Weekly epidemiological record Relevé épidémiologique hebdomadaire

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Weekly epidemiological record

Relevé épidémiologique hebdomadaire

26 MARCH 2021, 96th YEAR / 26 MARS 2021, 96^e ANNÉE No 12, 2021, 96, 89–104

http://www.who.int/wer

2021, 96, 89–104 No 12

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Contents

89 Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza A viruses and development of candidate vaccine viruses for pandemic preparedness

Sommaire

89 Caractéristiques génétiques et antigéniques des virus grippaux A zoonotiques et mise au point de virus vaccinaux candidats pour se préparer à une pandémie

Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza A viruses and development of candidate vaccine viruses for

pandemic preparedness

March 2021

The development of influenza candidate vaccine viruses (CVVs), coordinated by WHO, remains an essential component of the overall global strategy for influenza pandemic preparedness.

Selection and development of CVVs are the first steps towards timely vaccine production and do not imply a recom- mendation for initiating manufacture.

National authorities may consider the use of ≥1 of these CVVs for pilot lot vaccine production, clinical trials and other pandemic preparedness purposes based on their assessment of public health risk and need.

Zoonotic influenza viruses continue to be identified and evolve both genetically and antigenically, leading to the need for additional CVVs for pandemic preparedness purposes. Changes in the genetic and antigenic characteristics of these viruses relative to existing CVVs and their potential risks to public health justify the need to select and develop new CVVs.

This document summarizes the genetic and antigenic characteristics of recent zoonotic influenza viruses and related viruses circulating in animals¹ that are relevant to CVV updates. Institutions interested in receiving these CVVs should contact WHO at [email protected] or

1 For information relevant to other notifiable influenza virus infections in animals refer to http://www.who.int/influenza/

vaccines/virus/candidates_reagents/home/en/

Caractéristiques génétiques et antigéniques des virus grippaux A zoonotiques et mise au point de virus vaccinaux candidats pour se préparer à une pandémie

Mars 2021

La mise au point de virus grippaux vaccinaux candidats, sous la coordination de l’OMS, demeure une composante essentielle de la stratégie mondiale globale de préparation aux pandémies de grippe.

La sélection et la mise au point de virus vaccinaux candidats représentent les premières étapes vers la production en temps utile des vaccins, mais n’impliquent pas qu’il soit recommandé d’en démarrer la fabrication. Les autorités nationales peuvent envisager d’utili- ser un ou plusieurs de ces virus vaccinaux candidats pour la production de lots pilotes de vaccins, la réalisation d’essais cliniques et d’autres activités de préparation aux pandé- mies, selon leur évaluation des risques et des besoins en matière de santé publique.

Des virus grippaux zoonotiques continuent d’être identifiés et présentent une évolution à la fois génétique et antigénique, d’où la néces- sité de disposer de virus vaccinaux candidats supplémentaires pour se préparer à une éven- tuelle pandémie. Compte tenu de l’évolution des caractéristiques génétiques et antigéniques de ces virus par rapport aux virus vaccinaux candidats existants et des risques potentiels qui en résultent pour la santé publique, il est essen- tiel que de nouveaux virus vaccinaux candidats soient sélectionnés et mis au point.

Le présent document fournit un récapitulatif des caractéristiques génétiques et antigé- niques des virus grippaux zoonotiques récem- ment isolés, ainsi que des virus apparentés qui circulent chez l’animal¹ et qui présentent un intérêt pour l’actualisation des virus vaccinaux candidats. Les institutions souhaitant

1 Pour toute information relative aux autres infections grippales à noti- fier chez l’animal, consulter: http://www.who.int/influenza/vaccines/

virus/candidates_reagents/home/en/

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90 WEEKLY EPIDEMIOLOGICAL RECORD, NO 12, 26 MARCH 2021

the institutions listed in announcements published on the WHO website.²

Influenza A(H5)

Since their emergence in 1997, highly pathogenic avian influenza (HPAI) A(H5) viruses of the A/goose/Guang- dong/1/96 haemagglutinin (HA) lineage have become enzootic in some countries, have infected wild birds and continue to cause outbreaks in poultry and sporadic human infections. These viruses have diversified genetically and antigenically, leading to the need for multiple CVVs. Notably, H5 viruses have been detected paired with a variety of neuraminidase (NA) gene segments (N1, N2, N3, N4, N5, N6, N8 or N9). This summary provides updates on the characterisation of A/goose/

Guangdong/1/96-lineage A(H5) viruses and the status of the development of influenza A(H5) CVVs.

Influenza A(H5) activity from 1 October 2020 to 3 March 2021

Fourteen human infections with A/goose/

Guangdong/1/96-lineage viruses were reported in this period. Since 2003, there have been 7 A(H5N8), 30 A(H5N6) and 862 A(H5N1) human infections reported.

A/goose/Guangdong/1/96-lineage A(H5) viruses were detected in domestic and wild birds in many countries since September 2020 (Table 1).

Antigenic and genetic characteristics of influenza A(H5) viruses

The nomenclature for phylogenetic relationships among the HA genes of A/goose/Guangdong/1/96-lineage A(H5) viruses is defined in consultation with representatives of WHO, the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO), the World Organisation for Animal Health (OIE) and academic institutions.³ A(H5) viruses circulating and/or characterized from 1 October 2020 to 3 March 2021 belong to the following clades:

Clade 2.3.2.1a viruses were detected in poultry in Bangladesh. Viruses tested were similar genetically to A/duck/Bangladesh/17D1012/2018, for which a CVV is in development, but reacted poorly with a post-infection ferret antiserum raised against this virus. Analyses of further viruses from Bangladesh is underway to determine the need for additional CVVs.

Clade 2.3.2.1c viruses were detected in poultry in Cambodia and in poultry and a human in Lao People’s Democratic Republic. The human virus was similar genetically to viruses detected in poultry in the region in recent years and reacted well with post-infection ferret antiserum raised against the A/duck/Vietnam/

NCVD-1584/2012 CVV. The antigenic characterisation of recent viruses from Cambodia is ongoing.

2 See http://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/Wahidhome/Home

3 See http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/irv.12324/epdf

recevoir ces virus vaccinaux candidats devront prendre contact avec l’OMS, à l’adresse [email protected], ou avec les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.²

Grippe A(H5)

Depuis leur émergence en 1997, des virus de la grippe aviaire A(H5) hautement pathogènes contenant le gène de l’hémagglu- tinine (HA) de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 sont devenus enzootiques dans certains pays, ont infecté des oiseaux sauvages et continuent de provoquer des flambées chez la volaille, ainsi que des infections sporadiques chez l’homme. Ces virus se sont diversifiés sur le plan génétique et antigénique, ce qui a imposé de mettre au point plusieurs virus vaccinaux candidats. En particulier, on a détecté des virus H5 présentant divers segments du gène de la neuraminidase (NA) (N1, N2, N3, N5, N6, N8 ou N9). Le présent résumé fait le point sur la caractérisation des virus A(H5) de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 et sur l’état d’avancement de la mise au point des virus candidats devant entrer dans la composition d’un vaccin contre la grippe A(H5).

Activité de la grippe A(H5) entre le 1^er octobre 2020 et le 3 mars 2021

Quatorze infections humaines par des virus de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 ont été notifiées pendant cette période.

Depuis 2003, on a recensé 7 infections humaines par des virus A(H5N8), 30 par des virus A(H5N6) et 862 par des virus A(H5N1).

Des virus A(H5) de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 ont été détectés chez des oiseaux domestiques et sauvages dans plusieurs pays depuis septembre 2020 (Tableau 1).

Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux A(H5)

La nomenclature des liens de parenté phylogénétiques existant entre les gènes HA des virus A(H5) de la lignée A/goose/

Guangdong/1/96 est définie en consultation avec des représen- tants de l’OMS, de l’Organisation des Nations Unies pour l’ali- mentation et l’agriculture (FAO), de l’Organisation mondiale de la santé animale (OIE) et d’établissements universitaires.³ Les virus A(H5) qui circulaient et/ou qui ont été caractérisés entre le 1^er octobre 2020 et le 3 mars 2021 appartenaient aux clades suivants:

Clade 2.3.2.1a: Des virus de ce clade ont été détectés chez des volailles au Bangladesh. Les virus testés étaient génétiquement analogues à la souche A/duck/Bangladesh/17D1012/2018, pour laquelle un virus vaccinal candidat est en cours de développement, mais présentaient une réaction médiocre avec des antisérums de furet postinfection dirigés contre ce virus. L’analyse d’autres virus issus du Bangladesh est en cours pour déterminer si des virus vaccinaux candidats supplémentaires sont nécessaires.

Clade 2.3.2.1c: Des virus de ce clade ont été détectés chez des volailles au Cambodge, ainsi que chez des volailles et chez un cas humain en République démocratique populaire lao. Le virus humain, qui était génétiquement semblable aux virus détectés chez la volaille dans la région ces dernières années, a bien réagi avec un antisérum de furet postinfection dirigé contre le virus vaccinal candidat dérivé de la souche A/duck/Vietnam/NCVD- 1584/2012. La caractérisation antigénique des virus récemment détectés au Cambodge est en cours.

2 Voir http://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/Wahidhome/Home/index/newlang/fr

3 Voir http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/irv.12324/epdf

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RELEVÉ ÉPIDÉMIOLOGIQUE HEBDOMADAIRE, N^o 12, 26 MARS 2021 91 Table 1 A(H5) activity reported to international agencies since September 2020

Tableau 1 Activité de la grippe A(H5) signalée aux agences internationales depuis septembre 2020

Country, area or territory – Pays, zone ou territoire Host – Hôte Genetic clade a (subtype)^a – Clade génétique (sous-type)^a

Afghanistan Poultry – Volaille Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Algeria – Algérie Poultry – Volaille Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Austria – Autriche Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Bangladesh Poultry – Volaille 2.3.2.1a (H5N1)

Belgium – Belgique Wild birds – Oiseaux sauvages

Poultry – Volaille

Unknown (H5) – Inconnu (H5); 2.3.4.4b (H5N8)

2.3.4.4b (H5N8); Unknown (H5N5) – Inconnu (H5N5)

Bulgaria – Bulgarie Poultry – Volaille Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Cambodia – Cambodge Poultry – Volaille 2.3.2.1c (H5N1)

China – Chine Human (6)^b – Humain (6)^b

Poultry/environmental – Volaille/

Environnemental Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4h; Unknown (H5N6) – Inconnu (H5N6) 2.3.4.4h (H5N6); 2.3.2.1f (H5N1) Unknown (H5N6/N8) – Inconnu (H5N6/N8);

2.3.4.4b (H5N8) China, Hong Kong SAR – Chine, Hong Kong RAS Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Taiwan, China – Taïwan, Chine Poultry – Volaille

Wild birds – Oiseaux sauvages

Unknown (H5N2/5) – Inconnu (H5N2/5) Unknown (H5) – Inconnu (H5)

Croatia – Croatie Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N8)

Czechia – Tchéquie Poultry – Volaille

2.3.4.4b (H5N8) 2.3.4.4b (H5N8)

Denmark – Danemark Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N5/N8) 2.3.4.4b (H5N8)

Estonia – Estonie Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Finland – Finlande Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

France Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N8); Unknown (H5N3) – Inconnu (H5N3)

2.3.4.4b (H5N5/8)

Georgia – Géorgie Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Germany – Allemagne Wild birds – Oiseaux sauvages

Unknown (H5N/x/1/3/4) – Inconnu (H5N/x/1/3/4); 2.3.4.4b (H5N5/8)

2.3.4.4b (H5N5/8)

Hungary – Hongrie Wild birds – Oiseaux sauvages

Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8) Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

India – Inde Poultry – Volaille

Unknown (H5N1/8) – Inconnu (H5N1/8) – Inconnu (H5N1/8)

2.3.4.4b (H5N8); 2.3.4.4b (H5N1) Iran (Islamic Republic of) – Iran (République islamique d’) Wild birds – Oiseaux sauvages

Iraq Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N8)

Ireland – Irlande Wild birds – Oiseaux sauvages

Unknown (H5N3) – Inconnu (H5N3);

2.3.4.4b (H5N8) 2.3.4.4b (H5N8)

Israel – Israël Wild birds – Oiseaux sauvages

Italy – Italie Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N1/5/8) Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Japan – Japon Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N8) 2.3.4.4b (H5N8)

Kazakhstan Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N8) 2.3.4.4b (H5N8)

Kuwait – Koweït Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N8)

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Clade 2.3.2.1f viruses were detected in environmental samples collected in live poultry markets in China.

These viruses had HAs showing greatest similarity to those of viruses detected in China in 2015 and had 7 HA1 amino acid substitutions compared to A/chicken/

Ghana/20/2015, the clade 2.3.2.1f recommended CVV.

Clade 2.3.4.4b viruses were detected in poultry and/or wild birds in Belgium, Croatia, Czechia, Denmark, France, Germany, India, Iraq, Ireland, Italy, Japan, Kazakhstan, Republic of Korea, Kuwait, the Netherlands, Norway, Poland, the Russian Federation, Sweden and the United Kingdom. The majority of clade 2.3.4.4b virus HAs belonged to 1 of 2 phylogenetic groups (Figure 1) consisting of one group of viruses detected in Europe

Country, area or territory – Pays, zone ou territoire Host – Hôte Genetic clade a (subtype)^a – Clade génétique (sous-type)^a Lao People’s Democratic Republic – République démocratique

populaire lao Human (1) – Humain (1)

2.3.2.1c (H5N1) Unknown (H5N1) – Inconnu (H5N1)

Latvia – Lettonie Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Lithuania – Lituanie Wild birds – Oiseaux sauvages

Nepal – Népal Poultry – Volaille Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Netherlands – Pays-Bas Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N1/5/8) 2.3.4.4b (H5N1/8)

Nigeria – Nigéria Poultry – Volaille Unknown (H5N1) – Inconnu (H5N1)

Norway – Norvège Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N8) 2.3.4.4b (H5N8)

Poland – Pologne Poultry – Volaille

2.3.4.4b (H5N8) 2.3.4.4b (H5N5/8) Republic of Korea – République de Corée Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N8) 2.3.4.4b (H5N8)

Romania – Roumanie Poultry – Volaille

Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8) Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8) Russian Federation – Fédération de Russie Wild birds – Oiseaux sauvages

Poultry – Volaille Human (7) – Humain (7)

2.3.4.4b (H5N8) 2.3.4.4b (H5N5/8) 2.3.4.4b (H5Nx/N8)^c

Saudi Arabia – Arabie Saoudite Poultry – Volaille Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Senegal – Sénégal Poultry – Volaille

Slovakia – Slovaquie Poultry – Volaille

Unknown (H5N5/8) – Inconnu (H5N5/8) Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Slovenia – Slovénie Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N5/8) – Inconnu (H5N5/8)

Spain – Espagne Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Sweden – Suède Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N5/8) 2.3.4.4b (H5N5/8)

Switzerland – Suisse Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N4) – Inconnu (H5N4)

Ukraine Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N8)

United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland – Royaume-Uni

de Grand-Bretagne et Irlande du Nord Wild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N1/2/3/5/8) 2.3.4.4b (H5N1/8)

Viet Nam Poultry – Volaille Unknown (H5N1) – Inconnu (H5N1);

2.3.4.4h (H5N6)

a Using proposed update to the unified nomenclature for highly pathogenic avian influenza A(H5) viruses. – Selon la mise à jour proposée de la nomenclature unifiée des virus aviaires A(H5) hautement pathogènes.

b Number of reported human cases. – Nombre de cas humains signalés.

c Final confirmation of clade designation is pending for 6 of the 7 reported cases. – La confirmation finale de l’appellation du clade est en attente pour 6 des 7 cas signalés.

Table 1 (continued) – Tableau 1 (suite)

Clade 2.3.2.1f: Des virus de ce clade ont été détectés dans des échantillons environnementaux provenant de marchés de volailles vivantes en Chine. Les gènes HA de ces virus présentaient le plus haut degré de parenté avec les virus détectés en Chine en 2015 et étaient porteurs de 7 substitutions d’acides aminés au niveau de la sous-unité HA1 par rapport à la souche A/chicken/Ghana/20/2015, le virus vaccinal candidat recommandé pour le clade 2.3.2.1f.

Clade 2.3.4.4b: Des virus de ce clade ont été détectés chez des volailles et/ou des oiseaux sauvages dans les pays suivants: Alle- magne, Belgique, Croatie, Danemark, Fédération de Russie, France, Inde, Iraq, Irlande, Italie, Japon, Kazakhstan, Koweït, Norvège, Pays- Bas, Pologne, République de Corée, République tchèque, Royaume- Uni et Suède. Les gènes HA de la plupart de ces virus de clade 2.3.4.4b appartenaient à l’un des 2 groupes phylogénétiques suivants (Figure 1): un groupe constitué de virus détectés en

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RELEVÉ ÉPIDÉMIOLOGIQUE HEBDOMADAIRE, N^o 12, 26 MARS 2021 93 Figure 1 Phylogenetic relationships of A(H5) clade 2.3.4.4 haemagglutinin genes

Figure 1 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine des virus grippaux A(H5) appartenant au clade 2.3.4.4

The available candidate vaccine viruses appear in red. The proposed vaccine candidate is indicated by (•); all human viruses are in bold font. The viruses collected in years 2020 et 2021 are in blue. The viruses tested in haemagglutination inhibition assay are indicated by hashes (#). NA subtypes other than N1 are specified. The tree was built from the nucleotide sequences coding for the mature HA1 protein. The scale bar represents the number of substitutions per site. Bootstrap supports of topology are shown above selected nodes. – Les virus vaccinaux candidats disponibles apparaissent en rouge. Le vaccin candidat proposé est indiqué par (•); tous les virus humains sont indiqués en caractères gras. Les virus collectés au cours de 2020 et 2021 sont indiqués en bleu. Les virus testés au moyen de l’épreuve d’inhibition de l’hémagglutination sont indiqués par le symbole (#). Les sous-types de NA autres que N1 sont spécifiés.

L’arbre a été constitué à partir des séquences nucléotidiques codant pour la protéine mature HA1. La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site. Les valeurs de boostrap supportant la topologie de l’arbre sont indiquées au-dessus des nœuds sélectionnés.

0.02

A/chicken/Vietnam/NCVD-15A59/2015 A/chicken/Laos/LPQ001/2014

A/whooper_swan/Shanxi/4/2020 (N8)

A/Whooper_swan/Xinjiang/1/2020

A/turkey/Rostov-on-Don/332-10/2021 (N8) #

A/chicken/Vietnam/Raho4-Cd-19-7446/2019

A/duck/Jiangsu/m234/2012 (N2)

A/duck/Bangladesh/43129/2020

A/goose/Shandong/k1204/2009 (N5)

A/environment/Chongqing/38172/2016

A/steamer_duck/Germany-SN_AI00346/2020 (N8)

A/environment/Xinjiang/27739/2015 (N9)

A/common_gull/Saratov/1676/2018

A/goose/Omsk/0002/2020 (N8) # A/Guangxi/13486/2017

A/chicken/Vietnam/Raho6-19-18283/2019

A/Eurasian_wigeon/Italy/20VIR7301-362/2020 (N8) A/turkey/Stavropol/320-03/2020 (N8) #

A/Guangdong/18SF020/2018

A/chicken/Vietnam/NCVD-17A224/2016

A/peregrine_falcon/Ireland/20VIR7872-1/2020 (N8) A/wild_duck/Korea/H331/2020 (N8) A/environment/Fujian/28686/2016

A/duck/Vietnam/NCVD-17A231/2016

A/environment/Anhui/01578/2016 (N2)

A/breeder_duck/Korea/Gochang1/2014 (N8)

A/goose/Taiwan/0161/2016 (N8) A/duck/Vietnam/Raho6-17-316/2017

A/chicken/Kostroma/1717/2017 (N2) A/Anhui/33162/2016

A/Environment/Chongqing/12680/2020

A/Hubei/29578/2016

A/chicken/Rostov-on-Don/308-02/2020 (N8) # A/duck/Vietnam/NCVD-H5C18LS58/2018

A/oriental_magpie_robin/Hong_Kong/6154/2015

A/wigeon/Sakha/1/2014 (N8) #

A/Chongqing/00013/2021

A/environment/Kamchatka/18/2016 (N5) #

A/Guangxi/32797/2018

A/Hunan/55555/2016

A/chicken/Sergiyev_Posad/38/2017 (N8) #

A/Environment/Guangdong/33285/2018

A/buzzard/Germany-MV_AI02166/2020 (N5) A/environment/Chongqing/36534/2017

A/duck/Vietnam/Raho6-18-05/2018

A/Sichuan/26221/2014

A/chicken/Nghe_An/27VTC/2018 #

A/chicken/Sweden/SVA161122KU0453/SZ0209317/2016 (N8) A/Gallus_gallus/Belgium/12168_002/2020 (N5) A/duck/Taiwan/1702004/2017

A/chicken/Romania/20VIR357/2020 (N8)

A/Anhui/2021-00011/2020

A/goose/Omsk/0114/2020 (N8) #

A/chicken/England/043315/2020 (N1) A/muscovy_duck/Vietnam/LBM631/2014 (N1)

A/mute_swan/Netherlands/20015931-001/2020 (N8)

A/Mandarin_duck/Korea/H242/2020 (N8)

A/Environment/Chongqing/12642/2020 A/environment/Guangdong/35460/2017

A/Hunan/30727/2016

A/Jiangsu/32888/2018

A/chicken/Egypt/N13732A/2017 #

A/domestic_duck/Poland/263/2020 (N8) A/chicken/Kostroma/304-03/2020 (N8)

A/chicken/Tyumen/302-01/2020 (N8) #

A/duck/Laos/XBY118/2015

A/Ostrich/South_Africa/S2017_08_0046_P2/2017 (N8)

A/Environment/Yunnan/13709/2020

A/chicken/Sichuan/J1/2014

A/Turkey/Sweden/SVA201114SZ0001_20KN303106/2020 (N8) A/Guangxi/55726/2016

A/mallard/Korea/W452/2014 (N8)

A/mute_swan/North_Ossetia-Alania/325-02/2020 (N8) A/chicken/Vietnam/NCVD-18A99/2017

A/Yunnan/44625/2015

A/duck/Bangladesh/19D851/2017 (N6)

A/duck/Hebei/3/2011 (N2)

A/duck/Hungary/1565/20VIR749-2/2020 (N8)

A/duck/Guangdong/wy24/2008 (N5)

A/chicken/Rostov-on-Don/766/2018 (N8) #

A/duck/Guangdong/wy11/2008 (N5)

A/chicken/Dongguan/1250/2018

A/turkey/Rostov-on-Don/332-08/2021 (N8) #

A/Grey-Headed_Gull/Uganda/200144/2017 (N8) # A/tufted_duck/Denmark/17740-1wp1/2016 (N8) #

A/duck/India/10CA01/2016 (N8)

A/chicken/Tokushima/1T/20200 (N8) A/barnacle_goose/Denmark/14138-1/2020 (N8)

A/turkey/Poland/475/2020 (N8) A/Astrakhan/3212/2020 (N8) #

A/Environment/Chongqing/12637/2020 A/Environment/Chongqing/12679/2020

A/environment/Sichuan/32310/2016

A/chicken/China/AH/2012 (N1)

A/chicken/Japan/AQ-HE144/2015

A/chicken/Kostroma/1718/2017 (N2) # A/goose/Zhejiang/925104/2014 (N8)

A/Shenzhen/1/2016

A/duck/Jiangxi/X2346/2018 A/Jiangsu/13616/2020

A/chicken/Dong_Nai/25437VTC/2019 #

A/chicken/Czech_Republic/1175-1/2020 (N8) A/goose/Eastern_China/L1214/2012

A/duck/Hyogo/1/2016

A/great_crested_grebe/Tyva/34/2016 (N8) # A/chicken/Korea/HN1/2016

A/duck/Beijing/FS01/2014 (N8)

A/chicken/Krasnodar/334-03/2021 (N8) #

A/chicken/Iraq/1/2020 (N8)

A/chicken/Krasnodar/334-02/2021 (N8) # A/environment/Chongqing/22875/2016

A/American_green-winged_teal/Washington/195750/2014 (N1) A/duck/Guizhou/2771/2018

A/northern_pintail/Hokkaido/M13/2020 (N8)

A/Guangxi/31906/2018

A/chicken/Rostov-on-Don/308-03/2020 (N8) # A/domestic_goose/Kazakhstan_1-261_2-20-B/2020 (N8) A/environment/Hunan/10177/2016

A/duck/Taiwan/18060007/2018 (N2) A/pigeon/Sichuan/NCXN29/2014

A/chicken/Vietnam/NCVD-14-A324/2014

A/chicken/France/20P016448/2020 (N8)

A/Eurasian_wigeon/Netherlands/1/2016 (N8)

A/duck/Vietnam/NCVD-15-A18/2015

A/duck/Vietnam/Raho3-20As89/2020

A/chicken/Astrakhan/321-05/2020 (N8) # A/gyrfalcon/Washington/41088-6/2014 (N8) #

A/Fujian-Sanyuan/21099/2017 #

A/duck/Guangxi/1932/2018

A/mute_swan/Shimane/3211A001/2017

A/chicken/Vietnam/Raho6-19-21077/2019

A/Crow/India/12CA06/2020 (N8)

2.3.4.4h

2.3.4.4f

2.3.4.4g

2.3.4.4c

2.3.4.4b 2.3.4.4a

2.3.4.4d 2.3.4.4e

99

71

98 93

96 80 82 84

99 84

97

99

99 100

100 100 100

100

100 100

100

(6)

in early 2020 and viruses detected in Asia in late 2020, and the other consisting of viruses from the Middle East, Kazakhstan and the Russian Federation, together with European strains from the last quarter of 2020.

These 2 phylogenetic groups were also antigenically distinct demonstrating antigenic diversity when representative avian viruses were tested with post-infection ferret antisera raised against the A(H5N6) A/Fujian- Sanyuan/21099/2017 CVV (Tables 2 and 3). Although A(H5N1), A(H5N2), A(H5N3), A(H5N4), and A(H5N5) 2.3.4.4b viruses were detected in this period, most of the viruses identified in poultry were of the A(H5N8) subtype. Seven human cases of A(H5) virus infection in workers on a farm in the Russian Federation are under investigation following an A(H5N8) virus poultry outbreak. To date, for the investigated human cases, one virus (A/Astrakhan/3212/2020) has been confirmed as A(H5N8) clade 2.3.4.4b. This virus and those from poultry were nearly identical and were closely related to other clade 2.3.4.4b viruses detected in poultry and wild birds in other parts of Eurasia during this reporting period (Figure 1). The HA of A/Astrakhan/3212/2020 differed by no more than 3 amino acids from that of viruses detected in the Russian Federation, during 2016,

Table 2 Haemagglutination inhibition a assay of clade 2.3.4.4 influenza viruses

Tableau 2 Épreuves d’inhibition de l’hémagglutination a obtenues avec les virus grippaux appartenant au clade 2.3.4.4

Subtype – Sous-type Clade A/gyrfalcon/Wash- ington/41088/2014 RG43A A/chicken/Sergiyev Posad/38/ 2017 A/chicken/Kostro- ma/1718/2017 A/goose/ Omsk/0114/2020 A/chicken/Dong Nai/25437VTC/2019 A/chicken/Nghe An/27VTC/2018

Reference antigens – Antigènes de référence

A/gyrfalcon/Washington/41088/2014 RG43A H5N8 2.3.4.4c 10 <10 <10 <10 <10 <10

A/wigeon/Sakha/1/2014 H5N8 2.3.4.4c 320 40 80 80 20 <10

A/chicken/Sergiyev Posad/38/ 2017 H5N8 2.3.4.4b 40 20 40 40 <10 <10

A/chicken/Kostroma/1718/2017 H5N2 2.3.4.4b 10 <10 80 <10 <10 <10

A/goose/Omsk/0002/2020 H5N8 2.3.4.4b 20 20 <10 20 <10 <10

A/goose/Omsk/0114/2020 H5N8 2.3.4.4b 10 10 <10 20 <10 <10

A/chicken/Dong Nai/25437VTC/2019 H5N6 2.3.4.4g 160 10 20 20 <10 <10

A/chicken/Nghe An/27VTC/2018 H5N6 2.3.4.4h <10 <10 <10 <10 <10 <10

Test antigens – Antigènes d’épreuve

A/Astrakhan/3212/2020 H5N8 2.3.4.4b <10 10 <10 <10 <10 <10

A/chicken/Tyumen/302-01/2020 H5N8 2.3.4.4b 10 10 <10 <10 <10 <10

A/chicken/Rostov-on-Don/308-02/2020 H5N8 2.3.4.4b 80 10 20 20 <10 <10

A/chicken/Rostov-on-Don/308-03/2020 H5N8 2.3.4.4b 20 10 10 <10 <10 <10

A/turkey/Stavropol/320-03/2020 H5N8 2.3.4.4b 20 <10 <10 <10 <10 <10

A/chicken/Astrakhan/321-05/2020 H5N8 2.3.4.4b 20 10 10 <10 <10 <10

A/turkey/Rostov-on-Don/332-08/2021 H5N8 2.3.4.4b 80 20 10 10 <10 <10

A/turkey/Rostov-on-Don/332-10/2021 H5N8 2.3.4.4b 80 20 10 20 <10 <10

A/chicken/Krasnodar/334-02/2021 H5N8 2.3.4.4b 20 <10 <10 <10 <10 <10

A/chicken/Krasnodar/334-03/2021 H5N8 2.3.4.4b 20 10 10 <10 <10 <10

Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antigènes/d’antisérum homologue.

a Haemagglutination inhibition assay was conducted using turkey red blood cells. – L’épreuve d’inhibition de l’hémagglutination a été pratiquée avec des érythrocytes de dinde.

Europe au début 2020 et en Asie à la fin 2020, et un autre groupe constitué de virus du Moyen-Orient, du Kazakhstan et de la Fédé- ration de Russie, ainsi que de souches observées en Europe au dernier trimestre de 2020. Ces 2 groupes phylogénétiques étaient également distincts sur le plan antigénique, avec mise en évidence de cette diversité antigénique lorsque des virus aviaires représen- tatifs étaient testés avec des antisérums de furet postinfection dirigés contre le virus vaccinal candidat dérivé de la souche A(H5N6) A/Fujian-Sanyuan/21099/2017 (Tableaux 2 et 3). Bien que des virus A(H5N1), A(H5N2), A(H5N3), A(H5N4) et A(H5N5) du clade 2.3.4.4b aient été détectés pendant cette période, la majorité des virus identifiés chez les volailles appartenaient au sous-type A(H5N8). Une enquête est en cours sur 7 cas d’infection humaine par des virus A(H5) survenus parmi des travailleurs d’une exploi- tation agricole en Fédération de Russie après une flambée de grippe A(H5N8) chez la volaille. Parmi ces cas humains, un virus (A/Astrakhan/3212/2020) a à ce jour été confirmé comme étant un virus A(H5N8) du clade 2.3.4.4b. Ce virus était quasiment identique aux virus observés chez la volaille et était étroitement apparenté aux autres virus du clade 2.3.4.4b détectés chez les volailles et les oiseaux sauvages dans d’autres parties d’Eurasie pendant la période couverte par le présent rapport (Figure 1). Le gène HA du virus A/Astrakhan/3212/2020 présentait une divergence maximale de 3 acides aminés par rapport aux virus détectés en Fédération

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RELEVÉ ÉPIDÉMIOLOGIQUE HEBDOMADAIRE, N^o 12, 26 MARS 2021 95

2017 and 2018, which reacted well with post-infection ferret antisera raised against the A(H5N6) A/Fujian- Sanyuan/21099/2017 CVV (Tables 2 and 3). To provide a clade 2.3.4.4b CVV with an NA more representative of currently circulating viruses, an A/Astrakhan/3212/2020 A(H5N8) CVV is proposed.

Clade 2.3.4.4h viruses were detected in poultry in Viet Nam and in 5 humans and in poultry/environmental samples in China (Figure 1). These viruses were similar genetically to viruses previously detected in these countries. Representative viruses, including those isolated from humans, reacted well with post-infection ferret antisera raised against the A/Guangdong/18SF020/2018 CVV.

Influenza A(H5) candidate vaccine viruses

Based on current antigenic, genetic and epidemiologic data, a new A(H5N8) clade 2.3.4.4b CVV antigenically like A/Astrakhan/3212/2020 is proposed. The available and pending A(H5) CVVs are listed in Table 4.

Influenza A(H7)

Human infections with A/Anhui/1/2013 HA lineage avian influenza A(H7N9) viruses were first reported to WHO on 31 March 2013. Other lineages of A(H7) viruses have also caused zoonotic infections in previous years.

This summary provides updates on the characterisation of A(H7) viruses related to these zoonotic viruses and the status of the development of corresponding CVVs.

Table 3 Haemagglutination inhibition a assay of clade 2.3.4.4b influenza viruses

Tableau 3 Épreuves d’inhibition de l’hémagglutination a obtenues avec les virus grippaux appartenant au clade 2.3.4.4b

Subtype Fujian-

Sanyuan/21099

Ghg/Uganda/200144 Ck/Egypt/N13732A Tufted dk/Drk/2016

Reference antigens – Antigènes de référence A/Fujian-Sanyuan/21099/2017

(CNIC-21099)

H5N6 80 40 40 40

A/Grey-headed Gull/

Uganda/200144/2017

H5N8 80 160 80 80

A/chicken/Egypt/N13732A/2017 H5N8 160 160 160 160

A/tufted duck/Denmark/17740- 1wp1/2016

H5N8 80 80 80 80

Test antigens – Antigènes d’épreuve

A/environment/Kamchatka/18/2016 H5N5 80 80 80 40

A/chicken/Sergiyev Posad/38/2017 H5N8 80 160 160 160

A/chicken/Rostov-on-Don/766/2018 H5N8 160 160 160 160

A/chicken/Kostroma/1718/2017 H5N2 40 40 20 20

A/great crested grebe/Tyva/34/2016 H5N8 40 80 80 40

Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antigènes/d’antisérum homologue.

a Haemagglutination inhibition assay was conducted using chicken red blood cells. – L’épreuve d’inhibition de l’hémagglutination a été pratiquée avec des érythrocytes de poulet.

de Russie en 2016, 2017 et 2018, qui réagissaient bien avec des antisérums de furet postinfection dirigés contre le virus vaccinal candidat A(H5N6) dérivé de la souche A/Fujian-Sanyuan/21099/2017 (Tableaux 2 et 3). Pour disposer d’un virus vaccinal candidat du clade 2.3.4.4b porteur d’un gène NA plus représentatif des virus actuellement en circulation, un nouveau virus vaccinal candidat A(H5N8) de type A/Astrakhan/3212/2020 est proposé.

Clade 2.3.4.4h: Des virus de ce clade ont été détectés chez des volailles au Viet Nam, ainsi que chez 5 cas humains et dans des échantillons environnementaux et des volailles en Chine (Figure 1).

Ces virus étaient génétiquement analogues à ceux qui avaient précédemment été détectés dans ces pays. Les virus représentatifs testés, y compris ceux isolés chez les cas humains, ont bien réagi avec des antisérums de furet postinfection dirigés contre le virus vaccinal candidat dérivé de la souche A/Guangdong/18SF020/2018.

Virus candidats destinés à la préparation d’un vaccin contre la grippe A(H5)

Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques actuelles, un nouveau virus vaccinal candidat A(H5N8) du clade 2.3.4.4b, antigéniquement analogue à A/Astrakhan/3212/2020, est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H5) disponibles et en attente sont recensés dans le Tableau 4.

Grippe A(H7)

Les premiers cas d’infection humaine par des virus grippaux aviaires A(H7N9) de la lignée A/Anhui/1/2013 ont été notifiés à l’OMS le 31 mars 2013. D’autres lignées de virus A(H7) ont égale- ment été à l’origine d’infections zoonotiques ces dernières années.

Le présent résumé fait le point sur la caractérisation des virus A(H7) liés à ces virus zoonotiques et sur l’état d’avancement de la mise au point de virus vaccinaux candidats correspondants.

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96 WEEKLY EPIDEMIOLOGICAL RECORD, NO 12, 26 MARCH 2021 Table 4 Status of influenza A(H5) candidate vaccine virus development^a

Tableau 4 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H5)^a

Candidate vaccine viruses^b – Virus vaccinaux candidats^b Clade Institution^c Available – Disponible

CDC-RG (A/Viet Nam/1203/2004) 1 CDC Yes – Oui

SJRG-161052 (A/Viet Nam/1203/2004) 1 SJCRH Yes – Oui

NIBRG-14 (A/Viet Nam/1194/2004) 1 NIBSC Yes – Oui

NIBRG-88 (A/Cambodia/R0405050/2007) 1.1 NIBSC Yes – Oui

IDCDC-RG34B (A/Cambodia/X0810301/2013) 1.1.2 CDC Yes – Oui

SJRG-166614 (A/duck/Hunan/795/2002) 2.1.1 SJCRH/HKU Yes – Oui

CDC-RG2 (A/Indonesia/5/2005) 2.1.3.2 CDC Yes – Oui

NIIDRG-9 (A/Indonesia/NIHRD11771/2011) 2.1.3.2a NIID Yes – Oui

SJRG-163222 (A/bar-headed goose/Qinghai/1A/2005)^c 2.2 SJCRH/HKU Yes – Oui

IBCDC-RG7 (A/chicken/India/NIV33487/2006) 2.2 CDC/NIV Yes – Oui

SJRG-163243 (A/whooper swan/Mongolia/244/2005) 2.2 SJCRH Yes – Oui

IDCDC-RG11 (A/Egypt/2321-NAMRU3/2007) 2.2.1 CDC Yes – Oui

NIBRG-23 (A/turkey/Turkey/1/2005) 2.2.1 NIBSC Yes – Oui

IDCDC-RG29 (A/Egypt/N03072/2010) 2.2.1 CDC Yes – Oui

IDCDC-RG13 (A/Egypt/3300-NAMRU3/2008) 2.2.1.1 CDC Yes – Oui

NIBRG-306 (A/Egypt/N04915/2014) 2.2.1.2 NIBSC Yes – Oui

SJRG-166615 (A/common magpie/Hong Kong/5052/2007) 2.3.2.1 SJCRH/HKU Yes – Oui

IDCDC-RG30 (A/Hubei/1/2010) 2.3.2.1a CDC Yes – Oui

SJ007 (A/duck/Bangladesh/19097/2013) 2.3.2.1a SJCRH Yes – Oui

SJ003 (A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010) 2.3.2.1b SJCRH/HKU Yes – Oui

NIBRG-301 (A/duck/Vietnam/NCVD-1584/2012) 2.3.2.1c NIBSC Yes – Oui

SJ002 (A/chicken/Hong Kong/AP156/2008) 2.3.4 SJCRH/HKU Yes – Oui

IBCDC-RG6 (A/Anhui/1/2005) 2.3.4 CDC Yes – Oui

CBER-RG1 (A/duck/Laos/3295/2006) 2.3.4 FDA Yes – Oui

SJRG-164281 (A/Japanese white eye/Hong Kong/1038/2006) 2.3.4 SJCRH/HKU Yes – Oui

IDCDC-RG36 (A/chicken/Bangladesh/11rs1984-30/2011) 2.3.4.2 CDC Yes – Oui

IDCDC-RG35 (A/Guizhou/1/2013) 2.3.4.2 CDC/CCDC Yes – Oui

IDCDC-RG42A (A/Sichuan/26221/2014) (H5N6) 2.3.4.4a CDC/CCDC Yes – Oui

IDCDC-RG43A (A/gyrfalcon/Washington/41088-6/2014) (H5N8) 2.3.4.4c CDC Yes – Oui

NIID-001 (A/duck/Hyogo/1/2016) (H5N6) 2.3.4.4e NIID Yes – Oui

SJRG-165396 (A/goose/Guiyang/337/2006) 4 SJCRH/HKU Yes – Oui

IDCDC-RG12 (A/chicken/Vietnam/NCVD-016/2008) 7.1 CDC Yes – Oui

IDCDC-RG25A (A/chicken/Vietnam/NCVD-03/2008) 7.1 CDC Yes – Oui

Candidate vaccine virus in preparation – Virus vaccinaux candidats en préparation Clade Institution Available – Disponible

A/duck/Bangladesh/17D1012/2018-like 2.3.2.1a CDC Pending – En attente

A/chicken/Guiyang/1153/2016-like 2.3.2.1d SJCRH/HKU Pending – En attente

A/chicken/Ghana/20/2015-like 2.3.2.1f CDC Pending – En attente

A/chicken/Vietnam/NCVD-15A59/2015 (H5N6)-like 2.3.4.4f SJCRH Pending – En attente

A/Guangdong/18SF020/2018 (H5N6)-like 2.3.4.4h CDC/CCDC Pending – En attente

A/Hubei/29578/2016 (H5N6)-like 2.3.4.4d CCDC Pending – En attente

A/Astrakhan/3212/2020 (H5N8)-like 2.3.4.4b FDA Pending – En attente

A/Fujian-Sanyuan/21099/2017 (H5N6)-like 2.3.4.4b CCDC Pending – En attente

A/chicken/Vietnam/RAHO4-CD-20-421/2020 (H5N6)-like 2.3.4.4g CDC Pending – En attente

a All listed candidate vaccine viruses have been produced using reverse genetics. – Tous les virus vaccinaux candidats recensés ont été produits au moyen de la génétique inverse.

b Where not indicated, the virus subtype is H5N1. – Lorsque le sous-type de virus n’est pas indiqué, il s’agit du sous-type H5N1.

c Institutions developing and/or distributing the candidate vaccine viruses: – Institutions distribuant les virus vaccins candidats:

CDC: Centers for Disease Control and Prevention, USA – CDC: Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis

CCDC: Chinese Center for Disease Control and Prevention, China – CCDC: Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies, Chine FDA: Food and Drug Administration, USA – FDA: Food and Drug Administration, États-Unis

HKU: University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region, China – HKU: Université de Hong Kong, Hong Kong, Région administrative spéciale de la Chine

NIBSC: National Institute for Biological Standards and Control, a centre of the Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), United Kingdom – NIBSC: National Institute for Biological Standards and Control, un centre du Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), Angleterre

NIID: National Institute of Infectious Diseases, Japan – NIID: Institut national des maladies infectieuses, Japon NIV: National Institute of Virology, India – NIV: National Institute of Virology, Inde

SJCRH: St Jude Children’s Research Hospital, USA – SJCRH: St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis

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RELEVÉ ÉPIDÉMIOLOGIQUE HEBDOMADAIRE, N^o 12, 26 MARS 2021 97

Influenza A(H7) activity from 1 October 2020 to 3 March 2021

No human infections with A(H7), including A/Anhui/1/2013-lineage A(H7N9) viruses, have been detected in this period. In October 2020, 14 chicken samples tested positive for A(H7N9) virus in Shandong province, China. No information was available on whether these viruses were of low pathogenicity or were highly pathogenic. Low pathogenicity A(H7N7) viruses were detected in domestic geese in Italy and in poultry in South Africa in this period. LPAI (H7) viruses were also detected in wild bird droppings in China and the Republic of Korea.

Influenza A(H7) candidate vaccine viruses

Based on the current epidemiologic data, no new CVVs are proposed. The available and pending CVVs for A(H7) viruses including A(H7N9) are listed in Table 5.

Influenza A(H9N2)

Influenza A(H9N2) viruses are enzootic in poultry in parts of Africa, Asia and the Middle East with the majority of viruses belonging to either the A/quail/Hong Kong/

G1/97 (G1) or A/chicken/Beijing/1/94 (Y280/G9) lineage.

Since the late 1990s, when the first human infection was identified, the detection of A(H9N2) viruses in human and swine specimens has been reported sporadically with associated mild disease in most human cases and no evidence for human-to-human transmission. Since 1998 a total of 74 A(H9N2) human infections have been documented.

Influenza A(H9N2) activity from 1 October 2020 to 3 March 2021

Seventeen human cases of A(H9N2) virus infection were reported by China in this period, 5 with illness onset dates prior to October 2020. The majority of these infections were in children. In all but one of the 17 cases disease severity was mild, and all recovered from infection.

Y280/G9-lineage viruses continue to predominate in environmental and poultry samples in China and Lao People’s Democratic Republic. G1-lineage viruses were detected in poultry in some countries of Africa, Asia and the Middle East.

Antigenic and genetic characteristics of influenza A(H9N2) viruses

All recent A(H9N2) human and poultry infections in China, and poultry infections in Lao People’s Demo- cratic Republic, were caused by viruses of the Y280/

G9-lineage. Seven of the viruses detected in humans in this reporting period were sequenced; 2 had HA genes showing greatest similarity to the A/Anhui-Luji- ang/39/2018 CVV, while the others were most similar to the A/Hong Kong/308/2014 CVV (Figure 2). The viruses from humans reacted well with post-infection ferret antiserum raised against either A/Anhui-Lujiang/39/2018 or A/Hong Kong/308/2014. Poultry viruses collected in

Activité de la grippe A(H7) entre le 1^er octobre 2020 et le 3 mars 2021

Aucune infection humaine par des virus A(H7), y compris par les virus A(H7N9) de la lignée A/Anhui/1/2013, n’a été détectée durant cette période. En octobre 2020, 14 échantillons prélevés sur des poulets ont donné des résultats positifs pour le virus A(H7N9) dans la province de Shandong, en Chine. Aucune information n’était disponible concernant le degré de pathogénicité de ces virus. Des virus A(H7N7) faiblement pathogènes ont été détectés chez des oies domestiques en Italie et chez des volailles en Afrique du Sud pendant cette période. Des virus aviaires (H7) hautement pathogènes ont également été détectés dans des fientes d’oiseaux sauvages en Chine et en République de Corée.

Virus candidats destinés à la préparation d’un vaccin contre la grippe A(H7)

Au vu des données épidémiologiques actuelles, aucun nouveau virus vaccinal candidat n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats disponibles et en attente pour la grippe A(H7), y compris A(H7N9), sont recensés dans le Tableau 5.

Grippe A(H9N2)

Des virus grippaux A(H9N2) sont enzootiques parmi les popula- tions de volailles de certaines parties de l’Afrique, de l’Asie et du Moyen-Orient, la majorité d’entre eux appartenant aux lignées A/quail/Hong Kong/G1/97 (G1) ou A/chicken/Beijing/1/94 (Y280/

G9). Depuis que le premier cas d’infection humaine a été identi- fié à la fin des années 1990, des détections sporadiques de virus A(H9N2) ont été signalées dans des échantillons humains et porcins. Dans la majorité des cas humains, les symptômes de la maladie associée étaient bénins et aucun signe de transmission interhumaine n’a été relevé. Depuis 1998, 74 cas d’infection humaine par des virus A(H9N2) ont été enregistrés au total.

Activité de la grippe A(H9N2) entre le 1er octobre 2020 et le 3 mars 2021

La Chine a signalé 17 cas d’infection humaine par des virus A(H9N2) pendant cette période; pour 5 d’entre eux, la maladie était apparue avant octobre 2020. La majorité des personnes infectées étaient des enfants. À une exception près, ces 17 cas ont tous présenté une forme bénigne de la maladie. Tous les malades se sont rétablis.

Les virus de la lignée Y280/G9 restent prédominants dans les échantillons prélevés dans l’environnement et chez les volailles en Chine et en République démocratique populaire lao. Des virus de la lignée G1 ont été détectés chez la volaille dans certains pays d’Afrique, d’Asie et du Moyen-Orient.

Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux A(H9N2)

Toutes les infections à virus A(H9N2) récemment détectées chez l’homme et parmi la volaille en Chine, ainsi que toutes les infections chez la volaille en République démocratique populaire lao, étaient imputables à des virus de la lignée Y280/G9. Parmi les virus détectés chez l’homme pendant cette période, 7 ont été séquencés; 2 possédaient des gènes HA présentant le plus grand degré de parenté avec ceux du virus vaccinal candidat A/Anhui- Lujiang/39/2018, tandis que les autres s’apparentaient de plus près au virus vaccinal candidat A/Hong Kong/308/2014 (Figure 2). Les virus isolés chez l’homme ont bien réagi avec un antisérum de furet postinfection dirigé soit contre A/Anhui-Lujiang/39/2018,

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Lao People’s Democratic Republic were antigenically related to the A/chicken/Hong Kong/G9/97 CVV. In addi- tion, currently available CVVs were antigenically representative of the G1-lineage viruses detected in birds in Bangladesh, despite some genetic divergence.

Influenza A(H9N2) candidate vaccine viruses Based on the available antigenic, genetic and epidemiologic data, no new CVVs are proposed. The available and pending A(H9N2) CVVs are listed in Table 6.

soit contre A/Hong Kong/308/2014. Les virus prélevés chez les volailles en République démocratique populaire lao étaient anti- géniquement proches du virus vaccinal candidat dérivé de A/chicken/Hong Kong/G9/97. En outre, les virus vaccinaux candidats actuellement disponibles étaient représentatifs, sur le plan antigénique, des virus de la lignée G1 détectés chez les oiseaux au Bangladesh, malgré une certaine divergence génétique.

Virus candidats destinés à la préparation d’un vaccin contre la grippe A(H9N2)

Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiolo- giques disponibles, aucun nouveau virus vaccinal candidat n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H9N2) disponibles et en attente sont recensés dans le Tableau 6.

Table 5 Status of influenza A(H7) candidate vaccine virus development

Tableau 5 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H7)

Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats

Lineage (subtype) – Lignée (sous-type)

Type Institution^a Available – Disponible

IDCDC-RG33A (A/Anhui/1/2013) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui NIBRG-268 (A/Anhui/1/2013) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse NIBSC Yes – Oui NIIDRG-10.1 (A/Anhui/1/2013) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse NIID Yes – Oui SJ005 (A/Anhui/1/2013) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse SJCRH Yes – Oui NIBRG-267 (A/Shanghai/2/2013) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse NIBSC Yes – Oui CBER-RG4A (A/Shanghai/2/2013) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse FDA Yes – Oui IDCDC-RG32A (A/Shanghai/2/2013) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui IDCDC-RG32A.3 (A/Shanghai/2/2013) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui IDCDC-RG56B (A/Hong Kong/125/2017) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui IDCDC-RG56N (A/Guangdong/17SF003/2016) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui NIBRG-375 (A/Guangdong/17SF003/2016) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse NIBSC Yes – Oui CBER-RG7C (A/Guangdong/17SF003/2016) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse FDA Yes – Oui CBER-RG7D (A/Guangdong/17SF003/2016) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse FDA Yes – Oui IDCDC-RG64A (A/Gansu/23277/2019-like) A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui

IBCDC-5 (A/turkey/Virginia/4529/2002) American (H7N2) Conventional – Classique CDC Yes – Oui

SJRG-161984-B (A/Canada/rv444/2004) American (H7N3) Reverse genetics – Génétique inverse SJCRH Yes – Oui

NIBRG-109 (A/New York/107/2003) American (H7N2) Conventional – Classique NIBSC Yes – Oui

IBCDC-1 (A/mallard/Netherlands/12/2000) Eurasian (H7N7) Conventional – Classique CDC Yes – Oui NIBRG-60 (A/mallard/Netherlands/12/2000) Eurasian (H7N3) Reverse genetics – Génétique inverse NIBSC Yes – Oui NIBRG-63 (A/mallard/Netherlands/12/2000) Eurasian (H7N1) Reverse genetics – Génétique inverse NIBSC Yes – Oui Candidate vaccine virus in

preparation – Virus vaccinaux candidats en préparation

Lineage (subtype) – Lignée

(sous-type) Type Institution* Available – Disponible

A/chicken/Jiangsu/1/2018-like Eurasian (H7N4) Reverse genetics – Génétique inverse CCDC Pending – En attente A/Hunan/02650/2016-like A/Anhui/1/2013 (H7N9) Reverse genetics – Génétique inverse CCDC Pending – En attente

a Institutions developing and/or distributing the candidate vaccine viruses: – Institutions distribuant les virus vaccins candidats:

CDC: Centers for Disease Control and Prevention, USA – CDC: Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis

CCDC: Chinese Center for Disease Control and Prevention, China – CCDC: Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies, Chine FDA: Food and Drug Administration, USA – FDA: Food and Drug Administration, États-Unis

HKU: University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region, China – HKU: Université de Hong Kong, Hong Kong, Région administrative spéciale de la Chine

NIBSC: National Institute for Biological Standards and Control, a centre of the Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), United Kingdom – NIBSC: National Institute for Biological Standards and Control, un centre du Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), Angleterre

NIID: National Institute of Infectious Diseases, Japan – NIID: Institut national des maladies infectieuses, Japon NIV: National Institute of Virology, India – NIV: National Institute of Virology, Inde

SJCRH: St Jude Children’s Research Hospital, USA – SJCRH: St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis