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Partie 1 : Analyse du protéome du ventricule gauche dans un modèle expérimental d’insuffisance

IV) Discussion

Afin de mettre en évidence de nouveaux biomarqueurs du RVG post-IDM, nous avons

utilisé le modèle expérimental de rats dont l’ACG a été ligaturée [Mulder et al. 1997] pour

mettre en évidence une association entre les modifications des paramètres échographiques et

hémodynamiques et les modulations du protéome induites par le RVG.

Cette étude nous a permis de valider l’utilisation de ce modèle expérimental pour

étudier à la fois la phase précoce et la phase tardive du RVG. En effet, nous avons pu mettre

IC2 Mr (k Da) 72 55 43 34 26 17 95 VG T1 T2IC1 Plasma Mr (k Da) 72 55 43 34 26 95 VG T1 T2IC1 Plasma IC2

A B

IC2 Mr (k Da) 72 55 43 34 26 17 95 VG T1 T2IC1 Plasma Mr (k Da) 72 55 43 34 26 95 VG T1 T2IC1 Plasma IC2

A B

en évidence un RVG modéré après sept jours de ligature avec une dilation du VG sans

hypertrophie alors que le RVG était plus important après deux mois de ligature avec une

hypertrophie et une dilation importante du VG associées à une dysfonction de ce dernier, ce

qui est similaire à ce que l’on peut observer chez l’homme. De plus, ce modèle induit une

faible mortalité postopératoire puisque seuls deux animaux parmi les vingt-quatre sont

décédés avant la fin de l’analyse à deux-mois post-ligature.

L’étude du protéome par gels d’électrophorèse 2D coloré au nitrate d’argent nous a

permis de mettre en évidence des modulations d’expression de vingt-sept protéines dans le

VG des animaux IC à deux mois post-ligature. Les principaux résultats obtenus sont résumés

en Figure 52.

Figure 52 : Modulation d’expression des protéines du VG dans les différentes phases du RVG

post-IDM. SOD : Superoxyde dismutase, Gpx : Glutathion péroxydase, CHF : Chronic heart failure.

De manière intéressante, la majorité des ces protéines correspondent à plusieurs spots

localisés dans une zone de Mr compris entre 45 et 70 kDa et une zone de pH compris entre

3,5 et 5, ce qui peut laisser supposer la présence de différentes isoformes de la même

protéine. Une analyse bibliographique des protéines identifiées nous a alors permis de mettre

en avant que quatorze protéines parmi les vingt-sept identifiées possèdent des sites de

phosphorylation décrits dans la littérature (Table XVIII).

Table XVIII : Liste des protéines dont l’expression varie dans le VG des rats IC et leurs sites de

phosphorylation connus.

De manière étonnante, nous n’avons pas mis en évidence de modulations du niveau

d’expression des protéines contractiles dans cette étude alors que celles-ci ont été décrites

dans la littérature. En effet, des modulations de l’expression des chaînes lourdes de myosine

[Barry et al. 2008], de la titine [Taegtmeyer et al. 2010] ou de l’α-actine [Taegtmeyer et al.

Nom protéine Sites de phosphorylation Références

HSP β-2 HSP β-6 HSP β-7

α-B crystalline Sérine 19, 45 et 59 Ito et al , 1997

Protéine disulfide isomérase 1 Sérine ou thréonine Barati et al , 2006

Isozyme L3 de l'ubiquitine carboxyl-terminal hydrolase Sous-unité β-3 du protéasome

Péroxirédoxine-2 Phosphorylée Bhojwani et al , 2006

Péroxirédoxine-6 Thréonine 177 Wu et al , 2009

Glutathion péroxidase 1 Tyrosine 96 Cao et al , 2003

Superoxyde dismutase 2 Sérine82 Yamakura et al , 2010

Phosphoglycérate kinase 1 Tyrosine 76 Shetty et al , 2010

Glycéraldéhyde-3-phosphate déhydrogénase Phosphorylée Baba et al , 2010

Triose phosphate isomérase Phosphoglycérate mutase 1 Acyl-coenzyme A thioestérase 2 Enoyl-coenzyme A hydratase Sérine 113 Dean et al , 1989 Thréonine 349 Reinders et al , 2007 Fumarate hydratase Dihydrolipoyl déshydrogénase

Sous-unité de 24 kDa de la NADH-ubiquinone oxidoréductase Non connu

Chaîne D de l'ATP synthase Non connu

Boja et al , 2009 Reinders et al , 2007 Sérine 10, 263 et 373 Arrell et al , 2006 Thréonine 107, 112, 237, 262, 312 et 368 Reinders et al , 2007 Précurseur du kininogène T-1 Précurseur du kininogène T-2 Inhibiteur de sérine protéase A3K Protéines impliquées dans le stress oxydant

Enzymes de la glycolyse

Protéines impliquées dans le métabolisme des acides gras

Tyrosine Non connu

Protéines impliquées dans les voies de stress et de dégradation du réticulum endoplasmique Protéines chaperonnes

Non connu

Non connu

Yamaoka et al , 2006

Enzymes du cycle de Krebs

Non connu

Sous-unité α de l'isocitrate déshydrogénase

Protéines impliquées de la chaîne respiratoire mitochondriale Protéines impliquées dans la synthèse de l'ATP

Protéines impliquées dans la voie de la kinine

Non connu

Sous-unité β de l'ATP synthase

2010] ont été mises en évidence dans le VG hypertrophié. Cependant, les chaînes lourdes de

myosine et la titine sont des protéines de très haut poids moléculaire, respectivement 200 et

3000 kDa. Pour cette étude, nous avons utilisé des conditions standards de gels

d’électrophorèse 2D nous permettant d’accéder aux plus grands nombres de protéines du VG

afin de réaliser une étude protéomique globale. Les conditions utilisées ne nous permettent

pas de détecter les protéines de très haut (supérieure à 100 kDa) ou très bas (inférieure à 10

kDa) poids moléculaire, ce qui pourrait expliquer l’absence de ces protéines dans notre

analyse.

Par ailleurs, l’implication de la phosphorylation dans le mécanisme de la contraction

cardiaque a été bien décrit. En effet, la phosphorylation de la TnT, de la TnI ou de la MLC-2

induit un ralentissement de la cinétique de formation des ponts actine-myosine [Noland, Jr. et

al. 1992]. Des sites de phosphorylation ont également été décrits pour la MLC-1/3 [Arrell et

al. 2001a], l’α-tropomyosine [Mak et al. 1978] ou la desmine [Kitamura et al. 1989], [Inada

et al. 1998].

Au vu de ces résultats intéressants, nous nous sommes orientés vers l’étude du

phosphoprotéome, correspondant à l’ensemble des protéines phosphorylées d’un échantillon,

afin de mieux comprendre les mécanismes physiopathologiques impliqués dans le RVG

post-IDM.

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