Des séquences simples composées du motif (GGC) ont d'abord été trouvées dans quelques clones génomiques de poulet donnant un signal d1 ho mologie partielle avec un ADN complémentaire cloné de 1‘histone H5. On a par la suite déterminé que ces séquences formaient une famille de séquences faiblement répétées, chez le poulet et d1 autres organismes chez les oi seaux, les poissons et les mammifères. Quelques gènes ont été identifiés comme étant porteurs de ce type de séquences, particulièrement dans leurs portions non codantes pour plus de trois répétitions consécutives des tri- nucléotides. Par la suite, il s1 est avéré que ces séquences étaient trans crites, probablement surtout en ARN nucléaires dans l'embryon de 6 jours et les érythrocytes immatures de poulet. Je ferai ici brièvement quelques hypothèses sur 1'origine de ces séquences et les rôles qu'elles pourraient être susceptibles de jouer.
On a vu qu'un mécanisme de mauvais appariement et glissement des courtes répétitions directes lors de la réplication de 1'ADN pourrait expliquer la génération du polymorphisme dans le nombre de (GGC) tel que rencontré dans les cas du gène de H5 et de l'oncogène des cellules T24 (par rapport au gène normal). On pourrait dire de façon générale que la généra tion de ces séquences pourrait d'abord être soumise à l'existence préalable d'au moins 2 répétitions directes de (GGC) puis de l'action de ce mécanis me. Les chances que ces séquences soient retrouvées dans le génome se
raient fonction de sa taille (les résultats des hybridations des "dots" d'ADN génomiques semblent en accord avec cette hypothèse) et de sa compo sition en G+C. A ce propos, il est intéressant de souligner qu'une défi cience en dinucléotides CpG est commune aux génomes des vertébrés supé
rieurs puisque les cytosines méthylées ont tendance à muter spontanément en thymines (Bird, 1980). Etant donné que ce dinucléotide fait partie des sé quences (GGC)n, on pourrait peut-être relier la faible représentation de ces dernières dans les génomes des vertébrés étudiés avec la faible propor tion de CpG par rapport aux autres dinucléotides, rendant ainsi la présence de 2 répétitions directes de (GGC) moins fréquente. Par la suite, le main tien de ces séquences dépendrait de la sélection naturelle exercée sur elles. Dans certains cas, elles apporteraient une contribution à l'expres sion du phénotype et dans d'autres, elles n'auraient aucun rôle en soi dé pendant de leur localisation dans le génome (séquences adjacentes).
La présence de ces séquences riches en G+C à motif répété pourrait contribuer à la formation locale de structures particulières dans 11 ADN, inconnues et différentes de la structure B qui est la plus répan due. D'ailleurs, plusieurs exemples ont été rapportés dans la littérature où des séquences simples sont sensibles à certaines nuclëases spécifiques et par conséquent peuvent engendrer des modifications locales dans la structure de 1'ADN (Hentschel , 1982; Glikin et al., 1983).
Ces structures pourraient également être reconnues lors d'évé nements de recombinaison génique. Plusieurs exemples de l'implication des séquences simples dans des mécanismes de conversion ont déjà été cités dans la littérature (Sures et col!., 1978; SIightom et col!., 1980; Cohen et col!., 1982). On connaît peu de choses sur la structure que ces séquences peuvent avoir dans 1'ADN alors qu'on sait par exemple d'après des expérien ces in vitro, que la structure Z est observée en conditions appropriées avec des séquences ayant une composition alternée en purines-pyrimidines, ce sujet, il a été rapporté dans la littérature que de courtes séquences de 8 pb pouvant adopter cette conformation étaient contenues dans des séquen ces ayant une activité amplificatrice d'un promoteur chez SV-40 (Nordheim et Rich, 1983). Les auteurs ont ainsi proposé un modèle de régulation transcriptionnelle impliquant des changements dans la superhëlici té de T ADN.
Du point de vue de la transcription de ces séquences, il est étonnant de constater que bien qu'elles soient faiblement répétées dans le génome de poulet, on a pu détecter des transcrits. On peut se demander si la présence de ces séquences pourrait affecter 1‘efficacité de la trans cription d'un gène de par des modifications dans la structure de 1'ADN. On a vu que ces séquences étaient retrouvées à des positions variées dans des gènes. On se rappellera qu'il y a présence de la séquence (GGC)5 entre les séquences consensus de type "CCAAT" et "TATA" dans le gène de g-actine de poulet et de (GGC)7 dans une portion importante pour 1'activité transfor mante de l'oncogène des cellules T24 de carcinome de vessie humaine.
11 ADN complémentaire cloné (p541). Il n'en demeure pas moins que ce poly morphisme dans le nombre de (GGC) n'est pas une mutation léthale.
On peut souligner que chez le poulet deux ARN messagers d'histones, H5 et H2A.F ont une séquence simple de (GGC)n dans leurs por tions 5' transcrites mais non traduites. Est-ce que cela signifie un méca nisme commun de régulation ou Ta t-il déjà signifié par le passé? Il est à noter que tous deux possèdent de façon exceptionnelle par rapport aux autres messagers d'hi stones connus, des extrémités 3' polyadënylëes (Harvey et al, 1983; Ruiz-Carrillo et al., 1983).
Il apparaîtrait simpliste de vouloir à tout prix attribuer ou non un rôle général à ces séquences. Il semble que le rôle de ces séquen ces s'il en est, pourrait être fonction de l'endroit où elles se trouvent et être dévoilé par divers types d'études. Ainsi, des expériences de recons titution de la chromatine en présence d'oligonucléotides synthétiques, utili sés seuls ou en association avec des séquences dites "conventionnelles" seraient un premier type d'approche pour examiner s'il se produit des chan gements dans la chromatine. En outre, on pourrait poursuivre 1'analyse des séquences géniques amorcée dans le présent travail afin de déterminer où elles apparaissent,, si elles sont associées avec des séquences adjacentes d'un type particulier et si elles ont été conservées chez des gènes homolo gues de différentes espèces. Au niveau de l'étude directe de la régulation de l'expression des gênes, on identifierait, par exemple pour H5, les élé ments régulateurs par des techniques de mutagënêse et d'expression en vi tro. Nous verrions si ces séquences simples sont impliquées. Il faudrait également regarder l'état de la méthylation dans les séquences (GGC) iden tifiées en amont de certains gênes étant donné leur composition riche en cytosines mëthylabies.
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Une variété de rôles ont été suggérés pour de nombreux
exemples de séquences simples rapportés dans la littérature. L'intérêt de ce type de séquences réside dans les répétitions consécutives d'un motif de quelques paires de bases.
Pour le moment, il reste beaucoup de travail à accomplir pour justifier 1'existence de ces séquences et par extension du grand nombre de séquences non géniques des génomes d'eucaryotes. Cela rend le défi
d'autant plus grand pour progresser dans la voie de cette connaissance. Le présent travail fournit quelques éléments qui espérons-le, pourront
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