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Diversité et fonction des communautés d'oiseaux et de lépidoptères dans les paysages forestiers fragmentés : réponses multi-échelles et interactions trophiques

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Academic year: 2021

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Diversité et fonction des communautés d’oiseaux et de

lépidoptères dans les paysages forestiers fragmentés :

réponses multi-échelles et interactions trophiques

Luc Barbaro

To cite this version:

Luc Barbaro. Diversité et fonction des communautés d’oiseaux et de lépidoptères dans les paysages forestiers fragmentés : réponses multi-échelles et interactions trophiques. Sciences du Vivant [q-bio]. Université des Sciences et Technologies (Bordeaux 1), 2013. �tel-02810764�

(2)

Diplôme d’Habilitation à Diriger des Recherches

(HDR)

Présenté à

L’UNIVERSITÉ BORDEAUX 1

Ecole Doctorale Sciences et Environnements (SE) Spécialité Ecologie évolutive, fonctionnelle et des communautés

Par

Luc Barbaro

Chargé de Recherches

UMR 1202 BIOGECO INRA-Université Bordeaux 1 - Equipe Ecologie des Communautés

Diversité et fonction des communautés d’oiseaux et de lépidoptères

dans les paysages forestiers fragmentés : réponses

multi-échelles et interactions trophiques

Soutenue le 25 juin 2013 devant la commission d’examen formée de :

Françoise BUREL Directrice de Recherches CNRS, Rennes Rapporteur

Gérard BALENT Directeur de Recherches INRA, Toulouse Rapporteur

Jean-Louis MARTIN Directeur de Recherches CNRS, Montpellier Rapporteur

Philippe CLERGEAU Professeur Muséum National d’Histoire Naturelle, Paris Examinateur

Lluis BROTONS Directeur de Recherches CTFC, Solsona, Espagne Examinateur

(3)

Il suffit que nous parlions d’un objet pour nous croire objectifs.

(4)

Table des matières

Remerciements

5

Curriculum vitae

6

1

ère

partie : Introduction générale

15

1.1. Préambule

16

1.2. Introduction : diversité, échelles et processus

17

1.2.1. Une approche multi-niveaux des systèmes écologiques

17

1.2.2. Biodiversité dans les paysages hétérogènes

18

1.2.3. Fragmentation et interactions biotiques

19

1.2.4. Traits de vie et structure du paysage

20

1.2.5. Diversité fonctionnelle des oiseaux insectivores

21

1.3. Changements globaux et incertitude des données écologiques

22

1.3.1. ‘Patterns and processes’: lier observation et experimentation en écologie

22

1.3.2. Un climat d’incertitude

22

1.3.3. Apports de la biogéographie évolutive

23

1.3.4. De nouvelles méthodes pour de nouvelles données

24

1.4. Questions de recherche et structure du rapport

25

2ème partie : Diversité et fonction des communautés d’oiseaux et de

27

lépidoptères dans les paysages forestiers fragmentés

2.1. Hétérogénéité des paysages et communautés d’oiseaux et de lépidoptères

28

2.1.1. Effets de la composition et de la structure du paysage sur la distribution

28

spatiale des oiseaux et des carabiques

2.1.2. Rôle des intérieurs et des lisières d’habitats pour les papillons des paysages

41

forestiers fragmentés

2.2. Guildes et traits de vie : un lien entre diversité et fonction des communautés

51

2.2.1. Effet de la végétation environnante sur les guildes de lépidoptères herbivores

51

2.2.2. Relier les traits de vie des oiseaux, des carabiques et des papillons à la

59

(5)

2.3. Réponses numériques et fonctionnelles des oiseaux insectivores à un

72

défoliateur forestier

2.3.1. Sélection multi-échelles de l’habitat et écologie du foraging chez la huppe fasciée 72

2.3.2. Réponses hivernales des oiseaux généralistes à un défoliateur forestier

83

2.4. Effets directs et indirects de l’insectivorie avienne en forêt

93

2.4.1. Effets de lisière et de surface sur les assemblages d’oiseaux et l’insectivorie

93

dans les forêts natives fragmentées

2.4.2. Effet indirect de la prédation par les oiseaux sur la résistance des plantules

104

aux insectes herbivores

3ème partie : Discussion générale et perspectives

114

3.1. Réponses multi-échelles des communautés dans les paysages hétérogènes

115

3.1.1. Les communautés d’oiseaux et de lépidoptères en forêt de plantation

115

3.1.2. Fragmentation du paysage ou hétérogénéité spatiale ?

116

3.1.3. Fragmentation, niche climatique et coexistence des oiseaux forestiers

117

3.2. Diversité et fonction des communautés d’oiseaux et de lépidoptères

119

3.2.1. Réponses des guildes d’arthropodes à l’insectivorie avienne

119

3.2.2. Insectivorie et diversité fonctionnelle des communautés d’oiseaux

121

3.3. Contrôle biologique par conservation dans les paysages forestiers

122

3.3.1. Lutte biologique et complémentarité fonctionnelle entre prédateurs

122

3.3.2. Réponses numériques et fonctionnelles de chauves-souris insectivores

123

Conclusion : conservation et fonction de la biodiversité dans les paysages

124

hétérogènes

Références

126

(6)

Remerciements

Le parcours d’un chercheur est marqué à la fois par l’innovation et la permanence.

Aussi, je suis reconnaissant à Gérard Balent d’avoir accompagné mon parcours quasiment

depuis ses débuts jusqu’à aujourd’hui, en tant que rapporteur de ce travail. Je remercie

également chaleureusement les membres du jury, Françoise Burel, Jean-Louis Martin, Didier

Alard, Lluis Brotons et Philippe Clergeau pour avoir accepté de le juger à l’aune de leurs

propres recherches, qui ont été et sont toujours pour moi une source d’inspirations multiples.

Le parcours d’un chercheur est également à la fois un exercice solitaire et un projet

collectif sans cesse revivifié par les étudiants et les autres chercheurs que l’on côtoie. Je suis

donc particulièrement reconnaissant à Hervé Jactel et Emmanuel Corcket pour avoir

accompagné mes recherches au cours de la décennie écoulée, notamment via l’encadrement

collaboratif de différents travaux qui se sont avérés centraux pour mon évolution personnelle.

Je dois ici beaucoup aux trois doctorants que j’ai co-encadré ces dernières années, Inge van

Halder, Brice Giffard et Yohan Charbonnier qui m’ont chacun à leur manière apporté un

souffle nouveau en m’intéressant à de nouveaux objets, de nouveaux concepts et de nouvelles

méthodes, voire en rafraîchissant des intérêts anciens.

La créativité de la recherche étant régulièrement réamorcée par la mise en commun de

connaissances permettant à chacun de franchir de nouveaux paliers, je remercie les

chercheurs, mi-érudits et mi-explorateurs, avec qui j’ai eu la chance d’échanger au sein de

plusieurs projets collectifs enthousiasmants qui ont fourni la matière centrale du présent

mémoire. Je pense en particulier à Marc Dufrêne, Marc Deconchat, Ecki Brockerhoff,

Vincent Bretagnolle, Arndt Hampe, Andrea Battisti, Jean-Charles Bouvier, Frédéric Archaux

et Jean-Yves Barnagaud, qui m’ont apporté à un moment ou à un autre des éléments essentiels

pour mes propres recherches. Merci également à Fabien Anthelme, Christophe Bouget,

Jean-Michel Carnus, Frédéric Gosselin, Dominique Guyon, José Antonio Hódar, Christian

Kerbiriou, Sylvie Ladet, Jean-Marc Louvet, Jean-Claude Martin, Pierre Menassieu, Tim

Nuttle, Annie Ouin, Steve Pawson, Dominique Piou, Aurélien Plichon, Alain Roques, Adrien

Rusch, Sonia Said et Corinne Vacher pour leur aide, leur soutien ou leur collaboration.

La recherche en écologie passe, quoiqu’on puisse lire ou entendre ici ou là, par le

recueil de données de qualité selon des protocoles rigoureux, sur le terrain. Sur le terrain, cela

signifie en forêt, en montagne, dans les dunes, les champs, les vignes ou les prairies, les pieds

dans l’eau, dans le froid ou sous une chaleur de plomb. Cela génère des moments difficiles,

mais aussi des observations quelquefois inoubliables. Je remercie ici mes compagnons de

terrain les plus réguliers, Fabrice Vétillard, Julien Nezan, Olivier Lannès, Gilles Trochard et

l’indispensable et infatigable Sébastien Blache. Un grand merci aussi aux (ex)-étudiant(e)s

avec qui j’ai travaillé et partagé de bons moments ces dernières années, en particulier Laurent,

Bruce, Laurène, Fabrice, Estelle, Manon, Karine, Jean-Charles, Maïmiti, Antoine, Amélie,

Jorge, Elsa, Jean-Sébastien, Guillaume, Pierre et Nathalie. Bonne route à tous.

Enfin, j’adresse un remerciement tout particulier à Alan et Kaye Leckie à

Christchurch, pour nous avoir récupérés, hébergés et préparé de délicieuses gauffres ‘maison’

le lendemain du séisme. Merci aussi pour l’échasse noire, le disque de Tim Buckley et ton

best-of des meilleures chansons à écouter après un tremblement de terre, Alan !

(7)

Curriculum vitae

Luc Barbaro

né le 8 octobre 1971 à Marseille (13), nationalité française

Adresse professionnelle :

INRA UMR1202 BIOGECO Ecologie des communautés

69 route d'Arcachon, 33612 Cestas cedex, téléphone : +335 57 12 27 40

courriel : luc.barbaro@pierroton.inra.fr

Formation universitaire

2013 : Habilitation à Diriger Des Recherches de l’Université de Bordeaux 1 : Diversité et fonction

des communautés d’oiseaux et de lépidoptères dans les paysages forestiers fragmentés : réponses multi-échelles et interactions trophiques. Soutenue le 25 juin 2013.

1999 : Doctorat de Biologie de l’Université de Grenoble 1 : Dynamique agro-écologique des

communautés de pelouses sèches calcicoles du Vercors méridional: application à la gestion conservatoire de la biodiversité par le pastoralisme. Soutenue le 27 octobre 1999, mention très

honorable avec félicitations du jury.

1995 : DEA Gestion des Espaces Montagnards, Université Grenoble 1 1994 : Maîtrise de Géographie Physique, Université Paris 7

1993 : Licence de Géographie Physique, Université Paris 7 1992 : Deug de Géographie, Université Paris 12

1989 : Baccalauréat D, Lycée de Dourdan (91)

Activités professionnelles, missions et stages

Poste actuel : Chargé de Recherches de 1ère classe dans l'Equipe Ecologie des Communautés, UMR BIOGECO, INRA et Université de Bordeaux (33)

2014 : Mission de 3 semaines à l’Universidad Mayor de San Andrès, La Paz, Bolivie dans le cadre

du projet IRD BIO-THAW (collaboration avec F. Anthelme, K. Naoki et O. Dangles)

2011 : Mission de 8 semaines à SCION Forest Research Institute, Christchurch, Nouvelle-Zélande,

dans le cadre du projet TRANZFOR (collaboration avec E. Brockerhoff)

2005 : Mission de 6 semaines à SCION Forest Research Institute, Christchurch, Nouvelle-Zélande

(collaboration avec E. Brockerhoff et M. Deconchat)

2004 : Chargé de Recherches de 1ère classe dans l'Equipe Entomologie Forestière et Biodiversité, UMR BIOGECO, INRA-Pierroton (33)

2000 : Chargé de Recherches de 2ème classe dans l'Equipe Entomologie Forestière et Biodiversité, UMR BIOGECO, INRA-Pierroton (33)

2000 : Chargé de mission au Centre Ornithologique Rhône-Alpes, Romans sur Isère (26)

1995-1999 : Doctorant dans l’Unité de Recherches Agricultures et Milieux Montagnards, Cemagref

Grenoble (38), sous la direction de P. Cozic et J.P. Peltier

(8)

Production scientifique (H-index=10 avec 269 citations Scopus)

Articles scientifiques ISI (23 articles)

Barnagaud J.Y., Barbaro L., Papaïx J., Deconchat M., Brockerhoff E.G. 2014 Habitat filtering by landscape and local forest composition in native and exotic New Zealand birds. Ecology 95: 78-87.

Barbaro L., Giffard B., Charbonnier Y., van Halder I., Brockerhoff E.G. 2014 Bird functional diversity

enhances insectivory at forest edges: a transcontinental experiment. Diversity and Distributions 20: 149-159.

Martin-Garcia J., Barbaro L., Diez J.J., Jactel H. 2013 Contribution of poplar plantations to bird conservation in riparian landscapes. Silva Fennica 47(4): 1043.

Barnagaud J.Y., Barbaro L., Hampe A., Jiguet F., Archaux F. 2013 Species’ thermal preferences affect forest bird communities along landscape and local scale habitat gradients. Ecography 36: 1218-1226.

Baeten L., Verheyen K., Wirth C., Bruelheide H., Bussotti F., Finér L., Jaroszewicz B., Selvi F., Valladares F., Allan E., Ampoorter E., Auge H., Avăcăriei D., Barbaro L., Bărnoaiea I., Bastias C., Bauhus J., Beinhoff C., Benavides R., Benneter A., Berger S., Berthold F., Boberg J., Bonal D. et al. 2013 A novel comparative research platform designed to determine the functional significance of tree species diversity in European forests. Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics 15: 281-291.

Giffard B., Barbaro L., Jactel H., Corcket E. 2013 Plant neighbours mediate bird predation effects on arthropod abundance and herbivory. Ecological Entomology 38: 448-455.

Barbaro L., Dulaurent A.M., Payet K., Blache S., Vetillard F., Battisti A. 2013 Winter bird numerical responses

to a key defoliator in mountain pine forests. Forest Ecology and Management 296: 90-97.

Barbaro L., Brockerhoff E.G., Giffard B., van Halder I. 2012 Edge and area effects on avian assemblages and

insectivory in fragmented native forests. Landscape Ecology 27: 1451-1463.

Giffard B., Jactel H., Corcket E., Barbaro L. 2012 Influence of surrounding vegetation on insect herbivory: a matter of spatial scale and herbivore specialisation. Basic and Applied Ecology 13: 458-465.

Giffard B., Corcket E., Barbaro L., Jactel H. 2012 Bird predation enhances tree seedling resistance to insect herbivores in contrasting forest habitats. Oecologia 168: 415–424.

van Halder I., Barbaro L., Jactel H. 2011 Conserving butterflies in fragmented plantation forests: are edge and interior habitats equally important? Journal of Insect Conservation 15: 591-601.

Barbaro L., Battisti A. 2011 Birds as predators of the pine processionary moth (Lepidoptera: Notodontidae).

Biological Control 56: 107-114.

Deconchat, M., Brockerhoff E.G., Barbaro L. 2009 Effects of surrounding landscape composition on the conservation value of native and exotic habitats for native forest birds. Forest Ecology and Management 258S: S196-S204.

Barbaro L., van Halder I. 2009 Linking bird, carabid beetle and butterfly life-history traits to habitat

fragmentation in mosaic landscapes. Ecography 32: 321-333.

van Halder I., Barbaro L., Corcket E., Jactel H. 2008 Importance of semi-natural habitats for the conservation of butterfly communities in landscapes dominated by pine plantations. Biodiversity and Conservation 17: 1149-1169.

Barbaro L., Couzi L., Bretagnolle V., Nezan J., Vetillard F. 2008 Multi-scale habitat selection and foraging

ecology of the eurasian hoopoe (Upupa epops) in pine plantations. Biodiversity and Conservation 17: 1073-1087.

Barbaro L., Rossi J.P., Vetillard F., Nezan J., Jactel H. 2007 The spatial distribution of birds and carabid beetles

in pine plantation forests: the role of landscape composition and structure. Journal of Biogeography 34: 652-664.

Barbaro L., Pontcharraud L., Vetillard F., Guyon D., Jactel H. 2005 Comparative responses of bird, carabid,

and spider assemblages to stand and landscape diversity in maritime pine plantation forests. Ecoscience 12: 110-121.

Barbaro L., Dutoit T., Anthelme F., Corcket E. 2004 Respective influence of habitat conditions and

management regimes on prealpine calcareous grasslands. Journal of Environmental Management 72: 261-275.

Anthelme F., Michalet R., Barbaro L., Brun J.J. 2003 Environmental and spatial influences of shrub cover (Alnus viridis DC.) on vegetation diversity at the upper treeline in the inner western Alps. Arctic, Antarctic

and Alpine Research 35: 48-55.

Barbaro L., Dutoit T., Grossi J.L. 2003 Influence des facteurs agro-écologiques sur les assemblages d’orchidées

dans les pelouses calcicoles du Vercors (Préalpes, France). Botanica Helvetica 113: 63-79.

Barbaro L., Dutoit T., Cozic P. 2001 A six-year experimental restoration of biodiversity by shrub-clearing and

(9)

Barbaro L., Corcket E., Dutoit T., Peltier J.P. 2000 Réponses fonctionnelles des communautés de pelouses

calcicoles aux facteurs agro-écologiques dans les Préalpes françaises. Canadian Journal of Botany 78: 1010-1020.

Chapitres d'ouvrages (11 chapitres)

Barbaro L., Couanon V., Lannès O.2014 Bruant fou, Bruant jaune, Crave à bec rouge, Huppe fasciée, Merle à

plastron, Tarier des prés, Mésange huppée, Locustelle tachetée, Pipit farlouse, Roitelet huppé. In: LPO Aquitaine (ed.) Atlas des oiseaux nicheurs d’Aquitaine, Delachaux & Niestlé.

Jactel H., Barbaro L., Brockerhoff E.G., Castagneyrol B., Dulaurent A.M., Samalens J.C., Schlyter F.E.2014

Effect of tree species diversity on Thaumetopoea pityocampa infestations. In: Roques A. (ed.). Processionary moths and global change: an update. Springer Verlag.

Barbaro L., Charbonnier Y., Vetillard F., Blache S., Battisti A. 2014 Numerical and functional responses of

predatory vertebrates to the pine processionary moth. In: Roques A. (ed.). Processionary moths and global change: an update. Springer Verlag.

Trochard G., Blache S., Kayser Y., Barbaro L. 2013 La Chevêchette d’Europe Glaucidium passerinum: premiers éléments de son régime alimentaire sur les Hauts Plateaux du Vercors. In : FRAPNA (ed.) Actes du colloque ‘La prédation’, 22-23 mars 2013, ENS Sciences, Lyon: 67-72.

Jactel H., Barbaro L. 2009 Impacts de la production intensive de biomasse sur la biodiversité dans les forêts de plantations: l’exemple des futaies à courte révolution de Pin maritime. In: Landmann G., Gosselin F., Bonhême I. (eds). Bio2, Biomasse et biodiversité forestières. Paris, MEEDDM-Ecofor: 89-97.

Giffard B., Corcket E., Barbaro L., Jactel H. 2008 Variations dans les interactions tritrophiques lors de la régénération d’essences feuillues. In: Bonis A. (ed) Actualité de la recherche en écologie des communautés végétales : actes du 4e colloque Ecoveg, Rennes, 12-14 mars 2008, Lavoisier, Tec & Doc, Paris: 87-93. Jactel H., Barbaro L., Brockerhoff E. 2007 Contribution of plantation forests to biodiversity conservation: the

landscape perspective. In: Martres J.L. (ed), Proceedings of the International Congress on Cultivated Forests, USSE, Spain: 336-337.

van Halder I., Barbaro L., Corcket E., Jactel H. 2007 Butterfly diversity in pine plantation landscapes. In: Martres J.L. (ed), Proceedings of the International Congress on Cultivated Forests, USSE, Spain: 338-339. Jactel H., Barbaro L. 2004 Projet ISLANDES: évaluation de la méthode des îlots de feuillus en mélange pour

restaurer la biodiversité de l’écosystème simplifié de pin maritime des Landes de Gascogne. In: Millier C., Barre V., Landeau S. (eds), Biodiversité et Gestion Forestière. GIP Ecofor, Paris: 18-26.

Barbaro L. 2003 Bergeronnette printanière, Accenteur mouchet, Rougequeue à front blanc, R. noir, Tarier des

prés, Rousserolle verderolle, Roitelet huppé, R. triple-bandeau, Mésange nonnette, M. boréale, M. huppée, Moineau soulcie. In: CORA Drôme (ed.) Atlas des oiseaux nicheurs de la Drôme, Romans: pp 127 à 223.

Barbaro L., Blache S., Ladet A. 2003 Moineau soulcie (Petronia petronia). In: CORA (ed) Oiseaux nicheurs de

Rhône-Alpes, Centre Ornithologique Rhône-Alpes, Lyon: p 259.

Articles non-indexés (11 articles)

Blache S., Trochard G., Barbaro L. 2014 Distribution spatiale et densité de la Chevêchette d’Europe

Glaucidium passerinum sur la Réserve Biologique Intégrale des Hauts-Plateaux du Vercors : état des lieux

2009-2011. Le Bièvre, sous presse.

Barbaro L. 2010 Note sur les observations de Coucou-geai Clamator glandarius en Aquitaine et

Charente-Maritime. Online at www.faune-aquitaine.org, réf. n°0003_FA2009.

Barbaro L. 2009 La Huppe fasciée, alliée du forestier. La Gazette des Forêts 12: 3.

Barbaro L., Plichon A. 2009 Les Coléoptères carabiques (Coleoptera, Carabidae) des habitats humides de la

Réserve Naturelle de l’Etang de Cousseau (Lacanau, Gironde). Bulletin de la Société Linnéenne de

Bordeaux 144/37: 85-93.

Barbaro L., Vetillard F., Menassieu P., van Halder I. 2006 Liste commentée des Coléoptères carabiques

(Coleoptera Carabidae) de la forêt des Landes de Gascogne (Landes et Gironde). Bulletin de la Société

Linnéenne de Bordeaux 141/34: 197-210.

Barbaro L., Vetillard F. 2005 Les Coléoptères carabiques bioindicateurs de la gestion forestière dans les Landes

de Gascogne. Sud Ouest Nature 129: 26-28.

Barbaro L., Grisser P., Nezan, J. 2004 Phénologie et effectifs des plongeons en période internuptiale sur le

littoral aquitain de 1993 à 2004. Le Courbageot 24: 24-27.

Barbaro L., Nezan J., Bakker M., Revers F., Couzi L., Vetillard F., Le Gall O. 2003 Distribution par habitats

des oiseaux nicheurs à enjeu de conservation en forêt des Landes de Gascogne. Le Courbageot 21/22: 12-23.

Barbaro L. 2000 Gestion de la biodiversité par le pastoralisme: exemple des pelouses calcicoles sèches du

Vercors méridional. La Fayolle 2: 18-27.

Barbaro L., Boyer P. 1999 Observations sur la nidification et l'évolution récente du Moineau soulcie (Petronia

(10)

Barbaro L., Cozic P. 1998 Organisation agro-écologique des pelouses et landes calcicoles du Parc Naturel

Régional du Vercors. Ecologie 29: 443-457.

Communications dans des congrès et colloques (49 communications)

Barbaro L., Battisti A., Charbonnier Y., Dulaurent A.M., Jactel H. 2014 Trophic interactions between

vertebrate insectivores and a climate-driven expanding forest moth. IUFRO World Congress, Salt Lake City, USA, 5-11th October 2014 (communication orale).

Barbaro L. 2014 Comparaison de l’avifaune nicheuse et migratrice dans un réseau de prairies humides

girondines. Séminaire ‘Restauration d’une prairie humide alluviale en Gironde’, Univ. Bordeaux, 17 janvier 2014 (communication orale).

Voinopol-Sassu J., Brockerhoff E.G., Hock B., Barbaro L. 2013 Functional habitat connectivity for the Rifleman Acanthisitta chloris on Banks Peninsula, New Zealand. EcoTas13, 5th joint conference of New Zealand Ecological Society and Ecological Society of Australia, Auckland, New Zealand, 24-29th November 2013 (communication orale).

Blache S., Barbaro L., Trochard G., de Lacoste N., Kayser Y. 2013 Ecologie du domaine vital et régime alimentaire de la Chevêchette d’Europe dans une Réserve Biologique Intégrale préalpine. 1ères rencontres nationales du réseau LPO-ONF ‘Petites chouettes de montagne’ 8-10 novembre 2013, Sarrebourg (communication orale).

Barbaro L., Battisti A. 2013 Stratégies de prédation d’un lépidoptère urticant par les oiseaux insectivores :

l’exemple de la processionnaire du pin. 7èmes Rencontres du Groupe des Entomologistes Forestiers Francophones, Brens, 22-24 octobre 2013 (communication orale).

Charbonnier Y., Barbaro L., Theillout A., Jactel H. 2013 Réponses numériques et fonctionnelles de chauves-souris insectivores à la processionnaire du pin. 7èmes Rencontres du Groupe des Entomologistes Forestiers Francophones, Brens, 22-24 octobre 2013 (communication orale).

van Halder I., Barbaro L., Jactel H. 2013 Effet de la taille, l’isolation et la qualité des îlots de feuillus sur les cortèges de papillons de jour. 7èmes Rencontres du Groupe des Entomologistes Forestiers Francophones, Brens, 22-24 octobre 2013 (communication orale).

Barbaro L. 2013 Les traits de vie comme indicateurs de réponses multi-taxa à la fragmentation des paysages

forestiers. Atelier scientifique ‘Intérêts et limites des approches multi-taxonomiques de la biodiversité’, programme BGP, GIP Ecofor, Maison de la Forêt, Bordeaux, 26 juin 2013 (communication orale).

Barbaro L. 2013 Relier conservation de la biodiversité et interactions trophiques : les communautés d’oiseaux

et de lépidoptères dans les mosaïques de paysages forestiers. Soutenance d’Habilitation à Diriger des Recherches, INRA Bordeaux, 25 juin 2013.

Barbaro L., Brockerhoff E.G., Giffard B., Charbonnier Y., van Halder I., Deconchat M. 2013 Insectivorie et

diversité fonctionnelle des communautés d’oiseaux dans les lisières forestières. Séminaire de l’UMR Biogeco, INRA Pierroton, 5 avril 2013 (communication orale).

Giffard B., Corcket E., Barbaro L., Prud’homme R., Jactel H. 2013 Composition du peuplement forestier et voisinage végétal modulent les interactions trophiques dans la régénération forestière. Colloque ECOVEG 9, Tours, 3-5 avril 2013 (communication orale).

Charbonnier Y., Barbaro L., Theillout A., Jactel H. 2013 Numerical and functional responses of foraging forest bats to a key pine defoliator. 3rd International Berlin Bat Meeting: Bats in the Anthropocene, 1st - 3rd March 2013, Berlin, Germany (communication affichée).

Barbaro L., Deconchat M., Terraube J., Archaux F., van Halder I., Charbonnier Y. 2012 Réponses de l’avifaune

et de l’insectivorie avienne aux lisières forestières. Réunion annuelle du projet GIP Ecofor BILISSE, Toulouse, 13 décembre 2012 (communication orale).

Corcket E., Barbaro L., Jactel H. 2012 Régulation biologique dans les forêts. Conférences du pôle de compétitivité Xylofutur, Bordeaux Sciences Agro, Gradignan, 25 septembre 2012 (communication orale).

Barbaro L., Brockerhoff E.G., Giffard B., Terraube J., Charbonnier Y., van Halder I. 2012 Edge effects on bird

functional diversity and insectivory in mosaic forest landscapes: a transcontinental comparison. 2d IUFRO Conference, Biodiversity in forest ecosystems and landscapes, University College, Cork, Ireland, 28-31 August 2012 (communication orale).

Giffard B., Corcket E., Barbaro L., Jactel H. 2012 Neighbouring vegetation influences tritrophic interactions between insectivorous birds, herbivorous insects and tree seedlings. Ecology and Behaviour, 8th Annual Meeting (SERL), 2 April – 6 April 2012, CEBC CNRS Chizé (communication orale).

van Halder I., Barbaro L., Jactel H. 2012 Conserving butterflies in plantation forests. International Butterfly Congress, Future of Butterflies in Europe III, Wageningen, Nederland, March 2012 (communication orale).

Barbaro L., Brockerhoff E.G., Giffard B., van Halder I. 2011 Effets des lisières et de la fragmentation forestière

sur la prédation par les oiseaux insectivores dans les forêts natives néo-zélandaises. 5èmes Journées d’Ecologie du Paysage IALE France, 7-10 novembre 2011, Aix en Provence (communication orale).

(11)

Samalens J.C., Dulaurent A.M., Barbaro L., Piou D., Jactel H. 2011 Epidémiologie du paysage : le cas de la chenille processionnnaire du pin (Thaumetopoea pityocampa). 5èmes Journées d’Ecologie du Paysage IALE France, 7-10 novembre 2011, Aix en Provence (communication orale).

Barbaro L., Charbonnier Y., Dulaurent A.M., Battisti A., Vetillard F., Jactel H. 2011 Functional and numerical

responses of predatory vertebrates to the pine processionary moth: a synthesis. Final meeting, ANR Urticlim, 17-19 November 2011, Belgodère, Corsica (communication orale).

Terraube J., Giffard B., Charbonnier Y., van Halder I., Barbaro L. 2011 Effet de la prédation par les oiseaux sur les populations d’insectes forestiers et ses implications pour les communautés végétales. 6èmes Rencontres du Groupe des Entomologistes Forestiers Francophones, Le Teich, 12-14 octobre 2011 (communication orale). Brockerhoff E., Ecroyd C., Hock B., Pawson, S., Paul T., Barbaro L., Deconchat M., Jactel H. 2010 The role of

plantation forests in biodiversity conservation in New Zealand. Biodiversity: 2010 and beyond, New Zealand Ecological Society Conference, 22-25 November 2010, Dunedin, New Zealand (communication orale). Giffard B., Corcket E., Barbaro L., Prudhomme R., Louvet J.M., Jactel H. 2010 Effet indirect des oiseaux

insectivores sur les dommages foliaires d’insectes phytophages: influence de l’espèce de plantule forestière et du type de peuplement. Colloque Ecologie 2010, 2-4 septembre 2010, Montpellier (communication affichée).

Barbaro L. 2010 Biodiversité dans les lisières forestières: comment gérer les interfaces entre forêts et milieux

ouverts pour la biodiversité ? Conseil Scientifique du pôle de compétitivité Xylofutur, 25 mars 2010, Pierroton (communication orale).

Barbaro L., Derouault A., Payet K., Blache S., Vetillard F., Jean F. 2009 Insectivorous bird assemblages along

an elevation gradient of T. pityocampa expansion in the southern Alps. Annual meeting, ANR Urticlim, INRA Orléans, 12-13 november 2009 (communication orale).

Giffard B., Corcket E., Barbaro L., Jactel H. 2009 Variations de réponse des dégâts d’insectes aux cascades trophiques lors de la régénération d’essences feuillues. 4èmes Rencontres du Groupe des Entomologistes Forestiers Francophones, Semur en Auxois, 20-22 octobre 2009 (communication orale).

Barbaro L. 2008 Les oiseaux insectivores prédateurs de la processionnaire du pin. Colloque Insectes et

changement climatique, Micropolis (Aveyron) 14-15 novembre 2008 (communication orale).

Barbaro L., Blache S., Payet K., Vetillard F., Jean F. 2008 Mise en place du dispositif de suivi de l'avifaune

prédatrice. Colloque Insectes et changement climatique, Micropolis (Aveyron) 14-15 novembre 2008 (communication orale).

Barbaro L., van Halder I., Vetillard F., Nezan J. 2008 Life-history traits indicate bird, beetle and butterfly

responses to landscape fragmentation in plantation forests. IUFRO Conference, Kamloops, British Columbia, Canada, 4-9 aout 2008 (communication orale).

Brockerhoff E., Deconchat M., Barbaro L., Paul T., Luecht S., Muir J., Henley D. 2008 Effects of land cover on indigenous forest birds in Canterbury, New Zealand. IUFRO Conference, Kamloops, Canada, 4-9 aout 2008 (communication orale).

van Halder I., Barbaro L., Jactel H. 2008 Quel est l’intérêt d’échantillonner les lisières pour évaluer la diversité des papillons de jour en forêt de plantation ? 3èmes Rencontres du Groupe des Entomologistes Forestiers Francophones, Bedoin, 27 mars 2008 (communication orale).

Giffard B., Corcket E., Barbaro L., Jactel H. 2008 Impact des oiseaux insectivores et du couvert arboré sur les variations d'herbivorie lors de la régénération des essences feuillues. Colloque ECOVEG 4, Rennes, mars 2008 (communication orale).

Brockerhoff E., Deconchat M., Barbaro L., Luecht S., Muir J., Henley D. 2007 Effects of land cover type on indigenous forest birds in Canterbury. New Zealand Ecological Society Conference, novembre 2007, Christchurch, New Zealand (communication orale).

Deconchat M., Barbaro L., Brockerhoff E. 2007 Les plantations exotiques peuvent-elles favoriser la conservation des oiseaux forestiers indigènes dans des paysages fragmentés de Nouvelle Zélande ? 4èmes Journées d’Ecologie du Paysage IALE France, INRA Toulouse, novembre 2007 (communication orale).

Barbaro L., Couzi L., Nezan J., Vetillard F., Bretagnolle V. 2007 Complémentation entre habitats à l’échelle du

paysage pour la Huppe fasciée (Upupa epops) en forêt de plantation. 4èmes Journées d’Ecologie du Paysage IALE France, INRA Toulouse, novembre 2007 (communication orale).

Barbaro L., Corcket E., van Halder I., Burlett R., Witte I., Vetillard F. 2007 Réponse des plantes vasculaires,

des papillons de jour, des coléoptères carabiques et des oiseaux nicheurs au microclimat en forêt de plantation. Colloque ECOVEG 3, Bordeaux, mars 2007 (communication affichée).

Barbaro L., Couzi L., Nezan J., Vetillard F., Bretagnolle V. 2006 Rôle fonctionnel et conservation de la Huppe

fasciée Upupa epops en forêt des Landes de Gascogne. 3èmes Rencontres Naturalistes de la LPO Aquitaine, Belin-Beliet, juin 2006 (communication orale).

Jactel H., Barbaro L., Brockerhoff E. 2006 Contribution of plantation forests to biodiversity conservation: the landscape perspective. IUFRO Conference, Ecosystem goods and services from planted forests, Bilbao, October 2006 (communication orale).

(12)

Jactel H., Barbaro L., van Halder I. 2006 Vers des indicateurs d’habitat pour la biodiversité des forêts ? Séminaire Indicateurs de Biodiversité Forestière, GIP ECOFOR, Paris, mai 2006 (communication orale). van Halder I., Barbaro L., Corcket E., Jactel H. 2006 Butterfly diversity in pine plantation landscapes. IUFRO

Conference, Ecosystem goods and services from planted forests, Bilbao, October 2006 (comm. orale). van Halder I., Jactel H., Barbaro L., Corcket E., Vetillard F. 2006 Towards indirect, management oriented

indicators for biodiversity in plantation forests. IUFRO Conference, Indicators for sustainable forest management in cultivated forests, Porto, 11-13 December 2006 (communication orale).

Barbaro L., Dupuich M., Corcket E., van Halder I., Witte I., Burlett R., Vetillard F., Brunet Y. 2005 Approche

multi-taxa des relations microclimat-biodiversité en forêt de plantation. Colloque ECCO, Programme National coordonné ANR, 5-7 Dec. 2005, Météo France, Toulouse, France (communication affichée).

Barbaro L., Vetillard F., Nezan, J., Sin F. 2005 The scale-dependent effect of spatial heterogeneity on

biodiversity in pine plantation landscapes. IUFRO Conference, Biodiversity and conservation biology in plantation forests, 26-29 April 2005, Bordeaux, France (communication orale).

van Halder I., Barbaro L., Lugot A., Jactel H. 2005 Butterfly community structure in maritime pine plantation landscapes. IUFRO Conference, Biodiversity and conservation biology in plantation forests, 26-29 April 2005, Bordeaux, France (communication affichée).

Jactel H., Rossi J.P., Barbaro L., Piou D., Vetillard F., Barthelemy B., Menassieu P. 2004 Landscape diversity reduces processionary moth infestations in pine plantations. IUFRO Conference, Forest diversity and resistance to native and exotic pest insects, 10-13 August 2004, Hanmer Springs, New Zealand (communication orale).

Barbaro L. 2003 Bird and ground-beetle diversity along the sand deposition gradient in south-western French

coastal dunes. Workshop IMPACS, Integrated Management of Pressures Affecting Coastal Sand Dunes, Carcans, 19-22 June 2003 (communication orale).

Jactel H., Barbaro L. 2003 Biodiversity indicators at stand and landscape scales in pine plantation forests. IUFRO Conference, Monitoring and indicators of forest biodiversity in Europe, 12-15 November 2003, Florence, Italie (communication orale).

Barbaro L., Jactel H., Tavernier A., Menassieu P., Vetillard F., Balent G., Cornic J.F., Couzi L., Goulard M.,

Guinberteau J., Guyon D., Lung B., Revers F., Timbal J. 2002 Les îlots de feuillus en forêt des Landes de Gascogne: effet sur la biodiversité et l’état sanitaire des plantations de Pin maritime. Séminaire Biodiversité et Gestion Forestière, GIP Ecofor, Engref Paris, février 2002 (communication orale).

Barbaro L., Corcket E., Dutoit T., Peltier J.P. 1999 Réponses fonctionnelles des communautés de pelouses

calcicoles aux facteurs agro-écologiques dans les Préalpes françaises. Journées d’Ecologie Fonctionnelle, La Grande Motte, 15 au 17 mars 1999 (communication affichée).

Mémoires et rapports de recherche (20 rapports)

Barbaro L., Ouin A., Jactel H., Deconchat M., van Halder I. 2013 Biodiversité dans les lisières forestières :

comment gérer les interfaces entre forêts et milieux ouverts pour la biodiversité ? Rapport final du projet Biolis, Action interrégionale Aquitaine - Midi-Pyrénées: 13 p.

Barbaro L. 2013 Linking biodiversity conservation to trophic interactions: avian and lepidopteran communities

in mosaic forest landscapes. Mémoire d’Habilitation à Diriger des Recherches, Univ. de Bordeaux 1: 136 p.

Barbaro L. 2013 Evaluation de l’indicateur ‘Déplacement des espèces lié au changement climatique’ de

l’Observatoire National de la Biodiversité pour la Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité, mars 2013.

Jactel H., Barbaro L., Vetillard F., Nezan J., Charbonnier Y., Terraube J., van Halder I., Rigot T., Roques A., Tavares C., Branco M. 2012 Lutte biologique contre la cochenille du pin maritime Matsucoccus feytaudi en Corse 2009-2012. Rapport final du programme quadriennal, Lutte biologique contre la cochenille du pin maritime, Région Corse: 50 p.

Barbaro L., Terraube J., Duphil E., Deconchat M., Charbonnier Y., Ouin A., van Halder I., Corcket E., Alard

D., Jactel H. 2012 Biodiversité dans les lisières forestières. Bilan scientifique du projet BIOLIS, INRA - Régions Aquitaine et Midi-Pyrénées: 25 p.

Trochard G., Blache S., Barbaro L. 2012 La Chevêchette d’Europe Glaucidium passerinum sur la Réserve Biologique Intégrale des Hauts Plateaux du Vercors : bilan de trois années de recherche sur l’écologie et la biologie de l’espèce (2009-2010-2011). Rapport final LPO Drôme, ONF, Réserve Naturelle des Hauts Plateaux du Vercors: 51 p.

Barbaro L., Vetillard F., Payet K., Derouault A., Blache S. 2011 Etude de l’impact de l’expansion de la

processionnaire sur la biodiversité interspécifique des zones néo-colonisées : avifaune prédatrice. Rapport final, ANR Urticlim, INRA Biogeco: 7 p.

Barbaro L., Jouandoudet F. 2008 Bilan préliminaire de l’inventaire des Orthoptères de la Réserve Naturelle de

(13)

Barbaro L. 2008 Ecologie de la recherche alimentaire de la Huppe fasciée Upupa epops en forêt des Landes de

Gasxcogne. Bilan de programme personnel n°142, CRBPO, MNHN: 6 p.

Rossi J.P., Jactel H., van Halder I., Barbaro L., Corcket E., Alard D. 2007 Indicateurs indirects de biodiversité en forêt de plantation. Rapport final, GIP ECOFOR, Les indicateurs de biodiversité en milieu forestier: 19 p.

Barbaro L. 2006 Action 3.1. Pratiques sylvicoles et diversité. In: Kremer A. (coord.), Rapport d’évaluation de

l’Unité Mixte de Recherche BIOGECO, INRA -Univ. Bordeaux 1.

van Halder I., Barbaro L., Corcket E., Jactel H. 2006 Rapport final du projet FORSEE. Indicateurs de biodiversité. Projet INTEREGIIIB Espace Atlantique: 24p.

Barbaro L., Brunet Y. 2005 FORMICA (FORêts, MICroclimat et Assemblages d’espèces): une approche

hiérarchisée des relations entre microclimat, biodiversité et fonctionnement des paysages forestiers. Rapport d’activité 2004-2005 du Programme National - ACI ECCO: 8 p.

Barbaro L. 2004 Critère 4: conservation et amélioration appropriées de la biodiversité dans les écosystèmes

forestiers. In: Carnus J.M. (coord), GIS Observatoire des Forêts d'Aquitaine, Document d'orientations 2004-2007, INRA Pierroton: 20-23.

Jactel H., Barbaro L. 2004 Biodiversité spécifique et fonctionnelle des îlots de feuillus en pinède de plantation (Landes de Gascogne). Rapport final du projet ISLANDES, programme Biodiversité et gestion forestière 2001-2003, GIP Ecofor: 95 p.

Barbaro L., Jactel H. 2002 Projet ISLANDES. Les îlots de feuillus en forêt des Landes de Gascogne: relations

entre la biodiversité forestière et l’état sanitaire des plantations de Pin maritime. Rapport d'étape du programme Biodiversité et gestion forestière, GIP Ecofor: 18 p.

Barbaro L. 2002 Action 3.1. Pratiques sylvicoles et diversité; Action 5.1. Conservation de la diversité. In:

Kremer A. (coord.), Demande de reconnaissance d'une Unité Mixte de Recherche ‘Diversité Biologique des Ecosystèmes Terrestres’, INRA-Univ. Bordeaux 1: pp 56 et 61-62.

Jactel H., Barbaro L., Lung B., Guyon D., Timbal J., Guinberteau J. 2000 Projet ISLANDES : évaluation de la méthode des îlots de feuillus en mélange pour restaurer la biodiversité de l'écosystème simplifié de Pin maritime des Landes de Gascogne et améliorer sa résistance aux insectes ravageurs et champignons pathogènes. Projet de recherche GIP Ecofor, Biodiversité et gestion forestière, INRA Pierroton: 39 p.

Barbaro L. 1999 Dynamique agro-écologique des communautés de pelouses sèches calcicoles du Vercors

méridional: application à la gestion conservatoire de la biodiversité par le pastoralisme. Thèse de Biologie, Université Joseph Fourier Grenoble 1: 185 p.

Boyer P., Barbaro L. 1996 Passereaux nicheurs et pratiques pastorales: contribution au suivi écologique de l'Article 19 en Ariège. Ministère de l’Environnement, Cemagref Grenoble: 96 p.

Produits à vocation pédagogique destinés à un large public

2014 Interview dans le documentaire ‘Discrète chevêchette’, réalisation Yoann Périé, production Vue sur Terre,

septembre 2013 (http://www.vuesurterre.com/)

2013 Interview dans le documentaire ‘Les conquérants: la processionnaire du pin’, réalisation Vincent

Amouroux, production Arte-Zed, diffusion 2e semestre 2013.

2010 Interview dans le film ‘La biodiversité et la santé des forêts’, INRA - Salon de l’Agriculture.

(http://www7.bordeaux-aquitaine.inra.fr/layout/set/print/toute_l_actu/videos/video_biodiv_foret)

2007 Interview pour le magazine d’information jeunesse en Gironde ‘Peti’potin’, n°11, printemps 2007. Travaux encadrés ou co-encadrés (3 thèses, 2 post-docs, 8 masters, 6 autres)

Voinopol-Sassu J. 2013 Effect of native forest connectivity on rifleman Acanthisitta chloris in Banks Peninsula,

New Zealand. MSc project, University of Lincoln, New Zealand (co-encadrement E. Brockerhoff).

De Lacoste N. 2013 Sélection de l’habitat forestier de la Chevêchette d’Europe Glaucidium passerinum par

analyse des domaines vitaux dans une Réserve Biologique Intégrale de montagne. Master 1, Ecologie, Biodiversité, Evolution, Univ. Paris Sud Orsay (co-encadrement S. Blache).

Gaüzère P. 2012 Effects of forest composition on activity and structure of bat communities. Master Pro,

Biodiversité et Développement Durable, Université de Perpignan (co-encadrement Y. Charbonnier).

Barnagaud J-Y. 2012 Effets de la fragmentation des forêts natives sur l’avifaune native et exotique de

Nouvelle-Zélande. Chercheur post-doctoral, INRA Pierroton.

Charbonnier Y. 2011- Diversité fonctionnelle des forêts et des communautés de chiroptères et d’oiseaux

insectivores sur un gradient latitudinal en Europe. Thèse de doctorat en cours (co-direction H. Jactel).

Terraube J. 2011 Réponses de l’avifaune aux lisières forestières dans des paysages fragmentés. Chercheur

post-doctoral, INRA Pierroton.

Derouault A. 2009 Comparaison des communautés d’oiseaux insectivores sur des gradients d’expansion en

(14)

Giffard B. 2008-2011 Rôle des interactions tri-trophiques complexes dans la régénération d’essences feuillues.

Thèse de doctorat soutenue le 3/10/2011 (co-direction E. Corcket et H. Jactel).

Payet K. 2008 Analyse quantitative de la structure et de la composition des paysages forestiers sur le versant

Nord-Ouest du Mont Ventoux. Contrat d’Ingénieur de Recherches, ANR Urticlim.

Giffard B. 2007 La prédation par les oiseaux sur les insectes herbivores : effets indirects sur la régénération

d’espèces feuillues. Master 2, Univ. Bordeaux 1 (co-encadrement E. Corcket).

Nezan J. 2006 Etude par radiopistage des domaines vitaux et des sites de recherche alimentaire de huppes

fasciées en forêt de plantation. Contrat d’Ingénieur de Recherches, ANR ECCO.

van Halder I. 2005- Effets de la connectivité fonctionnelle des paysages de plantations de pin maritime sur la

biodiversité des lépidoptères rhopalocères associés aux îlots de feuillus. Thèse de doctorat en cours, suspendue pour recrutement professionnel (co-direction H. Jactel).

Dupuich M. 2005 Distribution spatiale et effet des lisières sur les déplacements de deux coléoptères carabiques

(Coleoptera Carabidae) en forêt landaise. Master 2, Univ. Bordeaux 1.

Grillon X. 2004 Protocole du premier inventaire araignées de la Réserve Naturelle de l'Etang de Cousseau

(Lacanau-Gironde). Stage de DESS, RN Etang de Cousseau, SEPANSO (co-encadrement A. Plichon).

Sin F. 2004 Relations spatiales prédateur-proie en forêt de plantation: la huppe fasciée Upupa epops et la

processionnaire du pin T. pityocampa dans les Landes de Gascogne. Master 1, Univ. Bordeaux 1.

Le Mouel S. 2003 Cartographie numérique d’un paysage forestier hétérogène: le bassin-versant du Tagon en

Gironde. Contrat d’Ingénieur de Recherches, ANR Ecologie Quantitative.

Claudel L. 2003 Ecologie et gestion conservatoire d'un papillon menacé Coenonympha oedippus à la Réserve

Naturelle de l'Etang de Cousseau (Gironde). Stage volontaire, RN Etang de Cousseau-Univ. Bordeaux 1 (co-encadrement B. Touzard).

Pontcharraud L. 2002 Structure du paysage et biodiversité en forêt landaise. Stage de DESS SIGMA,

ENSAT-Univ. Toulouse Le Mirail (co-encadrement D. Guyon).

Vetillard F. 2001 Des feuillus au secours des résineux: projet de restauration de la biodiversité par

l’implantation de feuillus dans la forêt monospécifique des Landes de Gascogne. Stage de BTSA GPN, (co-encadrement H. Jactel).

Jurys et comités de thèses Jurys de thèse et de diplômes EPHE

Miguet P. 2013 Influence of crop heterogeneity in farmlands on population dynamics and distribution, CNRS

Chizé, INRA AMAP (dir. V. Bretagnolle & C. Gaucherel, déc. 2013)

Haquart A. 2013 Référentiel d’activité des chiroptères : éléments pour l’interprétation des dénombrements de

chiroptères avec les méthodes acoustiques en zone méditerranéenne française. Diplôme Ecole Pratique des Hautes Etudes, Univ. Montpellier 2 (dir. C. Kerbiriou, J.F. Julien et A. Besnard).

Gillis H. 2011 Changement global et dynamique de sélection d’habitat de reproduction d’un oiseau nichant au

sol: cas du busard cendré en milieu agricole intensif. Thèse de Doctorat, Univ. Pierre et Marie Curie, CNRS Chizé (dir. V. Bretagnolle).

Giffard B. 2011 Rôle des interactions tri-trophiques complexes dans la régénération d’essences feuillues. Thèse

de Doctorat, Univ. de Bordeaux (dir. H. Jactel, E. Corcket et L. Barbaro).

Avon C. 2010 Influences de la composition et de la structure actuelles de la mosaïque paysagère sur la diversité

de la flore en forêt. Thèse de Doctorat, Univ. d’Orléans (dir. J.L. Dupouey et L. Bergès).

Debras J.F. 2007 Rôles fonctionnels des haies dans la régulation des ravageurs: le cas du psylle Cacopsylla pyri

L. dans les vergers du sud-est de la France. Thèse de Doctorat, Univ. d’Avignon (dir. T. Dutoit et R. Rieux).

Blache S. 2005 La Chevêche Athene noctua en zone d'agriculture intensive: habitat, alimentation, reproduction.

Diplôme Ecole Pratique des Hautes Etudes, Univ. Montpellier 2 (dir. M. Thévenot).

Richard E. 2004 Conversion en futaie régulière et diversité des Coléoptères carabiques: aspects

méthodologiques et réponse des communautés. Thèse de Doctorat, Engref Paris (dir. F. Gosselin).

Principaux projets scientifiques

2013-2017 - BIO-THAW, Modeling Biodiversity and land use interactions under changing glacial water

availability in Tropical High Andean Wetlands, IRD - Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité

2013-2015 - LEVANA, Influence de l’organisation des paysages agricoles sur la distribution, la stabilité et la

dispersion des papillons, programme DIVA 3 Agriculture et Biodiversité

2012-2014 - Restauration écologique en zone humide fluviatile fortement dégradée: l'Ile de Raymond en basse

(15)

2011-2014 - FunDivEUROPE, Functional significance of forest biodiversity in Europe, Programme FP7, Union

Européenne

2011-2013 - BILISSE, Biodiversité et services écosystémiques dans les lisières forestières, GIP ECOFOR

(coordinateur de WP)

2011-2012 - BIOLIS, Biodiversité dans les lisières forestières, Action inter-régionale Aquitaine-Midi-Pyrénées

(coordinateur)

2010-2013 - Lutte biologique contre la cochenille du pin maritime en Corse, Région Corse (coordinateur de WP) 2008-2011 - URTICLIM, Anticipation des effets du changement climatique sur l'impact écologique, sanitaire et

social d'insectes forestiers urticants, ANR Biodiversité (coordinateur de WP)

2006-2007 - Indicateurs indirects de biodiversité en forêt de plantation, GIP Ecofor programme BGF

2005-2008 - Ecologie et adaptation des insectes phytophages et gestion de leurs populations, ANR ECOGER 2005-2008 - Ecologie de la recherche alimentaire de la huppe fasciée, programme personnel CRBPO-MNHN 2005-2006 - FORMICA, Forêts, microclimat et assemblages d'espèces, ANR ECCO - PNBC (coordinateur) 2004-2006 - FORSEE, Indicateurs de gestion durable des forêts, INTERREG III A

2002-2003 - Spatialisation et dynamique des processus écologiques à l'échelle de paysages forestiers

hétérogènes, ACI Ecologie Quantitative (co-coordinateur)

2001-2003 - ISLANDES, Biodiversité des îlots feuillus en forêt de plantation, GIP ECOFOR (co-coordinateur) Reviewing scientifique

Ecologie: Journal of Applied Ecology, Ecology, Journal of Animal Ecology, Journal of Biogeography,

Ecography, Oikos, Plant Ecology, Biological Journal of the Linnean Society, Bird Study, Landscape and Urban Planning, Acta Oecologica, Biologia.

Entomologie et Forêt: Forest Ecology and Management, Biological Control, Agricultural and Forest

Entomology, European Journal of Forest Research, Annals of Forest Science, Revue Forestière Française.

Activités d'enseignement

Master 2 Recherche Fonctionnement des Ecosysytèmes Terrestres, Université Bordeaux 1, UE Interactions biotiques : ‘Prédation et insectivorie avienne’

Activités administratives et expertises

Evaluation de l’indicateur ‘Déplacement des espèces lié au changement climatique’ de l’Observatoire National de la Biodiversité pour la FRB (Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité) en 2013

Présentation du bilan scientifique ‘Conservation de la biodiversité’ devant la commission d’évaluation de l’UMR Biogeco par l’AERES en novembre 2009

Correspondant INRA pour l’entretien des collections entomologiques cédées à la Société Linnéenne de Bordeaux (Musée d’Histoire Naturelle de Bordeaux) par l’INRA Bordeaux

Responsable du groupe de travail AQR ‘Documentation’ de l’UMR Biogeco

Participation à la rédaction du rapport d’évaluation et du projet quadriennal de l’UMR Biogeco en 2006 et 2009 Participation au groupe de travail ‘Biodiversité’ du GIS Observatoire des Forêts d'Aquitaine et à la rédaction du

document d'orientations 2004-2007

Participation à des comités scientifiques

Membre du Conseil Scientifique du Conservatoire Régional Espaces Naturels d’Aquitaine Membre du Comité d’Homologation Régional des observations d’oiseaux rares en Aquitaine Co-organisateur des 3èmes Rencontres Naturalistes organisées par la LPO Aquitaine en juin 2006

Qualifications complémentaires

Stage de formation du CNRS Chizé ‘Modélisation spatio-temporelle et utilisation des SIG dans les études d'écologie évolutive’ - novembre 2001

Stages de formation du Muséum National d'Histoire Naturelle (CRBPO) ‘Techniques de capture, de manipulation et de mesures biométriques d'oiseaux’ - avril 2001, sept. 2003, aout 2005

(16)

1

ère

partie :

Introduction générale

Astronomy was a respected science long before ecology, and Copernicus and Galileo

never moved a star.

(17)

1.1. Préambule

Mon parcours de recherche se situe à l’interface de la biogéographie et de l’écologie

des communautés, dont j’ai progressivement assimilé les concepts et les outils au cours de

ma formation universitaire initiale de géographe jusqu’à mon doctorat sur les communautés

végétales prairiales de montagne. Depuis une dizaine d’années, mes recherches se sont peu à

peu centrées sur le rôle de l’hétérogénéité des mosaïques paysagères dans la conservation

de la biodiversité multi-taxonomique dans les forêts de plantation. Le niveau d’organisation

du paysage s’est naturellement avéré comme le plus pertinent pour aborder des questions

relevant à la fois de la biogéographie de la conservation et de l’écologie des communautés.

J’ai ainsi travaillé, souvent dans le cadre de collaborations, sur plusieurs taxa de vertébrés et

d’arthropodes prédateurs (araignées, coléoptères carabiques, chiroptères), mais tout

particulièrement sur les oiseaux insectivores et les lépidoptères herbivores, dans une

perspective finalisée de contrôle biologique des insectes ravageurs forestiers par

conservation de la diversité des ennemis naturels.

Le présent travail s’organise en trois parties, comprenant d’abord une introduction des

concepts et des méthodes essentiels à la compréhension des patrons et des processus

écologiques étudiés. L’introduction générale de ce mémoire présente le contexte théorique et

méthodologique dans lequel mes recherches se situent : une approche hiérarchique

multi-niveaux d’organisation des systèmes écologiques, une approche des mosaïques paysagères

comme des continuums d’habitats plutôt que des fragments isolés dans une matrice de

non-habitat, et une utilisation des guildes trophiques et des traits d’histoire de vie des espèces

comme des facteurs explicatifs de la réponse des communautés à la structure et à la

composition des habitats. La diversité fonctionnelle des communautés permet en effet de

relier des questions d’écologie de la conservation à des questions de fonction de la

biodiversité dans les paysages forestiers, et de services écosystémiques rendus par les

oiseaux insectivores en forêt de production. Cependant, les changements globaux placent ces

interactions trophiques entre oiseaux et lépidoptères dans un climat d’incertitude rendant

nécessaire l’utilisation de concepts et méthodes issus de la biogéographie évolutive et de

l’écologie expérimentale, notamment des outils spécifiques d’analyse des données, qui sont

détaillés dans la deuxième partie de l’introduction générale.

Cette introduction est suivie d’une sélection de travaux publiés depuis 2007, rédigés

pour une grande partie en collaboration avec les doctorants que j’ai encadrés durant cette

période. Ces travaux s’intéressent d’abord aux réponses multi-échelles des communautés

d’oiseaux et de lépidoptères à l’hétérogénéité et à la fragmentation des paysages forestiers,

puis aux interactions trophiques entre oiseaux prédateurs et lépidoptères proies vues

comme un élément structurant les réponses des espèces à cette hétérogénéité. Enfin, une

discussion générale synthétise les principales contributions de mes travaux à la construction

de ce lien entre conservation de la diversité et fonction des communautés d’oiseaux, tout en

dessinant mes perspectives de recherche future autour de trois questions structurantes : (1) la

compréhension des mécanismes sous-tendant les patrons de réponses des oiseaux forestiers

aux méso- et macro-échelles, (2) l’analyse de la relation existant entre magnitude de

l’insectivorie et métriques de diversité fonctionnelle des communautés et (3) la question

plus finalisée de la complémentarité fonctionnelle des taxa prédateurs pour assurer un

(18)

1.2. Introduction : diversité, échelles et processus

1.2.1. Une approche multi-niveaux des systèmes écologiques

La complexité naissant des interactions entre niveaux hiérarchiques d’organisation

dans l’espace et dans le temps est une composante essentielle des systèmes écologiques

(Allen & Starr 1982, Larrère & Larrère 1997). Les patrons et les processus sont

intrinsèquement liés en écologie du paysage, et cette relation est dépendante du niveau

d’organisation et de l’échelle spatiale et temporelle considérés (Burel & Baudry 1999,

Whittaker et al. 2005). L’hétérogenéité spatio-temporelle des systèmes écologiques nécessite

des approches multi-niveaux d’organisation tenant compte de facteurs explicatifs emboîtés

agissant comme des ‘filtres écologiques’ (Allen & Starr 1982, Wiens 1995, Cushman &

McGarigal 2002). Les niveaux d’organisation généralement retenus en biogéographie et en

écologie du paysage correspondent à des hétérogénéités de structure à différentes échelles

spatiales ou temporelles (Tews et al. 2004, Schweiger et al. 2005, Wu 2013). Par exemple,

pour l’analyse de la fragmentation forestière, les facteurs explicatifs peuvent être hiérarchisés

aux niveaux de la parcelle, du fragment forestier et du paysage environnant le fragment

(Deconchat & Balent 1996). Ce niveau du paysage à méso-échelle s’emboîte lui-même dans

le niveau à macro-échelle du biome ou de la région biogéographique (Jenkins & Ricklefs

2011). A chacun de ces niveaux correspond un niveau d’organisation de la diversité

biologique (α, β, γ) ayant chacun des ‘drivers’ spécifiques, environnementaux, biotiques,

stochastiques et historiques (Whittaker et al. 2001, Meynard et al. 2011, Svenning et al.

2011). Le pouvoir explicatif des facteurs historiques a été globalement moins étudié que celui

des facteurs environnementaux ou stochastiques (Larrère & Larrère 1997, Svenning et al.

2011). S’ils s’avèrent parfois inopérants en raison d’une absence de corrélation claire entre

patterns actuels et passés (Mac Nally and Horrocks 2002, Ernoult et al. 2006), ils sont souvent

essentiels dans la compréhension des dynamiques actuelles de la biodiversité dans les

paysages hétérogènes (Petit et Burel 1998, Knick & Rotenberry 2000, Hermy & Verheyen

2007, Sirami et al. 2010, Bonthoux et al. 2013). Plus généralement, les approches

multi-échelles en écologie du paysage permettent de mettre en évidence les facteurs responsables de

la distribution des espèces et des communautés à chaque niveau d’organisation de la

biodiversité, en particulier dans les études multi-taxa (Burel et al. 1998, Cushman &

McGarigal 2002, Herrando & Brotons 2002, Mac Nally et al. 2004, Bossenbroek et al. 2005,

Schweiger et al. 2005, Coreau & Martin 2007, Kissling et al. 2008, Sirami et al. 2010).

Les analyses spatialement explicites permettent en particulier d’isoler la composante

environnementale de la variabilité purement liée à la dimension spatiale dans la distribution

des espèces et des communautés (Heikkinen et al. 2004, Legendre et al. 2005, Dormann et al.

2007, Keil et al. 2012). Une part essentielle des patrons de distribution peut s’expliquer par

les facteurs environnementaux sous-jacents aux structures spatiales mesurées à large échelle,

en particulier la quantité et la distribution spatiale des habitats dans la mosaïque paysagère

(Cushman & McGarigal 2002, Heikkinen et al. 2004, Knick et al. 2008, Fahrig et al. 2011,

chap. 2.1.1). Cependant, des structures spatiales indépendantes de l’habitat peuvent subsister,

qu’on attribue en général à des interactions de compétition ou d’aggrégation inter- ou

intra-spécifiques, des facteurs historiques de dispersion et recolonisation d’espèces, voire des

interactions hôtes-pathogènes à large échelle (Wiens 1995, Svenning et al. 2011, Ricklefs

2013). Pour une espèce donnée, on peut considérer que la persistance d’une population est

déterminée par l’interaction entre la dispersion et l’hétérogénéité spatio-temporelle de

l’environnement (Holt 2009). La mesure de la multi-dimensionnalité de la niche écologique le

long des principaux facteurs environnementaux permet alors de mieux comprendre les patrons

(19)

de distribution des communautés d’espèces au sein de paysages hétérogènes dans le temps et

dans l’espace (Prodon & Lebreton 1981, Balent & Courtiade 1992, Clavero & Brotons 2010,

Barnagaud et al. 2012). Il s’agit alors d’analyser dans un degré de complexité supplémentaire,

comment la biodiversité est organisée dans des paysages hétérogènes et fragmentés.

1.2.2. Biodiversité dans les paysages hétérogènes

Dans les paysages terrestres, plusieurs visions de l’hétérogénéité spatiale des habitats

se sont succédé historiquement selon trois principaux paradigmes : la théorie de la

biogéographie des îles, celle des métapopulations, et celle du continuum d’habitats, que nous

adoptons préférentiellement dans le présent travail (MacArthur & Wilson 1967, Dunning et

al. 1992, Wiens 1995, Hanski 1999, Manning et al. 2004). Selon les deux premières, les

paysages sont vus de manière binaire comme des mosaïques d’habitats et de non-habitat

tandis que la troisième les considère comme des matrices d’habitats de différentes qualités

distribués en mosaïques spatialement hétérogènes (Wiens 1995, Brotons et al. 2003, Kupfer et

al. 2006). Ce changement progressif de paradigme a beaucoup influencé les recherches en

écologie du paysage ces dernières années, notamment en mettant l’accent sur le lien entre

fragmentation du paysage et mécanismes de sélection de l’habitat et de mobilité des espèces.

Il a également considérablement précisé la notion de fragmentation des habitats en isolant les

effets inter-reliés de ses différentes composantes : la perte d’habitat (‘habitat loss’), la

fragmentation sensu stricto (réduction de la taille des fragments) et les effets de lisière (Fahrig

2003, Ewers & Didham 2006, Fletcher et al. 2007, chap. 2.1.2 et 2.4.1). Il a aussi souligné

l’influence parfois prépondérante des processus écologiques intervenant dans la matrice

paysagère sur les processus intra-fragment d’habitat (Dunning et al. 1992, Wiens 1995,

Brotons et al. 2003). Cette influence de la matrice se traduit notamment par une réduction ou

une augmentation de la fréquence et de la magnitude des processus intra-fragments (Norton et

al. 2000, Laurance 2002, Tscharntke et al. 2012).

Une complexité ou une hétérogénéité accrue dans les mosaïques paysagères a

généralement un effet positif marqué sur la biodiversité des communautés occupant ces

paysages (Balent & Courtiade 1992, Tews et al. 2004, Fahrig et al. 2011, Haslem & Bennett

2011). De plus, opérer une distinction entre hétérogénéité fonctionnelle (nombre et

proportions des types d’habitat) et hétérogénéité de configuration (arrangement spatial des

types d’habitat) permet de répondre aux interrogations sur le devenir de la biodiversité dans

les paysages de production (Fahrig et al. 2011). En agissant directement sur les composantes

des mosaïques paysagères, les pratiques de gestion influencent directement la dynamique des

paysages hétérogènes (Balent & Courtiade 1992, Baudry et al. 2003, Benton et al. 2003,

Aviron et al. 2005). La mise en évidence de mécanismes de complémentation et de

supplémentation de ressources entre habitats dans les paysages en mosaïques représente un

bon exemple du rôle joué par l’hétérogénéité fonctionnelle sur la persistance de certaines

espèces (Dunning et al. 1992, Ouin et al. 2004, Tubelis et al. 2004, Ethier & Fahrig 2011,

chap. 2.3.1). La présence d’éléments structurants clés (‘keystone structures’) comme les

haies, les arbres isolés, et les fragments d’habitats semi-naturels (corridors et continuités)

permet en effet d’augmenter la connectivité, tant structurelle que fonctionnelle, dans les

paysages hétérogènes (Clergeau et Burel 1997, Tews et al. 2004, Fischer et al. 2006, Haslem

& Bennett 2011). Cette connectivité fonctionnelle du paysage permet d’inférer les

mouvements d’une espèce donnée entre fragments d’habitats à différentes échelles de temps,

mais également les processus d’extinction et de recolonisation locale à l’origine de la

persistance des espèces dans ces fragments (Petit & Burel 1998, Hanski 1999, Boulinier et al.

Références

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