Comment classer les cinq espèces suivantes : souris, chauve-souris, moineau, manchot,
ornithorynque ? Bien sûr, nous savons que certains sont des oiseaux, d'autres des Mammifères, mais cette classification est-elle justifiée si on veut construire une classification phylogénétique ?
Note ; je n'ai pas mis les annotations sur les cladogrammes ; ce travail a été fait en classe.
Premier essai ; construction d'un phénogramme.
Si nous comptons le nombre de différences entre les différents organismes, nous pouvons construire la matrice suivante.
souris moineau chauve-souris manchot ornithorynque
souris 0 10 2 10 6
moineau 0 11 1 7
chauve-souris 0 10 7
manchot 0 7
ornithorynque 0
On voit que le manchot et le moineau n'ont qu'une seule différence. Selon le principe phénétique, il sont donc étroitement apparentés. En procédant ainsi de proche en proche on peut construire le phénogramme suivant :
((moineau,manchot),(ornithorynque,(souris,chauve-souris)));
Critique de cette méthode
Nous avons utilisé des symplésiomorphies : ce sont des caractères présents chez tous les spécimens étudiés. Les poumons thoraciques existent chez tous les tétrapodes. Les vertèbres et le squelette interne chez tous les vertébrés. Il est osseux (vrai os = os enchondral) chez tous les Ostréichtyens.
Analyse cladistique de cet arbre ; constructin d'un cladogramme.
Les synapomorphies
Les crocodiles sont ovipares. Les Oiseaux aussi. La souris et la chauve-souris sont vivipares. La
viviparité est donc un caractère dérivé partagé (une synapomorphie). De même les clavicules soudées sont une synapomorphie des Oiseaux.
Ici, mettre un schéma avec les endroits où apparaissent les synapomorphies (ou quelques unes)
Les homoplasies.
On peut constater sur cet arbre qu'il n'est pas possible de ne faire apparaître les ailes à un seul endroit et qu'on doit se résoudre à adopter la solution suivante :
Est-ce le meilleur consensus ?
On pourrait, pour que les ailes n'apparaissent qu'une fois envisager le cladogramme suivant :
Toutefois, en reportant les caractères sur ce cladogramme, on voit qu'il conduit àun nombre
d'homoplasies plus grand. L'arbre envisage dans le début du devoir est donc un arbre qui obtient un meilleur consensus et c'est celui que nous conserverons. Oon voit donc que la classification
ancienne considérant les oiseaux et les Mammifères comme des phylums doit être conservées dans une optique phylogénétique.
