• Aucun résultat trouvé

Les méthodes actuelles 2.1

2.1.1 Les méthodes de détection et de quantification

2.1.1 Les méthodes de détection et de quantification

2.1.1.1 Le Southern Blot

_&@A5&b 95%@A7%?%c=9B?5%(A&"A.97>B5.AA.F&%&5_"""Z6.@B@@.=9B? %.@A.7,B&? 5_""" %&@ BA?&@ +9?6&@ %_ F.?5 %B j'%41  IMk] &AA& A&"-7.>B& .6=5.>B&=5B@.&B?@=?9"&@@B@\5=?(=?A.97%&@@97%&@Z5_(5&"A?9=-9?'@&Z5_-I!?.%A.97@B? %&@6&6!?7&@&A5%(A&"A.97]9B?=&?6&AA?&5?(5.@A.97%&5A&"-7.>B&Z5_&HA?.A %&"&55B5&@.7+&"A(&@=?5&%9.A@B!.?&7=?(5!5&B7&%(7AB?A.97&Ad9BB7&%.,&@A.97 &7JI6A.>B&j.&A5]wuvx[].&A5]wuv|k] 5B@.&B?@6(A-9%&@%_&HA?"A.97@=&BF&7A)A?&&7F.@,(&@] 5&@A=9@@.!5&%&+.?&B7& &HA?"A.97A9A5&%&5_"&55B5.?&]&=&7%7AZ5&?A.9.6=9?A7A%&5_?"=??==9?A 5_"""=&BA)A?&@9B?"&%&"97A6.7A.97]9B?+F9?.@&?5%(A&"A.97%&5_"""&A5 =B?&A( %& 5 A&"-7.>B&Z .5 &@A =?(+(?!5& %_&++&"AB&? B7& &HA?"A.97 %&  >B. =&?6&A %_.@95&? %&@  &HA?"-?969@96.BH A&5@ >B& 5_"""] 7 =?.7".=&Z 5&@ 6&6!?7&@ 5.=.%.>B&@ &A 5&@ "=@.%&@ F.?5&@ @97A %("96=9@(&@ +.7 %& 5.!(?&? 5&@ ".%&@ 7B"5(.>B&@ F.?BH]"-?96A.7&&@A&7@B.A&=?(".=.A(&=?B7&@95BA.97"97"&7A?(&&7@&5=&?6&AA7A %&@(=?&?5"-?96A.7&"&55B5.?&&A5_5.(%&+$97"9F5&7A&%&@=?9A(.7&@j5_?"k %&5_&H&6=A(%&=?9A(.7&@j5_"""k>B.@&?&A?9BF&%7@5&@B?7,&7A]&@B?,&7A &@A&7@B.A&=B?.+.(=?%B=-(7959?,7.>B&]

%(A&"A.97%&5_Z@&+.A9)%&@@97%&@>B.F97A?&"9770A?&@=(".+.>B&6&7A5 @(>B&7"& %_.7A(?)A] &@ @97%&@ =&BF&7A )A?& 6?>B(&@ =?(5!5&6&7A =? %&@ A&"-7.>B&@ ?%.9"A.F&@9B797]

?6. 5&@ 6(A-9%&@ ?%.9"A.F&@Z 97 %.@A.7,B& 5&@ @97%&@ 6?>B(&@ F&" B7 =-9@=-9?& xw] &@ @97%&@ @97A %& +9?A& (7&?,.& &A 5_.7"9?=9?A.97 %B ,?9B=& =-9@=-A& %7@ 5&@ 7B"5(9A.%&@ &@A +".5&] &=&7%7A "&AA& A&"-7.>B& =?(@&7A& %&@ .7"97F(7.&7A@] & =-9@=-9?& xw =9@@'%& B7& +.!5& %&6.fF.& j%& %&BH @&6.7&@k "& >B. 7("&@@.A& B7& BA.5.@A.97 ?=.%&] & =5B@Z  "B@& %& @&@ +9?A&@ ?%.A.97@Z .5 &@A 7("&@@.?& %_BA.5.@&? %&@ 6A(?.BH@=(".5.@(@]

?6. 5&@ 6(A-9%&@ 797f?%.9"A.F&@Z 97 %.@A.7,B& 5 %(A&"A.97 =? +5B9?&@"&7"&] &55&f".7("&@@.A&5_BA.5.@A.97%&@97%&@6?>B(&@F&"B7+5B9?9"-?96&j%(A&"A.97%.?&"A&k

|z 9B "9B=5(&@  B7& 695("B5& +5B9?&@"&7A& j%(A&"A.97 .7%.?&"A&k "966& =? &H&6=5& 5& @I@A'6&@A?&=AF.%.7&f!.9A.7&]%(A&"A.97.7%.?&"A&=&?6&AB7&6&.55&B?&6=5.+."A.97%B @.,75]

6(A-9%&5=5B@BA.5.@(&=9B?%(A&"A&?5_"""=?9BA-&?7!59A&@A5_BA.5.@A.97 %& @97%&@ 6?>B(&@ =? 5 %.,9H.,&7.7 j k] 5 @_,.A %_B7& 6(A-9%& !&B"9B= =5B@ @&7@.!5&Z=5B@?&=?9%B"A.!5&&A=5B@@B?&%7@567.=B5A.97j55&+@&A5]v~~uk] 5,?(5&+.A>B&5&9BA-&?759A?&@A&B7&6(A-9%&%&?(+(?&7"&=9B?5%(A&"A.97 %&5_"""Z&55&?&@A&B7&A&"-7.>B&797f==5."!5&=9B?B7B@,&"5.7.>B&"B@&%&5 =&A.A&A.55&%&@!.9=@.&@&A%&@+.!5&@&7@.!.5.A(]&=5B@Z.5@_,.A%_B7&6(A-9%&59B?%&>B. &@A"9DA&B@&&7A&6=@] 2.1.1.2 La PCR quantitative (qPCR)

 95I6(?@& "-.7 ?&"A.97 jk &@A B7& 6(A-9%& 5?,&6&7A BA.5.@(& =9B? 5 >B7A.+."A.97F.?5&]&AA&A&"-7.>B&(79?6(6&7A(F95B(%&=B.@@%("9BF&?A&&A&55&&@A B39B?%_-B.BA.5.@(&&7?9BA.7&=9B?5%(A&"A.97&A5&%(=.@A,&]

5&H.@A&=?.7".=5&6&7A%&BH6(A-9%&@%&&7A&6=@?(&5j'%41 INk\

•  =?&6.'?& ?&=9@& @B? 5_.7"9?=9?A.97 %_,&7A@ .7A&?"57A "966& 5& I!&?,?&&7] &AA&6(A-9%&&@A!@(&@B?5_BA.5.@A.97%&6?>B&B?@+5B9?&@"&7A@>B.F97A@&+.H&? @B?5_=&7%7A5=-@&%_(597,A.97]&=5B@5_&H".AA.97%&"&@+5B9?9"-?96&@ =&?6&A%_(6&AA?&B7@.,75>B.B,6&7A&&7+97"A.97%&5>B7A.A(%_6=5.+.(] •  %&BH.'6& ?&=9@& @B? 5_BA.5.@A.97 %& @97%&@ +5B9?&@"&7A&@ >B. F97A F&7.?

?&"9770A?& @=(".+.>B&6&7A 5_ ".!5& &A >B. F97A @&?F.? %_69?"& =9B? 5_6=5.+."A.97%B!?.7]7%.@A.7,B&.7@.5A&"-7.>B&%&b5B9?&@&"&7"&&@977"& 7&?,I?7@+&?Acjk&A5A&"-7.>B&>67]

o  A&"-7.>B&  ?&=9@& @B? 5& =?.7".=& %B b>B&7"-.7,c] 5 @_,.A %& %&BH @97%&@ +5B9?9,(7.>B&@ >B. @_-I!?.%&7A %& +$97 @=(".+.>B& %& 5_  6=5.+.&?] 7& %&@ @97%&@ "97A.&7A B7 %977&B? A7%.@ >B& 5_BA?& @97%& "97A.&7AB7""&=A&B?]&@%&BH+5B9?9"-?96&@@97A"-9.@.@%&+$97"&>B& 5&B? @=&"A?& %_(6.@@.97 "-&FB"-& 5& @=&"A?& %_&H".AA.97]  @97%& F&" %977&B?&@A6?>B(&&7x_59?@>B&5@97%&""&=A&B?&@A6?>B(&&7z_] 9?@%&5Z5&@%&BH@97%&@F97A-I!?.%&?%&@?(,.97@%3"&7A&@%&5_

|{ ".!5&6&AA7A5&%977&B?&A5_""&=A&B?=?9H.6.A(]&%977&B?F)A?&&H".A( &AA?7@6&A@97(7&?,.&5_""&=A&B?>B.F%97"(6&AA?&55B6.'?&>B.F )A?&%(A&"A(&&A>B7A.+.(&] o A&"-7.>B&%&>67?&=9@&@B?B7=?.7".=&@.6.5.?&]&=&7%7A%7@"& "@Z5&@%&BH+5B9"-?96&@@&?&A?9BF&7A@B?B7&@&B5&@97%&&A59?@%&5_(A=& %& 5_(597,A.97Z 5 @(=?A.97 %B %977&B? &A %& 5_""&=A&B? =&?6&A 5 5.!(?A.97%&5B6.'?&]

5B@.&B?@6(A-9%&@%&97A(A(6.@&@&7=5"&=9B?=9BF9.?>B7A.+.&?5_%B &A=9B?&@@I&?%_B,6&7A&?5@&7@.!.5.A(&A5@=(".+.".A(%&"&AA&A&"-7.>B&]

=?&6.'?&6(A-9%&=9B?5%(A&"A.97%&5_"""(A(%(F&59==(&&7v~~xF&" %&@69?"&@@=(".+.>B&@%&5_""">B.97A(A(6.@&@&7=5"&]55&@@97A@.AB(&@B7.F&B %B b,=c =?(@&7A @B? 5&@ %&BH !?.7@ %_ %B ,(796& %B ]  "B@& %_B7& ?(,.97 -96959,B& &7A?& 5_""" &A 5_?"Z 5 @=(".+.".A( %& @&@ 69?"&@ &@A "96=?96.@& &7 =?(@&7"&%&,?7%&>B7A.A(%_?"j ;"4&A"-5."-Av~~xk]9B?5?(%B.?&ZB7&%.,&@A.97 =?(5!5&F&"B7&@&@=(".+.>B&j9Bzk&@A@9BF&7ABA.5.@(&]9B?%.6.7B&?5&@ "97A6.7A.97@ZB7&%&@A&"-7.>B&@&7F.@,(&&@A%&,(7(?&?%&@69?"&@>B.F97A@&+.H&? @=(".+.>B&6&7A @B? B7 "9A( %B b,=c %B !?.7 7(,A.+ %& 5_?" A7%.@ >B& 5&@ @97%&@ @&?97A+.H(&@%&5_BA?&":A(].7@.5>=95I6(?@&7&@&?=@"=!5&%_AA&.7%?&5 @97%&@_.57_I=@%_F.?5"966&6A?."&]&AA&A&"-7.>B&=&?6&A%97"5_6=5.+."A.97 %&5_"""%BF&"B7&!977&5.7(?.A(%7@5A?7"-&%&vuuvu|"9=.&@j&&A5] wuuwk]&AA&6(A-9%&%&>B7A.+."A.97(A((,5&6&7A%=A(=9B?=&?6&AA?&5%(A&"A.97 %& 5_""" %7@ 5&@ !.9=@.&@ -(=A.>B&@ %B?7A 5&@ %.++(?&7A&@ =-@&@ %& 5_.7+&"A.97 "-?97.>B&]&55&f"."97@.@A&%.,(?&?5_&HA?.A=?%&5=&?6&AA7A5_(5.6.7A.97 %& 5_?" &A >B& >B7A.+.&? 5_""" F&" %&@ 69?"&@ @=(".+.>B&@ %B b,=c j&?5&g =9@A955&&A5]wuuy[!.&79B5.6wuuzk]6(A-9%&%&>%.A&b"97F&7A.977&55&c "97A.7B&  )A?& BA.5.@(& =9B? 5 %(A&"A.97 &7 ?9BA.7& %& 5_"""Z 6.@ 5&@ ?.@>B&@ %& "97A6.7A.97 F&" 5_?" &A 5& 67>B& %& @&7@.!.5.A( %& 5 A&"-7.>B& =9B? %&@ ("-7A.5597@ +.!5&6&7A "97"&7A?(@ "966& 5&@ !.9=@.&@ ?&@A&7A &7"9?& %&@ =?9!5'6&@  ?(@9B%?&j].&A5]wuv|k]

7& BA?& 6(A-9%& %&   (A( 6.@& &7 =5"& %7@ 5&@ 77(&@ wuuu\ 5  "96=(A.A.F&>B..6=5.>B&%&BH6A?."&@\

|| • 7&6A?."&b"96=(A.A.F&c%&>B7A.A("977B&

• 7&6A?."&".!5&%&>B7A.A(.7"977B&]

597,B&B?%&@=?9%B.A@%&%B"96=(A.A&B?&A%&5".!5&&@A%.++(?&7A&&A=&BA%97" )A?&>B7A.+.(&&A%.@A.7,B(&]??==9?AB7&=5B@"97F&7A.977&55&Z"&AA&6(A-9%&%& %(A&"A.97 &@A B7 =&B =5B@ =?(".@& &A @&7@.!5& 6.@ 5&@ ?.@>B&@ %& "97A6.7A.97 F&" B7& 6=5.+."A.97797f@=(".+.>B&%&5_?"@97A&7"9?&=9@@.!5&@59?@>B&>B&"&%&?7.&?&@A&7 ,?7%&>B7A.A(j].&A5]wuv|k]

 7+.7Z B7& BA?& 6(A-9%& %("?.A& =9B? >B7A.+.&? 5_""" &@A 5 b&@A&% c] &AA& A&"-7.>B&  (A( @9BF&7A =?9=9@(& =9B? ?(%B.?& 5&@ 6=5.+."A.97@ 797f@=(".+.>B&@ %_B7&  "5@@.>B&] 55& "97@.@A&  BA.5.@&? %&BH =.?&@ %_69?"&@ .6=5.>B(&@ @B""&@@.F&6&7A B "9B?@ %_B7& ?("A.97 %& ] & @&"97% 3&B %_69?"&@ 6=5.+.& B7& @&"97%&".!5&j5@(>B&7"&".!5&.7.A.5&k>B.&@A@.AB(&B@&.7%B=?9%B.A%&5=?&6.'?&] .7@.5@&"97%&?("A.97%&6=5.+.&?@&B5&6&7A5@(>B&7"&@=(".+.>B&&A7_6=5.+.&? =@5&@@(>B&7"&@797f@=(".+.>B&@>B&5_97B?.A=B9!A&7.?59?@%&5=?&6.'?&?("A.97j] ] @97 &A 5] v~~}k] &=&7%7AZ 5_.7"97F(7.&7A %& "&AA& 6(A-9%& &@A >B& 5&@ %&BH ?("A.97@%&B,6&7A&7A5&?.@>B&%&"97A6.7A.97]

 .&7 >B& 5  &7 A&6=@ ?(&5 @9.A B7& 6(A-9%& %& "-9.H =9B? 5 >B7A.+."A.97 %_F.?5Z"&AA&A&"-7.>B&67>B&%&@&7@.!.5.A(=9B?5%(A&"A.97%&A?'@+.!5&>B7A.A( %_]7&++&AZ%&@A?"&@%_"""=&?@.@A&7A%7@5&79IB%&"&55B5&@.7+&"A(&@=?'@5&@ %.++(?&7A@A?.A&6&7A@7A.F.?BH&A.5&@A%97"7("&@@.?&%&%(F&59==&?B7&A&"-7.>B&=5B@ @&7@.!5&A&55&>B&5.,.A5j].&A5]wuv|k] 2.1.1.3 RCA b955.7,.?"5&6=5.+."A.97c9B?6.+."A.976=5.+."A.97jk] 5@_,.A%_B7& A&"-7.>B&@.6=5&Z+.!5&&A+97%(&Z@B?B7&6=5.+."A.97.@9A-&?6.>B&>B.7&7("&@@.A&=@ %_(>B.=&6&7A@=(".+.>B&7.B7&&H=&?A.@&@=(".+.>B&j'%41 IOk]&AA&6(A-9%&&@A!@(& @B? 5&@ =?9=?.(A(@ %& 5 =95I6(?@& =-. w~  >B. &@A B7& &7JI6& %_B7 !"A(?.9=-,& BA.5.@(&=9B?@=?9=?&?(=5."A.97]&AA&=95I6(?@&=9@@'%&=5B@.&B?@"?"A(?.@A.>B&@>B. 5B.=&?6&AA&7A%_)A?&BA.5.@(@)09)751=9B?5_6=5.+."A.97%&5_]&AA&=?9A(.7&B7.>B&%& {}  =&BA ?(5.@&? %&BH ?("A.97@ %& @I7A-'@& &A A?9.@ ?("A.97@ %& %(,?%A.97] 55& =9@@'%& .7@. B7& +9?A& "A.F.A( &H97B"5(@& &7 x_ &A &@A "=!5& %& =95I6(?.@&? |uuuu

|} 7B"5(9A.%&@@7@@&%(A"-&?%&56A?."&]55&%(A.&7AB7&"A.F.A(%&%(=5"&6&7A%&!?.7Z "&>B.5B.=&?6&A%&=9BF9.?@&%(=5"&?@B?5&!?.7"96=5(6&7A.?&%&56A?."&%B?7A5 @I7A-'@&%_]

B? 5&@ 6A?."&@ ".?"B5.?&@Z "&AA& =95I6(?@& =&BA @9.A ?(5.@&? B7& 6=5.+."A.97 5.7(.?&@9.AB7&6=5.+."A.97F&"?6.+."A.97=B.@>B&5&@!?.7@7(9+9?6(@"97@A.AB&7AB7 79BF&B @.A& %& 5..@97 =9B? 5&@ 69?"&@ %_6=5.+."A.97] & =9.%@ 695("B5.?& %B =?9%B.A +.75&@A@B=(?.&B?B=9.%@.7.A.5Z"?.5"97A.&7A=5B@.&B?@"9=.&@%&5".!5&]

96=?(&5Z"&AA&A&"-7.>B&&@A=5B@?(@.@A7A&BH.7-.!.A&B?@>B&5_97=&BA A?9BF&? %7@ %&@ ("-7A.5597@ "5.7.>B&@ &A ?&>B.&?A 69.7@ %_9=A.6.@A.97] &AA& A&"-7.>B& %977&69.7@%&!..@%_6=5.+."A.97&AB76&.55&B??&7%&6&7A>B&5"5@@.>B&]

&AA& 6(A-9%&  (A( %=A(& =9B? =&?6&AA?& 5_6=5.+."A.97 %& 5_"""] 9B=5(& F&"5Z5&@AB7&A&"-7.>B&B@@.@&7@.!5&>B&5>F&"5_F7A,&%_6=5.+.&? 5&,(796&"96=5&A%B=5BA:A>B_B7&=?A.&%B,(796&&AF&"B7&=5B@,?7%&+.!.5.A( >B&5j?,&?.%97&A5]wuu}k]55&=B)A?&BA.5.@(&=9B?=&?6&AA?&5_6=5.+."A.97%& 5_ %B  %7@ 5& @(?B6] &AA& 6=5.+."A.97  (A( =9@@.!5& ,? "&  5 6.@& B =9.7A %_B7& @&B5& (A=& =&?6&AA7A 5_"-'F&6&7A %B !?.7 =9@.A.+ &A 5 5.,A.97 %B !?.7 )0 9)751] j?A&5&A5]wuvxk]

Documents relatifs