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Traçage flexible d'exécutions de programmes parallèles

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Academic year: 2021

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HAL Id: tel-00010555

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Submitted on 12 Oct 2005

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Traçage flexible d’exécutions de programmes parallèles

Cyril Guilloud

To cite this version:

Cyril Guilloud. Traçage flexible d’exécutions de programmes parallèles. Réseaux et télécommunica-

tions [cs.NI]. Institut National Polytechnique de Grenoble - INPG, 2004. Français. �tel-00010555�

(2)

INSTITUT NATIONAL POLYTECHNIQUE DE GRENOBLE

N°attribué par la bibliothèque /_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/

THÈSE

pour obtenir le grade de DOCTEUR DE L’INPG

Spécialité : “Informatique, Systèmes et Logiciels”

préparée au laboratoire Informatique et Distribution

dans le cadre de l’École Doctorale “Mathématiques, Sciences et Technologies de l’Information, Informatique”

présentée et soutenue publiquement par

Cyril Guilloud

Le 5 février 2004 Titre :

Traçage flexible d’exécutions de programmes parallèles

Directeur de thèse : Brigitte Plateau

Co-directeur : Jacques Chassin de Kergommeaux

JURY

M. Andrzej Duda

Président

M. José C. Cunha

Rapporteur

M. Bertil Folliot

Rapporteur

M me

Brigitte Plateau

Examinatrice

M. Jaques Chassin de Kergommeaux

Examinateur

M me

Pasale Rossé-Laurent

Examinatrice

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(6)

bien voulu examiner e travail. Je suis très reonnaissant à Andrzej Duda d'avoir

aepté de présider lejury, à José Cuhna etBertil Folliotpour leurs ommentaires

avisés sur e manusrit et à Pasale Rossé pour avoir suivi e travail au ours des

trois dernières années. Jedois aussi de partiuliers remeriementà BrigittePlateau

pour m'avoir permis d'eetuer ette thèse et pour son enadrement lors de mon

DEA.

Jaques Chassin de Kergommeaux à été un direteur de thèse partiulièrement

attentif à tous les aspets tehniques et rédationnels de ette thèse. Ses onseils

toujours pertinents(bien queje lelesaipas toujours suivis...),sadisponibilitéetsa

patiene pour les nombreuses reletures du manusrit ont permis de mener à bien

ette thèse.

DenombreuxaspetstehniquesdutravailprésentéiidoiventbeauoupàJaques

Briat, je l'en remerie vivement. Je tiens àsaluer également : tous les membres du

laboratoireID, Philippe Waille,Jean-Mar, Thierry, PhilippeAugerat, Jean-Louis,

Denis etDenis,Bruno, Olivier, Guillaume,ave une mentionspéialepour Grégory

dont ladisponibilitéetla apaité àrésoudre tous lesproblèmes sontun atout pré-

ieux; tous les thésards du laboratoire, PF, Georges, Bruno, Remi, Cyrille, Anne,

Corine,Florene,Emmanuel(s),Mauriio,Jésus,Renaud,Gustavoettouslesautres;

Šukasz pour les longues disussions politiques et religieuses qui ont pimentées es

trois ans;lesstagiairesquej'aienadréave beauoup de plaisir(Xiaoyan,Vinent,

Alaa); les assistantes Hélène, Marion et Anne-Laure pour leur talent à vainre les

imbrogliosadministratifsrelatifsaux diverses missions eetuées.

L'éradiation d'un très grand nombre de fautes d'orthographe, de grammaire et

de français est à porter au rédit des reletures attentives de Myriam, André et

Aline.

Cettethèseaétéunlongparours,etettedernièreannéepartiulièrementéprou-

vante, 'est pourquoije tiensà remerier très haleureusement toutes les personnes

qui m'ont aidées plus ou moins diretement sur un plan plus personnel que teh-

nique àen arriverauterme:toutd'abordmafamilleetnosamis pour leurprésene

et leur soutient et que je ne pourrait susamment remerier ii; et pour nir, un

grand meri à tous mes amis : tout d'abord à Franis, qui, malgré ses goûts musi-

aux etinématographiquespartiulièrementéletiques futun oloatairedes plus

agréables etpuisàtouslesautres,Cathy,Grégoire,Magali,Pierre(Bontron etNey-

ron), Aline,Manu, Erwan, Marion, tous lesOliviers (Guyotot, Cinquin, Mansiot et

Maury), Matthieu,Margueritte,Karim,Carole,Remi,Jean-Gilles,Tanguy,Pauline,

Romain, Sophie,Sylvia, Jean-Christophe, Magali, Éri(et Bastien).

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I Introdution 1

I.1 Le parallélisme. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1

I.2 Le laboratoireInformatique et Distribution(ID-Imag) . . . . . . . . 1

I.3 Contribution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2

I.4 Organisation de e doument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4

II Mise au point de programmes parallèles 7 II.1 Intérêts etontraintes du parallélisme . . . . . . . . . . . . . . . . . 7

II.2 Les grappes de PC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8

II.3 Utilisation eae de grappes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10

II.4 Débogagedes logiiels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11

II.4.1 Débogagepour laorretion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13

II.4.2 Débogagepour lesperformanes. . . . . . . . . . . . . . . . . 14

II.4.2.1 Estimationdesperformanes . . . . . . . . . . . . . . . 14

II.4.2.2 Comparaisondes performanes . . . . . . . . . . . . . . 15

II.4.2.3 Reherhe etorretion de problèmesde performane . . 15

II.5 Observation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17

II.5.1 Pourquoi observer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17

II.5.2 Observation en ligne oupost mortem . . . . . . . . . . . . . . 18

II.6 Conlusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19

III Tehniques d'observation et de ollete de données 21 III.1 Tehniques d'observation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21

III.1.1 Surveillane (monitoring) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21

III.1.1.1 Surveillanesystème etréseau . . . . . . . . . . . . . . 23

III.1.1.2 Surveillanematérielle . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23

III.1.2 Débogage interatif . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24

III.1.3 Génération d'indiateursstatistiques . . . . . . . . . . . . . . 25

III.1.4 Prolage(proling) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25

(9)

III.1.5 Observation omportementale . . . . . . . . . . . . . . . . . 26

III.2 Colletede données . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26

III.2.1 Éhantillonnage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27

III.2.2 Chronométrage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27

III.2.3 Comptage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28

III.2.3.1 Lesompteurs matérielsde performane . . . . . . . . . 28

III.2.4 Traçageévénementiel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31

III.2.4.1 Traçage matériel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32

III.2.4.2 Traçage hybride . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33

III.2.4.3 Traçage logiiel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34

III.2.5 Comparaisonsdes tehniques . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34

III.3 Instrumentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35

III.3.1 Tehniques d'instrumentation. . . . . . . . . . . . . . . . . . 36

III.3.2 Instrumentationdu binaireexéutable . . . . . . . . . . . . . 36

III.3.3 Instrumentationdynamique à l'exéution . . . . . . . . . . . 37

III.3.4 Utilisationd'une bibliothèque instrumentée . . . . . . . . . . 37

III.3.5 Instrumentationdu ode soure . . . . . . . . . . . . . . . . 38

III.3.5.1 Instrumentation automatique . . . . . . . . . . . . . . 38

III.3.5.2 Instrumentation manuelle . . . . . . . . . . . . . . . . 39

III.4 Fontionsd'enregistrement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39

III.4.1 Rledes fontions d'enregistrement . . . . . . . . . . . . . . 40

III.4.2 Eaité de l'enregistrement . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40

III.4.3 Ativation /désativation du traçage . . . . . . . . . . . . . 40

III.5 Conlusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42

IV Interprétation des observations 43 IV.1 Rledes outilsde représentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43

IV.2 Caratéristiques des tehniques de représentation de données . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44

IV.2.1 Salabilité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45

IV.2.2 Interativité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45

IV.2.3 Observation multi-niveaux . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46

IV.2.4 Flexibilité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47

IV.3 Représentation des données . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48

(10)

IV.3.2 Indiateurs globaux . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49

IV.3.3 Représentation graphique 2D . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50

IV.3.4 Troisdimensions etréalité virtuelle . . . . . . . . . . . . . . 51

IV.3.5 Représentation sonore . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51

IV.4 Conlusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52

V Outils d'observation 53 V.1 Systèmes d'observation logiielsexistants. . . . . . . . . . . . . . . . 53

V.1.1 VampirVampirTrae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53

V.1.2 Tau . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54

V.1.3 SvPablo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57

V.1.4 Xmpi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59

V.2 Pajé . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60

V.2.1 Ahage / Visualisation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60

V.2.2 Interativité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61

V.2.2.1 Ahage desidentiants . . . . . . . . . . . . . . . . . 62

V.2.2.2 Inspetion. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62

V.2.3 Salabilité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64

V.2.3.1 Filtrage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64

V.2.3.2 Agrégation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65

V.2.3.3 Zoom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65

V.2.4 Génériité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66

V.2.5 Format Pajé . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67

V.2.5.1 Desriptiondu format . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67

V.2.5.2 Modèle de visualisation . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68

V.2.5.3 Instaniationde lahiérarhie . . . . . . . . . . . . . . . 69

V.2.5.4 Événements de l'exéution . . . . . . . . . . . . . . . . 70

V.3 Conlusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70

VI Traçage exible 73 VI.1 Flexibilitédu traçage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73

VI.2 Dénitiondes événements. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75

VI.3 Lesformats de trae. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76

VI.3.1 Tailledes traes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77

VI.3.2 Exploitationdes traes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78

(11)

VI.3.2.1 Utilisationd'unformat de trae standard . . . . . . . . 78

VI.3.2.2 Conversions entre formatsde trae. . . . . . . . . . . . 79

VI.3.2.3 Génériité desformats detrae . . . . . . . . . . . . . 80

VI.4 Distintion des formats . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81

VI.4.1 Format brut . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81

VI.4.1.1 Enregistrement desévénements . . . . . . . . . . . . . 82

VI.4.1.2 Releture desévénements . . . . . . . . . . . . . . . . 83

VI.4.2 Format élaboré . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84

VI.4.3 Conversion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84

VI.4.3.1 Règlesde réériture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85

VI.5 Manipulation des traes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86

VI.5.1 Colletedes traes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86

VI.5.2 Filtrage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86

VI.5.3 Agrégationde données . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87

VI.5.4 Tri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88

VI.6 Conlusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88

VII Validation expérimentale 91 VII.1 Conguration etinstrumentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91

VII.1.1 Observation d'Athapasan . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92

VII.1.2 Dénition des événements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93

VII.1.3 Instrumentation. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94

VII.1.4 Exéutionet génération des traes . . . . . . . . . . . . . . 95

VII.2 Conguration de laonversion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96

VII.2.1 Modèle graphique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96

VII.2.2 Règles de réériture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96

VII.3 Visualisation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99

VII.4 Conlusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100

VIIIConlusion et perspetives 103

Bibliographie 109

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