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Solutions de gestion des données d’imagerie:exemples avec Shanoir, Archimed et Cati-DB

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Academic year: 2021

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Texte intégral

(1)

HAL Id: inserm-01895596

https://www.hal.inserm.fr/inserm-01895596

Submitted on 15 Oct 2018

HAL is a multi-disciplinary open access

archive for the deposit and dissemination of sci-entific research documents, whether they are pub-lished or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers.

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Solutions de gestion des données d’imagerie:exemples

avec Shanoir, Archimed et Cati-DB

Michael Kain

To cite this version:

Michael Kain. Solutions de gestion des données d’imagerie:exemples avec Shanoir, Archimed et Cati-DB. JFR 2018 - Journées Françaises de Radiologie, Oct 2018, Paris, France. pp.1-9. �inserm-01895596�

(2)

Solutions de gestion des données d’imagerie:

exemples avec Shanoir, Archimed et Cati-DB

(3)

• Pour les études multi-centriques, cliniques et précliniques :

– Images (brutes (DICOM) et derivées/traitées)

– Meta-data associeés, par ex. time points, protocole d‘étude etc.

• Dans un environnement complexe:

– Standards/formats :

DICOM, PACS, DICOM De-identification, Pseudonymization

and

Anonymization, DICOMWeb: WADO-URI, -WS or -RS, QIDO-RS, STOW-RS, NIfTI,

NRRD, XDS, HL7 CDA, HL7

FHIR, BIDS, NIDM, Medical Health Records (DMP, EHR, PHR,

openEHR) à

interopérabilité

– Juridique :

• France: CNIL, « agrément HDS », ANSM

• Europe: GDPR, applied on 25. May 2018

• USA: HIPAA & Title 21 CFR Part 11 by FDA

– Sécurité

:

cybersécurité et -attaques, serveur et hardware

– Besoins scientifiques et économiques

• Besoin pour un hébergement professionel/industriel: -> FLI-IAM

• Bases de données: ArchiMed, CATI-DB, Shanoir, XNAT

Bases de données en imagerie médicale

(4)

3/6

Et son environnement

CT

ECG

Dicoms

Rawdata

Other …

Connecté à l’environement Clinique,

MRI

Pour la recherche et ses outils,

Centralized 3D Viewer & Post Processing Other research tools Matlab / Python / Batch processing

DB

Workstation

Desktop

3

1

Authentication

2

Study Choose

5

Data Import (Local)

4

Data Check Centers Deidentication

… Multicenter

Eureka

HTTPS + Encryption Local Secured Copy

v

ArchiMed Platform

(5)

CATI-DB

(6)
(7)

XNAT

(8)

Summary

Name

Who? Concept/Model/Speci

als/Scenario?

Modali

ties?

Brow

ser?

Links?

Open-

Source?

ArchiMed

CIC-IT

Nancy,

Inserm

Centralized server, model

most close to DICOM/PACS,

Desktop client, PAAS

MRI, CT,

XA

No

Site web

CIC-IT

Not yet

CATI-DB

CATI

Paris,

CEA

Centralized File-system

(NFS) with meta-data

server, model oriented on

processings, perfectly

adapted and coupled into

CATI infra, turn-key

MRI,

PET/SPE

CT

No

https://cati-neuroimaging.c

om

Yes, register

for access

Shanoir

Visages,

Rennes,

Inria

Centralized server

Ontology based,

Model remains fix, Web

client, PAAS

MRI,

PET,

Bruker,

EEG in

2019

Yes

http://shanoir.o

rg

Yes

15.11.2018

On GitHub

XNAT

NRG

Lab

Wash.,

Centralized server

Schema based,

Default model to

MRI,

(9)

FLIIAM : Intégration of Data Management Solutions

-Common catalog, search engine

(10)

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