Etat des lieux de la résistance

(1)

Etat des lieux de la résistance

Emmanuelle Varon

AP-HP, HEGP, Paris

(2)

BACTÉRIES À GRAM POSITIF

(3)

SARM : évolution du % au sein de l’espèce et de l’incidence

E. VARON – Séminaire BUA 19/10/2017 3

onerba.org/onerba/Rapports/Rapport-ONERBA-2015.pdf

Réseau APHP

(4)

SARM : évolution de la sensibilité aux autres ATB

Réseau APHP

(5)

SARM : évolution de la sensibilité aux autres ATB

Réseau C-CLIN-Paris-Nord

(6)

(7)

(8)

Enterococcus faecalis

http://onerba.org/IMG/pdf/rapport_onerba_2015.pdf

(9)

Enterococcus faecium

9 http://onerba.org/IMG/pdf/rapport_onerba_2015.pdf

E. VARON – Séminaire BUA 19/10/2017

(10)

Antibiotic resistance among early clinical isolates of E. faecium in

the United States

(11)

Epidémiologie 2015 – souches invasives (bactériémies)

11 http://ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/antimicrobial-resistance-europe-2015.pdf

E. faecalis Genta R E. faecium Vanco R

E. VARON – Séminaire BUA 19/10/2017

(12)

(13)

Pneumocoques de sensibilité diminuée à la pénicilline G (PSDP)

1984-1997 : P. Geslin; 2001-2016 : CNRP-ORP, E. Varon, L. Gutmann

1

http://www.sante.gouv.fr/htm/actu/34_01.htm

2

Vaccin conjugué pneumococcique (PCV)

0,5

48 52

25

0 10 20 30 40 50 60

1984 1985 1986 1987 1988 1989 1990 1991 1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016

% de PSDP

63 062 souches étudiées

Plan antibiotiques¹ PCV7²

PCV13²

13 E. VARON – Séminaire BUA 19/10/2017

(14)

Souches invasives : sensibilité aux β-lactamines

Varon et al. CNRP Annual report 2016, http://cnr-pneumo.fr

Méningites

Bactériémies

(15)

Incidence des pneumocoques de sensibilité diminuée aux bêta-lactamines isolés de bactériémies

EPIBAC-Santé Publique France et CNRP-ORP

(16)

S. pneumoniae : résistance aux autres antibiotiques

< 15 ans

Adultes

(17)

CMI extrêmes, mg/L ParC/E (ou Efflux) ParC/E+GyrA

Lévofloxacine 1 – 2 4 – 32

Moxifloxacine 0,12 - 0,25 2 - ≥8

S. pneumoniae : résistance aux fluoroquinolones (%)

2000-2006 : E. Varon, HB. Drugeon - Réseau du suivi des résistances du pneumocoque Depuis 2007 : Données ORP-CNRP

Prélèvements respiratoires de l’adulte

0,0%

0,5%

1,0%

1,5%

2,0%

2,5%

3,0%

3,5%

4,0%

675 965 968 980 1008 1044 387 359 378 399 356

2000 - 01 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2009 2011 2013 2015 Année (Nombre de souches étudiées)

ParC/E+GyrA GyrA

Efflux ParC/E

17

(18)

BACTÉRIES À GRAM NÉGATIF

(19)

18^esJNI, Saint-Malo, du 21 au 23 juin 2017 19

E. coli : évolution sensibilité aux ATB dans les hémocultures

0 20 40 60 80 100

ampi-amox céfotaxime gentamicine amikacine tobramycine ciprofloxacine

2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 41

89 93

98

91

84

% de Sensibilité

Données 3 réseaux de l’ONERBA : réseau AZAY résistance, réseau Ile de France, réseau REUSSIR (EARS-Net)

Marie Kempf – JNI 2017

(20)

E. coli : % résistance aux C3G dans les bactériémies

0 5 10 15 20 25

2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015

Proportionofisolatesnon-susceptibleto 3rdGCephalosoprins

Year

France

http://ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/antimicrobial-resistance-europe-2015.pdf

EARS-Net

(21)

E. coli : % résistance aux C3G dans les bactériémies

0 5 10 15 20 25

2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015

Proportionofisolatesnon-susceptibleto3rdGCephalosoprins

Year

Greece Portugal Spain United Kingdom Austria Netherlands France Germany Sweden

http://ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/antimicrobial-resistance-europe-2015.pdf

EARS-Net

(22)

% de Sensibilité

E. coli: sensibilité aux C3G en Europe, EARS-Net 2015 (bactériémies)

0 20 40 60 80

100 médiane

88

moyenne

85

Marie Kempf – JNI 2017

(23)

SARM et entérobactéries productrices de BLSE :

évolution de l’incidence pour 100 admissions en France

(24)

E. coli producteurs de BLSE : incidence des bactériémies diagnostiquées à l'hôpital par lieu d'acquisition

0 0,01 0,02 0,03 0,04 0,05 0,06 0,07

2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015

/1000 JH all / 1000 JH Nosocomial / 100 admissions Communautaire / Community

Incidence /1000JH

Réseau des Hygiénistes du Centre, 2007-2015

0,053

0,004

Marie Kempf – JNI 2017

(25)

0 20 40 60 80 100

E. coli: sensibilité aux FQ en Europe, EARS-Net 2015 (bactériémies)

% de Sensibilité

médiane

79

moyenne

74

Marie Kempf – JNI 2017

(26)

E. coli : évolution sensibilité aux ATB dans prélèvements urinaires

Moyenne annuelle : 36,000 souches

Réseau REUSSIR

0 20 40 60 80 100

2011 2012 2013

% de Sensibilité

98 93 86

92 93

60

76

99 98

Marie Kempf – JNI 2017

(27)

E. coli : évolution sensibilité aux ATB dans prélèvements urinaires hôpital versus ville

orange = hôpital - données REUSSIR vert = ville - données MEDQUAL

0 20 40 60 80 100

2011 REUSSIR 2011 MEDQUAL 2012 REUSSIR 2012 MEDQUAL 2013 REUSSIR 2013 MEDQUAL

% de Sensibilité

Marie Kempf – JNI 2017

(28)

Sensibilité aux antibiotiques de E. coli dans les urines

 Molécules par voie orale

 Réseaux ONERBA de 2013 à 2016

% sensibilité Onerba ville 2013

REUSSIR 2013♀

AFORCOPI BIO 2015

MedQual 2016

Amoxicilline 55,6 - 50,2 58,3

Co Amoxi Clav 70,4 61,7 69,3 85,2

Céfixime 95,0 92,4 92,1 94,3

Mecillinam - 93,3 92,4 -

Fosfomycine 98,7 98,7 98,7 99,1

Furanes 98,7 98,2 98,7 99,4

Ciprofloxacine 89,5 87,3 87,8 90,8

Cotrimoxazole 79,6 77,3 77,5 80,6

(29)

EVOLUTION

29

Effet EUCAST

Thomas GUEUDET – JNI 2017

(30)

Sensibilité de E. coli aux antibiotiques par tranches d’âge (AFORCOPI-BIO, 2015)

Thomas GUEUDET – JNI 2017

(31)

AFORCOPI-BIO, 2015

Thomas GUEUDET – JNI 2017

(32)

 La proportion de patients porteurs de souches

d’E.coli BLSE augmente avec l'âge

(33)

Résistance chez les hommes

Thomas GUEUDET – JNI 2017

(34)

 La présence de E.coli BLSE était globalement plus

fréquente chez les hommes que chez les femmes

(35)

AFORCOPI-BIO, 2015

Thomas GUEUDET – JNI 2017

(36)

2016 TRANSVILLE 3,6 % de E.coli BLSE

5,83

3,39

2,66

3,85 3,74

2,66

3,00

3,06

2,81 3,39

4,17

3,77

3,39

2013

3,8%

(37)

E coli BLSE EHPAD

Thomas GUEUDET – JNI 2017

(38)

(39)

K. pneumoniae: évolution sensibilité aux ATB dans prélèvements urinaires

0 20 40 60 80 100

2011 2012 2013

% de Sensibilité

95 84 79

93 81

71

81 81

75

Moyenne annuelle : 3,500 souches

Réseau REUSSIR

Marie Kempf – JNI 2017

(40)

K. pneumoniae : évolution sensibilité aux ATB dans les hémocultures

% de Sensibilité

70 92

70 77

70

- Céfotaxime :

84% de S dans urines (REUSSIR 2013) vs 72%

dans hémocultures (EARSS 2013)

- Baisse de sensibilité vis-à-vis de tous les ATB excepté l’amikacine

- Ciprofloxacine :

79% de S dans urines (REUSSIR 2013) vs 70%

dans hémocultures (EARSS 2013)

réseau AZAY résistance, réseau Ile de France, réseau REUSSIR

Marie Kempf – JNI 2017

(41)

0 0,01 0,02 0,03 0,04 0,05 0,06 0,07

2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015

Incidence /1000JH

E. coli et KES productrices de BLSE : incidence des bactériémies diagnostiquées à l'hôpital

Réseau des Hygiénistes du Centre, 2007-2015

E. coli

0,019KES

0,053

Marie Kempf – JNI 2017

(42)

Klebsiella, Enterobacter, et Serratia productrices de BLSE : incidence des bactériémies diagnostiquées à l'hôpital par lieu d'acquisition

0 0,005 0,01 0,015 0,02 0,025

2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015

/1000 JH all / 1000 JH Nosocomial / 100 admissions Communautaire / Community

Incidence /1000JH

Réseau des Hygiénistes du Centre, 2007-2015

0,019

0,008

Marie Kempf – JNI 2017

(43)

0 20 40 60 80 100

% de Sensibilité

médiane

68

moyenne

67

K. pneumoniae : sensibilité aux C3G en Europe, EARS-Net 2015 (bactériémies)

24

Marie Kempf – JNI 2017

(44)

Enquête SPA 2016 (Uro-SPA)

J. Robert, R. Gauzit, P. Lesprit, Y. Péan, C. Rabaud, S. Alfandari

Analyser les modalités de prise en charge

des « pyélonéphrites » et des « infections urinaires masculines » communautaires

dans les établissements de soins français en 2016

(45)

18^esJNI, Saint-Malo, du 21 au 23 juin 2017

Bactériologie

(ECBU d’entrée ou hémoculture)

Espèce %

E. coli 73.0 %

K. pneumoniae 7.0 %

P. mirabilis 4.0 %

Autres entérobactéries 4.0 %

E. faecalis 2.5 %

P. aeruginosa 2.0 %

S. aureus 1.0 %

Autres 3.0 %

Stérile ou inconnu 3.5 %

Jérôme Robert– JNI 2017

(46)

Profil de sensibilité (%) des souches de E. coli et de K. pneumoniae

51

74 96 89 88 87 87

98 96

79 11,4 0

20 40 60 80 100

E.coli

K.pneumoniae

(47)

18^esJNI, Saint-Malo, du 21 au 23 juin 2017

Profil de sensibilité (%) des souches

de E. coli selon les ATCD d’hospitalisation

46

73 93 83 83 81 81 97 94

72 17 53

76 97 91 89 91 89 98 96

81 8,8 0

20 40 60 80 100

OUI NON ATCD H

Jérôme Robert– JNI 2017

(48)

Profil de sensibilité (%) des souches

de E. coli selon les ATCD de Tt antibiotique

36

60

93 78 75 81 76

96 92

65 23 56

78 97 93 93 91 91 98 97

83 7 0

20 40 60 80 100

OUI

NON

ATCD ATB

(49)

Pseudomonas aeruginosa : sensibilité (%) aux antibiotiques, bactériémies

Réseau Ile de France

(50)

Pseudomonas aeruginosa : sensibilité (%) aux antibiotiques en Europe, EARS-Net 2015 (bactériémies)

Données 3 réseaux de l’ONERBA : réseau AZAY résistance, réseau Ile de France, réseau REUSSIR

http://onerba.org/IMG/pdf/rapport_onerba_2015.pdf