CHAPITRE III : CARACTERISTIQUES PEDOLOGIQUES ET ANALYSE DIRECTE
3.2. Analyse directe de gradients : ordination canonique
Une ordination canonique via la CCA a été effectuée à partir d'un nombre réduit de
relevés jugé assez représentatif de l'ensemble des phytocénoses étudiés. Ces relevés
concernent ceux au sein desquels les variables environnementales (pente, profondeur, pH
et teneur en matière organique) ont été mesurées. Cette analyse directe de gradients a été
faite dans le but d'identifier les variables environnementales qui gouvernent la
composition floristique et quelles en sont les plus discriminantes. Cette démarche a permis
donc la meilleure interprétation des axes d'ordination de la carte factorielle issue de
l'ensemble de données soumis à la DCA.
Soulignons que les quarante deux relevés concernés ont été préalablement soumis à
une ordination sensu stricto (DCA) afin de s'assurer que les groupements discriminés sont
à peu près les mêmes que ceux obtenus après avoir soumis à la DCA tous les relevés
effectués.
Afin de montrer si les quatre variables mesurées sont significatives, nous avons
utilisé le test de permutation de Monte Carlo (disponible dans le logiciel Canoco). Les
résultats de ce test sont consignés dans le tableau 3.2.
Tableau 3.2 : Résultats du test de permutation de Monte Carlo (P-value<0,05 = seuil
critique).
Variables environnementales P-value Variance expliquée par chaque variable
sur une variance totale de 1,75
Pente 0,2550** 0,33
Teneur en matière organique (MO) 0,0050* 0,45
pH-eau 0,0050* 0,49
Profondeur (Prof) 0,0050* 0,67
* significatif; ** non significatif
Par convention, quand P-value d'une variable testée est inférieure ou égale à 0,05,
cette variable a un effet significatif et peut être incluse dans l'analyse.
D'après le tableau 3.2, les variables environnementales significatives, c'est-à-dire
celles ayant une influence sur la composition floristique sont la profondeur, le pH et la
teneur en matière organique, la première étant la plus discriminante car la variance
expliquée est la plus élevée. Ainsi, pour l'ordination canonique, seules les variables
significatives ont été utilisées.
Le tableau 3.3 donne les valeurs propres, l'inertie totale (= variance totale) et les
variances cumulées des quatre premiers axes. La CA sur cette matrice constituée de 42
relevés et de 159 espèces donne une inertie totale de 11,287. La CCA donne une inertie
totale de 1,756. D'après les résultats de la CCA (analyse contrainte), les trois premiers axes
expliquent à 100 % la variance totale (dont 40,8 % pour l'axe 1). Les deux premiers axes
cumulant à eux seuls une inertie de 77,5 % montrent qu'ils sont suffisamment
représentatifs pour l'interprétation des résultats. En d'autres termes les informations ne sont
pas dispersées sur tous les axes factoriels.
Les résultats de l'analyse non contrainte sont fournis dans la présente analyse, à titre
indicatif D'après ces résultats, la variance cumulée des espèces sur les quatre premiers
axes est de 19,4 % et met donc en évidence la dispersion d'informations sur tous les axes
factoriels.
La figure 3.2 représente la carte factorielle issue de l'ordination canonique des
quarante deux relevés associés aux trois variables retenues. L'axe 1 sépare assez nettement
les phytocénoses des forêts et savanes de celles des prairies et/ou pelouses. Cet axe a une
meilleure corrélation avec la profondeur et peut donc être interprété comme l'axe du
gradient de celle-ci. En effet la matrice de corrélation pondérée donne ime valeur r = 0,85
(r = corrélation espèces-environnement). Ces valeurs sont de 0,59 et -0,46 respectivement
pour le pH et la MO. L'axe 2 ne montre pas de bonnes corrélations vis à vis de l'une ou
l'autre des trois variables environnementales. Cet axe peut être, plus ou moins, interprété
comme l'axe de gradient de la matière organique dont la corrélation avec celui-ci est la plus
élevée (r = 0,46). La figure 3.3 donne, dans le même plan des axes 1 et 2, la répartition des
espèces correspondantes. Au total, dans l'interprétation de l'ensemble de nos relevés
soumis à l'ordination (analyse indirecte de gradients), la profondeur constitue donc la
donnée écologique de première importance. En effet, c'est elle qui gouverne, le mieux, la
composition floristique et donc la répartition des groupements.
Tableau 3.3 ; Valeurs propres et pourcentage de variance expliquée par les quatre premiers
axes d'ordination
Axes 1 2 3 4 Inertie totale
Eigenvalues (= valeurs propres) 0,717 0,424 0,329 0,287 11,287
Species-environment corrélations 0,9133 0,881 0,920 0,889
Cumulative percentage variance of
species data 6,4 10,1 13,0 15,6
species-environment relation 40,8 65,0 83,7 100,0
Sum of ail unconstrained eigenvalues 11,287
Sum of ail canonical eigenvalues 1,756
Figure 3.2 : Projection sur les axes 1 et 2 de la CCA appliquée aux 42 relevés et aux
variables environnementales (profondeur, pH, MO, pente).
O X—I
+
Indigcmi Acoipubc , Afropilo Sopusimp Schibrev X>Tistra * Cansdecu Anagpumi H>Tnenor FimbdicliA^lale .Tripmini Cochtinc lindicong Ttphflcx Lindexil Macrbifl Andrafri , Spcriwpp , Ctcneieg Crotpail •C>pepust Mallopos Lannvclu Sporfcst P Ovanlong • . - - - Annoscne Fimbhisp ScirangoDrosindi '^iisu^ Annose Ophicost Ljndesch Ipommaur Loudscac Micrindi Entaafri
Loudanin • Schisang Ambaya Mcllmicr , Mucupogg Peritaxi
Pennunis Hypainvo ‘ Sperslac Cochpian _ Uctaimcr Indilepr Cissmfc* Panigrif Indideig Aspibuss Dcinpinn . , Diosbulb Acacsicb Dioscume Arisring Diosmcsp t Antiveno Lecacupa . , • Ancnwehv ATxeafri Paulpinn Clerpoly * Ficuabut Fcreapod Adiaphil
Alloarri Commerce Anogicio Ooilcelt Cissnibr Parkbigl Dcsmgang Cisspeti • «
Oplihirt Diosab>'s’ Albizygi Ipomargc Aspiangu * • RoUcoch Pennpoly ^ Ampebomb •Styllanc Termglau Ccibpctu Combeo!) ’Sterseli
Cisspopu Bombeost • Pseuhook Andrtcct Chlopasi • ■ BuAafri Dioatogo Hexamono Uapatogo . Nephundu . . Sterkunt
Paricura Ptererin Adenpani Amoraoys Cyphsoko• Bridferr crinzcvl ^hascaud
Cissaden. Tepliclag combmoll
Ficuglum Andnaacr E^lafn Aspaafn T-, .** Siphaeth Lantrhod Laanacid Phau bar Eypiandr F Vignrace • Isobdoka Vitepara Monokers . Taccleon Grawaioll Curapilo Ulorsimp Neryumbr Danioliv Grcwbico Chloblcp Dihaampl Vitedoni Gardenib Andrschi Bridsclc Ischamet -
1.0
-1
-1.0
Figure 3.3 : Répartition des espèces dans le plan des axes 1 et 2
Légende :
Mierkunt (Microchloa kunthii), Andrfast (Andropogon fastigiatu), Indigemi (Indigofera geminata), Solelati (Solenostemon latifolia), Aeolpube (Aeollanthus pubescens), Afropilo (Afrotrilepis pilosa), Sopusimp (Sopubia simplex), Schibrev (Schizachyrium brevifolium), Cyanlana (Cyanotis lanata), Xyristra (Xyris straminea), Cansdecu (Canscora decussata), Anagpumi (Anagallis pumila), Hymeflor (Hymenodictyon floribundum), Utrisubu (Utricularia subulata), Tripomini (Tripogon minimus), Cochtinc (Cochlospermum tinctorium), Tephflex (Tephrosia flexuosa), Indicong (Indigofera congolensis), Fimbdico (Fimbristylis dichotoma), Aeshiate (Aeschynomene lateritia), Lindexil (Lindemia exilis), Macrbifl (Maocrotyloma biflorum), Andrafri (Andropogon africanus), Sperhepp (Spermacoce hepperana), Cteneleg (Ctenium elegans), Fimbhisp (Fimbristylis hispidula), Crotpail (Crotalaria palida), Scirpangol (Scirpus angolensis), Cypepust (Cyperus pustulata), Sporfest (Sporobolus festivus), Cynalong (Cyanotis longifolia), Annosene (Annona senegalensis), Scilsuda (Scilla sudanica), Hypasubp (Hyparrhenia subplumosa), Ipommaur (Ipomoea mauritiana), Lindesch (Lindemia schweinfurthii), Loudscat (Loudetia scaettae), Micrindi (Micrichloa indica), Entaafri (Entada africana), Loudarun (Loudetia arundinacea), Schisang (Schizachyrium sanguineum), Andrgaya (Andropogon gayanus), Mellmicr (Melliniellia micrantha), Mucupobe (Mucuna poggei), Perilaxi(Pericopsis laxiflora), Pennunis (Pennisetum unisetum), Hypainvo (Hyparrhenia involucrata), Sperstac (Spermacoce stachydea), Cochpian (Cochlospermum planchonii), Detamicr (Detarium microcarpum), Indilepr (Indigofera leprieurii), Cissrufe (Cissus mfescens syn. Cyphostemma r.), Indihirs (Indigofera hirsuta), Deinpinn (Deinbolia pinnata), Malloppo (Malotus oppositifolia), Diosbulb (Dioscorea bulbifera), Acacsieb (Acacia sieberiana), Dioscume (Dioscorophyllum cumminsii), Loneseri (Lonchocarpus sericeus), Arisring (Aristolochia rengens), Diospyros mespiliformis Antiveno (Antidesma venosum), Lecacupa (Lecaniodiscus cupanioides), Anchwelw (Anchomanes welwitschii), Afzeafri (Afzelia africana), Desm velu (Desmodium velutinum), Colamill (Cola millenii), Paulpinn (Paullinia pinnata), Ficuabut (Ficus abutilifolia), Malaalni (Malacantha ainifolia), Ceibpent (Ceiba pentandra), Cleropoly (Clerodendrum polycephalum), Adiaphil (Adiantum philippense), Fereapod (Feretia apodanthera), Anogleio (Anogeissus leiocarpa), Commerce (Commelina erecta), Alloafr (Allophylus africanus), Desmgang (Desmodium gangeticum), Parkbigl (Parkia biglobosa), Cissrubr (Cissus rubrosetosum), Opilcelt (Opilia celtidifolia syn. : O. amentacea), Diosabys (Diospyros abyssinica), Cisspeti (Cissus petiolata), Albizygi (Albizia zygia), Aspiang (Aspilia angustifolia), Combcoll (Combretum collinum), Sterseti (Sterculia setigera), Ampebomb (Ampelocissus bombyssina), Termglau (Terminalia glaucescens Syn. : T. schimperiana), Cisspopu (Cussus populnea), Bombeost (Bombax costatum), Pseuhook (Pseudocedrela hookeri), Andrtect (Andrpogon tectomm), Chlopusi (Chlorophytum pusillum), Burkafri (Burkea africana), Hexamono (Hexalobus monopetalus), Uapatogo (Uapaca togoensis), Nephundu (Nephrolepis undulata), Ptererin (Pterocarpus erinaceus), Adenpani (Adenodolichos paniculatus), Bridferr (Bridelia ferruginea), Cyphsoko (Cyphostemma sokodense), Ficuglum(Ficucus glumosa), Andrmacr (Andropogon macrophyllus), Siphaeth (Siphonochillus aethiopicus), Lantrhod (Lantana rhodesiensis), Lannacid (Lannea acida), Phaubart (Phaulopsis barteri), Isobdoka (Isoberlinia doka), Monkers (Monotes kerstingii), Ischamet (Ischaemum amethystinum), Taccleon (Tacca leontopetaloides), Aneilanc (Aneilema lanceolata), Grewmoll (Grewia mollis), Curepilo (Curculigo pilosa), Glorsimp (Gloriosa simplex), Grewbico (Grewia bicolor), Chloblep (Chlorophytum blepharophyllum), Ostrstuh (Ostryoderris stuhimannii), Andrschi (Andropogon schirensis), Danioliv (Daniellia oliveri).