Identification de la flore fongique contaminant les aliments de bétail

Pour des raisons matérielles, l’identification a été très délicate. Dans notre travail nous nous somme limité à l’identification des genres et à quelques espèces.

Dans cette partie nous avons procédé à une identification morphologique, basée sur l’aspect macroscopique et l’aspect microscopique des moisissures. L’identification repose principalement sur le mode de formation des spores (conidies), de leur type de groupement, leur couleur et leur forme. Les conidies sont formées à partir des cellules conidiogènes, à l’extrémité d’un conidiophore. En se référant aux clefs d’identification de Pitt et Hocking (2009) et de Botton et al., (1990), nous avons pu identifier plusieurs genres et quelques espèces (cf. Figure 14 à 40).

Figure 14 : colonies de moisissures poussant sur différents milieux de culture après 7 jours d’incubation à partir des aliments de bétail analysés (avant repiquage).

Figure 15 : aspect macroscopique et microscopique (x40) de Penicillium sp1 après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de rebuts de datte.

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Figure 16 : aspect macroscopique et microscopique (x40) de Penicillium sp2 après 7 jours de culture sur milieu MEA, isolé d’un échantillon d’Orge.

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Figure 17 : aspect macroscopique et microscopique (x100) de Penicillium sp3 après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de son de blé.

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Figure 18 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus niger après 7 jours de culture sur milieu Sabouraud, isolé d’un échantillon d’ensilage de maïs.

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Figure 19 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus flavus après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de pain.

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Figure 20 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus flavus après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de concentré.

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Figure 21 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus flavus après 7 jours de culture sur milieu CYA, isolé d’un échantillon de foin d’avoine.

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Figure 22 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus niger après 7 jours de culture sur milieu CYA, isolé d’un échantillon de pain.

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Figure 23 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus ochraceus après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de concentré.

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Figure 24 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus niger après 7 jours de culture sur milieu CYA, isolé d’un échantillon de paille.

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Figure 25 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus niger après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de concentré.

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Figure 26 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus ochraceus après 14 jours de culture sur milieu Sabouraud, isolé d’un échantillon de foin d’avoine.

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Figure 27 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus fumigatus après 7 jours de culture sur milieu Sabouraud, isolé d’un échantillon de paille.

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Figure 28 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus fumigatus après 7 jours de culture sur milieu Sabouraud, isolé d’un échantillon de paille.

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Figure 29 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Aspergillus sp après 14 jours de culture sur milieu Sabouraud, isolé d’un échantillon de son de blé.

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Figure 30 : aspect macroscopique et microscopique (x100) d’Alternaria alternata après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de son de blé.

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Figure 31 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Alternaria alternata après 7 jours de culture sur milieu MEA, isolé d’un échantillon de concentré.

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Figure 32 : aspect macroscopique et microscopique (x40) d’Alternaria alternata après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de foin d’avoine.

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Figure 33 : aspect macroscopique et microscopique (x40) du genre Mucor après 7 jours de culture sur milieu MEA, isolé d’un échantillon de concentré.

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Figure 34 : aspect macroscopique et microscopique (x40) de Mucor après 7 jours de culture sur milieu Sabouraud, isolé d’un échantillon d’ensilage de maïs.

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Figure 35 : aspect macroscopique et microscopique (x40) de genre Rhizopus après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de Luzerne.

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Figure 36 : aspect macroscopique et microscopique (x40) du genre Rhizopus après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon d’ensilage d’herbe.

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Figure 37 : aspect macroscopique et microscopique (x40) de Rhizopus après 7 jours de culture sur milieu MEA, isolé d’un échantillon d’orge.

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Figure 38 : aspect macroscopique et microscopique (x40) de Rhizopus après 7 jours de culture sur milieu Sabouraud, isolé d’un échantillon de foin d’avoine.

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Figure 39 : aspect macroscopique et microscopique (x100) du genre Fusarium après 7 jours de culture sur milieu PDA, isolé d’un échantillon de paille.

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Figure 40 : aspect macroscopique et microscopique (x100) du genre Fusarium après 7 jours de culture sur milieu CYA, isolé d’un échantillon de foin d’avoine.

Une description morphologique des espèces fongiques isolées, basée sur les caractères culturaux est présentée dans tableau 15.

Tableau 15 : caractères culturaux de quelques espèces de moisissures isolées. Genre Mycélium Couleur de colonie Couleur de

revers Vitesse de croissance Aspect des colonies Aspergillus Cloisonné, plus dense vers le centre, lâche en périphérie. Aspergillus flavus

-Vert-jaune sur milieu PDA.

-Vert-olive sur milieu CYA. -incolore -beige claire Rapide Poudreux Cloisonné, très haut au centre et plus claire Aspergillus fumigatus

- Vert-Grisâtre sur milieu Sabouraud. -Gris-Verdâtre sur milieu

PDA. -Gris-Pâle -incolore Rapide Velouté avec des bordures blanches Cloisonné Aspergillus niger

-Noir sur milieu PDA Sabouraud, CYA. -Gris-Verdâtre, sur milieu

MEA, avec présence des points noirs. -Grise-Pâle -Jaune-Pâle Rapide Granuleux Cloisonné Aspergillus ochraceus

-Ocre-jaunes à chamois sur milieu Sabouraud. -Jaune-vert sur milieu

PDA. -Jaune-Pâle -Jaune-Pâle Lente Poudreux Penicillium Cloisonné, présente une structure surélevée au centre Penicillium sp1

-Vert-bleu avec contour gris-bleu sur PDA

Tableau 15 : caractères culturaux de quelques espèces de moisissures isolées (suite). Genre Mycélium Couleur de colonie Couleur

de revers Vitesse de croissance Aspect des colonies Penicillium Cloisonné Penicillium sp2

- Vert grisâtre + contour blanc sur MEA

-Jaune pâle Lente Contour

irrégulier

Cloisonné Penicillium sp3

- Vert sur PDA -Jaune Lente

Alternaria Cloisonné

Alternaria alternata

- Brun-gris à noires avec une périphérie blanche

-Marron foncé à noir Rapide Laineux et veloutées Mucor Non cloisonné Mucor sp

-Blanche devenant brun gris en vieillissant sur milieu Sabouraud et MEA.

-Brun Très rapide Duveteux

Rhizopus

Non cloisonné

Rhizopus sp

- Blanche puis devenant noire sur milieu PDA et

MEA.

-Blanche puis devenant brun sur milieu Sabouraud

-Brun -Brun Très rapide, envahissent de manière quasi-totale les boites de cultures Filamenteux Fusarium Cloisonné Fusrium sp

-Blanche, puis devenant rose saumon à violet avec

contour blanc sur milieu PDA.

-Blanche à rose pâle sur milieu CYA.

-Pourpre

-Orange

Modérée ^Cotonneux