abdallah 1978) ou Cu2+ (Xiao and Kisaalita 1995), com posterior análise por MS e NMR de fracções com absorção relevante a 400 nm, poderá resolver esta questão. O estudo da purificação desta molécula com recurso a uma precipitação induzida por elevada concentração de etanol é também um passo a ter em conta, pois poderá auxiliar na obtenção de uma amostra mais pura.
Na caracterização estrutural obteve-se um modelo proposto essencialmente a partir dos espectros de massa, mas que é coerente com toda a informação espectroscópica de FT-IR, absorção UV-Vis, fluorescência, NMR de protão, e com o comportamento em solução da molécula. No entanto, a impossibilidade de se obter espectros de NMR de 13C dado a molécula se decompor em solução a pH ácido durante a realização dos ensaios, mostra ser necessária a sua realização num aparelho de potência superior ao utilizado, 400 MHz, e/ou a realização de espectros de NMR de estado sólido (de 1H e 13C), de modo a ser possível aplicar técnicas de correlação de ligações múltiplas heteronuclear (HMBC) e correlação quântica múltipla heteronuclear (HMQC). Estes dados deverão eliminar algumas dúvidas que persistem na sequência de resíduos de aminoácidos, bem como a configuração, D ou L, destes. Estes dados permitirão comparar, de forma mais definitiva, e aprofundada a estrutura da Pv estudada nesta dissertação com outras, e clarificar a relação entre a estrutura e as propriedades deste fluoróforo. A
Considerações Finais e Perspectivas
poderá ser confirmada por NMR, ou então pelo uso de colunas cromatográficas, como por exemplo de afinidade para o Fe3+ (Meyer and Abdallah 1978) ou para o Cu2+(Xiao and Kisaalita 1995).
Para a Pvpp NB3L verifica-se uma quase ausência de emissão de fluorescência a valores de pH ácidos, bem como um desvio para o azul dos comprimentos de onda de emissão, excitação e absorção máximos. Estudos mais detalhados, principalmente na determinação dos valores de pKa dos ligandos envolvidos na complexação dos iões metálicos, efectuando titulações na presença e ausência de vários catiões, poderão esclarecer a capacidade quelante da Pvpp NB3L relativamente a outras Pv’s descritas na literatura. O estudo detalhado da interacção destes iões com a Pvpp NB3L, determinando as constantes de afinidade para os vários iões e a velocidade da formação do complexo, com a respectiva extinção ou aumento da intensidade de fluorescência, poderão relevar-se úteis para futuros ensaios em que se procure determinar se existe uma função não só para a emissão de fluorescência desta molécula, como também para a ligação a estes iões. A realização de espectros de absorção UV-Vis para os ensaios de Fe3+, Al3+ e Cu2+ poderá elucidar se a transição S0→S2 se torna realmente proibida, caso não surja nos espectros de absorção, ou se existe um outro processo não radiativo bastante eficiente a partir de S2, que promove o desaparecimento desta banda.
Nos decaimentos de fluorescência verifica-se que as componentes dos tempos de vida são bastante mais longas que as descritas (Folschweiller et al. 2002) mesmo a valores de pH ácidos comparativamente a valores básicos da Pv documentada nesse mesmo estudo. Os dados sugerem uma conformação mais rígida da Pvpp NB3L, que poderá eliminar algumas vias de relaxação electrónica não radiativas. No entanto, estudos do decaimento de fluorescência na presença de diversos iões metálicos, e na presença de vários tampões, parece essencial para compreender completamente a interacção deste sideróforo com o meio que o envolve.
Relativamente aos tempos de correlação rotacional calculados, a conversão total da Pvpp NB3L presente em solução numa forma complexada com um ião ou na forma apo, poderá auxiliar na determinação de valores mais
Considerações Finais e Perspectivas precisos. A realização de experiências de decaimentos de anisotropia poderá igualmente auxiliar na determinação dum tempo de correlação rotacional mais preciso, ou até da detecção de mais do que um tempo de correlação rotacional, e assim permitir um entendimento mais profundo das propriedades de absorção e fluorescência e do comportamento em solução desta molécula.
A determinação do rendimento quântico da molécula purificada pelos diferentes métodos, bem como na presença de diferentes metais e valores de pH, e a determinação de um coeficiente de absorção molar, é vital para a possível aplicação desta molécula em qualquer campo tecnológico. A comprovar-se a elevada fotoestabilidade da molécula, esta poderá inclusivé vir a ser utilizada como padrão para a determinação do rendimento quântico de outros fluoróforos, desde que em condições tais que esteja presente apenas uma espécie emissiva. Uma hipótese será a saturação com Al3+, uma vez que este ião leva a um aumento da intensidade de fluorescência.
Os resultados obtidos indicam que a Pvpp NB3L se trata de uma nova Pv entre todas as documentadas até hoje, principalmente no que diz respeito à sua fotoestabilidade em solução, propriedades químicas e espectroscópicas. Este estudo e os ensaios posteriores poderão melhorar o conhecimento do papel biológico desta família de compostos, principalmente em funções que vão além do transporte de ferro para o interior da célula. Estes resultados poderão também demonstrar-se essenciais para compreender se as Pv’s possuem um papel de Quorum Sensing nas colónias e biofilmes de bactérias, principalmente no efeito da fluorescência do Chr nesse âmbito, dada a sua interacção com iões metálicos e variações com o pH.
Finalmente, será também interessante averiguar se as características aparentemente únicas da Pv estudada neste trabalho se devem às características particulares do meio marinho, nomeadamente no que diz respeito à concentração dos vários iões metálicos.
Lista de Referências Bibliográficas
Lista de Referências Bibliográficas
1. Ackerley DF, Lamont IL (2004) Characterization and genetic manipulation of peptide synthetases in Pseudomonas aeruginosa PAO1 in order to generate novel pyoverdines. Chem.Biol. 11, 971-980.
2. Adonizio A, Kong KF, Mathee K (2008) Inhibition of quorum sensing- controlled virulence factor production in Pseudomonas aeruginosa by South Florida plant extracts. Antimicrob.Agents Chemother. 52, 198-203. 3. Albesa I, Barberis LI, Pajaro MC, Eraso AJ (1985) Pyoverdine Production
by Pseudomonas-Fluorescens in Synthetic Media with Various Sources of Nitrogen. Journal of General Microbiology 131, 3251-3254.
4. Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ (1990) Basic Local Alignment Search Tool. Journal of Molecular Biology 215, 403-410.
5. Alves da Mata AT (2008) Isolamento e Produção Fermentativa de Bactérias Provenientes de Invertebrados Marinhos.
6. André R (2008) Detecção e Quantificação de Moléculas de Comunicação Entre Bactérias.
7. Atkinson RA, Salah El Din AL, Kieffer B, Lefevre JF, Abdallah MA (1998) Bacterial iron transport: 1H NMR determination of the three-dimensional structure of the gallium complex of pyoverdin G4R, the peptidic siderophore of Pseudomonas putida G4R. Biochemistry 37, 15965- 15973.
8. Barelmann I, Fernandez DU, Budzikiewicz H, Meyer JM (2003) The pyoverdine from Pseudomonas chlororaphis D-TR133 showing mutual acceptance with the pyoverdine of Pseudomonas fluorescens CHAO.
Biometals 16, 263-270.
9. Barelmann I, Taraz K, Budzikiewicz H, Geoffroy V, Meyer JM (2002) The structures of the pyoverdins from two Pseudomonas fluorescens strains accepted mutually by their respective producers. Z.Naturforsch.C. 57, 9- 16.
10. Baysse C, De Vos D, Naudet Y, Vandermonde A, Ochsner U, Meyer JM, Budzikiewicz H, Schafer M, Fuchs R, Cornelis P (2000) Vanadium interferes with siderophore-mediated iron uptake in Pseudomonas aeruginosa. Microbiology-Uk 146, 2425-2434.
11. Becerra C, Albesa I, Eraso AJ (2001) Leukotoxicity of pyoverdin, production of reactive oxygen species, and effect of UV radiation.
Biochem.Biophys.Res.Commun. 285, 414-418.
12. Beiderbeck H, Taraz K, Meyer JM (1999) Revised structures of the pyoverdins from Pseudomonas putida CFBP 2461 and from Pseudomonas fluorescens CFBP 2392. Biometals 12, 331-338.
Lista de Referências Bibliográficas 13. Berezin MY, Achilefu S (2010) Fluorescence Lifetime Measurements and
Biological Imaging. Chemical Reviews 110, 2641-2684.
14. Boopathi E, Rao KS (1999) A siderophore from Pseudomonas putida type A1: structural and biological characterization. Biochimica et
Biophysica Acta-Protein Structure and Molecular Enzymology 1435, 30-
40.
15. Boukhalfa H, Reilly SD, Michalczyk R, Iyer S, Neu MP (2006) Iron(III) coordination properties of a pyoverdin siderophore produced by Pseudomonas putida ATCC 33015. Inorg.Chem. 45, 5607-5616.
16. Budzikiewicz H, Fuchs R, Taraz K (1998) Dihydropyoverdin-7-sulfonic acids - Unusual bacterial metabolites. Natural Product Letters 12, 125- 130.
17. Budzikiewicz H, Schafer M, Fernandez DU, Matthijs S, Cornelis P (2007) Characterization of the chromophores of pyoverdins and related siderophores by electrospray tandem mass spectrometry. Biometals 20, 135-144.
18. Bultreys A, Gheysen I (2000) Production and comparison of peptide siderophores from strains of distantly related pathovars of Pseudomonas syringae and Pseudomonas viridiflava LMG 2352. Applied and
Environmental Microbiology 66, 325-331.
19. Bultreys A, Gheysen I, Wathelet B, Schafer M, Budzikiewicz H (2004) The pyoverdins of Pseudomonas syringae and Pseudomonas cichorii.
Z.Naturforsch.C. 59, 613-618.
20. Buyer JS, Wright JM, Leong J (1986) Structure of Pseudobactin A214, A Siderophore from A Bean-Deleterious Pseudomonas. Biochemistry 25, 5492-5499.
21. Chen CF, Chen QY (2004) A tetra-sulfonamide derivative bearing two dansyl groups designed as a new fluoride selective fluorescent chemosensor. Tetrahedron Letters 45, 3957-3960.
22. Chen Y, Jurkevitch E, Barness E, Hadar Y (1994) Stability-Constants of Pseudobactin Complexes with Transition-Metals. Soil Science Society of
America Journal 58, 390-396.
23. Clement E, Mesini PJ, Pattus F, Schalk IJ (2004) The binding mechanism of pyoverdin with the outer membrane receptor FpvA in Pseudomonas aeruginosa is dependent on its iron-loaded status.
Biochemistry 43, 7954-7965.
24. Cody YS, Gross DC (1987) Characterization of Pyoverdin(pss), the Fluorescent Siderophore Produced by Pseudomonas syringae pv. syringae. Appl.Environ.Microbiol. 53, 928-934.
Lista de Referências Bibliográficas
25. Cutignano A, Bruno I, Bifulco G, Casapullo A, Debitus C, Gomez-Paloma L, Riccio R (2001) Dactylolide, a new cytotoxic macrolide from the Vanuatu sponge Dactylospongia sp. European Journal of Organic
Chemistry 775-778.
26. del Olmo A, Caramelo C, SanJose C (2003) Fluorescent complex of pyoverdin with aluminum. J.Inorg.Biochem. 97, 384-387.
27. Demange P, Bateman A, Mertz C, Dell A, Piemont Y, Abdallah MA (1990a) Bacterial siderophores: structures of pyoverdins Pt, siderophores of Pseudomonas tolaasii NCPPB 2192, and pyoverdins Pf, siderophores of Pseudomonas fluorescens CCM 2798. Identification of an unusual natural amino acid. Biochemistry 29, 11041-11051.
28. Demange P, Wendenbaum S, Linget C, Mertz C, Cung MT, Dell A, Abdallah MA (1990b) Bacterial siderophores: structure and NMR assignment of pyoverdins Pa, siderophores of Pseudomonas aeruginosa ATCC 15692. Biology of Metals 3, 155-170.
29. Dieckmann R, Graeber I, Kaesler I, Szewzyk U, von Dohren H (2005) Rapid screening and dereplication of bacterial isolates from marine sponges of the Sula Ridge by Intact-Cell-MALDI-TOF mass spectrometry (ICM-MS). Applied Microbiology and Biotechnology 67, 539-548.
30. Diggle SP, Matthijs S, Wright VJ, Fletcher MP, Chhabra SR, Lamont IL, Kong X, Hider RC, Cornelis P, Camara M, Williams P (2007) The Pseudomonas aeruginosa 4-quinolone signal molecules HHQ and PQS play multifunctional roles in quorum sensing and iron entrapment.
Chem.Biol. 14, 87-96.
31. Dorrestein PC, Poole K, Begley TP (2003) Formation of the chromophore of the pyoverdine siderophores by an oxidative cascade. Org.Lett. 5, 2215-2217.
32. Eastman JW (1967) Quantitative Spectrofluorimetry - Fluorescence Quantum Yield of Quinine Sulfate. Photochemistry and Photobiology 6, 55-&.
33. Eldin ALMS, Kyslik P, Stephan D, Abdallah MA (1997) Bacterial iron transport: Structure elucidation by FAB-MS and by 2D NMR (H-1, C-13, N-15) of pyoverdin G4R, a peptidic siderophore produced by a nitrogen- fixing strain of Pseudomonas putida. Tetrahedron 53, 12539-12552. 34. Elliot RP (1958) Some properties of pyoverdine, the water-soluble
fluorescent pigment of the pseudomonads. Appl.Microbiol. 6, 241-246. 35. Fernandez DU, Fuchs R, Schafer M, Budzikiewicz H, Meyer JM (2003)
The pyoverdin of Pseudomonas fluorescens G173, a novel structural type accompanied by unexpected natural derivatives of the corresponding ferribactin. Z.Naturforsch.C. 58, 1-10.
Lista de Referências Bibliográficas 36. Fernandez DU, Fuchs R, Taraz K, Budzikiewicz H, Munsch P, Meyer JM
(2001) The structure of a pyoverdine produced by a Pseudomonas tolaasii-like isolate. Biometals 14, 81-84.
37. Folschweiller N, Gallay J, Vincent M, Abdallah MA, Pattus F, Schalk IJ (2002) The interaction between pyoverdin and its outer membrane receptor in Pseudomonas aeruginosa leads to different conformers: a time-resolved fluorescence study. Biochemistry 41, 14591-14601.
38. Fuchs R, Schafer M, Geoffroy V, Meyer JM (2001) Siderotyping--a powerful tool for the characterization of pyoverdines.
Curr.Top.Med.Chem. 1, 31-57.
39. Greenwald J, Hoegy F, Nader M, Journet L, Mislin GL, Graumann PL, Schalk IJ (2007) Real time fluorescent resonance energy transfer visualization of ferric pyoverdine uptake in Pseudomonas aeruginosa. A role for ferrous iron. J.Biol.Chem. 282, 2987-2995.
40. Imperi F, Tiburzi F, Visca P (2009) Molecular basis of pyoverdine siderophore recycling in Pseudomonas aeruginosa.
Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A 106, 20440-20445.
41. Jacques P, Ongena M, Bernard F, Fuchs R, Budzikiewicz H, Thonart P (2003) Fluorescent Pseudomonas mainly produce the dihydro form of pyoverdine at low specific growth rate. Lett.Appl.Microbiol. 36, 259-262. 42. Jacques P, Ongena M, Gwose I, Seinsche D, Schroder H, Delfosse P,
Thonart P, Taraz K, Budzikiewicz H (1995) Structure and characterization of isopyoverdin from Pseudomonas putida BTP1 and its relation to the biogenetic pathway leading to pyoverdins.
Z.Naturforsch.C. 50, 622-629.
43. Kefalas E, Castrits-Catharios J, Miliou H (2003) Bacteria associated with the sponge Spongia Officinalis as indicators of contamination. Ecological
Indicators 2, 339-343.
44. Kilz S, Lenz C, Fuchs R, Budzikiewicz H (1999) A fast screening method for the identification of siderophores from fluorescent Pseudomonas spp. by liquid chromatography/electrospray mass spectrometry. J.Mass
Spectrom. 34, 281-290.
45. Knapp EW (1984) Vibrational Line-Shapes in Liquids - the Role of Resonant Intermolecular Coupling. Journal of Chemical Physics 81, 643- 652.
46. Knapp EW, Fischer SF (1981) On the Theory of Homogeneous and Inhomogeneous Line Broadening - An Exactly Solvable Model. Journal of
Lista de Referências Bibliográficas
47. Knapp EW, Fischer SF (1982) The Concentration-Dependence of the Vibrational Linewidth and Shift in Liquid Binary-Mixtures - An Analytical Model. Journal of Chemical Physics 76, 4730-4735.
48. Lakowicz JR (2006) 'Principles of Fluorescence Spectroscopy.' (Springer Science: New York, USA)
49. Lane D (1991) 16S/23S rRNA Sequencing. In 'Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics'. pp. 115-175. (Wiley, John & Sons: New York) 50. Maksimova NP, Blazhevich OV, Lysak VV, Fomichev I (1994)
[Characterization of the fluorescent pigment pyoverdine Pm, produced by Pseudomonas putida bacteria]. Mikrobiologiia 63, 1038-1044.
51. Manwar AV, Khandelwal SR, Chaudhari BL, Meyer JM, Chincholkar SB (2004) Siderophore production by a marine Pseudomonas aeruginosa and its antagonistic action against phytopathogenic fungi.
Appl.Biochem.Biotechnol. 118, 243-251.
52. Marinho PR, Moreira APB, Pellegrino FLPC, Muricy G, Bastos MDD, dos Santos KRN, Giambiagi-deMarval M, Laport MS (2009) Marine Pseudomonas putida: a potential source of antimicrobial substances against antibiotic-resistant bacteria. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz
104, 678-682.
53. Marquardt DW (1963) An Algorithm for Least-Squares Estimation of Nonlinear Parameters. Journal of the Society for Industrial and Applied
Mathematics 11, 431-441.
54. Marques A (2009) 'Relatório de Bolsa de Integração na Investigação.' 55. Meyer JM (2000) Pyoverdines: pigments, siderophores and potential
taxonomic markers of fluorescent Pseudomonas species. Arch.Microbiol.
174, 135-142.
56. Meyer JM, Abdallah MA (1978) Fluorescent Pigment of Pseudomonas- Fluorescens - Biosynthesis, Purification and Physicochemical Properties.
Journal of General Microbiology 107, 319-328.
57. Meyer JM, Geoffroy VA, Baysse C, Cornelis P, Barelmann I, Taraz K, Budzikiewicz H (2002) Siderophore-mediated iron uptake in fluorescent Pseudomonas: characterization of the pyoverdine-receptor binding site of three cross-reacting pyoverdines. Arch.Biochem.Biophys. 397, 179-183. 58. Meyer JM, Gruffaz C, Tulkki T, Izard D (2007) Taxonomic heterogeneity,
as shown by siderotyping, of strains primarily identified as Pseudomonas putida. Int.J.Syst.Evol.Microbiol. 57, 2543-2556.
59. Meyer JM, Hornsperger JM (1978) Role of Pyoverdinepf, Iron-Binding Fluorescent Pigment of Pseudomonas-Fluorescens, in Iron Transport.
Lista de Referências Bibliográficas 60. Meyer JM, Neely A, Stintzi A, Georges C, Holder IA (1996) Pyoverdin is
essential for virulence of Pseudomonas aeruginosa. Infect.Immun. 64, 518-523.
61. Meyer JM, Stintzi A, Coulanges V, Shivaji S, Voss JA, Taraz K, Budzikiewicz H (1998) Siderotyping of fluorescent pseudomonads: characterization of pyoverdines of Pseudomonas fluorescens and Pseudomonas putida strains from Antarctica. Microbiology 144 (Pt 11), 3119-3126.
62. Meyer JM, Stintzi A, De VD, Cornelis P, Tappe R, Taraz K, Budzikiewicz H (1997) Use of siderophores to type pseudomonads: the three Pseudomonas aeruginosa pyoverdine systems. Microbiology 143 (Pt 1), 35-43.
63. Moll H, Johnsson A, Schafer M, Pedersen K, Budzikiewicz H, Bernhard G (2008) Curium(III) complexation with pyoverdins secreted by a groundwater strain of Pseudomonas fluorescens. Biometals 21, 219-228. 64. Mureseanu M, Renard G, Galarneau A, Lerner DA (2003) A
demonstration model for a selective and recyclable uptake of metals from water: Fe(III) ions complexation and release by a supported natural fluorescent chelator. Talanta 60, 515-522.
65. Ongena M, Jacques P, Delfosse P, Thonart P (2002) Unusual traits of the pyoverdin-mediated iron acquisition system in Pseudomonas putida strain BTP1. Biometals 15, 1-13.
66. Ongena M, Jacques P, Thonart P, Gwose I, Fernandez DU, Schafer M, Budzikiewicz H (2001) The pyoverdin of Pseudomonas fluorescens BTP2, a novel structural type. Tetrahedron Letters 42, 5849-5851.
67. Palanche T, Blanc S, Hennard C, Abdallah MA, Albrecht-Gary AM (2004) Bacterial iron transport: coordination properties of azotobactin, the highly fluorescent siderophore of Azotobacter vinelandii. Inorg.Chem. 43, 1137- 1152.
68. Pandey P, Kang SC, Gupta CP, Maheshwari DK (2005) Rhizosphere competent Pseudomonas aeruginosa GRC1 produces characteristic siderophore and enhances growth of Indian mustard (Brassica campestris). Curr.Microbiol. 51, 303-309.
69. Patriquin GM, Banin E, Gilmour C, Tuchman R, Greenberg EP, Poole K (2008) Influence of quorum sensing and iron on twitching motility and biofilm formation in Pseudomonas aeruginosa. J.Bacteriol. 190, 662-671. 70. Peix A, Ramirez-Bahena MH, Velazquez E (2009) Historical evolution
and current status of the taxonomy of genus Pseudomonas. Infection
Lista de Referências Bibliográficas
71. Persmark M, Frejd T, Mattiasson B (1990) Purification, Characterization, and Structure of Pseudobactin-589-A, A Siderophore from A Plant- Growth Promoting Pseudomonas. Biochemistry 29, 7348-7356.
72. Pulido-Tofino P, Moreno JM, Perez-Conde MC (2000) A flow-through fluorescent sensor to determine Fe(III) and total inorganic iron. Talanta
51, 537-545.
73. Rashid MA, Gustafson KR, Boyd MR (2001) New chondropsin macrolide lactams from marine sponges in the genus Ircinia. Tetrahedron Letters
42, 1623-1626.
74. Romanenko LA, Uchino M, Falsen E, Frolova GM, Zhukova NV, Mikhailov VV (2005a) Pseudomonas pachastrellae sp nov., isolated from a marine sponge. International Journal of Systematic and Evolutionary
Microbiology 55, 919-924.
75. Romanenko LA, Uchino M, Falsen E, Lysenko AM, Zhukova NV, Mikhailov VV (2005b) Pseudomonas xanthomarina sp nov., a novel bacterium isolated from marine ascidian. Journal of General and Applied
Microbiology 51, 65-71.
76. Romanenko LA, Uchino M, Tebo BM, Tanaka N, Froloval GM, Mikhailov VV (2008) Pseudomonas marincola sp nov., isolated from marine environments. International Journal of Systematic and Evolutionary
Microbiology 58, 706-710.
77. Ruangviriyachai C, Fernandez DU, Fuchs R, Meyer JM, Budzikiewicz H (2001) A new pyoverdin from Pseudomonas aeruginosa R'.
Z.Naturforsch.C. 56, 933-938.
78. Saleh N, Al-Soud YA, Nau WM (2008) Novel fluorescent pH sensor based on coumarin with piperazine and imidazole substituents.
Spectrochimica Acta Part A-Molecular and Biomolecular Spectroscopy
71, 818-822.
79. Schafer M, Fuchs R, Budzikiewicz H, Springer A, Meyer JM, Linscheid M (2006) Structure elucidation of cyclic pyoverdins and examination of rearrangement reactions in MS/MS experiments by determination of exact product ion masses. J.Mass Spectrom. 41, 1162-1170.
80. Schalk IJ (2008) Metal trafficking via siderophores in Gram-negative bacteria: specificities and characteristics of the pyoverdine pathway.
J.Inorg.Biochem. 102, 1159-1169.
81. Schalk IJ, Lamont IL, Cobessi D (2009) Structure-function relationships in the bifunctional ferrisiderophore FpvA receptor from Pseudomonas aeruginosa. Biometals 22, 671-678.
Lista de Referências Bibliográficas 82. Schalk IJ, Yue WW, Buchanan SK (2004) Recognition of iron-free
siderophores by TonB-dependent iron transporters. Molecular
Microbiology 54, 14-22.
83. Schönberg CHL, Loh WKW (2005) Molecular identity of the unique symbiotic dinoflagellates found in the bioeroding demosponge Cliona orientalis. MARINE ECOLOGY PROGRESS SERIES 299, 157-166. 84. Schons V, Atkinson RA, Dugave C, Graff R, Mislin GLA, Rochet L,