Facteurs Viraux

O Unified Medical Language System é um sistema terminológico desenvolvido em 1986 pela National Library of Medicine (NLM) que contém uma lista exaustiva de termos biomédicos para o desenvolvimento de sistemas computacionais capazes de abranger vocabulários especializados usado em Biomedicina e saúde. Sua finalidade é integrar informações de diversas fontes terminológicas incompatíveis facilitando o desenvolvimento de sistemas de computador que entendem linguagem biomédica. O UMLS é utilizado pela NLM e por outras instituições na recuperação de informação, no processamento de linguagem natural, no desenvolvimento de serviços de vocabulário, além de em uma ampla variedade de outras aplicações.

O UMLS consiste em fontes de conhecimento (base de dados de terminologia) e um conjunto de ferramentas de software. Seus componentes principais são: Metatesauro, Rede Semântica e Léxico Especialista.

a) Metatesauro: É a base de dados do UMLS que abrange informações sobre conceitos biomédicos e de saúde, seus vários nomes e as relações entre eles. Usado em uma grande variedade de aplicações, possui uma coleção de conceitos e terminologias e de vários vocabulários controlados e seus relacionamentos, em diversos idiomas. Compreende mais de um milhão de conceitos biomédicos e cinco milhões de nomes de conceitos que decorrem de mais de 150 vocabulários controlados incorporados e sistemas de classificação. Esta ferramenta é construída a partir de versões eletrônicas de diversos tesauros, classificações, conjunto de códigos e listas de termos controlados e é utilizada em várias aplicações como na assistência aos pacientes, na cobrança de serviços de saúde, nas estatísticas de saúde pública e na indexação de literatura biomédica. Alguns exemplos de vocabulários controlados incorporados são: CID-104_{, MeSH}5_{, SNOMED CT}6_{, DSM-IV}7 _,

LOINC8_{, WHO Adverse Drug Reaction Terminology, UK Clinical Terms, RxNorm, Gene}

Ontology, OMIM9, dentre outros (NLM, 2009).

O Metatesauro é ligado às outras fontes de conhecimento do UMLS (Rede semântica e Léxico especialista). Tem sua organização orientada por conceito ou significado e vincula nomes alternativos e visões sobre o mesmo conceito identificando as relações úteis entre diferentes conceitos. O Metatesauro retrata fielmente tanto os casos de vocabulários diferentes que usam nomes diferentes para o mesmo conceito ou aqueles que usam o mesmo nome para conceitos diferentes. Sua estrutura inclui nomes dos conceitos, seus identificadores e as características principais destes conceitos. Todos os conceitos no Metatesauro são atribuídos a, pelo menos, um tipo da Rede Semântica fornecendo assim categorização consistente de todos os conceitos no Metatesauro representado nesta rede. Os relacionamentos entre os conceitos são representados, por exemplo, como hierárquicos – "is a", para subclasses; "is part of" para subunidades; ou como associativos, tais como "is caused by" ou "in the literature often occurs close to" (este último derivado de Medline).

b) Rede Semântica: São as categorias nas quais as informações do Metatesauro estão divididas configurando-se como um método de organização. A Rede Semântica consiste de:

Classificação Internacional de Doenças 5 _{Medical Subject Headings}

6

Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms 7 _{Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders} 8

Logical Observation Identifiers Names and Codes 9 _{Online Mendelian Inheritance in Man}

o um conjunto de categorias de assuntos gerais, ou Tipos de Semântica, que fornecem uma categorização consistente de todos os conceitos representados no Metatesauro UMLS;

o um conjunto de relações úteis e importantes, ou Relações Semânticas, que existem entre tipos semânticos.

A Rede semântica objetiva proporcionar uma categorização consistente de todos os conceitos representados no Metatesauro UMLS e fornecer um conjunto de relações úteis entre estes conceitos. Atualmente contém 133 tipos semânticos e 54 relacionamentos sendo os tipos semânticos constituídos pelos nós da rede e as relações entre eles, pelos links. Os principais tipos semânticos são: organismos, estruturas anatômicas, função biológica, produtos químicos, eventos, objetos físicos e os conceitos ou ideias. As ligações entre os tipos semânticos define a estrutura da rede e mostra as relações importantes entre os grupos e conceitos. O principal elo entre os tipos semânticos é "is a", estabelecendo uma hierarquia de tipos. (NLM, 2009).

FIGURA 26 - Parte da Rede Semântica UMLS. Hierarquia “Função Biológica”

FIGURA 27 – Parte da Rede Semântica UMLS

FONTE: NLM, 2009.

A rede também possui cinco grandes categorias de relações não hierárquicas (ou associativas) que constituem os restantes 53 tipos de relacionamentos.

c) Léxico Especialista: O Léxico Especialista é um banco de dados de informação lexicográfica para uso em processamento de linguagem natural distribuído como uma das fontes de conhecimento UMLS. Esta base de dados contém os critérios para a categorização dos conceitos no Metatesauro e define as categorias da rede semântica, que é o organizador dos termos individuais e conceitos no Metatesauro.

FIGURA 28 – Característica de uma entrada no Léxico Especialista.

Além dos componentes principais o UMLS abrange outras ferramentas como Ferramentas Lexicais, Serviços de Terminologia UMLS (UTS) e Metamorphosys. As ferramentas lexicais são projetadas para lidar com o alto grau de variabilidade dos termos e palavras na linguagem natural permitindo ao usuário abstrair variações ortográficas e variações do conjunto de caracteres (incluindo o inglês britânico e o inglês americano).

O UTS constitui um conjunto de ferramentas interativas baseadas na Web com interface que permite aos usuários e desenvolvedores o acesso às fontes de conhecimento UMLS, incluindo os vocabulários do Metatesauro. Contém o site de download para os arquivos de dados UMLS e os arquivos Metatesauro completos. O acesso a muitos componentes UTS é restrito aos usuários cadastrados que tenham assinado o Contrato de Licença de Uso do Metatesauro UMLS. O UTS é um ponto de partida útil para a obtenção de um conhecimento do teor dos recursos UMLS.

Metamorphosys é uma aplicação java multi-plataforma que deve ser utilizado se as fontes de conhecimento UMLS (Metathesaurus, Rede Semântica, e Léxico especialista) são instaladas localmente em um computador.O Metamorphosys também suporta a criação e o aperfeiçoamento de subconjuntos personalizadas do Metatesauro. Em geral, o Metatesauro deve ser personalizado para ser utilizada de forma eficaz em aplicações específicas (NLM, 2009).

Por meio dos recursos do UMLS é possível superar duas barreiras significativas: o a variedade de maneiras pelas quais os mesmos conceitos são expressos em

diferentes fontes e por pessoas diferentes;

o a distribuição de informações úteis entre os muitos sistemas e bancos de dados distintos.

Todas as fontes de conhecimento UMLS e ferramentas de software associadas são gratuitas: a rede semântica, o léxico especialista e ferramentas lexicais associadas estão acessíveis na internet em termos abertos. Contudo, para utilização do Metatesauro, os usuários precisam assinar uma licença e apresentar relatórios anuais, pois esta ferramenta inclui vocabulário produzido por detentores de direitos diferentes. Usuários acadêmicos podem utilizar o UMLS gratuitamente para fins de pesquisa, mas o uso comercial ou de produção requer licença de direitos autorais de alguns dos vocabulários incorporados (NLM, 2009).

De forma esquemática discriminam-se abaixo, as principais características desta fonte:

QUADRO 16

Características de Fontes de Informação – UMLS

Critério Características

Modalidade Sistema de Terminológico

Idioma Multilingue

Área de domínio Biomedicine e saúde

Propriedade National Lybrary of Medicine

Cobertura Biomedicina

Estrutura Sua estrutura inclui nomes dos conceitos, seus identificadores e as características principais destes conceitos e suas relações.

Quantitativo do acervo Compreende mais de um milhão de conceitos biomédicos e cinco milhões de nomes de conceitos que decorrem de mais de 150 vocabulários controlados incorporados e sistemas de classificação. Propósito Integrar informações de diversas fontes terminológicas incompatíveis

facilitando o desenvolvimento de sistemas de computador que entendem linguagem biomédica.

Possibilidades de Pesquisa Serviços de Terminologia UMLS (UTS) Controle de versão /

Atualização Não identificada

Link de acesso https://uts.nlm.nih.gov/home.html FONTE: Elaborado pela autora, 2013.