CONCLUSION - Enrichissement de paires de gènes dont les interactions causent la schizophrénie à

Tel que prévu, la méthode JE a permis de ressortir du bruit des informations permettant d’identifier de nouveaux biomarqueurs de diagnostic de la schizophrénie à l’aide de méthodes d’enrichissement. Ces résultats sont compatibles avec les théories d’élagage neuronal anormal. De son côté, la régression logistique n’a pas été assez adaptée pour avoir la puissance nécessaire à avoir des résultats statistiquement significatifs. Les méthodes d’enrichissement ont permis d’obtenir plus de résultats statistiquement significatifs qu’une sélection se basant simplement sur les valeurs d’associations marginales. De par leur fonctionnement fondamentalement différent, les méthodes d’enrichissement Biofilter et GSEA ont donné des résultats différents mais complémentaires.

Au début de ma maîtrise, j’ai fait l’exercice de vulgarisation que l’on retrouve à l’Annexe A8 dans le cadre d’un concours de bourse de vulgarisation. J’y compare la schizophrénie à une chaise brisée. Aujourd’hui, au vu des résultats du projet, nous pourrions vulgariser la schizophrénie comme étant un problème électrique dans la boîte électrique principale de la maison. L’électricien qui a fait l’installation initialement avait passé beaucoup de filage dans les murs, plus que nécessaire afin de ne pas devoir recommencer. Cependant, quand fut le temps d’effectuer tous les bons branchements et de retirer les fils superflus, il est arrivé quelques problèmes. Certains fils ont été endommagés et d’autres connectés à la mauvaise place, créant ainsi des courts-circuits. Tant que la consommation en électricité reste faible, ces problèmes peuvent passer inaperçus. Cependant, quand la consommation est plus grande, comme par exemple l’hiver quand il fait très froid, qu’on fait le lavage pendant que le souper cuit et que plusieurs lumières de la maison sont ouvertes, ces courts-circuits prennent une plus grande importance. La boite électrique peut donc commencer à boucaner, premier signe de la maladie qu’on appelle prodrome. Si la situation perdure, le feu va tout simplement prendre dans la boîte électrique et donc la maladie va se développer. La médecine actuelle ne permet pas de corriger le problème. Les différentes molécules que

nous avons ne font que couper le courant principal de la boîte électrique. Notre projet va donc apporter un éclairage nouveau sur le fonctionnement de la boîte électrique afin de pouvoir prévenir et dans le futur, guérir la maladie.

Pour le futur, plusieurs avenues pourraient servir de suite au projet. Nous avons regardé les paires de gènes. Il pourrait être intéressant de regarder les triplets. Les scripts qui ont été produits sont facilement modifiables pour ajouter ce niveau de complexité. Par contre, le temps de calcul risque de ne pas être raisonnable. Il y aurait cependant la possibilité de faire un travail d’optimisation algorithmique qui réduirait légèrement ce temps de calcul. D’autres méthodes d’enrichissement comme ALIGATOR et MAGENTA pourraient être étudiées et utilisées. Une étude en protéomique pourrait être faite sur les paires identifiées afin de voir et comprendre les mécanismes exacts que ces interactions pourraient avoir. Nous pourrions aussi faire une sorte de carte de chaleur (heat map) afin de tenter de regrouper nos différents cas dans un dendrogramme qui pourrait nous permettre de faire ressortir un classement représentant des types de schizophrénie en se basant sur les résultats de notre projet. Pour ce faire, nous pourrions attribuer un score sur l’allèle en se basant sur le nombre de copies de l’allèle afin de pouvoir définir un score de proximité. Nous avons bien sûr les potentiels biomarqueurs et les interactions multigéniques que nous avons identifiés sur lesquels une investigation plus poussée pourrait être faite afin d’en venir au développement d’un test de diagnostic précoce des risques de susceptibilité ou l’identification de nouveaux candidats comme cibles thérapeutiques.

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