Mesures sur molécules uniques

6.9.1

Mesures types

Une mesure type dure une heure, une fois que le dépôt d’une molécule unique d’ADN λ porteuse de groupes disulfide sur les électrodes d’or a eu lieu. Elle est effectuée à 0, 01 Hz, dans du tampon PB. La molécule n’est pas étirée (Ext= 2 µm), les pinces optiques sont éteintes. La

distance entre les électrodes est de 70 nm pour une mesure deux points, et la température est de l’ordre de 25o_{C. Des mesures de ce type sont représentées sur la figure 6.15 pour V}

0 = 60

mV . On remarque que avec ou sans ADN sur les électrodes (figures 6.15A et B) I ≃ 1, 5 pA et ϕ ≃ −90o5_.

On peut aussi effectuer les mesures "à sec". Une fois le dépôt de la molécule réalisé en solution, on sèche la surface avec un flux très faible d’air comprimé. On vérifie avec un objectif 100X à air que les deux billes de silice encadrent toujours les électrodes de mesure (figure 6.16). De telles mesures sont présentées sur les figures 6.15 C et D. Les courants mesurés sont plus faibles qu’en solution (de l’ordre de 30 fA), mais la phase est aussi de l’ordre de −90o_{. Ces signaux sont aussi}

moins stables qu’en solution, le courant mesuré étant plus faible. Enfin, on ne remarque aucune différence significative avec ou sans ADN sur les électrodes (I ≃ 30 fA et ϕ ≃ −90o_).

Nous avons été en mesure de réaliser en tout une soixantaine de mesures avec de l’ADN. Les différents types de mesures (deux ou quatre points, en solution ou à sec, avec ou non ajout d’ions M g2+_{) sont détaillés par la suite.}

6.9.2

Mesures 2 points en solution et à sec

Les figures 6.17A,B,C,D présentent des résultats de mesures deux points en solution et à sec, avec ou sans ADN, pour des valeurs de V0 allant de 4 mV à 60 mV .

Pour les expériences sans ADN, la phase est égale à ϕ = −90o _{(figure 6.17B et D) et on}

observe donc principalement l’effet de la capacité Ct+ Cs. A sec, les mesures présentées sur la

figure 6.17C nous donnent Cs,sec = 0, 01 ± 0, 005 nF . Les mesures en solution présentées sur la

figure 6.17A permettent de calculer une valeur moyenne de Ct> Cs égale à Ct,P B = 0, 6 ± 0, 1 5

Nous avons augmenté V0 jusqu’à des valeurs de quelques centaines de millivolts à 1 V, mais les électrodes

6. CONDUCTIVITÉ DE L’ADN 89

A B

C

D

Figure 6.15:_{Mesure du module I du courant i(t) et de sa phase ϕ en fonction du temps, entre deux} électrodes distantes de 70 nm, pour f = 0, 01 Hz et V0= 60 mV . A. Mesure dans du tampon PB sans ADN. B. Mesure dans du tampon PB après le dépôt d’une molécule d’ADN sur les électrodes. C. Mesure sur une surface "sèche", sans ADN. D. Mesure sur une surface "sèche", avec une molécule d’ADN déposée sur les électrodes.

nF . On remarque que les barres d’erreurs des quantités mesurées sont plus grandes à sec, les signaux étant beaucoup plus faibles.

On n’observe aucune différence significative lorsqu’une molécule d’ADN a été déposée sur les électrodes. Le module efficace du courant I varie de la même manière en fonction du module efficace de la tension imposée V0, et i(t) est toujours en quadrature de phase par rapport à v(t),

à sec comme en solution.

6.9.3

Ajout d’ions M g

L’ion Mg2+ _{s’intercale dans les sillons d’un double brin d’ADN. Nous avons parlé de l’im-}

90 6. CONDUCTIVITÉ DE L’ADN

Figure 6.16:_{Mesure de conductance sur une surface "sèche". Il n’y a pas d’eau sur l’échantillon posi-} tionné sous l’objectif du microscope. L’échantillon est encadré par deux réservoirs contenant du gel de silice granulé. La mesure s’effectue à l’intérieur d’une cage en toile de cuivre finement tressée.

réalisé des expériences comparables à celles décrites précédemment, en ajoutant au tampon PB 1 mM d’ions M g2+. Les résultats, présentés sur la figure 6.18, sont similaires aux expériences sans ions Mg2+_{. La phase ϕ reste égale à −90}o_{, la variation de I en fonction de V}

0 est la même

avec ou sans ADN, mais en solution la pente est légèrement plus grande que sans ions Mg2+ _(la

solution étant plus salée).

6.9.4

Mesures 4 points en solution et à sec

La mesure quatre points de i(t) (figure 6.19) est identique à sa mesure deux points : La valeur de Ctne semble pas dépendre de la distance entre les deux électrodes, entre lesquelles on impose

v0(t) (70 nm ou 530 nm). Ceci est facilement compréhensible : lorsque la distance d entre les

électrodes augmente, la valeur de Rt augmente mais reste toujours négligeable devant la valeur

de Ce qui elle ne change pas, étant caractéristique de la surface en regard des électrodes et de la

concentration en sel du tampon.

Les mesures du courant i(t) et de la tension v(t) restent identiques avec ou sans dépôt de molécules d’ADN (en solution ou à sec). L’impédance d’entrée pour la mesure de v(t) (1012 _Ω)

n’étant pas très supérieure à 1

(Ct+Cs)w (1011 Ω en solution et 1013Ω à sec et pour une fréquence

de 0, 01 Hz), il est difficile de donner un sens à cette mesure (figure 6.20).

6.9.5

Calcul de la borne inférieure de la résistance mesurée

La figure 6.21 est un tracé de la valeur théorique de ϕ et I en fonction de la résistance Ra

à partir des équations 6.17 et 6.18, pour une fréquence f = 0, 01 Hz, pour V0 = 4 mV ou 60

6. CONDUCTIVITÉ DE L’ADN 91

A

B

C D

Figure 6.17:_{Mesures du module I du courant i(t) et de sa phase ϕ entre deux électrodes distantes de 70} nm, pour une fréquence f = 0, 01 Hz, en fonction de V0. Mesures avec (points en rouge) ou sans (points en noir) ADN. A. Mesure dans du tampon PB du module I du courant i(t). B. Mesure dans du tampon PB de la phase ϕ du courant i(t). C. Mesure à sec (après une incubation en tampon PB de l’échantillon) du module I du courant i(t). D. Mesure à sec (après une incubation en tampon PB de l’échantillon) de la phase ϕ du courant i(t).

en mesure de détecter après un dépôt d’ADN un changement de la phase de −90o _{à −80}o_{. Ceci}

nous permet de donner une borne inférieure de la résistance Ra en solution :

Ra,solution>1011Ω (6.23)

De même, à sec :

92 6. CONDUCTIVITÉ DE L’ADN

A B

D C

Figure 6.18: _{Mesures du module I du courant i(t) et de sa phase ϕ entre deux électrodes distantes de} 70 nm, pour f = 0, 01 Hz, en fonction de V0. Mesures avec (points en rouge) ou sans (points en noir) ADN. A. Mesure dans du tampon PB+1 mM M g2+ _{du module I du courant i(t). B. Mesure dans du} tampon PB+1 mM M g2+ _{de la phase ϕ du courant i(t). C. Mesure à sec (après une incubation en} tampon PB+1 mM M g2+ _{de l’échantillon) du module I du courant i(t). D. Mesure à sec (après une} incubation en tampon PB+1 mM M g2+ _{de l’échantillon) de la phase ϕ du courant i(t).}