Le bacille pyocyanique, est désigné sous le nom d'espèce Pseudomonas aeruginosa.
C'est l'espèce la plus connue et la plus répandue du genre Pseudomonas. Elle est considérée comme la plus pathogène et constitue l'espèce-type du genre et des infections hospitalières ou nosocomiales et peut aussi associée à l’altération de certains végétaux.
a. Caractéristiques des Pseudomonas associées à l’altération des produits frais (végétaux)
P. fluorescens oxydase positif représente un groupe très hétérogène et peut être subdivisé en plus de cinq sérotypes ou sérovars. P. fluorescens appartenant à différents sérovars ont été trouvés associés à des produits frais, y compris les épinards, la laitue, le chou, la pomme de terre, les tomates, l'endive, salade de légumes et la carotte. Le sérovar II (sérotype B) est le plus courant isolé de produits frais et des racines de rhizosphères. Les souches pectolytiques de ce dernier sont bien connues pour leur capacité de provoquer des maladies pour les plantes sur le terrain et pour l’altération des produits frais après la récolte.
Bien que le sérovar II soit considéré comme le principal Pseudomonas responsable de l’altération des produits frais, d'autres sérovars de P. fluorescens sont également impliqués.
Par exemple, 40 % des altérations des produits frais peuvent être causées par P. viridiflava oxydase négative et au moins trois sérovars de P. fluorescens (I, II et IV).
Autres espèces de Pseudomonas sont également connues pour provoquer une détérioration de certains types de produits. Une épidémie d’altération des bulbes d'oignon a
été causée par P. aeruginosa, une épidémie d’altération des champignons a été causée par P. tolaasii, P. cichorii est une autre Pseudomonas fluorescente connue pour être associée à
une altération spécifique de produits tels que la laitue.
Les Pseudomonas pectolytiques sont généralement considérées comme les principales causes d’altération des produits frais stockés à des températures de réfrigération. Ces Peudomonas sont psychrotrophes et capables de se développer et d'induire une altération des produits frais à 10 °C ou moins.
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Tableau 05 : Association de différents sérovars de Pseudomonas fluorescens avec des produits frais et des rhizosphères de plantes (de W Blackburn, 2006).
Sources P. fluorescens identifiée
Fruits et légumes Sérovars II, & V
Tubercules de pomme de terre,
rhizosphère et tissu feuilleté Sérovars II, & V Tubercules de graines de pommes de
terre Sérovars I, II, IV & V
Salade fraîche Sérovars I, II, III & V
Epinards frais Sérovars I, IV & V
Céleri séché et le chou stockés à 1 °C Sérovars II & V Endive prête à l'emploi stockée à 10 °C
pendant 10 jours Sérovars I, II, III & V Racines de tomates Sérovars I, II, IV & V
b. Caractéristiques des Pseudomonas associées à l’altération des produits d’origine animale
La caractérisation phénotypique et moléculaire des psychrotrophes isolés de la viande fraîche et gâtée de l'agneau, le lait bovin, le lait de chèvre, le fromage, les poissons et les
volailles ont révélé la présence de trois espèces principales de Pseudomonas (P. fluorescens, P. fragi et P. lundensis).
b1. P. fluorescens
Contrairement à P. aeruginosa qui est bien définie, les souches de P. fluorescens associées avec des plantes ou des animaux sont extrêmement hétérogènes en termes de leurs caractéristiques phénotypiques et moléculaires. Une étude récente sur les pseudomonades associées avec des plantes et des animaux indiquait que chaque sérovar de P. fluorescens pourrait être élevé à une espèce distincte.
Les sérovars I et III de Pseudomonas fluorescens, souvent en combinaison avec P.
Fragi et P. lundensis constituent une composante dominante de la microflore associée à divers types d'aliments, y compris le lait, les viandes, les vollailes et les poissons.
41 b2. P. fragi
Les souches pathogènes de P. fragi ne sont pas fluorescentes et immobiles. Cependant, les souches atypiques de P. fragi qui sont fluorescents ont été isolées à partir de lait cru et les poissons. Néanmoins, la grande majorité des souches de P. fragi examinées jusqu'à présent sont flagellées, bien que la mobilité de ces souches flagellées ne soit pas facilement détectable. Pseudomonas fragi constitue une composante régulière et principale de la microflore native associée à des aliments frais et gâtés. Il compte pour 61 % des Pseudomonas de viandes et 76 à 79 % des Pseudomonas de porc. Ce Pseudomonas se caractérise par sa capacité à produire une odeur désagréable et de former un anneau acide dans le lait de tournesol.
Des souches de Pseudomonas fragi ont été trouvées dans de nombreux types différents des aliments, y compris le lait, les poissons, les viandes et les volailles. Une grande proportion de ces Pseudomonas est capable de produire des protéases extracellulaires, des lipases, des exopolysaccarides et une odeur désagréable.
b3. P. lundensis
La caractérisation phénotypique et moléculaire des Pseudomonas isolées de la viande fraiche et gâtée, des poissons, des volailles et du lait a révélé la présence d'une espèce distincte de Pseudomonas maintenant désigné sous le nom P. Lundensis. Les souches pathogènes de P. lundensis sont fluorescentes et mobiles. P. lundensis est identique d'un sérovar V de P. fluorescens ; elle est également étroitement liée au sous-groupe P. fragi B3.
Cependant, les souches de P. lundensis peuvent être différenciées des autres Pseudomonas en fonction de leur capacité ou l'incapacité de dénitrifier, d'utiliser le tréhalose, la créatine et le D- mannitol. En outre, P. lundensis peut être distingué de P. fragi en fonction de l'incapacité de ce dernier à produire un pigment fluorescent et exposer la motilité.
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Tableau 06 : Association des principales espèces de Pseudomonas avec des aliments dérivés d'animaux (de W Blackburn, 2006).
Types d’aliments Pseudomonas spp. identifiées
Lait cru et lait pasteurisé
P. fluorescens sérovars I & III (> 70 %) P. fragi (20%)
P. fluorescens sérovars I, II & III P. aureofaciens
P. fluorescens sérovars I, II, III, & IV P. aurefaciens
P. aeruginosa