Revue frangaise des SGIEIIGES DE ['EAU, 2 (19831 437-442
L'acide d6soxyribonucl6 ique
D e s o x y r i b o n u c l e i c a c i d
D . F O N T V I E I L L E *
S o m m a i r e 1 - M 6 t h o d e s d ' a n a L y s e d e L ' A - D . N .
2 . A p p L i c a t i o n s d e s m e s u n e s d ' A . D - N - e [ ' 6 t u d e d e s m i t i e u x a q u a t i q u e s
3 - P e r s p e c t i v e s d ' a o p L i c a t i o n s d u d o s a g e d ' A . D . N . 4 . R 6 f 6 r e n c e s b i b L i o g r a p h i q u e s .
T . r a c i d c d 6 q o v w r i h o n l r . l 6 i o u e u L J v ^ f ! r l v e s t I ' u n d c s e o m n o s 6 s c e l l r r ' l a i r e s d o n t l e d . o s a q e a 6 t 6 a d a D t 6 a I ' 6 t u d e d e s m i f i e u x n a t u r e l s d a n s f e b u t d ' o b - t e n i r u i e i n d i c a t i o i d e f a b i o m a s s e d e s m i c r o - o r g a n i s m e s o u d e l e u r a c - t i v i t 6 . C e t a c i d e n u c t 6 i q u e e s t e n e f f e t u n c o m p o s a n t u n i v e r s e l d e s
n e l l r r l e q . l r n q u q , , - f s r \ 1 u sl c q n r r e l l e s o n o e u t c o n s i d 6 r p r - c n o r t r F - . r r r i I e S t e n
q u a n t i t 6 r e l a t i v e m e n t c o n s t a n t e p o u r u n m e n e m i c r o - o r q a n i s m e .
I - l k r H o D E S D ' A N A L Y S E D E L ' A , D , N ,
L ' i n t d r € t d e s a c i d e s n u c l 6 i q u e s p o u r I ' 6 t u d e d e s p o p u l a t i o n s n i c i ' o - b i e n n e s e s t d o u b l e :
- 6 v a l u a t i o n d ' u n e b i o m a s s e - o a r I e d o s a g e d e s q u a n t i L 6 s d ' A . D . N . p r e s e n - t e s A u n i n s t a n t d o n n 6 ,
- 6valuation d ' u n t a u x d e c r o i s s a n c e p a r I a m e s u r e d u t a u x d e s y n t h d s e d e I ' A . D , N . o u d e s A . R - N .
* L a b o r a t o i , r e d ' E c o l o g i e - B . P ' 1 1 A 4 - , l o c o b - B e l l e c o m b e t t e 7 3 0 1 1 C H A I 4 B E R Y C 6 d e x .
e t L , A , C N R S n " 3 6 2 E c o l o g i e d e s E a u x D o u c e s .
A c e s d e u x a p p r o c h e s c o r r e s p o n d e n t d e u x g r o u p e s d e t e c h n i q u e s .
1 - 1 M 6 t h o d e s d e d o s a q e d e I ' A . D . l l .
C e s m 6 t h o d e s c o m p o r t e n t t l p i q u e m e n t d e u x p h a s e s : d ' a b o r d l - ' e x t r a c - t i o n d e l ' A . D . N . p u i s s o n d o s a g e p r o p r e m e n t d i t .
1 - 1 - 1 M d x h o d e s d ' e x t r a c t i o n d e 7 ' A - D . N -
C ' e s t l a p r e m i E r e 6 t a p e o b l i g a t o i r e d e I a m e s u r e , d u f a i t d e I ' o r i g i n e i n t r a c e l l u l a i r e d e c e c o m p o s 6 . E n r 6 a l i t 6 , d a n s s e s a p p l i c a t i o n s h y d r o - b i o l o g i q u e s , c e t t e o p 6 r a t i o n i n c l u t 6 g a l e m e n t I ' e x t r a c t j . o n d e I ' A . D . N . d e I ' e n s e m b l e d e s c o m p o s 6 s r n i n 6 r a u x e t o r g a n i q u e s q u i c o n s t i t u e n t I e m i l i e u o l f I ' a n a l y s e e s t e f f e c t u 6 e . C ' e s t a u s s i 1 ' 6 t a p e q u i r e s t e 1 a p l u s d i s c u - t a b l e ( p a r suite d e l a g r a n d e v a r i a b i l i t 6 d e s o n r e n d e m e n t ) e t c e d ' a u t a n l p l u s q u ' e 1 1 e d 6 v r a i t 6 t r e s p 6 c i f i q u e d c h a q u e c a s d ' a p p l i c a t i o n .
L a p l u p a r t d e s t e c h n i q u e s d S r i v e n t d e 3 m 6 t h o d e s o r i g i n a l e s d o n t p l u - s i e u r a u t e u r s o n t f a i t I ' 6 t u d e c o m p a r a t i v e : L E S L I E ( 1 9 5 4 ) , I ^ I E B B e t L E V Y
( 1 9 5 6 ) , M U N R O e t F L E C K ( 1 9 6 6 ) . c e s a u t e u r s o n t m o n t r 6 n o t a n m e n t I ' i m p o r - t a n c e d e s p e r t e s d ' A . D . N . d u f a i t d e 1 ' a c t i v i t 6 d e s n u c l 6 a s e s , d a n s l e c a s o t l f a c o n s e r v a t i o n d e 1 ' 6 c h a n t i l l o n e s t n 6 c e s s a i r e e t r 6 a l i s 6 e p a r c o n g 6 l a t i o n . U n p r 6 t r a i t e m e n t d I ' a c i d e f r o i d a v a n t 1 a c o n q 6 l a t i o n p e r m e t d ' i n h i b e r 1 e s n u c l 6 a s e s e t d o n c d e l i m i t e r c e s p e r t e s . D a n s t o u s l e s c a s ' i l s e m b l e c e p e n d a n t q u e 1 a c o n g 6 l a t i o n s o i t d 6 v i t e r a u t a n t q u e p o s s i b l e ' L e s m 6 t h o d e s p r o p o s 6 e s c o m p o r t e n t t y p i q u e m e n t 3 6 t a p e s s u c c e s s i v e s : - u n e e x t r a c t i o n . d e p e t i t e s m o l 6 c u l e s d I ' a c i d e f r o i d ,
- une extraction par solvant organique de Ia fraction lipidique de
I e c n a n E . a I I o n ,
- une 6tape, variable s e l o n l e s a u t e u r s , v i s a n t i I a s 6 p a r a t i o n d e I ' A . D . N . , d e s A . R . N . e t d ' u n r 6 s i d u p r o t 6 i n i q u e - S o u s s a f o r m e l a p l u s s i m p l e ' c e t t e 6 t a p e e s t u n e h y d r o l y s e d e s a c i d e s n u c l 6 i q u e s o a r t r a i t e m e n t i l - ' a c i d e c h a u d ( m i s e e n s o l u t i o n d e s s u c r e s e t d e s b a s e s p u r i q u e s e t p y r i n i d i q u e s ) .
En ce qui concerne 1a premidre 6tape, un compromis doit 6tre trouve
e n t r e 1 ' e f f i c a c i t 6 d ' e x t r a c t i o n d e s p e t i t e s m o l 6 c u l e s q u i p e u v e n t i n t e r - f 6 r e r d a n s I e d o s a g e d ' A . D . N . ( n u c l 6 o t i d e s l i b r e s , s u c r e s , p h o s p h a - t e s . . . ) e t l a p r 6 s e r v a t i o n d e I ' i n t 6 g r i t 6 d e l a m o l 6 c u l e d t A - D . N . ( d ' o r l l ' e m p l o i d f r o i d d ' a c i d e s p e u c o n c e n t r 6 s : a c i d e p e r c h l o r i q u e 0 , 2 N p a r e x e n r p l e ) . C e t t e m 6 m e r a i s o n e x p l i q u e f e f a i t q u e l a d e u x i d m e 6 t a p e d ' e x - t r a c t i o n l i p i d i q u e s o i t d 6 c o n s e i l l 6 e p a r c e r t a i n s a u t e u r s . L a r u D t u r e d e l a m o l 6 c u 1 e d ' A . D . N . p r o v o q u 6 e i I a t r o i s i A m e 6 t a p e d o i t r e s p e c t e r , p a r c o n t r e , I ' i n t 6 g r i t 6 d e s p e n t o s e s s u r l e s q u e l s s o n t b a s 6 e s c e r t a i n e s t e c h n i q u e s d e d o s a g e . P l u s i e u r s p r o c 6 d 6 s u t i l i s e n t d c e s t a d e l f a c i d e p e r c h l o r i q u e 0 , 5 l J a 7 0 o C .
L a m i s e a u p o i n t r 6 c e n t e d ' u n e m 6 t h o d e o e r f o r r n a n t e d e d o s a g e d e s a c i -
d e q n r c l 5 i d r r c q n a r f l r r o r i m 6 l - r i a ( r z o i r n l t t q t r a c ) a n e r n i s 5 p A U L e t M E Y E R S
v l J r r u u r L r Y s v r y q ! w v r t t , r q v
( 1 9 8 2 ) d e r 6 d u i r e I a p h a s e d ' e x t r a c t i o n , d a n s I e c a s d e s p o p u l a t i o n s p l a n c t o n i q u e s , d u n s i m p l e t r a i t e m e n t i f r o i d p a r l e t r i t o n X 1 0 0 e t l e c i t r a t e t r i s o d i q u e s u i v i d . ' u n e s o n i f i c a t i o n d e 3 0 s e c o n d e s . D a n s I e c a s d e s S c h a n t i l l o n s c o n c e n t r 6 s p a r f i l t r a t i o n , u n e c e n t r i f u g a t i o n t e r m i n e I ' o p 6 r a t i o n p o u r 6 l i m i n e r 1 e s d 6 b r i s d e f i l t r e . S e l o n I e s a u t e u r s , c e t t e m 6 t h o d e a p p l i q u 6 e d . u n e s u s p e n s i o n b a c t 6 r i e n n e e x t r a i t 2 8 ? d ' A . D . N ' d e p l u s q u e I a m 6 t h o d e i I r a c i d e p e r c h l o r i q u e .
N / ? a
3 - 1 - 2 M e t h o d e s d e d o s a g e d e f ' A - D . N -
L e d o s a g e d e I ' A . D . N . p e u t 6 r : r e e f f e c t u 6 p a r I ' i n t e r n 6 d i a j r e d e s e s t r o i s c o m p o s a n t s p r i n c i P a u x :
- Ie phosphore : dosage coLorj-m6trique'
- les bases puriques o u p y r i m i d i q u e s : s p e c t r o r n 6 t r i e d ' a b s o r p t i o n d a n s I ' U . V . e n l - r e 2 5 7 e L 2 ' 7 O n m o u d o s a g e s c o f o r i m 6 t r i q u e s ,
- Ie d6soxyribose : d o s a g e c o l o r i m e t r i q u e ,
^ r r n ^ r l c h i a i s d e m 6 t h o d e s f l u o r i n 6 t r i q u e s p l u s o u m o i n s s p 6 c i f i q u e s ' L a P l u p a r t d e s a p p l i c a t i o n s q u i o n t 6 t 6 r 6 a l i s 6 e s e n h y d r o b i o l o g i e
s o n t b a s 6 e s s u r L a r n 6 t h o d e f l u o r i m d t r i q u e ( H I I I E G A R D N E R , 1 9 7 1 ) a 1 ' a c i - d e 3 , 5 d i a m i n o - b e n z o i q u e ( D A B A ) o u s u r l a r n 6 t h o c l e c o l o r i m 6 t r i q u e
( D I S C H E , 1 9 5 3 m o d i f i 6 e p a r B U R T O N , 1 9 5 5 ) a 1 a d i p h 6 n y l a m i n e ( l i m i t e d e d 6 t e c t i o n 5 u g d ' A . D . N . s e l o n B U R T o N , 1 9 6 8 ) . L a p r e m i e r e e s t p l u s s e n s i -
b l e , m a i s p l u s d 6 l i c a t e a m e t t r e e n c e u v r e q u e l a s e c o n d e p l u s a d a p t 6 e d l a m e s u r e d e s f o r t e s c o n c e n t r a t i o n s e n A . D - N . S e f o n I W A - r 4 U R L e t a L . ,
0 g 1 o ) , l e u r s r 6 s u l t a t s r e s t e n t c e p e n d a n t t o u t a f a i t c o m p a r a b l e s . D a n s L e s d . e u x c a s , d e s 6 t u d e s o n t 6 t 6 r 6 a l i s 6 e s p o u r 1 ' o p t i m i s a t i o n d e s p r o t o - c o l e s o p 6 r a t o i r e s e n l i a i s o n a v e c l e u r a p p l i c a t i o n a u d o m a i n e h y d r o b i o - l o g i q u e ( H O I I 4 - H A N S E N e t a L . , 1 9 6 8 ; CLESCERI eL DAZE, 1975' FONTVIEILLE e t F E V o T T E , 1 9 8 1 ) .
L e s d o s a g e s s e s o n t t o u j o u r s r 6 v 6 l 6 s a s s e z s o 6 c i f i q u e s e t l e s - i n t e r -
f S r e n c e s a v e c d ' a u t r e s c o m p o s 6 s d u m i l i e u r e l a t i v e m e n t f a i b l e s d d s q u e c e r t a i n e s p r 6 c a u t i o n s o p 6 r a t o i r e s s o n t r e s p e c t 6 e s , n o t a r D m e n t e n c e q u 1 c o n c e r n e 1 a q u a l i t 6 d e s r 6 a c t i f s u t i l i s 6 s '
T r e s r e c e n n e n t , l a m 6 t h o d e f l u o r i r n 6 t r i q u e a c o n n u u n n o u v e a u d 6 v e L o p - p e m e n t a v e c l a m i s e a u p o i n t d e f l u o r o c h r o m e s t r a s s p 6 c j - f i q u e s ( p a s
d , i n t e r f 6 r e n c e a v e c 1 e s A . R . N . ) d 6 n o r o m 6 s D A P I ( 4 , 5 - d i a m i d i n o 2 - p h 6 n y I i n - d o l e ) e t H O E C H S T 3 3 2 5 8 ( b i s b e n z i m i d e , 2 - l 2 - ( 4 - h y d r o x y p h 6 n y l ) - 6 - b e n z i m i - i t a z o l y l l - 6- (1-m6thy1-4-piperazyl) b e n z i n i d a z o l e , t r i h y d r o c h l o r u r e ' p e n t a h y d r a t e ) . S e l o n P A U L e t M E Y E R S ( 1 9 8 2 ) l e p r e m i e r a c e D e n d a n t p o u r i n c o n v 6 n i e n t s d r a v o i r u n e f l u o r e s c e n c e i n t r i n s a q u e n o n n 6 g l i g e a b l e e t d ' e t r e i n h i b 6 p a r l e s i o n s M g + + . L e u r m 6 t h o d e , b a s 6 e s u r l e s e c o n d ' d o n n e d e s v a l e u r s d ' A . D . N . s u p 6 r i e u r e s d e 2 3 z A c e f l e s o b t e n u e s p a r l e
d o s a g e A l a d i p h 6 n y l a m i n e e t u n e s e n s i b i l i t 6 q u ' i l s e s t i m e n t i O ' 1 U q d ' A . D . N . ( e n v i r o n 1 0 7 c e l l u l e s b a c t 6 r ' i e n n e s ) '
I - 2 l ' ' ! e s u r e d u t a u x d e s y n t h O s e d e s a c i d e s n u c l 6 i q u e s
c e s m 6 t h o d e s s o n t b a s 6 e s s u r I a m e s u r e d e s t a u x d ' i n c o r p o r a t i o n d e p r 6 c u r s e u r s d e s a c i d e s n u c t d i q u e s m a r o u 6 s a u t L i t i u m : t h y m i d i n e
( e n o c r , 1 9 6 7 ) o u a d 6 n i n e ( K A R L , 1 9 8 1 ) . A p r d s i n c u b a t i o n , I a m e s u r e d u m a t 6 r i e l r a d i o a c L i f i n c o r p o r 6 e s t r 6 a l i s 6 e s u r l ' e n s e m b l e o u S u r u n e f r a c t i o n s p 6 c i f i q u e d u m a t 6 r i e l c e l l u l a i r e . K A R L ( 1 9 8 1 ) r 6 a l i s e a i n s i
I a m e s u r e s i m u l t a n e e d e s t a u x d e s y n t h d s e d e s A ' R ' N ' e t d e I ' A ' D ' N ' d a n s d e s p o p u l a t i o n s b a c t 6 r i e n n e s d ' e a u d e r n e r o u d ' 6 t a n g '
2 - A p p t - t c A T I 0 N D E S M E S U R E S D ' A , D , N , A L ' E t u o r D E S M I L I E U X I A Q U A T I O U E S
2 - L M e s u r e d e I a c o n c e n t r a t i o n d ' A . D . N . d a n s le s m i l i e u x a q u a t i q u e s
C e t t e t e c h n i g u e e s t u t i l j s d e d a n s l e b u t d e l ' d v a f u a t i o n d ' u n e b i o - m a s s e p l a n c t o n i q u e o u m i c r o b i e n n e . L e s a p p l i c a t l o n s a u d o m a i n e h y d r o - b i o l o g i q u e e n s o n t c e p e n d a n t e n c o r e t r o p r a r e s p o u r q u e I ' o n p u i s s e i t t o e r w 6 r i t a h l e h e n t d u b i e n - f o n d 6 d e s r 6 S u I t a t S e t d e s C r i t j a r r p s d r r i d n J -Y u r v r r u
6 t 6 p u b l i 6 s A s o n s u j e t .
T . r a n n l i c a f i n n l a o l l s f r 6 c u e n t e e n e s t f ' 6 v a l u t a t i O n d e I a b i o m a S s e m i c r o b i e n n e a u s e n s I a r g e , d a n s l e d o n a j n e o c 6 a n i q u e , e n l i a j s o n a v e c d ' a u t r e s p a r a r n d t r e s d ' a p p r 6 c i a t i o n g l o b a l e d e s b i o c o e n o s e s ( c h l o r o p h y l - I e s , p r o t 6 i n e s , A . R . N - , a c t i v i t 6 e n z 1 , : n a t i q u e , r e s p i r a t i o n " " , ) : F O T , M - H A N S E N e t a L , , 7 9 6 8 ; H O L I 4 - H A N S E N , 7 9 ' 7 3 ; H O B B T E e t a 7 . , l g 1 2 ; M A E D A e t T A G A , 7 9 7 4 ; Y A M A G U C H T e r S E K r , 1 9 7 7 , T A K A H A S H T e t a / . , 7 9 ' 7 4 ; p A U L e t M E Y E R S , 1 9 8 2 . C e s t r a v a u x m o n t r e n t , d e f a g o n g 6 n 6 r a l e , u n e b o n n e c o h 6 r e n c e d e s m e s u r e s d ' A . D . N . a v e c l e s r 6 s u l t a t s d o n n 6 s p a r l e s a u t r e s m 6 t h o d e s d ' 6 v a l u a t i o n d e b i o m a s s e ( d 6 n o n b r e m e n t s b a c t 6 r i e n s , c a r b o n e
n a r f i c ' r l a i r a n h l n r o n h r r l 1 a \ a r r ^ r : n f i r r i r A u s ( L \ n . T D a n f i r r i f 5 u s ^ 6 c h r z d r a a 6 -e u J r r l u ! v Y U
n a s i q u e , r e s p i r a t i o n ) . t - e s t r a v a u x m e n 6 s p l u s s p e 5 c i a l e m e n t e n l i a i s o n a v e c I ' 6 t u d e d u p h y t o p l a n c t o n ( T W A t v t U R A a f . o L . , 1 9 7 0 ; J O N E S , 7 9 1 7 ; M A R T I N e t G O N Z A L E Z , 1 9 7 8 ) d o n n e n t des r6sultats s i m i l a i r e s , D a n s c e r t a i n s c a s , c e p e n d a n t , 1 ' A . D . N . s e m b l e c o n d u i r e d d e s v a l e u r s s u r e s t i m 6 e s d e l a b i o m a s s e e t c e r t a i n s a u t e u r s ( H o L } , I - H A N S E N e t a L . , 1 9 6 g ; H O B B T E e t a L . ,
I 9 1 2 ) 5 m e L L e n t . l ' h y p o t h F s e d ' u n r e t a r d d e s a b i o d 6 q r a d a t i o n a p r F s l a m o r t d e s o r g a n i s m e s . C e s a u t e u r s m e t t e n t a i n s i e n d o u t e f a v a l e u r d e I ' n . D . N . e n t a n t q u e p a r a m d t r e e s t i n a t e u r d e l a b i o r n a s s e d a n s l e s z o n e s o r l s u b s i s t e n t d e f o r t e s c o n c e n t r a t i o n s e n m a t i d r e o r g a n i q u e i n e r t e . C e s o b s e r v a t i o n s n e t r o u v e n t p a s l e u r c o n f i r m a t i o n d a n s f e s r a r e s t r a v a u x e f f e c t u 6 s d e c e p o i n t d e v ' u e d a n s l e d o r n a i n e l i n n i q u e e t q u i c o n c e r n e n t p o u r t a n t d e s m i l i e u x r e l a t i v e m e n t c h a 1 9 6 s e n n a t i A r e s o r g a n i q u e s : C L E S C E R I e t D A Z E ( 1 9 7 5 ) q g 6 l i f i e n t I ' A . D " N " d e b o n c r i t A r e d ' 6 v a l u a t i o n d e I a b i o m a s s e e t d e I ' a c t i v i t 6 d e s n i c r o - o r g a n i s m e s ( b o n n e corrdlation a v e c 1 e p o t e n t i e l h 6 t 6 r o t r o p h e ) d a n s d e s s 6 d i m e n t s l a c u s t r e s . S u r l a b a s e d e s t r a v a u x d e W A L T E R S ( 1 9 G c ) ) , i I s c o n s i d d r e n t g u e I a b i o d 6 g r a d a - t i o n d e I ' A - D , N . e s t r a p i d e d a n s l e s m i l i e u x n a t u r e l s , P o u r F O N T V I E f L L E e t F E V O T T E ( 1 9 8 1 ) l a r e l a t i o n A . D " N . - n o r n b r e d e b a c t d r i e s e x i s t e 6 g a l e - n e n t , m a i s d e f a g o n i n c o n s t a n t e , d a n s l e s s 6 d i m e n t s d ' u n c o u r s d r e a u p o l l u 6 s p a r u n e f f f u e n t d e p o r c h e r i e . D e u x r a i s o n s s o n t i n v o q u E s p o u r e x p l i q u e r c e r 6 s u f t a t :
- . I ' i n c e r t i t u d e i m p o r t a n t e s u r l e s v a l e u r s c l e d 6 n o m b r e r n e n t s b a c t 6 r i e n s , - l e f a j t q u e i ' A . D . N . a i L p o u r o r i g i n e 1 ' e n s e m b l e d e s r n i c r o - o r g a n i s m e s
d u m i l i e u e t n o n I a s e u l e f l o r e b a c t 6 r i e n n e .
D a n s l - e d o m a i n e d u t r a i t e m e n t d e f ' e a u , q u e l q u e s a u t e u r s o n t m o n t r 6 f i n t d r e t d u d o s a g e d ' A " D " N - p o u r l e c o n t r 6 l e . d e l a b i o m a s s e e t d e I ' a c t i v i t 6 d e s b o u e s a c t i v 6 e s ( G E N E T E L L I , 196l ; BARDTKE et THOMANETZ, 1 9 7 6 ) .
f ) a n q . F f \ / n c d a m i l i ^ " 1 ^ ^ j - ' ^ - ^ i - ' s n 6 e i f i o r r e c o y u L f ! r ' 1 u L e c t c J L n a r f o i S ! / q L ! v l e l a t i v e -
m e n t f a i b l e e t l ' e m p l o i d e c o e f f i c i e n t s p o u r l a c o n v e r s j o n d e s m e s u r e s d ' A . D . N . e n b i o m a s s e b a c t 6 r i e n n e p e u t 6 t r e j u s t i f i 6 e : 1 e s v a f e u r s d o n -
n 6 6 c h r r A i ' . a - - - r r F ^ r 1 r q F f r a n n ^ r l - 6 F q - n r G E N E T E L L I S , 6 t e n d e n t s e l o n l e s
n p n r a q h : r f 6 r i a n c A o 1 , 8 " a ( p a r r a p p o r t a u p o j d s s e c ) p o u r S o h a c t " o L i l u s
4 4 1
a 5 , 4 z p o u : Z o o g L e a r a f t L : g e ? a . D a n s f e s m i l - i e u x n a t u r e l s , ' I e t e l l e s c o n v e r s i o n s d e v r a i e n t 6 t r e 6 v i t 6 e s , d u f a i t d e I a d i v e r s i t 6 d e s m i c r o - o r g a n i s m e s p r i s e n c o m p t e p a r I e d o s a g e "
? - 2 M e s u r e d u t a u x d e s y n t h d s e d e s a c i d e s n u c l 6 i q u e s
De nolibreux travaux montrent le caractdre universel dans Ie nonde
b a c t d r i e n d e s c o r r 6 f a t i o n s e n t r e I e t a u x d e c r o i s s a n c e d e l a c e l l u l e e t I e t a u x d e s y n t h d s e d e s a c i d e s n u c l 6 i q u e s e t d e s p r o t S i n e s ( N I E R L I C E '
7 g . 7 g i P R I T C H A R D e t a L . , 1 9 6 9 ) . r 1 a 6 t 6 m o n t r 6 p a r I a s u i t e , q u e l e s r a p p o r t s A . D . N _ / A . R . N . e t p r o t 6 i n e / A . R . l . l . s o n t d i r e c t e m e n t p r o p o r t j - o n n e l s a u x t a u x d e c r o i - s s a n c e c e l l u l a i r e ( B R U N S C H E D E e t A L . , 1 9 7 7 ) . C e s r 6 s u l t a t s n , o n t p a s e n c o r e f a i t I ' o b j e t d e b e a u c o u p d ' a p p l i c a t i o n s d a n s I e s m i l i e u x n a t u r e l s ( K A R L , 1 9 7 9 ; F U H R M A } I e t A z A I l , 1 9 8 0 ) ' R 6 c e m n e n t ' K A R L ( 1 9 8 1 ) a p r o p o s 6 I a m e s u r e s i m u l t a n 6 e d e s t a u x d e s y n t h b s e d e s A ' R ' N ' e t d e 1 ' a . o . l . p o u r I ' 6 t u d e d u d 6 v e l o p p e n e n t d e s p o p u l a t i o n s b a c t 6 r i e n n e s d u p l a n c t o n . S o n t r a v a l l r 6 v 6 1 e q u e l e r a p o r t A ' D ' N ' / A ' R ' N ' p e u t v a r i e r d e i , : a f t , 8 % p o u r l e s d i f f 6 r e n t s n i l i e u x q u ' i I a 6 t u d i 6 s ( o c 6 a n i q u e s e t l i n n i q u e s ) . E n o u t r e , i I n ' a p p a r a i t p a s d e c o r r 6 l a t i o n e n t r e c e r a p p o r t e t I a b i o m a s s e m i c r o b i e n n e . C e r 6 s u l t a t e s t c e p e n d a n t t o u t i f a i t d i s - c u t a b l e , l a b i o m a s s e 6 t a n t 6 v a l u 6 e p a r d o s a g e d ' A ' T ' P '
5 - P E n s p E c r t v E S D ' A p P L I c A T I o N S D U D o s A G E D ' A , D , N '
I I e s t c e r t a i n q u e l a r 6 v 6 l a t i o n f a i t e p a r c e r t a i n s a u t e u r s d r u n d v e n t u e l p r o b } d m e c o n c e l n a n t l a d u r 6 e d e l a b i o d 6 q r a d a t i o n p o s t - m o r t e m
d e l ' A . D . N . , a c o n s i d 6 r a b l e m e n t f r e i n 6 l e s r e c h e r c h e s d a n s c e d o m a i n e ' I l _ s e r J c l e r a i s o n n a b l e d e n e p a s g 6 n 6 r a l i s e r a c t u e l l e m e n t l e s c o n s t a t a - t i o n s q u i o n t 6 t 6 f a i t e s d c e s u j e t : p l u s q u ' d I ' a b o n d a n c e d e I a m a t i d r e o r g a n i q u e , 1 a r a p i d i t 6 d e l a b i o d 6 g r a d a t i o n d e I ' A ' D - N ' d e v r a i t 6 t r e 1 i 5 e d I ' a c t i v i t e m 6 t a b o l i q u e g 6 n 6 r a l e d u n r i l i e u e t i I a d i v e r s i t 6 d e s e n z y n e s p r 6 s e n t s : c ' e s t p r o b a b l e m e n t I e c a s d a n s l e s s 6 d i m e n t s e t d a n s d e s m i l i e u x t e l s q u e l e s b o u e s a c t i v 6 e s '
L e d o s a g e d ' A . D . N . e s t I ' e x e n p l e m a m e d e s t e c h n i q u e s d ' a p p r 6 h e n s i o n g l o b a l e d e s b i o c o e n o s e s p o u r l e s q u e l l e s i I e s t n 6 c e s s a i r e ' a v a n t t o u t ' d ' a c c r o i t r e c o n s i d 6 r a b l e m e n t l e n o m b r e d e s c a s d ' a p p l i c a t i o n e n l i a i s o n a v e c d . ' a u t r e s n 6 t h o d e s d e m e s u r e s d e b i o m a s s e e t d ' a c t i v i t 6 "
R E r E n r n c E s B I B L I o c R A P H I o U E S
BARDTKE D. et TBOMANETZ E., 1976. Unter- suchungen zur Erfassung der Biomasse von Belebtschlamen durch quantitative Analy- se der Desoxyribonukleinsaue. Wassen/
Abuasser, Lt7, 45I-453.
BRocK T.D,, 1967. Bacterial growth rate in the sea : direct analysis by thlmidi- ne autoradiography. Science, 155, 81-83.
BRTNSCIIEDE H., mVE T.L. et BREMER H., 1977. Establistment of exponential growth after a nutritional shift-up ln Escheri- chia coli B/r r accumulation of deoxyribo- nucleic acid, ribonucleic acid ant pro- t e i n . / . B a c t e r i o L . , 1 2 9 , 1 0 2 0 - 1 0 3 3 .
BURII)N K., 1955. A study of the condition and nechanisn of the diphenylain reaction for the colorimetric estimtlon of deoxy- rLbonucleic acld. Biochetn., J,, 62,
J I } - J Z J .
BURTON K., 1968. Detemination of DNA concentration by diphenylanlne. Methods E n z y n o L . , L 2 B . 1 6 3 - 1 6 6 .
CLESCERT L.S. et DAZE M., 1975. Relations between microbial heterotrophic activity, organics and deoxyribonucleic acid in oligotrophic lake sediments. Veth.
fnte"nat. Venein. L*rmoL., 19, 974-9a1.
D f S C H E 2 . , 1 9 5 3 . C o l o r r e a c t i o n s o f nucleic acids comlpnenxs. fn : Ttle nucleic a c i d s , v o l . I , C H A R G A F F ( e d . ) . A c a d e m i c P r e s s , N e w - Y o r k , 2 8 6 - 2 9 0 .
FONWIEILLE D. et FEVC'ITE G., 1981. DNA content of the sedinent in relation to self - purification in streams polluted by organic wastes. Vez'h. fnternat. Vez,ein.
L * m o L . , 2 1 , 2 2 r - 2 2 6 -
F U H R M A N J . A . e t A Z A M F . , 1 9 8 0 . B a c t e r i o - plankton secondary production estinates for coastal waters of British Colunbia.
Antarctica and california. AppL. Entsiz,on.
M i c r o b i o L . , 3 9 , 1 0 8 s - 1 0 9 5 .
GENETELLI E. 1967. DNA and nitrogen rela- tionships in bulklng activated sludge.
J o u v n a L V . P . C . F . , 3 9 , p a r t 2 , R 3 2 - R 4 4 . HINEGARDNER R.I., 1971. An inproved fluo- rimetric assay for DNA. ArnLAst. Bioehan., 3 9 , 1 9 7 - 2 0 1 .
H O B B I E J . E . , H O L M - H A N S E N O . , P A C K A R D T . T . , P O M E R O Y t . R . , S H E L D O N R . W . , T H O M A S J . p . e t W I E B E W . J . , 7 9 7 2 . A s t u d y o f t h e d i s - tribution and activity of micro-organisns in ocean water. Linmol. Oceanogr., 17, 544-554 -
HOLM-EANSEN O.t 1973. Determination of total nicrobial bionass by measurenent of ATP. Ir1 .' Estuarine Microbiol. Ecolo- 9y., L.H. STEVENSON et R.R. COtrIfELL
( e d s ) . U n i v . S o u t h C a r o l i n a P r e s s , 7 3 - 8 9 . IIOLM-IIANSEN O., SUTCLIFFE,W.H. Jr et SIIARP J.. 1968. Measurenent of deoxyribo- nuclel-c acid ln the oceil and its ecolo- gical significance. Linmol, Oeeanogr., 1 3 , 5 0 7 - 5 1 4 .
rwAIituRA T., NAGAr H. et ICHIMURA S., 1970.
Inproved methods for determining contents of chlorophyll, protein, ribonucleic and deoxyribonuclelc acids ln planktonic popu- Iations. Int. Reo, ges. HAd?obioL., 55, 1 3 1 - 1 4 7 .
JONES J.c., 1977. The study of aquatic nlcrobial cmunities. Iz .. Aquatlc Micro- biology, F.A. SKINNER et J.M. SHEWAN
( e d s ) , A c a d e n l c P r e s s , L n d o n , 3 6 9 p ,
I(ARL D.l,t., 1979. Measurement of nj.crobial activity ild growth in the oceil by rates of stabl-e ribonucleic synthesls. /ppZ.
Erutiron. Microbiol., 38, 850-860.
K A R L D . M . , 1 9 8 1 . S t n u l t a e o u s r a t e s o f ribonucleic acid ild deoxyribonucleic acid slmtheses for estiEating growth and ceII divislon of aquatic microbl-al comunities. AppL- Enoinon. MictobioL,, 4 2 , 8 O 2 - 8 r 0 .
LESLIE L.. 1954. Ttre nuclelc acid content of tissues and cells. fn | lhe nucleic acids, vo1. II, CHARGAFF (ed.), Acadenic P r e s s , N e w - Y o r k , 1 - 4 4 .
MAEDA M. et TAGA N., 1974. Occurrence ild distribution of deoxyribonucleic acid hydrolyzing bacteria in sea water.
J . e . e p . n a v . B i o L . E c o L . , t 4 , t s 7 - 1 6 9 . M A R T I N D . F . e t C O N Z A L E S M . H . , 1 9 7 8 . Effects of salinity on synthesis of DNA, acidic trrcIysaccharide and growth in the blue-green algae Gonphosphae?ia 6 p o n i n a . W a , t . R e s , , l 2 t 9 5 1 - 9 5 5 , MUNRO H.N. et FLECK A., 1966. ltre deter- mination of nucleic acjd. Meth. Bioehem,, 1 4 , L L 3 - 1 7 6 -
N T E R I I C H D . P . , 1 9 7 8 . R e g u l a t i o n o f b a c t e - rial growth, RNA and protein synthesis- Reo. I,?icrobiol., 32, 393-432.
P A U L J . H . e t M E Y E R S B . , L 9 8 2 . F l u o r i m e - tric detemination of DNA in aquatic EicroorganisEs by use of HOECHST 33258.
A p p L . E n o i n o n . l t i c n o b i o l . , 4 3 , 1 3 9 3 - 1 3 9 9 . PRIrcI,ARD R.H., BARTH P.T. et COLLINS J., 1969. Control of DNA synthesis in bacte- tj-a, fn : Microbial growth, 19 th s)mp.
S o c . g e n . M i c r o b i o l . , C M b r l d g e U n i v e r s i - ty Press, Ipndon.
TAKAHASHI M., NAGAI H. YAIIAGUCHI Y. et ICHIMURA s., t974. ltre distribution of chlorophyll a, protein, RNA and DNA in the North Pacific Ocean. /. oceanoa?.
S o c . J a p d t , 3 0 , 1 3 7 - 1 5 0 .
WALTERS J.A., 1969. A study of lethal factors affecting change in the assaya- b1e DNA of Esche?i,chia coLi. senior Thesis, Rensselaer Polytechnic fnst.
Troy, New-York.
W E B B J . e t L E V Y H . 8 . , 1 9 5 6 . N e w d e v e l o p - nsts in the chenical detemination of nucleic acids. Meth. bioehan., 6.
YAI.IAGUCIII Y. et SEKI H., 1977. Microbial bionass in the eutrophic bay of Shinoda as cmpiled by estinations of several bionass parmeters. J. oceanog?. Soc.
Japan, 33. 3a-44.
