Weekly epidemiological record
Relevé épidémiologique hebdomadaire
19 MARCH 2021, 96th YEAR / 19 MARS 2021, 96e ANNÉE No 11, 2021, 96, 77–88
http://www.who.int/wer
2021, 96, 77–88 No 11
Contents
77 Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2021–2022 northern hemisphere influenza season
Sommaire
77 Composition recommandée des vaccins antigrippaux pour la saison grippale 2021-2022 dans l’hémisphère Nord
Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2021–2022 northern hemisphere influenza season
February 2021
WHO convenes technical consultations1 in February and September each year to recommend viruses for inclusion in influ- enza vaccines2 for the northern and southern hemisphere influenza seasons, respectively. This recommendation relates to the influenza vaccines for use in the northern hemisphere 2021–2022 influenza season. A recommendation will be made in September 2021 relating to vaccines that will be used for the southern hemi- sphere 2022 influenza season. For coun- tries in tropical and subtropical regions, WHO recommendations for influenza vaccine composition (northern hemi- sphere or southern hemisphere) are avail- able on the WHO Global Influenza Programme website.3
Seasonal influenza activity
Public health and laboratory responses to the COVID-19 pandemic, caused by the coronavirus SARS- CoV-2, initially led to reduced influenza surveillance and/or reporting activities in many countries, which have been improving. Additionally, COVID-19 mitigation strategies including restrictions on travel, use of respiratory protection, and social-distancing measures in most countries have contributed to decreased influenza activity. Overall, record-low levels of influenza detections were reported and fewer viruses were available for characterization during the September 2020 to January 2021 time- period than in previous years.
Between September 2020 and January 2021, influenza A(H1N1)pdm09, A(H3N2)
1 See http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/en/
2 Description of the process of influenza vaccine virus selection and development available at: http://www.who.int/gb/pip/
pdf_files/Fluvaccvirusselection.pdf
3 Influenza in the tropics and subtropics: http://www.who.int/
influenza/vaccines/tropics/en/
Composition recommandée des vaccins antigrippaux pour la saison grippale 2021-2022 dans l’hémisphère Nord
Février 2021
En février et en septembre de chaque année, l’OMS organise des consultations techniques1 en vue de formuler des recommandations sur les virus devant entrer dans la composition des vaccins antigrippaux2 pour les saisons grippales de l’hémisphère Nord et de l’hémis- phère Sud, respectivement. La présente recom- mandation porte sur les vaccins antigrippaux à utiliser pendant la saison grippale 2021-2022 de l’hémisphère Nord. Pour la saison grippale 2022 de l’hémisphère Sud, une recommanda- tion sera formulée en septembre 2021. Pour les pays des régions tropicales et subtropicales, des recommandations de l’OMS sur la compo- sition des vaccins antigrippaux (hémisphère Nord ou hémisphère Sud) sont disponibles sur le site Web du Programme mondial de lutte contre la grippe de l’OMS.3
Activité grippale saisonnière
Les mesures de santé publique et l’activité des laboratoires en réponse à la pandémie de COVID-19, causée par le coronavirus SARS- CoV-2, ont initialement entraîné une réduction des activités de surveillance et/ou de notifica- tion de la grippe dans de nombreux pays; mais la situation s’améliore. En outre, les stratégies de lutte contre la COVID-19 mises en œuvre dans la plupart des pays, notamment les restric- tions de voyage, l’utilisation de protections respiratoires et les mesures de distanciation physique, ont contribué à réduire l’activité grip- pale. Dans l’ensemble, le nombre de détections de grippe a atteint un niveau historiquement bas et le nombre de virus disponibles pour la caractérisation pendant la période allant de septembre 2020 à janvier 2021 a été inférieur à celui des années précédentes.
Entre septembre 2020 et janvier 2021, des virus de la grippe A(H1N1)pdm09, A(H3N2)
1 Voir http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/en/
2 La description du processus de sélection et de mise au point des virus grippaux vaccinaux est disponible à l’adresse: http://www.who.int/
gb/pip/pdf_files/Fluvaccvirusselection.pdf
3 La grippe dans les régions tropicales et subtropicales: http://www.
who.int/influenza/vaccines/tropics/en/
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and influenza B viruses circulated in very low numbers and the relative proportions of the viruses circulating varied among reporting countries. Globally, since September 2020, influenza activity was mostly reported from coun- tries in the tropics and subtropics and some countries in the temperate zone of the northern hemisphere. Over- all, the percent positivity for influenza viruses in all specimens tested during this period was less than 0.2%.
In contrast, the average percent positivity during the same reporting period of the 3 previous seasons (2017–
2020) was 17%.
In the temperate zone of the northern hemisphere, influenza activity remained far lower than usual for this time of year, with very low-level detections of influ- enza A and B viruses in reporting countries. In Europe, there were only sporadic detections of influenza A or B viruses. By comparison with previous years, there was a 20% reduction in the number of specimens tested, but a 99% reduction in influenza positive samples. In North America, the percentage of tests that were positive for influenza virus was very low, despite testing at usual or increased levels. The majority of detections were influ- enza B, and where subtyping was performed, both A(H1N1)pdm09 and A(H3N2) viruses were reported. In Asia, influenza activity was also lower than usual for this time of year. Influenza A and B viruses were detected in most reporting countries with a predomi- nance of influenza B viruses in Afghanistan, China, the Islamic Republic of Iran, and Saudi Arabia. In the Democratic People’s Republic of Korea only influenza A viruses were reported, with A(H1N1)pdm09 predomi- nating. Japan reported a slight increase in influenza activity in week 5 of 2021, with a small outbreak of A(H3N2).
Influenza activity in tropical and subtropical countries was generally very low, with co-circulation of influenza A(H1N1)pdm09, A(H3N2) and influenza B viruses. In tropical countries of Africa, influenza activity was reported mainly from countries in East and West Africa.
In East Africa, small numbers of influenza A(H3N2) and influenza B viruses were reported, with a predominance of influenza B in Kenya. In West Africa, the countries of Burkina Faso, Côte d’Ivoire, Mali and Mauritania reported a predominance of influenza A(H3N2), followed by influ- enza B, and a few detections of A(H1N1)pdm09 viruses.
Influenza A(H3N2) and influenza B viruses were reported in equal proportions in Ghana and Senegal, while influ- enza B viruses predominated in Guinea and Sierra Leone.
A(H1N1)pdm09 viruses were predominant in Niger and Togo. In tropical countries of Asia, most influenza detec- tions were reported from Bangladesh, Cambodia, India, Lao People’s Democratic Republic, Thailand and Viet Nam; influenza A(H3N2) was predominant with a few detections of influenza B and A(H1N1)pdm09 viruses. In the tropical countries of the Caribbean and Central America, influenza activity was also very low; most detections were reported by Haiti, where the majority were influenza B viruses.
In the temperate zones of the southern hemisphere, influenza activity was much lower than usual inter- seasonal levels with sporadic detections in some coun- tries. Over 59 000 specimens were tested for influenza viruses during this period, and only 11 specimens, originating from Argentina and Chile, were positive for
et B ont circulé en très faible nombre et les proportions relatives des virus circulants dans les pays qui ont communiqué des données ont été variables. À l’échelle mondiale, depuis septembre 2020, l’activité grippale a été principalement signalée dans les pays des zones tropicales et subtropicales et dans certains pays de la zone tempérée de l’hémisphère Nord. Dans l’ensemble, le pourcentage de positivité pour les virus de la grippe dans tous les échantillons testés pendant cette période était inférieur à 0,2%. Par comparaison, le pourcentage moyen de positivité au cours de la même période de référence des 3 saisons précédentes (2017-2020) était de 17%.
Dans la zone tempérée de l’hémisphère Nord, l’activité grippale est restée bien plus faible que d’habitude à cette époque de l’an- née, avec un très faible taux de détection des virus A et B dans les pays qui ont communiqué des données. En Europe, les virus de la grippe A ou B n’ont été détectés que sporadiquement. Par rapport aux années précédentes, on a constaté une réduction de 20% du nombre d’échantillons testés, mais une réduction de 99%
des échantillons positifs pour la grippe. En Amérique du Nord, le pourcentage de tests positifs pour le virus de la grippe a été très faible, malgré des activités de dépistage aux niveaux habi- tuels ou supérieurs. La majorité des détections étaient des cas de grippe B, et lorsque le sous-typage a été effectué, des virus A(H1N1)pdm09 et A(H3N2) ont été signalés. En Asie, l’activité grippale a également été plus faible que d’habitude à cette époque de l’année. Des virus de la grippe A et B ont été détectés dans la plupart des pays qui ont communiqué des données, avec une prédominance de virus grippaux B en Afghanistan, en Arabie saoudite, en Chine et en République islamique d’Iran. En Répu- blique populaire démocratique de Corée, seuls des virus grippaux de type A ont été signalés, avec une prédominance de virus A(H1N1)pdm09. Le Japon a signalé une légère augmentation de l’activité grippale au cours de la semaine 5 de 2021, avec une petite flambée épidémique de grippe A(H3N2).
L’activité grippale dans les pays tropicaux et subtropicaux a été très faible de manière générale, avec une cocirculation de virus grippaux A(H1N1)pdm09, A(H3N2) et B. Dans les pays tropicaux d’Afrique, une activité grippale a été signalée princi- palement dans des pays d’Afrique de l’Est et de l’Ouest. En Afrique de l’Est, des virus grippaux A(H3N2) et B ont été signa- lés en petits nombres, avec une prédominance de virus grip- paux B au Kenya. En Afrique de l’Ouest, le Burkina Faso, la Côte d’Ivoire, le Mali et la Mauritanie ont signalé une prédominance de virus grippaux A(H3N2), suivie de virus grippaux B, et quelques détections de virus A(H1N1)pdm09. Les virus grip- paux A(H3N2) et B ont été signalés en proportions égales au Ghana et au Sénégal, tandis que les virus grippaux B ont prédo- miné en Guinée et en Sierra Leone. Les virus A(H1N1)pdm09 étaient prédominants au Niger et au Togo. Dans les pays tropi- caux d’Asie, la plupart des détections de grippe ont été signalées au Bangladesh, au Cambodge, en Inde, en République démocra- tique populaire lao, en Thaïlande et au Viet Nam; la grippe A(H3N2) était prédominante avec quelques détections de virus grippaux B et A(H1N1)pdm09. Dans les pays tropicaux des Caraïbes et d’Amérique centrale, l’activité grippale a également été très faible; la plupart des détections signalées concernaient Haïti, où la majorité des virus étaient des virus grippaux B.
Dans les zones tempérées de l’hémisphère Sud, l’activité grip- pale a été très inférieure aux niveaux intersaisonniers habituels, avec des détections sporadiques dans certains pays. Plus de 59 000 échantillons ont été testés pour les virus grippaux au cours de cette période, et seuls 11 échantillons, provenant d’Argentine et du Chili, étaient positifs pour les virus de la
influenza A or B viruses. Among reporting countries in Oceania and Southern Africa, influenza viruses were not detected despite testing.
Influenza A
Globally, from September 2020 through January 2021, overall influenza A virus detections were in the minority during this period compared to influenza B virus detec- tions. However, from September to November 2020, influ- enza A virus detections predominated in some countries.
In most countries, areas and territories reporting influ- enza A viruses, both A(H1N1)pdm09 and A(H3N2) subtypes were detected. Influenza A(H3N2) viruses were detected in higher proportions than influenza A(H1N1) pdm09 in some countries in Africa (Burkina Faso, Côte d’Ivoire, Ghana, Mali, Mauritania and Senegal) and Asia (Bangladesh, Cambodia, India, Lao People’s Democratic Republic, Thailand and Viet Nam). Influenza A(H1N1) pdm09 viruses predominated in other countries in Africa (Egypt, Niger and Togo), Asia (the Democratic People’s Republic of Korea) and Europe (Ukraine).
Influenza B
Globally, more influenza B viruses were detected than influenza A viruses during this period and influenza B viruses have predominated since November 2020. Of the influenza B viruses where lineage was determined, nearly all were the B/Victoria/2/87 lineage and the majority were reported from Afghanistan, China, Côte d’Ivoire, Ghana, Guinea, Haiti and Senegal.
B/Yamagata/16/88 lineage viruses were reported in very low numbers by a few countries (Afghanistan, Sweden and the United States of America) (Map 1).
Detailed information of the extent of seasonal influenza activity by country and type/subtype of viruses world- wide is available on the WHO website: http://www.who.
int/influenza/resources/charts/en/.
Antigenic and genetic characteristics of recent seasonal influenza viruses, human serology and antiviral susceptibility
Influenza A(H1N1)pdm09 viruses
A(H1N1)pdm09 viruses that have circulated since February 2020 have haemagglutinin (HA) genes that belong to phylogenetic clade 6B.1A5, with the vast majority clustering within subclade 6B.1A5A character- ized by HA1 amino acid substitutions N129D, T185I and N260D, taking the HA sequence of A/Idaho/07/2018 as the reference (a parental clade 6B.1A virus closely related to the former vaccine virus A/Brisbane/02/2018).
Subclade 6B.1A5A (5A) has further diverged into 2 major subclades: 5A-187A (also called,5A+187A), char- acterized by D187A and Q189E (located in HA antigenic site Sb), and 5A-156K (also called 5A+156K) defined by N156K (located in antigenic site Sa), K130N, L161I, V250A and E506D (E179D in HA2). Viruses belonging to both groups have co-circulated during 2020. While the global frequency of 5A-156K viruses had rapidly increased during the first half of 2020 until reaching similar proportions as 5A-187A, the majority of viruses characterized since September 2020 belong to group 5A-187A.
grippe A ou B. Parmi les pays d’Océanie et d’Afrique australe qui ont communiqué des données, aucun n’a détecté de virus grippal lors des tests.
Grippe A
Au niveau mondial, de septembre 2020 à janvier 2021, les détec- tions de virus grippaux A ont été globalement minoritaires par rapport aux détections de virus grippaux B. Cependant, entre septembre et novembre 2020, les détections de virus grippaux A ont prédominé dans certains pays. Dans la plupart des pays, zones et territoires ayant signalé la présence de virus grip- paux A, les deux sous-types A(H1N1)pdm09 et A(H3N2) ont été détectés. Les virus grippaux A(H3N2) ont été détectés dans des proportions plus élevées que les virus grippaux A(H1N1)pdm09 dans certains pays d’Afrique (Burkina Faso, Côte d’Ivoire, Ghana, Mali, Mauritanie et Sénégal) et d’Asie (Bangladesh, Cambodge, Inde, République démocratique populaire lao, Thaï- lande et Viet Nam). Les virus de la grippe A(H1N1)pdm09 ont prédominé dans d’autres pays d’Afrique (Égypte, Niger et Togo), d’Asie (République populaire démocratique de Corée) et d’Eu- rope (Ukraine).
Grippe B
À l’échelle mondiale, davantage de virus de la grippe B ont été détectés par rapport aux virus de la grippe A au cours de cette période et les virus de la grippe B prédominent depuis novembre 2020. Parmi les virus grippaux B dont la lignée a été déterminée, presque tous appartenaient à la lignée B/Victoria/2/87 et la majorité d’entre eux ont été signalés en Afghanistan, en Chine, en Côte d’Ivoire, au Ghana, en Guinée, en Haïti et au Sénégal.
Des virus de la lignée B/Yamagata/16/88 ont été signalés en très faible nombre par quelques pays (Afghanistan, États-Unis d’Amérique et Suède) (Carte 1).
Des informations détaillées sur l’ampleur de l’activité grippale saisonnière par pays et sur le type/sous-type de virus observés dans le monde sont disponibles sur le site Web de l’OMS: http://
www.who.int/influenza/resources/charts/en/.
Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux saisonniers récents, sérologie humaine et sensibilité aux antiviraux
Virus grippaux A(H1N1)pdm09
Les virus A(H1N1)pdm09 qui circulent depuis février 2020 présentent des gènes de l’hémagglutinine (HA) appartenant au clade phylogénétique 6B.1A5, la grande majorité se regrou- pant au sein du sous-clade 6B.1.A5A caractérisé par les subs- titutions d’acides aminés N129D, T185I et N260D au niveau de HA1, en prenant comme référence la séquence HA du virus A/Idaho/07/2018 (un virus du clade parental 6B.1A étroitement apparenté à l’ancien virus vaccinal A/Brisbane/02/2018). Le sous-clade 6B.1A5A (5A) a ensuite divergé en 2 sous-clades majeurs: 5A-187A (également appelé 5A+187A), caractérisé par les substitutions D187A et Q189E (situées au niveau du site antigénique Sb de HA), et 5A-156K (également appelé 5A+156K) défini par les substitutions N156K (située au niveau du site antigénique Sa), K130N, L161I, V250A et E506D (E179D dans la région HA2). Des virus appartenant à ces 2 groupes ont cocirculé au cours de l’année 2020. Si la fréquence des virus 5A-156K dans le monde avait rapidement augmenté au cours du premier semestre 2020 jusqu’à atteindre des proportions similaires à celle des virus 5A-187A, la majorité des virus caractérisés depuis septembre 2020 appartiennent au groupe 5A-187A.
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Map 1 Percentage of respiratory specimens tested positive for influenza viruses, by influenza transmission zone (as of 5 February 2021) Carte 1 Pourcentage d’échantillons respiratoires testés positifs pour les virus grippaux, par zone de transmission de la grippe (au 5 février 2021)
0 1,200 2 ,400 4,800 Km
Note: the available country data were joined in larger geographical areas with similar influenza transmission patterns to be able to give an overview (www.who.int/influenza/surveillance_monitoring/updates/EN_GIP_Influenza_transmission_zones.pdf). The displayed data reflect reports of the week from 1 September 2020 to 4 February 2021). – Note: on a regroupé les données par pays disponibles à l’intérieur de zones géographiques plus larges caractérisées par des schémas similaires de transmission de la grippe en vue d’en donner une présentation plus générale (www.who.int/influenza/surveillance_monitoring/updates/EN_GIP_Influenza_transmission_zones.pdf). Les données affichées reflètent les rapports hebdomadaires ayant été faits entre le 1 septembre 2020 et le 4 février 2021.
Source: WHO Global Influenza Programme/ Flunet (https://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/flunet/en/). – Programme mondial de lutte contre la grippe de l’OMS/Flunet (https://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/flunet/en/).
The boundaries and names shown and the designations used on this map do not imply the expression of any opinion whatsoever on the part of the World Health Organization concerning the legal status of any country, territory, city or area or of its authorities, or concerning the delimitation of its frontiers or boundaries. Dotted lines on maps represent approximate border lines for which there may not yet be full agreement. – Les appellations employées dans la présente publication et la présentation des données qui y figurent n’impliquent de la part de l’Organisation mondiale de la Santé aucune prise de position quant au statut juridique des pays, territoires, villes ou zones, ou de leurs autorités, ni quant au tracé de leurs frontières ou limites. Les lignes en pointillé sur les cartes représentent des frontières approximatives dont le tracé peut ne pas avoir fait l’objet d’un accord définitif.
© World Health Organization (WHO) 2021. All rights reserved. – © Organisation mondiale de la Santé (OMS) 2021. Tous droits réservés.
Influenza transmission zones – Zones de transmission de la grippe Samples tested positive for influenza (%)* – Échantillons testés positifs pour les virus grippaux (%)*
0–10 11–20 21–30
>30
Data not available – Données non disponibles
Virus subtype (%)** – Sous-type de virus (%)**
A(H1N1) pdm09 A(H1) A(H3)
A (not subtyped) – A (non déterminé) B
* When total number of samples tested >10. – Quand le nombre total d’échantillons testés est >10.
** When influenza positive samples >20. – Quand le nombre total d’échantillons testés positifs est >20.
The antigenic characteristics of A(H1N1)pdm09 viruses were assessed with post-infection ferret anti- sera in haemagglutination inhibition (HI) assays.
However, antigenic analysis of viruses with collection dates after August 2020 has been very limited due to the small number of viruses available. Results showed that viruses in the 5A-187A group were well recognized by antisera raised against the 2020-2021 northern hemi- sphere vaccine viruses (egg-propagated A/Guangdong- Maonan/SWL1536/2019 and cell culture-propagated A/Hawaii/70/2019). However, viruses in the 5A-156K group were poorly recognized by these antisera. Anti- sera raised against the 2021 southern hemisphere vaccine viruses (egg-propagated A/Victoria/2570/2019 and cell culture-propagated A/Wisconsin/588/2019) recognized viruses within the 5A-156K group well, but showed poor recognition of all the viruses that lack the N156K substitution in the HA (e.g. 5A, 5A-187A and 5B).
Human serology studies used 19 serum panels, from chil- dren (aged 6 months–17 years), adults (aged 18–64 years) and older adults (aged ≥65 years) who had received egg- based trivalent or quadrivalent inactivated vaccines (standard or high dose) or cell culture-based quadriva- lent inactivated vaccine or recombinant HA quadrivalent vaccine. Egg-based vaccine formulations contained anti- gens from A/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019 (H1N1) pdm09-like, A/Hong Kong/2671/2019 (H3N2)-like, B/Washington/02/2019-like and B/Phuket/3073/2013-like viruses (the latter not included in trivalent vaccines) according to the recommendation for the northern hemi- sphere 2020-2021 season. Cell culture-based and recom- binant HA vaccines contained A/Hawaii/70/2019 (H1N1) pdm09-like and A/Hong Kong/45/2019 (H3N2)-like virus antigens as well as the required influenza B components.
When compared to titres against egg-propagated A/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019 (H1N1)pdm09- like or cell culture-propagated A/Hawaii/70/2019 (H1N1) pdm09-like 5A-187A vaccine reference viruses, post- vaccination HI geometric mean titres (GMTs) against cell culture-propagated viruses in the 5A-156K HA subclade were significantly reduced in almost all serum panels. Post-vaccination HI GMTs were also reduced to a cell culture-propagated virus in the 5B HA subclade in some serum panels, but not reduced to cell culture- propagated 6B.1A3 or 6B.1A7 HA subclade viruses.
Twenty influenza A(H1N1)pdm09 viruses collected after August 2020 were tested for neuraminidase inhibitor (NAI) susceptibility using phenotypic and/or genotypic methods. None showed reduced inhibition by any of the inhibitors tested. Of 20 A(H1N1)pdm09 viruses analysed for susceptibility to the endonuclease inhibitor baloxa- vir, none had amino acid substitutions in the PA protein known to be associated with reduced susceptibility to this inhibitor.
Influenza A(H3N2) viruses
HA phylogenetic analysis indicated that A(H3N2) viruses collected from September 2020 to January 2021 had HA genes belonging to 3C.2a1b subclades 1a (also called T135K-A), which share HA1 substitutions T135K, A138S, G186D, D190N, F193S and S198P; 1b (also called T135K-B) that share HA1 substitutions T135K, S137F,
Les caractéristiques antigéniques des virus A(H1N1)pdm09 ont été déterminées au moyen d’antisérums de furet postinfection soumis à des épreuves d’inhibition de l’hémagglutination.
Toutefois, l’analyse antigénique des virus recueillis après août 2020 a été très limitée en raison du petit nombre de virus dispo- nibles. Les résultats ont montré que les virus du groupe 5A-187A ont été bien reconnus par les antisérums dirigés contre les virus vaccinaux recommandés pour la saison 2020-2021 dans l’hémis- phère Nord (virus de type A/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019 propagés sur œufs et virus de type A/Hawaii/70/2019 propagés en culture cellulaire). En revanche, les virus du groupe 5A-156K ont été mal reconnus par ces antisérums. Les antisérums dirigés contre les virus vaccinaux utilisés en 2021 dans l’hémisphère Sud (virus de type A/Victoria/2570/2019 propagés sur œuf et virus de type A/Wisconsin/588/2019 propagés en culture cellu- laire) ont bien reconnu les virus du groupe 5A-156K, mais ont mal reconnu tous les virus dépourvus de la substitution N156K au niveau de HA (par exemple 5A, 5A-187A et 5B).
Les études sérologiques chez l’homme ont utilisé 19 panels de sérums provenant d’enfants (âgés de 6 mois à 17 ans), d’adultes (âgés de 18 à 64 ans) et de personnes âgées (≥65 ans) ayant reçu un vaccin trivalent ou quadrivalent inactivé préparé sur œufs (dose standard ou élevée) ou un vaccin quadrivalent inactivé préparé en culture cellulaire ou un vaccin quadrivalent contenant l’hémagglu- tinine recombinante. Les formulations vaccinales préparées sur œufs contenaient des antigènes de virus de type A/Guangdong- Maonan/SWL1536/2019 (H1N1)pdm09, A/Hong Kong/2671/2019 (H3N2), B/Washington/02/2019 et B/Phuket/3073/2013 (ces derniers n’étaient pas inclus dans les vaccins trivalents) conformément aux recommandations pour la saison 2020-2021 dans l’hémisphère Nord. Les vaccins préparés en culture cellulaire et les vaccins conte- nant l’hémagglutinine recombinante contenaient des antigènes de virus de type A/Hawaii/70/2019 (H1N1)pdm09 et A/Hong Kong/45/2019 (H3N2) ainsi que les composants nécessaires du virus de la grippe B.
Comparée aux titres obtenus contre les virus vaccinaux 5A-187A de référence de type A/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019 (H1N1) pdm09 propagés sur œufs ou A/Hawaii/70/2019 (H1N1)pdm09 propagés en culture cellulaire, la moyenne géométrique des titres obtenus par inhibition de l’hémagglutination postvaccination contre les virus propagés en culture cellulaire du sous-clade 5A-156K étaient significativement réduites dans presque tous les panels de sérums. La moyenne géométrique des titres obtenus par inhibition de l’hémagglutination postvaccination a également été réduite contre un virus propagé en culture cellulaire du sous-clade 5B dans certains panels de sérums, mais pas contre les virus du sous-clade 6B.1A3 ou 6B.1A7 propagés en culture cellulaire.
Vingt virus grippaux A(H1N1)pdm09 recueillis après août 2020 ont été testés pour évaluer leur sensibilité aux inhibiteurs de neuraminidase au moyen de méthodes phénotypiques et/ou génotypiques. Aucun n’a montré une inhibition réduite par l’un des inhibiteurs testés. Sur les 20 virus A(H1N1)pdm09 analysés pour leur sensibilité à l’inhibiteur de l’endonucléase baloxavir, aucun ne présentait de substitutions d’acides aminés au niveau de la polymérase acide, connues pour être associées à une sensi- bilité réduite à cet inhibiteur.
Virus grippaux A(H3N2)
L’analyse phylogénétique des hémagglutinines a indiqué que les virus A(H3N2) recueillis entre septembre 2020 et janvier 2021 présentaient des gènes HA appartenant aux sous-clades 3C.2a1b 1a (également appelé T135K-A), qui portent les substitutions T135K, A138S, G186D, D190N, F193S et S198P au niveau de HA1;
1b (également appelé T135K-B), qui portent les substitutions
82 WEEKLY EPIDEMIOLOGICAL RECORD, NO 11, 19 MARCH 2021
A138S and F193S; and 2a (also called T131K-A) that share HA1 substitutions K83E, Y94N and T131K. Viruses with HA genes belonging to 3C.2a1b subclade 2b (also called T131K-B) which share HA1 substitutions T131K, Q197R and S219F, or clade 3C.3a were not detected in this period. Viruses from subclade 3C.2a1b.1a with an additional substitution I192F predominated in the West African countries Côte d’Ivoire, Ghana, Senegal and Togo while viruses from subclade 3C.2a1b.2a with addi- tional substitutions F193S and Y195F in HA1 predomi- nated in South and South-East Asia. Two groups formed among the latter subclade: viruses from Cambodia, Côte d’Ivoire, France, Lao People’s Democratic Republic, Spain and the United States of America shared addi- tional HA1 substitutions K171N, G186S and S198P, while those from Bangladesh, India, Oman, Sweden, United Arab Emirates and the United States of America shared additional HA1 substitutions Y159N, T160I (resulting in the loss of a glycosylation site), L164Q, G186D and D190N. Both groups of 3C.2a1b.2a viruses shared D463N and N465S amino acid substitutions in the neuramini- dase, which creates a potential N-linked glycosylation motif.
Antigenic characterization of A(H3N2) viruses was performed by HI assays and virus neutralization (VN) assays. Ferret antisera raised against cell culture-prop- agated A/Hong Kong/45/2019-like viruses (3C.2a1b.1b), representing the cell/recombinant-based vaccine viruses for the 2020-2021 northern hemisphere and 2021 southern hemisphere influenza seasons, recognized viruses belonging to subclade 3C.2a1b.1a well. However, the majority of viruses detected after August 2020 fell in HA subclade 3C.2a1b.2a and shared additional HA1 F193S and Y195F substitutions. Of the 2 virus groups that emerged within this subclade those with further HA1 substitutions K171N, G186S and S198P were recog- nized less well and those with HA1 substitutions Y159N, T160I, L164Q, G186D and D190N were recognized poorly.
Ferret antisera raised against egg-propagated A/Hong Kong/2671/2019-like viruses (3C.2a1b.1b), representing the egg-based vaccine viruses for the 2020-2021 north- ern hemisphere and 2021 southern hemisphere influ- enza seasons, recognized all viruses poorly.
Viruses belonging to subclade 3C.2a1b.1a and those of subclade 3C.2a1b.2a with additional HA1 substitutions K171N, G186S and S198P were recognized well by ferret antisera raised against cell culture-propagated A/Cambodia/e0826360/2020 and A/Tasmania/503/2020 (3C.2a1b.2a) in HI assays. In VN assays, ferret antisera raised against cell culture-propagated A/Cambodia/
e0826360/2020 and A/Tasmania/503/2020 recognized viruses of subclade 3C.2a1b.2a with HA1 substitutions K171N, G186S and S198P well, but those with substitu- tions Y159N, T160I, L164Q, G186D and D190N were recognized less well (Table 1). Compared to ferret anti- sera raised against cell culture-propagated viruses, neither group of 3C.2a1b.2a viruses was recognized as well by antisera raised against egg-propagated A/Cambodia/e0826360/2020-like viruses in HI and VN assays.
Human serology studies were conducted using serum panels described above, from children, adults and older
T135K, S137F, A138S et F193S au niveau de HA1; et 2a (également appelé T131K-A), qui portent les substitutions K83E, Y94N et T131K au niveau de HA1. Les virus qui présentent des gènes HA appartenant au clade 3C.2a1b, sous-clade 2b (également appelé T131K-B) et qui portent les substitutions T131K, Q197R et S219F au niveau de HA1, ou appartenant au clade 3C.3a, n’ont pas été détectés au cours de cette période. Les virus du sous-clade 3C.2a1b.1a portant la substitution supplémentaire I192F ont prédominé dans des pays d’Afrique de l’Ouest (Côte d’Ivoire, Ghana, Sénégal et Togo), tandis que les virus du sous-clade 3C.2a1b.2a portant les substitutions supplémentaires F193S et Y195F au niveau de HA1 ont prédominé en Asie du Sud et du Sud-Est. Deux groupes se sont formés au sein de ce dernier sous- clade: les virus détectés au Cambodge, en Côte d’Ivoire, en Espagne, aux États-Unis d’Amérique, en France et en République démocratique populaire lao présentaient les substitutions supplé- mentaires K171N, G186S et S198P au niveau de HA1, tandis que ceux détectés au Bangladesh, aux Émirats arabes unis, aux États- Unis d’Amérique, en Inde, à Oman et en Suède présentaient les substitutions supplémentaires Y159N, T160I (entraînant la perte d’un site de glycosylation), L164Q, G186D et D190N au niveau de HA1. Les deux groupes de virus 3C.2a1b.2a présentaient les subs- titutions d’acides aminés D463N et N465S au niveau de la neura- minidase qui créent un motif potentiel de N-glycosylation.
La caractérisation antigénique des virus A(H3N2) a été réalisée au moyen d’épreuves d’inhibition de l’hémagglutination et de neutralisation virale. Les antisérums de furet dirigés contre des virus de type A/Hong Kong/45/2019 (3C.2a1b.1b) propagés en culture cellulaire, qui représentaient les virus vaccinaux préparés en culture cellulaire/recombinants pour les saisons grippales 2020-2021 de l’hémisphère Nord et 2021 de l’hémisphère Sud, ont bien reconnu les virus appartenant au sous-clade 3C.2a1b.1a.
Toutefois, la majorité des virus détectés après août 2020 appar- tenaient au sous-clade 3C.2a1b.2a et portaient les substitutions supplémentaires F193S et Y195F au niveau de HA1. Parmi les 2 groupes de virus qui ont émergé au sein de ce sous-clade, ceux présentant en plus les substitutions K171N, G186S et S198P au niveau de HA1 ont été moins bien reconnus et ceux présentant les substitutions Y159N, T160I, L164Q, G186D et D190N au niveau de HA1 ont été mal reconnus. Les antisérums de furet dirigés contre des virus de type A/Hong Kong/2671/2019 (3C.2a1b.1b) propagés sur œufs, qui représentaient les virus vaccinaux prépa- rés sur œufs pour les saisons grippales 2020-2021 de l’hémisphère Nord et 2021 de l’hémisphère Sud, ont mal reconnu tous les virus.
Lors des épreuves d’inhibition de l’hémagglutination, les virus du sous-clade 3C.2a1b.1a et ceux du sous-clade 3C.2a1b.2a qui présentaient les substitutions supplémentaires K171N, G186S et S198P au niveau de HA1 ont été bien reconnus par les antisé- rums de furet dirigés contre les virus A/Cambodia/e0826360/2020 et A/Tasmania/503/2020 (3C.2a1b.2a) propagés en culture cellu- laire. Lors des épreuves de neutralisation virale, les antisérums de furet dirigés contre les virus A/Cambodge/e0826360/2020 et A/Tasmanie/503/2020 propagés en culture cellulaire ont bien reconnu les virus du sous-clade 3C.2a1b.2a présentant les subs- titutions K171N, G186S et S198P au niveau de HA1, mais moins bien ceux portant les substitutions Y159N, T160I, L164Q, G186D et D190N (Tableau 1). Comparativement aux antisérums de furets dirigés contre des virus propagés en culture cellulaire, aucun des deux groupes de virus 3C.2a1b.2a n’a été reconnu aussi bien par les antisérums dirigés contre des virus de type A/Cambodia/e0826360/2020 propagés sur œufs lors des épreuves d’inhibition de l’hémagglutination et de neutralisation virale.
Des études sérologiques chez l’homme ont été menées en utilisant les panels de sérums décrits ci-dessus, provenant d’enfants,
adults who had received 2020-2021 northern hemi- sphere influenza vaccines, in HI and VN assays. When compared to titres against cell culture-propagated A/Hong Kong/45/2019-like reference viruses, post-vacci- nation GMTs of most serum panels were significantly reduced against cell culture-propagated subclade – 3C.2a1b.1b and 3C.2a1b.2a viruses but not against those of either 3C.2a1b.1a or 3C.2a1b.2b subclades or the 3C.3a HA clade. When compared to titres against egg- propagated A/Hong Kong/2671/2019-like reference viruses, almost all serum panels showed significant reductions in GMTs against cell culture-propagated viruses from all HA subclades.
Of 140 A(H3N2) viruses collected after August 2020 and examined by genetic or phenotypic analysis, none showed evidence of reduced inhibition by neuraminidase inhib- itors. Of 147 A(H3N2) viruses collected in this period and examined by genetic or phenotypic analysis, none showed evidence of reduced susceptibility to baloxavir.
Influenza B viruses
Influenza B viruses accounted for 55% of the viruses typed with the vast majority being of the B/Victoria/2/87 lineage in all regions, while B/Yamagata/16/88 lineage viruses were very rarely detected and no viruses collected after August 2020 were available for characterization.
Table 1 Antigenic analysis of A(H3N2) viruses – focus reduction neutralization assay
Tableau 1 Analyse antigénique des virus A(H3N2) – épreuve de neutralisation par réduction des foyers
Reference ferret antisera – Référence antisérums de furet A/DarCELL EGG
A/HK CELL
A/Cam EGG
A/Cam CELL
A/Tas EGG
A/Tas CELL
A/Ban Collection date – Date de collecte
Reference antigens –
Antigènes de référence Passage Clade 3C.2a1b.1b 3C.2a1b.1b 3C.2a1b.2a 3C.2a1b.2a 3C.2a1b.2a 3C.2a1b.2a 3C.2a1b.2a
A/Darwin/726/2019 SIAT2 3C.2a1b.1b 5120 320 1280 160 1280 160 320
A/Hong Kong/2671/2019 E8 3C.2a1b.1b 5120 2560 320 640 320 640 160
A/Cambodia/e0826360/2020 SIAT2 3C.2a1b.2a 640 160 2560 320 2560 320 320
A/Cambodia/e0826360/2020 E5 3C.2a1b.2a 80 160 320 2560 320 2560 320
A/Tasmania/503/2020 SIAT2 3C.2a1b.2a 640 160 2560 320 2560 640 320
A/Tasmania/503/2020 E5 3C.2a1b.2a 160 320 640 2560 640 5120 320
A/Bangladesh/10006/2020 SIAT4 3C.2a1b.2a 320 160 1280 640 640 2560 1280
Antigen viruses – Antigènes testés
A/Malaysia/RP2217/2020 MDCK2, SIAT13C.2a1b.1a 640 80 320 160 320 160 80 2020-03-04
A/Malaysia/RP2204/2020 MDCK2, SIAT23C.2a1b.1b 1280 320 160 160 80 80 80 2020-03-06
A/Cambodia/e0908364/2020 SIAT1 3C.2a1b.2a 1280 320 5120 640 5120 1280 320 2020-07-01
A/Cambodia/e0826360/2020 SIAT1 3C.2a1b.2a 640 80 1280 160 1280 160 160 2020-07-16
A/Cambodia/e0925256/2020 SIAT1 3C.2a1b.2a 320 80 1280 80 1280 80 80 2020-09-25
A/Cambodia/e1009251/2020 SIAT2 3C.2a1b.2a 640 80 1280 160 1280 160 160 2020-10-08
A/Cambodia/e1009251/2020 SIAT2 3C.2a1b.2a 320 80 1280 160 1280 160 160 2020-10-08
A/Cambodia/e0925253/2020 SIAT3 3C.2a1b.2a 320 80 1280 160 2560 80 160 2020-09-23
A/Timor-Leste/2/2020 SIAT2 3C.2a1b.2a 640 160 2560 320 2560 320 320 2020-08-27
A/Timor-Leste/17/2020 SIAT4 3C.2a1b.2a 320 160 1280 160 2560 320 160 2020-07-05
Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antigènes/d’antisérum
d’adultes et de personnes âgées ayant reçu le vaccin contre la grippe 2020-2021 dans l’hémisphère Nord; ces panels ont été soumis à des épreuves d’inhibition de l’hémagglutination et de neutralisation virale. Comparées aux titres obtenus contre les virus de référence de type A/Hong Kong/45/2019 propagés en culture cellulaire, les moyennes géométriques des titres postvaccination ont été significativement réduites avec la plupart des panels de sérums dirigés contre les virus des sous-clades 3C.2a1b.1b et 3C.2a1b.2a propagés en culture cellulaire, mais pas avec ceux diri- gés contre les virus des sous-clades 3C.2a1b.1a ou 3C.2a1b.2b ou du clade 3C.3a. Comparés aux titres obtenus contre les virus de référence de type A/Hong Kong/2671/2019 propagés sur œufs, presque tous les panels de sérums ont montré une réduction signi- ficative des moyennes géométriques des titres d’anticorps contre les virus propagés en culture cellulaire de tous les sous-clades.
Sur les 140 virus A(H3N2) recueillis après août 2020 et soumis à une analyse génétique ou phénotypique, aucun ne présentait de signes de réduction de l’inhibition par les inhibiteurs de la neura- minidase. Sur les 147 virus A(H3N2) recueillis pendant cette période et soumis à une analyse génétique ou phénotypique, aucun n’a montré de signes de sensibilité réduite au baloxavir.
Virus de la grippe B
Les virus de la grippe B représentaient 55% des virus typés, la grande majorité appartenant à la lignée B/Victoria/2/87 dans toutes les régions, tandis que les virus de la lignée B/Yamagata/16/88 ont été très rarement détectés et qu’aucun des virus recueillis après août 2020 n’était disponible pour la caractérisation.
84 WEEKLY EPIDEMIOLOGICAL RECORD, NO 11, 19 MARCH 2021
HA gene sequences of B/Victoria lineage viruses charac- terized belonged to genetic clade 1A, with all belonging to subclade 1A.3 (also called 1A(∆3)B) which has a triple amino acid deletion in HA1 (positions 162-164) and the substitution K136E. Distinct virus groups have emerged within the 1A.3 HA subclade viruses. Many possessed HA1 amino acid substitution G133R, and some of these had an additional E128K substitution. However, of the low number (<200) of B/Victoria lineage viruses with collection dates after August 2020 the majority belonged to a group referred to as 1A.3-150K (also called 1A(∆3) B+150K), which share HA1 substitutions of N150K, G184E, N197D (resulting in loss of a glycosylation site) and R279K, but lack G133R. This 1A.3-150K HA group further diversified into 2 subgroups that had HA1 substitutions of either V220M and P241Q, which were identified primarily in China, or A127T, P144L and K203R, which were found in viruses from Asia, Europe, the Middle East, North America, and West Africa.
Antigenic analysis showed that the great majority of B/Victoria lineage viruses with a triple amino acid dele- tion in HA1 (positions 162-164) and K136E substitution (HA subclade 1A.3) that predominated early in 2020 were inhibited well by ferret antisera raised against both cell culture- and egg-propagated triple deletion viruses, such as B/Washington/02/2019. However, the majority of viruses with collection dates after August 2020 contained subgroup 1A.3-150K HA and showed reduced inhibition by ferret antisera raised against cell culture- and egg-propagated viruses, such as B/Wash- ington/02/2019 (current prototype vaccine virus). The vast majority of characterized viruses in this period were from China where subgroup 1A.3-150K viruses with additional HA1 V220M and P241Q substitutions dominated. Representative 1A.3-150K viruses with addi- tional HA1 A127T, P144L and K203R substitutions also showed reduced inhibition by antisera to cell culture- and egg-propagated viruses, such as B/Washing- ton/02/2019. While ferret antisera raised against cell culture-propagated reference viruses that contain 1A.3-150K subgroup HA proteins neutralised closely related viruses well, these antisera poorly inhibited other 1A.3 HA subclade viruses that circulated at high levels prior to the COVID-19 pandemic. Antisera to both egg- and cell culture-propagated double deletion viruses (B/Colorado/06/2017-like) inhibited HA subclade 1A.3 viruses poorly.
Very few B/Yamagata lineage viruses were available for characterization and none had collection dates after August 2020. Those that were characterized all had HA gene sequences belonging to genetic clade 3 and in HI assays the viruses were inhibited by post-infection ferret antisera raised against either cell culture- or egg- propagated B/Phuket/3073/2013.
Human serology studies were conducted using serum panels described above. Post-vaccination HI GMTs against most recent viruses of the B/Victoria lineage representing the dominant 1A.3 HA subclade, including viruses in the 1A.3-150K HA group, were not signifi- cantly reduced when compared to titres against cell culture-propagated B/Washington/02/2019-like vaccine viruses. When compared to the egg-propagated B/Wash-
Les séquences géniques de l’hémagglutinine des virus de la lignée B/Victoria caractérisés appartenaient au clade génétique 1A, sous-clade 1A.3 (également appelé 1A(∆3)B) qui présente une triple délétion d’acides aminés au niveau de HA1 (positions 162-164) et la substitution K136E. Des groupes de virus distincts sont apparus au sein des virus du sous-clade 1A.3. Nombre d’entre eux présentaient la substitution d’acides aminés G133R au niveau de HA1, et certains d’entre eux une substitution supplémentaire E128K. Toutefois, parmi le petit nombre (<200) de virus de la lignée B/Victoria recueillis après août 2020, la majorité appartenait à un groupe dénommé 1A.3-150K (égale- ment appelé 1A(∆3)B+150K), portant les substitutions N150K, G184E, N197D (entraînant la perte d’un site de glycosylation) et R279K au niveau de HA1, mais pas la substitution G133R. Ce groupe 1A.3-150K s’est ensuite diversifié en 2 sous-groupes présentant les substitutions V220M et P241Q au niveau de HA1, identifiées principalement en Chine, ou A127T, P144L et K203R, trouvées dans des virus en Asie, en Europe, au Moyen-Orient, en Amérique du Nord et en Afrique de l’Ouest.
L’analyse antigénique a montré que la grande majorité des virus de la lignée B/Victoria présentant une triple délétion d’acides aminés (positions 162-164) et une substitution K136E (sous- clade 1A.3) au niveau de HA1, qui ont prédominé au début de 2020, étaient bien inhibés par les antisérums de furet dirigés contre les virus présentant une triple délétion propagés en culture cellulaire et sur œufs, tels que B/Washington/02/2019.
Cependant, la majorité des virus recueillis après août 2020 conte- naient des HA appartenant au sous-groupe 1A.3-150K et présen- taient une inhibition réduite par les antisérums de furet dirigés contre des virus propagés en culture cellulaire et sur œufs, tels que le B/Washington/02/2019 (virus vaccinal prototype actuel).
La grande majorité des virus caractérisés au cours de cette période provenaient de Chine où dominaient les virus du sous- groupe 1A.3-150K portant les substitutions supplémentaires V220M et P241Q au niveau de HA1. Les virus 1A.3-150K repré- sentatifs portant les substitutions supplémentaires A127T, P144L et K203R au niveau de HA1 ont également montré une inhibition réduite par les antisérums dirigés contre les virus propagés en culture cellulaire et sur œufs, comme le virus B/Washing- ton/02/2019. Alors que les antisérums de furet dirigés contre des virus de référence propagés en culture cellulaire et portant des protéines HA du sous-groupe 1A.3-150K neutralisaient bien des virus étroitement apparentés, ces antisérums n’inhibaient que faiblement d’autres virus du sous-clade 1A.3 qui circulaient à des niveaux élevés avant la pandémie de COVID-19. Les anti- sérums dirigés contre les virus portant une double délétion (de type B/Colorado/06/2017) propagés sur œufs et en culture cellu- laire ont faiblement inhibé les virus du sous-clade 1A.3.
Très peu de virus de la lignée B/Yamagata étaient disponibles pour la caractérisation et aucun n’a été recueilli après août 2020.
Ceux qui ont été caractérisés portaient tous des séquences géniques de l’hémagglutinine appartenant au clade génétique 3 et, lors des épreuves d’inhibition de l’hémagglutination, ces virus ont été inhibés par des antisérums de furet postinfection dirigés contre des virus B/Phuket/3073/2013 propagés en culture cellulaire ou sur œufs.
Des études sérologiques chez l’homme ont été menées en utilisant les panels de sérums décrits ci-dessus. Dans le cadre des épreuves d’inhibition de l’hémagglutination postvaccination, les moyennes géométriques des titres d’anticorps dirigés contre la plupart des virus récents de la lignée B/Victoria, qui représentent le sous-clade dominant 1A.3, y compris les virus du groupe 1A.3-150K, n’étaient pas significativement réduites par rapport à celles obtenues contre les virus vaccinaux de type B/Washington/02/2019 propagés en
ington/02/2019 vaccine virus, HI GMTs of a few serum panels against some cell culture-propagated viruses were somewhat reduced, notably against cell culture- propagated 1A.3-150K HA subgroup viruses with the additional HA1 substitutions of V220M and P241Q, or A127T, P144L and K203R.
Post-vaccination HI GMTs against representative B/Yamagata lineage viruses were not significantly reduced when compared to the cell culture-propagated B/Phuket/3073/2013 reference virus.
Of the 144 influenza B viruses screened for NAI suscep- tibility, all showed normal inhibition by oseltamivir and one virus showed reduced inhibition by zanamivir.
Sixteen of these viruses were also tested against lanin- amivir and peramivir, all showed normal inhibition by both NAIs. A total of 41 viruses were screened for susceptibility to baloxavir by genetic and/or phenotypic analysis, and none showed evidence of reduced suscep- tibility.
Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2021–2022 northern hemisphere influenza season
The HAs of currently circulating A(H1N1)pdm09 viruses belong to phylogenetic clade 6B.1A5, with subclade 5A viruses predominating. While viruses belonging to 5A-187A and 5A-156K groups co-circulated during 2020, of the few viruses collected after August 2020 the major- ity belong to the 5A-187A group. Antigenic analyses using post-infection ferret antisera showed that antisera raised against viruses with 5A-187A HA (e.g.
A/Hawaii/70/2019) inhibited most viruses well but not those in the 5A-156K group. Group 5A-156K viruses were inhibited well by ferret antisera raised against reference viruses belonging to the same group, such as cell culture-propagated A/Wisconsin/588/2019 and egg- propagated A/Victoria/2570/2019. Analyses with post- vaccination human sera showed significant reductions in GMTs against cell-culture propagated viruses in the 5A-156K HA subclade in almost all serum panels.
A(H3N2) viruses collected in the period September 2020 to January 2021 belonged to subclade 3C.2a1b that split into 3 groups defined by specific sets of addi- tional HA1 substitutions (1a, 1b and 2a, also called T135K-A, T135K-B and T131K-A, respectively). The great majority of these recently circulating viruses were poorly recognized by ferret antisera raised against egg-propagated A/Hong Kong/2671/2019, the A(H3N2) vaccine component for the 2020-2021 north- ern hemisphere influenza season. However, the major- ity of viruses in subclade 3C.2a1b were inhibited well by ferret antisera raised against 3C.2a1b.2a cell culture- propagated A/Cambodia/e0826360/2020-like viruses, though less well by ferret antisera raised against egg- propagated A/Cambodia/e0826360/2020-like viruses.
Human serology assays showed GMTs were signifi- cantly reduced against circulating subclade 3C.2a1b.1b and 3C.2a1b.2a viruses when compared to GMTs of cell
culture cellulaire. Par rapport au virus vaccinal B/Washing- ton/02/2019 propagé sur œufs, les moyennes géométriques des titres d’anticorps de quelques panels de sérums contre certains virus propagés en culture cellulaire étaient quelque peu réduites lors des épreuves d’inhibition de l’hémagglutination, notamment contre les virus du sous-groupe 1A.3-150K propagés en culture cellulaire portant les substitutions supplémentaires V220M et P241Q, ou A127T, P144L et K203R au niveau de HA1.
Les moyennes géométriques des titres d’anticorps postvaccina- tion dirigés contre des virus représentatifs de la lignée B/Yama- gata n’ont pas été réduites de manière significative par rapport à celles obtenues contre le virus de référence B/Phuket/3073/2013 propagé en culture cellulaire.
Les 144 virus de la grippe B analysés pour déterminer leur sensibilité aux inhibiteurs de la neuraminidase ont tous montré une inhibition normale par l’oseltamivir et un virus a montré une inhibition réduite par le zanamivir. Seize de ces virus ont également été testés avec le laninamivir et le peramivir, et tous ont montré une inhibition normale par ces deux inhibiteurs de la neuraminidase. Au total, 41 virus ont été soumis à une analyse génétique et/ou phénotypique pour évaluer leur sensibilité au baloxavir; aucun n’a montré une sensibilité réduite.
Composition recommandée des vaccins antigrippaux pour la saison grippale 2021-2022 dans l’hémisphère Nord
Les hémagglutinines des virus A(H1N1)pdm09 actuellement en circulation appartiennent au clade phylogénétique 6B.1A5, les virus du sous-clade 5A étant prédominants. Alors que les virus appartenant aux groupes 5A-187A et 5A-156K ont cocirculé pendant l’année 2020, la majorité des quelques virus recueillis après août 2020 appartiennent au groupe 5A-187A. Des analyses antigéniques utilisant des antisérums de furet postinfection ont montré que les antisérums dirigés contre les virus du groupe 5A-187A (par exemple A/Hawaii/70/2019) inhibaient bien la plupart de ces virus, mais pas ceux du groupe 5A-156K. Les virus du groupe 5A-156K ont été bien inhibés par des antisé- rums de furet dirigés contre des virus de référence appartenant au même groupe, tels que les virus A/Wisconsin/588/2019 propa- gés en culture cellulaire et les virus A/Victoria/2570/2019 propa- gés sur œufs. Les analyses réalisées avec des sérums humains postvaccination ont montré des réductions significatives des moyennes géométriques des titres d’anticorps dirigés contre les virus propagés en culture cellulaire du sous-clade 5A-156K dans presque tous les panels de sérums.
Les virus A(H3N2) recueillis entre septembre 2020 et janvier 2021 appartenaient au sous-clade 3C.2a1b qui s’est divisé en 3 groupes définis par des ensembles spécifiques de substitutions supplémentaires au niveau de HA1 (1a, 1b et 2a, également appelés T135K-A, T135K-B et T131K-A, respectivement). La grande majorité de ces virus récemment en circulation ont été mal reconnus par les antisérums de furet dirigés contre le virus de type A/Hong Kong/2671/2019, composant du vaccin A(H3N2) pour la saison grippale 2020-2021 dans l’hémisphère Nord.
Toutefois, la majorité des virus du sous-clade 3C.2a1b ont été bien inhibés par les antisérums de furet dirigés contre les virus 3C.2a1b.2a de type A/Cambodia/e0826360/2020 propagés en culture cellulaire, mais moins bien par les antisérums de furet dirigés contre les virus de type A/Cambodia/e0826360/2020 propagés sur œufs. Les tests sérologiques chez l’homme ont montré que les moyennes géométriques des titres d’anticorps dirigés contre les virus circulants appartenant aux sous-clades 3C.2a1b.1b et 3C.2a1b.2a étaient significativement réduites par
86 WEEKLY EPIDEMIOLOGICAL RECORD, NO 11, 19 MARCH 2021
culture-propagated A/Hong Kong/45/2019-like refer- ence viruses.
All influenza B viruses collected in the period September 2020 to January 2021 belong to the B/Victoria/2/87 lineage. All the B/Victoria lineage viruses had a triple amino acid deletion in HA1 (HA subclade 1A.3 or 1A(∆3)B) and a significant proportion were inhibited well by post-infection ferret antisera raised against both cell culture- and egg-propagated triple deletion viruses, such as B/Washington/02/2019. Most recent B/Victoria lineage viruses examined belonged to the 1A.3-150K (1A(∆3)B+150K) HA group and these showed reduc- tions in inhibition by post-infection ferret antisera raised against both cell culture- and egg-propagated HA subclade 1A.3 viruses, such as B/Washington/02/2019.
However, post-vaccination human sera generally inhib- ited 1A.3-150K HA group viruses well. Very few B/Yamagata lineage viruses were available for charac- terization and none had collection dates after August 2020. The most recently detected B/Yamagata lineage viruses were antigenically and genetically closely related to the egg-propagated vaccine virus B/Phuket/3073/2013 and its cell culture-propagated equivalent.
Lists of egg- or cell culture-propagated candidate vaccine viruses (CVVs) suitable for use in human vaccine production are available on the WHO website.4 A list of reagents for vaccine standardization, including those for this recommendation, can also be found on the WHO website.
National or regional authorities approve the composi- tion and formulation of vaccines used in each country.
National public health authorities are responsible for making recommendations regarding the use of the vaccine. WHO has published recommendations on the prevention of influenza.5
CVVs (including reassortants) and reagents for use in the laboratory standardization of inactivated vaccines may be obtained from:
Biotherapeutics Section, Laboratories Branch, Medi- cal Devices and Product Quality Division, Therapeu- tic Goods Administration, P.O. Box 100, Woden, ACT, 2606, Australia (email: influenza.reagents@health.
gov.au; website: http://www.tga.gov.au)
Division of Virology, National Institute for Biolog- ical Standards and Control, a centre of the Medi- cines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), Blanche Lane, South Mimms, Potters Bar, Hertfordshire, EN6 3QG, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland (fax: +441707641050, email: enquiries@nibsc.org, website: http://www.
nibsc.org/science_and_research/virology/influ- enza_resource_.aspx
Division of Biological Standards and Quality Control, Center for Biologics Evaluation and Research, Food and Drug Administration, 10903 New Hampshire Avenue, Silver Spring, Maryland, 20993, the United States of America (fax: +1 301 480 9748), email: cber- shippingrequests@fda.hhs.gov)
4 See https://www.who.int/influenza/vaccines/virus/candidates_reagents/home/en/
5 See https://www.who.int/immunization/policy/sage/en/
rapport à celles obtenues contre des virus de référence de type A/Hong Kong/45/2019 propagés en culture cellulaire.
Tous les virus de la grippe B recueillis entre septembre 2020 et janvier 2021 appartiennent à la lignée B/Victoria/2/87. Tous les virus de la lignée B/Victoria présentaient une triple délétion d’acides aminés au niveau de HA1 (sous-clade 1A.3 ou 1A(∆3) B) et une proportion importante d’entre eux ont été bien inhi- bés par les antisérums de furet postinfection dirigés contre les virus présentant une triple délétion propagés en culture cellu- laire et sur œufs, tels que B/Washington/02/2019. La plupart des virus récents de la lignée B/Victoria examinés appartenaient au groupe 1A.3-150K (1A(∆3)B+150K) et ceux-ci ont montré une réduction de l’inhibition par les antisérums de furet postinfec- tion dirigés contre des virus du sous-clade 1A.3 propagés en culture cellulaire et sur œufs, tels que B/Washington/02/2019.
Toutefois, les sérums humains postvaccination ont générale- ment bien inhibé les virus du groupe 1A.3-150K. Très peu de virus de la lignée B/Yamagata étaient disponibles pour la carac- térisation et aucun n’a été recueilli après août 2020. Les virus de la lignée B/Yamagata les plus récemment détectés étaient étroitement apparentés sur les plans antigénique et génétique au virus vaccinal B/Phuket/3073/2013 propagé sur œufs et à son équivalent propagé en culture cellulaire.
La liste des virus vaccinaux candidats propagés sur œufs ou en culture cellulaire se prêtant à la production de vaccins humains est disponible sur le site Web de l’OMS.4 Une liste des réactifs destinés à la standardisation des vaccins, y compris ceux qui sont concernés par la présente recommandation, est également publiée sur le site Web de l’OMS.
Les autorités nationales ou régionales approuvent la composi- tion et la formulation des vaccins utilisés dans chaque pays.
Les autorités nationales de santé publique sont chargées de formuler des recommandations concernant l’utilisation de ces vaccins. L’OMS a publié des recommandations relatives à la prévention de la grippe.5
Les virus vaccinaux candidats (y compris réassortis) et les réac- tifs nécessaires à la standardisation en laboratoire des vaccins inactivés peuvent être obtenus auprès des organismes suivants:
i) Biotherapeutics Section, Laboratories Branch, Medical Devices and Product Quality Division, Therapeutic Goods Administration, P.O. Box 100, Woden ACT, 2606 Australie (télécopie: +61 262 328 564; courriel: influenza.reagents@
health.gov.au; site Web: http://www.tga.gov.au);
ii) Division of Virology, National Institute for Biological Stan- dards and Control, a centre of the Medecine and Health- care products Regulatory Agency (MHRA), Blanche Lane, South Mimms, Potters Bar, Hertfordshire, EN6 3QG, Royaume-Uni (télécopie: +44 1707 641 050; courriel: enqui- ries@nibsc.org; site Web: http://www.nibsc.org/science_
and_research/virology/influenza_resource_.aspx);
iii) Division of Biological Standards and Quality, Center for Biologics Evaluation and Research, Food and Drug Admi- nistration, 10903 New Hampshire Avenue, Silver Spring, Maryland, 20993, États-Unis (télécopie: +1 301 480 9748;
courriel: cbershippingrequests@fda.hhs.gov);
4 Voir https://www.who.int/influenza/vaccines/virus/candidates_reagents/home/en/
5 Voir https://www.who.int/immunization/policy/sage/en/
Influenza Virus Research Center, National Institute of Infectious Diseases, 4-7-1 Gakuen, Musashi- Murayama, Tokyo 208-0011, Japan (fax:
+81425616156, email: flu-vaccine@nih.go.jp) Requests for reference viruses should be addressed to:
WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Influenza, VIDRL, Peter Doherty Insti- tute, 792 Elizabeth Street, Melbourne, Victoria 3000,
WHO recommends that quadrivalent vaccines for use in the 2021–2022 northern hemisphere influenza season contain the following:
Egg-based vaccines
• an A/Victoria/2570/2019 (H1N1)pdm09-like virus;
• an A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2)-like virus;
• a B/Washington/02/2019 (B/Victoria lineage)-like virus; and
• a B/Phuket/3073/2013 (B/Yamagata lineage)-like virus.
Cell- or recombinant-based vaccines
• an A/Wisconsin/588/2019 (H1N1)pdm09-like virus;
• an A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2)-like virus;
• a B/Washington/02/2019 (B/Victoria lineage)-like virus; and
• a B/Phuket/3073/2013 (B/Yamagata lineage)-like virus.
WHO recommends that trivalent influenza vaccines for use in the 2021–2022 northern hemisphere influenza season contain the following:
Egg-based vaccines
• an A/Victoria/2570/2019 (H1N1)pdm09-like virus;
• an A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2)-like virus; and
• a B/Washington/02/2019 (B/Victoria lineage)-like virus.
Cell- or recombinant-based vaccines
• an A/Wisconsin/588/2019 (H1N1)pdm09-like virus;
• an A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2)-like virus; and
• a B/Washington/02/2019 (B/Victoria lineage)-like virus.
L’OMS recommande que les vaccins quadrivalents destinés à être utilisés pendant la saison grippale 2021-2022 dans l’hémisphère Nord contiennent les virus suivants:
Vaccins contenant des virus propagés sur œufs
• un virus de type A/Victoria/2570/2019 (H1N1)pdm09;
• un virus de type A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2);
• un virus de type B/Washington/02/2019 (lignée B/Victoria); et
• un virus de type B/Phuket/3073/2013 (lignée B/Yamagata).
Vaccins contenant des virus propagés en culture cellulaire ou recombinants
• un virus de type A/Wisconsin/588/2019 (H1N1)pdm09;
• un virus de type A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2);
• un virus de type B/Washington/02/2019 (lignée B/Victoria); et
• un virus de type B/Phuket/3073/2013 (lignée B/Yamagata).
L’OMS recommande que les vaccins antigrippaux trivalents destinés à être utilisés pendant la saison grippale 2021-2022 dans l’hémisphère Nord contiennent les virus suivants:
Vaccins contenant des virus propagés sur œufs
• un virus de type A/Victoria/2570/2019 (H1N1)pdm09;
• un virus de type A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2); et
• un virus de type B/Washington/02/2019 (lignée B/Victoria).
Vaccins contenant des virus propagés en culture cellulaire ou recombinants
• un virus de type A/Wisconsin/588/2019 (H1N1)pdm09;
• un virus de type A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2); et
• un virus de type B/Washington/02/2019 (lignée B/Victoria).
(iv) Centre de recherche sur le virus grippal, Institut national des maladies infectieuses, 4-7-1 Gakuen, Musashi- Murayama, Tokyo 208-0011, Japon (télécopie: +81 425 616 156; courriel: flu-vaccine@nih.go.jp);
Les souches de référence peuvent être obtenues en s’adressant aux organismes suivants:
i) Centre collaborateur OMS de référence et de recherche pour la grippe, VIDRL, Peter Doherty Institute, 792 Eliza- beth Street, Melbourne, Victoria 3000, Australie (télécopie:
