La corrélation génétique entre effets directs et effets sociaux peut-elle varier du fait de la sélection ? Une étude par simulation

Alexandre M. Martin1*, Ingrid David1, Denis Réale2, Dany Garant3, Laurianne Canario1

* alexandre.martin@inra.fr

GenPhySE, INRA, Castanet-Tolosan

La corrélation génétique entre effets directs et eff ets sociaux peut-elle varier du fait de la sélection ?

Une étude par simulation

1GenPhySE, Université de Toulouse, INRA, ENVT, Castanet Tolosan, France 2Département des Sciences Biologiques, UQAM, Montréal, Qc, Canada

3Département de biologie, Université de Sherbrooke, Sherbrooke, Qc, Canada

Programmation de la simulation

Stochastique, oligogénique permettant recombinations, pléiotropie, et mutations.

Avancement du projet

La programmation est maintenant terminée. Les simulations sont en cours.

#1

#2

#3

Effet social #1 sur #2

Effet social #1 ^{sur #3}

E. S. _{#2 sur #3}

E. S. #3 _sur

#₂

E. S. #3 su^{r #1}

E. S. #2 sur #1

Valeurs génétiques estimées Sélection des reproducteurs

Pédigrée Phénotype Pour 30 générations contemporaines sélectionnées

N individus N familles

Sélection génétique Évaluation

génétique

Paramètres génétiques

Distribution Normale Multivariée

Démographie

Valeurs génomiques simulées Génomique

N SNP / QTL

Taux de mutation N chromosomes Variance directe Variance indirecte

0.2 ; 0.5

0.018 ; 0.036 0.045 ; 0.091

σ²_AI

Corrélation

Direct/indirect ±(0.6 ; 0.3 ; 0) 50 000 / 500 10^-5

10

6 ; 8 ; 12 2

Pour 2000 générations historiques non sélectionnées Phase stable

N Femelles (= N Mâles) Taille de portée

Bottleneck (% conservé) Phase de croissance

Sex Ratio reproducteurs Taille de portée

20♀ : 1♂

12 100 2

10

Centre Toulouse Midi Pyrénées Chemin de Borde Rouge

CS 52627 • 31326 Castanet-Tolosan cedex Tél : +33(0) 05 62 28 50 20

par groupe

Introduction

Effet Génétique Indirect: influence génétique d'un individu sur le phénotype d'un autre individu. La sélection sur un

phénotype socialement affecté prenant en compte les

EGI est censé améliorer le progrès génétique et le bien-être des animaux élevés en groupes. La corrélation entre effets génétiques directs et indirects a une influence majeure sur la réponse à la sélection.

Objectif

Prédire la trajectoire évolutive à long terme des

(co)variances génétiques EGI-EGD selon leur valeurs avant sélection et la structure des groupes.

Modèle animal

Valeurs génomiques simulées Méiose : - recombinaison

- mutation

Structure de groupe