Partie 1 : Analyse du protéome du ventricule gauche dans un modèle expérimental d’insuffisance
IV) Discussion
Afin de mettre en évidence de nouveaux biomarqueurs du RVG post-IDM, nous avons
utilisé le modèle expérimental de rats dont l’ACG a été ligaturée [Mulder et al. 1997] pour
mettre en évidence une association entre les modifications des paramètres échographiques et
hémodynamiques et les modulations du protéome induites par le RVG.
Cette étude nous a permis de valider l’utilisation de ce modèle expérimental pour
étudier à la fois la phase précoce et la phase tardive du RVG. En effet, nous avons pu mettre
IC2 Mr (k Da) 72 55 43 34 26 17 95 VG T1 T2IC1 Plasma Mr (k Da) 72 55 43 34 26 95 VG T1 T2IC1 Plasma IC2
A B
IC2 Mr (k Da) 72 55 43 34 26 17 95 VG T1 T2IC1 Plasma Mr (k Da) 72 55 43 34 26 95 VG T1 T2IC1 Plasma IC2A B
en évidence un RVG modéré après sept jours de ligature avec une dilation du VG sans
hypertrophie alors que le RVG était plus important après deux mois de ligature avec une
hypertrophie et une dilation importante du VG associées à une dysfonction de ce dernier, ce
qui est similaire à ce que l’on peut observer chez l’homme. De plus, ce modèle induit une
faible mortalité postopératoire puisque seuls deux animaux parmi les vingt-quatre sont
décédés avant la fin de l’analyse à deux-mois post-ligature.
L’étude du protéome par gels d’électrophorèse 2D coloré au nitrate d’argent nous a
permis de mettre en évidence des modulations d’expression de vingt-sept protéines dans le
VG des animaux IC à deux mois post-ligature. Les principaux résultats obtenus sont résumés
en Figure 52.
Figure 52 : Modulation d’expression des protéines du VG dans les différentes phases du RVG
post-IDM. SOD : Superoxyde dismutase, Gpx : Glutathion péroxydase, CHF : Chronic heart failure.
De manière intéressante, la majorité des ces protéines correspondent à plusieurs spots
localisés dans une zone de Mr compris entre 45 et 70 kDa et une zone de pH compris entre
3,5 et 5, ce qui peut laisser supposer la présence de différentes isoformes de la même
protéine. Une analyse bibliographique des protéines identifiées nous a alors permis de mettre
en avant que quatorze protéines parmi les vingt-sept identifiées possèdent des sites de
phosphorylation décrits dans la littérature (Table XVIII).
Table XVIII : Liste des protéines dont l’expression varie dans le VG des rats IC et leurs sites de
phosphorylation connus.
De manière étonnante, nous n’avons pas mis en évidence de modulations du niveau
d’expression des protéines contractiles dans cette étude alors que celles-ci ont été décrites
dans la littérature. En effet, des modulations de l’expression des chaînes lourdes de myosine
[Barry et al. 2008], de la titine [Taegtmeyer et al. 2010] ou de l’α-actine [Taegtmeyer et al.
Nom protéine Sites de phosphorylation Références
HSP β-2 HSP β-6 HSP β-7
α-B crystalline Sérine 19, 45 et 59 Ito et al , 1997
Protéine disulfide isomérase 1 Sérine ou thréonine Barati et al , 2006
Isozyme L3 de l'ubiquitine carboxyl-terminal hydrolase Sous-unité β-3 du protéasome
Péroxirédoxine-2 Phosphorylée Bhojwani et al , 2006
Péroxirédoxine-6 Thréonine 177 Wu et al , 2009
Glutathion péroxidase 1 Tyrosine 96 Cao et al , 2003
Superoxyde dismutase 2 Sérine82 Yamakura et al , 2010
Phosphoglycérate kinase 1 Tyrosine 76 Shetty et al , 2010
Glycéraldéhyde-3-phosphate déhydrogénase Phosphorylée Baba et al , 2010
Triose phosphate isomérase Phosphoglycérate mutase 1 Acyl-coenzyme A thioestérase 2 Enoyl-coenzyme A hydratase Sérine 113 Dean et al , 1989 Thréonine 349 Reinders et al , 2007 Fumarate hydratase Dihydrolipoyl déshydrogénase
Sous-unité de 24 kDa de la NADH-ubiquinone oxidoréductase Non connu
Chaîne D de l'ATP synthase Non connu
Boja et al , 2009 Reinders et al , 2007 Sérine 10, 263 et 373 Arrell et al , 2006 Thréonine 107, 112, 237, 262, 312 et 368 Reinders et al , 2007 Précurseur du kininogène T-1 Précurseur du kininogène T-2 Inhibiteur de sérine protéase A3K Protéines impliquées dans le stress oxydant
Enzymes de la glycolyse
Protéines impliquées dans le métabolisme des acides gras
Tyrosine Non connu
Protéines impliquées dans les voies de stress et de dégradation du réticulum endoplasmique Protéines chaperonnes
Non connu
Non connu
Yamaoka et al , 2006
Enzymes du cycle de Krebs
Non connu
Sous-unité α de l'isocitrate déshydrogénase
Protéines impliquées de la chaîne respiratoire mitochondriale Protéines impliquées dans la synthèse de l'ATP
Protéines impliquées dans la voie de la kinine
Non connu
Sous-unité β de l'ATP synthase