2.1.1 Variétés clonales d’hévéa
L’ensemble de 30 variétés clonales utilisées pour cette étude comporte 18 clones cultivés de la population Wickham, un clone d’origine native amazonienne, neuf clones issus de croisements Wickham x Amazonien et deux clones de groupe génétique inconnu (Tab 2-1). Parmi ces 30 clones, onze (CD1174, CDC312, CDC56, FDR4575, FDR5240, FDR5665, FDR5788, FDR5802, PMB1, MDX607 et MDX624) ont été créés dans les années 1950 sur les plantations Firestone du Liberia et du Guatemala, puis sélectionnés au Brésil dans le cadre du programme « Cirad Michelin Selection » au cours des années 1990 ; GT1 est un clone primaire sélectionné en Indonésie ; huit clones (IRCA 18, 19, 145, 230, 303, 331, 41, 631) ont été créés par l’Institut de Recherche sur le Caoutchouc en Côte d’Ivoire ; MDF180 est un clone natif de l’Amazonie péruvienne, sélectionné dans le cadre d’un programme d’amélioration génétique pour la tolérance à la maladie SALB ; sept clones (PB217, PB254, PB260 ; RRIM600, RRIM802, RRIM901 et RRIM926) ont été sélectionnés en Malaisie ; deux clones RRIC100 et Yunyan77-4 ont été créés au Sri-Lanka et en Chine respectivement. Tous les clones appartiennent à l’espèce Hevea brasiliensis, sauf FDR5240 qui est issu du croisement interspécifique H. brasiliensis x H. spruceana.
Ces clones sont conservés en jardin à bois de greffe en Côte d’Ivoire (plantations SOGB et SAPH-Toupah) et/ou dans des pots en serres (à la température 26/28°C nuit/jour et 40-60 % d’humidité), à Clermont-Ferrand (Université Blaise Pascal) et à Montpellier (CIRAD), en France. Leur conformité clonale a été vérifiée par huit marqueurs microsatellites (SSR) (décrite dans le §2.5).
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Tableau 2-1. Clones d'hévéa utilisés dans cette étude.
Groupe génétique: les génotypes W (Wickham) correspondent aux graines historiquement transférées du Brésil au jardin botanique de Kew en Angleterre, par M. Henri Wickham, en 1876, et ensuite améliorées et multipliées en Asie et en Afrique; les génotypes WA ont été créés par croisement entre les génotypes W et A (natif amazonien).
Num Clone Croisement
(Femelle x Male)
Groupe
génétique Origine
1 CD1174 AVROS1581 x MDF315 WA
Cirad Michelin Selection, Guatemala 2 CDC312 AVROS308 x MDX40 WA 3 CDC56 MDX91 x RRIM614 ?W 4 FDR4575 HARBEL68 x FDR18 WA 5 FDR5240 HARBEL68 x TU45/525 WA 6 FDR5665 HARBEL62 x MDX25 WA 7 FDR5788 HARBEL8 x MDF180 WA 8 FDR5802 HARBEL67 x CD47 ? 9 PMB1 ? x ? WA 10 MDX607 AVROS1581 x MDF? WA 11 MDX624 AVROS1581 x MDF? WA
12 GT1 Clone primaire W Gondang Tapen, Indonesie
13 IRCA18 PB5/51 x RRIM605 W
14 IRCA19 PB5/51 x RRIM605 W
15 IRCA145 PB5/51 x RRIM501 W
16 IRCA230 GT1 x PB5/51 W
17 IRCA303 GT1 x IR22 W IRCA, Côte d'Ivoire
18 IRCA331 GT1 x PB217 W
19 IRCA41 GT1 x PB5/51 W
20 IRCA631 PB5/51 x RRIM707 W
21 MDF180 ? x ? A Pérou
22 PB217 PB5/51 x PB6/9 W
23 PB254 PB5/51 x PBS/78 W Prang Besar, Malaisie
24 PB260 PB5/51 x PB49 W
25 RRIM600 TJIR1 x PB86 W
RRIM, Malaisie
26 RRIM802 RRIM501 x RRIM623 W
27 RRIM901 PB5/51 x RRIM600 W
28 RRIM926 PB5/51 x RRIM623 W
29 RRIC100 RRIC52 x PB86 W RRIC, Sri Lanka.
47 2.1.2 Population F1 d’une famille biparentale
Une population F1 issue du croisement entre deux génotypes hétérozygotes, PB260 et RRIM600, a été créée au Vietnam par pollinisation manuelle sur une station expérimentale du Rubber Research Institute of Vietnam (RRIV). Le parent utilisé comme femelle, PB260 (origine Prang Besar, Malaisie), issu du croisement PB5/51 x PB49, est l’un des plus cultivés en Asie du Sud-Est pour sa productivité en caoutchouc élevée, mais il est réputé sensible à la maladie CLF. Le parent mâle RRIM600 (origine Rubber Research Institut of Malaysia, Malaisie), issu du croisement TJIR1 x PB86, est le clone qui a été le plus cultivé dans le monde. Il présente une sensibilité au CLF variable selon les environnements. Les quatre grands-parents de cette famille sont non apparentés, ce qui favorise l’hétérozygotie des parents, et donc les possibilités de ségrégation et de détection de QTL. Les graines issues de cette famille PB260 x RRIM600 ont été expédiées en Côte d’Ivoire et mises à germer à la SOGB (Société de Grand Béréby), puis les jeunes plants ont été mis en collection. Ils ont ensuite été multipliés par greffage à raison d’environ 10 répétitions par génotype en moyenne, en vue d’une expérimentation en champ. Deux essais, constitués de deux populations de génotypes différents de la même famille, ont été mis en place sur deux sites au Sud de la Côte d’Ivoire, dans le cadre d’un programme de sélection précoce (Fig 2.1), l’un à la SOGB, l’autre à Toupah sur une plantation du groupe SAPH (Société africaine de plantations d’hévéas) :
- Population plantée à la SOGB (Pop1) en 2012 : il comporte 265 génotypes et 5 clones témoins (GT1, PB217, PB235, PB260 et RRIM600), disposés sur une petite colline de 3 ha avec un dispositif de 2,5 x 2,5 m (densité plantée de 1600 arbres/ha). Il y a 11 blocs répartis sur trois panneaux. Les différents arbres greffés de chaque génotype ont été répartis dans les différents blocs, et les arbres d’un même bloc plantés en randomisation. Les blocs ne sont pas tout à fait complets. Les emplacements de bordure ont été plantés avec le clone témoin GT1.
- Population plantée à Toupah (Pop2) en 2013 : il comporte 176 génotypes et 5 témoins (RRIC100, GT1, IRCA230, IRCA41 et PB217) disposés sur une superficie presque plane de 2 ha (densité 1600 arbres/ha). Les génotypes ont été disposés aléatoirement dans 18 blocs incomplets. Les emplacements de bordure ont été plantés avec le clone témoin GT1.
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Fig 2.1: Lieux de recherche, des essais en champ dans le cadre de la thèse.
(1) une population F1 issue de la famille PB260 x RRIM600 a été créée au Sud du Vietnam par pollinisation manuelle. (2) deux essais, constitués de deux populations de génotypes différents de cette famille dans le cadre d’un programme de sélection précoce, et les clones d’hévéa (Tab 2-1) ont été plantés sur deux sites (SOGB et Toupah) au Sud de la Côte d’Ivoire. (3) les manipulations au laboratoire (génotypage, isolement, mise au point des tests avec clones d’hévéa en pots en serre) et l’analyse des données sont effectués à Clermont-Ferrand et Montpellier en France.
Equateur Essai à SOGB Essai à Toupah