TP3
suite La spécificité des lymphocytes est assurée par la présence de récepteurs spécifiques.
les LB possèdent des anticorps de surface.
Les lymphocytes B sont spécialisés dans la reconnaissance et l’élimination des antigènes circulants.
Ils possèdent à leur surface des anticorps, insérés dans la membrane plasmique.
Chaque lymphocyte est spécifique d’un Ag donné, grâce à ses anticorps de surface qui se fixent sur l’antigène. La fixation active le lymphocyte qui se multiplie et se transforme en cellule productrice
d’anticorps circulants (du même type que ceux présents à sa surface)
Comment est assurée cette spécificité ?
Partie 1 (guidée) : découverte de la structure de la molécule avec RASTOP Proposition de résolution :
Protocole :
8 Ouvrez « RASTOP », « fichier » « ouvrir », puis suivre les indications du professeur. Et « IGGTOTAL » La composition atomique :
- Le mode d'affichage par défaut montre uniquement les liaisons. Pour se rapprocher des
représentations usuelles en chimie, il est préférable d'afficher en sphères de Van der Waals avec le bouton :
- les atomes apparaissent : atomes mis en évidence : La mise en évidence de l’organisation de la molécule - « atomes », « colorer par », « chaîne »
- l’anticorps est constitué de
- (H et K) - (L et M)
- « ruban », « squelette carboné » (attention il faut effacer les atomes : « atomes », représentation »,
« effacer ».
Les 4 chaînes…
- « liaisons », « ponts disulfures », « afficher », pour les mettre mieux en évidence, nous allons les colorer : On affiche la palette de coloration, on choisit « ponts disulfures » dans le menu déroulant de la
palette puis une couleur.
On rappelle que les acides aminés « cystéines » possèdent des atomes de souffre qui peuvent établir en eux des liaisons, mettons en évidence ces atomes : « éléments », « S » puis activez le bouton
…et on affiche les atomes en utilisant l’icône « boules et bâtonnets » - les 4 chaînes sont reliées
Réalisez un schéma simplifié de la structure d’un anticorps.
Partie 2 : (en autonomie) des zones de fixation spécifique
On peut soumettre les molécules d’anticorps à une action enzymatique qui « découpe » la molécule en fragments. Ici on vous présente un fragment comportant l’extrémité d’une chaine lourde et d’une chaîne légère et un antigène fixé (en rouge)
8 Ouvrez « RASTOP », « fichier » « ouvrir », puis suivre les indications du professeur. Et « IGGLYS » - mission : présenter cette molécule en « sphères », colorer les chaînes, Zoomer et orienter le modèle pour montrer le site de fixation avec les commandes : APPELER le professeur.
Vous pouvez détailler cette zone : Cliquer sur « Sélectionner les atomes »
En maintenant appuyer le bouton gauche de la souris, sélectionner la limite entre l’Anticorps et l’Antigène Mettre en évidence cette zone par une représentation en ‘Sphères (VDW)’
Inverser la sélection (on sélectionne en fait le « reste de la molécule » hors zone de fixation) Cacher la sélection
Zoomer et observer la configuration de la zone alors mise en évidence.
APPELER le professeur
Sachant que l’on obtiendrait le même résultat avec l’extrémité symétrique de l’anticorps, complétez votre schéma.
Rendez votre schéma et les captures d’écrans qui vous semblent intéressantes pour illustrer votre propos.
Petits conseils :
- ZOOM : « shift » + roulette »
- Réalisez des captures d’écran à chaque étape et enregistrez-les dans votre dossier IACA (créez un dossier SVT)
- Pour imprimer attention « palette de couleur », « fond blanc » Partie 3 : (guidée) La séquence des chaînes :
8 Ouvrez « ANAGENE2», « fichier » « ouvrir », puis suivre les indications du professeur.
Les 4 chaînes sont des
- H et K : - L et M
- Comparer la séquence d’acides aminés des chaînes (utilisez comparaison avec alignement) : Résultats de la comparaison :
