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La génétique, un des leviers d’action pour maîtriser les mammites

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Academic year: 2021

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Texte intégral

(1)

HAL Id: hal-02786059

https://hal.inrae.fr/hal-02786059

Submitted on 4 Jun 2020

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La génétique, un des leviers d’action pour maîtriser les mammites

Rachel Lefebvre, Stephanie Minery

To cite this version:

Rachel Lefebvre, Stephanie Minery. La génétique, un des leviers d’action pour maîtriser les mammites.

Journée d’information technique “ Les mammites, quoi de neuf ? ”, Nov 2017, Paris, France. �hal-

02786059�

(2)

Mercredi 8 novembre 2017

À la Maison du Lait

Les projets RuminFlame et Plan mammites sont indépendants .

Partenaires du Plan Mammites Partenaires de RUMINflame

COLLOQUE

« Les mammites, quoi de neuf ? »

La génétique, un des leviers d’action pour maîtriser les mammites

Stéphanie Minery, Idele

Rachel Lefebvre, INRA

rachel.lefebvre@inra.fr

(3)

• Les cellules (CCS) et les mammites cliniques(MACL) ont de fortes corrélations génétiques (0.50 à 0.70)

• CCS sont plus héritables que les MACL (15% vs 3%)

• MACL a une forte variabilité génétique ( 30%) La sélection génétique

pour améliorer la santé de la mamelle

 C’est possible de sélectionner efficacement pour réduire les mammites cliniques,

 La sélection pour diminuer les cellules améliore la résistance aux mammites cliniques et subcliniques.

Rupp & Boichard, 2003

Govignon-Gion A. et al., 2012

(4)

20 ans de sélection

en France

1995 1997 2001 2005 2010 2012

CCS enregistrement dans la base nationale

1ers Index CCS

Index CCS inclus dans l’ ISU

CCS

2016

Enregistrement des mammites cliniques

1ers Index Mammites Cliniques

Mammites Cliniques

MACL intégré dans l’ISU & création de l’Index santé de la

mamelle

Index Santé mamelle (STMA)

Cellules Mammites 40%

Cliniques

60%

(5)

Les Index cellules sont efficaces

19 982 982 données HOLSTEIN,

Nées depuis 2008, Lactation 1 (Idele, INRA, 2016)

% CCS > 300 000 cel/ml

Index cellules de la vache

Index de la vache = + 1  QUE 5 % CCS > 300 000

Index de la vache= - 1  23 % CCS > 300 000

Vache avec bon index cellules = moins de cellules

dans son lait

(6)

Les index mammites cliniques sont efficaces

282 000 données NORMANDE,

Nées depuis 2008, Lactation 1 (Idele, INRA : 2016)

% lactations avec au moins une mammite clinique

Index MACL de la vache

Index de la vache : + 1 : QUE 6 % de lactation avec 1

mammite Index de la vache : - 1 : 19 % de lactation avec 1 mammite

Vache avec bon index mammites

cliniques = moins de cas !

(7)

Amélioration des taureaux d’IA

INDEX Santé Mamelle (Note : index positif => moins de mammites )

1ers index CELLULES

CELLULES

intégrées dans l’ISU

Mammites

Cliniques intégrées dans l’ISU

Exemple en HOLSTEIN, taureaux utilisés pour l’IA

Index génomiques

Amélioration du niveau génétique des taureaux

d’IA

Année de naissance

(8)

La génétique, un des outils de maîtrise des cellules

MAUVAIS

% CCS > 300 000 cell/mL

7 %

3 %

Niv génétique du père BON

Bonnes conditions d’élevage (bonne

alimentation, hygiène etc

…)

(9)

La génétique, un des outils de maîtrise des cellules

MAUVAIS

% CCS > 300 000 cell/mL

7 %

3 %

Niv génétique du père BON

Bonnes conditions d’élevage (bonne

alimentation, hygiène etc

…) 29 %

13 %

Mauvaises conditions

d’élevage (pb de machine

à traire, d’hygiène)….

(10)

La génétique, un des outils de maîtrise des cellules

% CCS > 300 000 cell/mL

7 %

3 % 29 %

13 %

Mauvaise génétique ET mauvaises

conditions d’élevage = Le plus haut niveau de cellules

Bonne génétique ET bonnes conditions d’élevage = Le plus bas niveau en cellules

MAUVAIS Niv génétique du père BON

La génétique fonctionne dans tous les élevages MAIS est d’autant plus pertinente dans

les élevages à souci!

(11)

Au niveau national = combinaison entre niveau génétique et conditions d’élevage

2010-2014 :

Amélioration en

génétique mais baisse en conditions d’élevage : CCS stable

Depuis 2015 :

Amélioration en génétique et des conditions d’élevage

 Baisse des CCS

Données Holstein

CCS

Génétique Conditions d’élevage

x1000 ccs/ml

Index

Diminution des CCS

année

(12)

• Les éleveur français disposent d’outils génétiques pour prévenir les mammites.

• Les index cellules et mammites cliniques sont pertinents.

• La génétique = un outil pour des résultats à moyen/long terme.

Continuer à appliquer les bonnes pratiques d’élevage, comme le recommande le plan de prévention nationale « Les mammites j’anticipe ».

En pratique

(13)

Expé « Mammites »

Contexte et Objectifs

Index génomiques

« Santé de la Mamelle » depuis 2012

Mammites cliniques (MC) +

- problème majeur en élevage

- seul prédicteur indirect en routine = CCS

(14)

Expé « Mammites »

Contexte et Objectifs

Index génomiques

« Santé de la Mamelle » depuis 2012

Sélection divergente sur la résistance aux mammites

Holstein + Normande

Domaine expérimental INRA du Pin-au-Haras

Mammites cliniques (MC) +

- problème majeur en élevage

- seul prédicteur indirect en routine = CCS

(15)

Expé « Mammites »

Contexte et Objectifs

Index génomiques

« Santé de la Mamelle » depuis 2012

Sélection divergente sur la résistance aux mammites

Holstein + Normande

Domaine expérimental INRA du Pin-au-Haras

Mammites cliniques (MC) +

- problème majeur en élevage

- seul prédicteur indirect en routine = CCS

✓ Validation de l’efficacité de la sélection

✓ Identification des mécanismes biologiques impliqués dans la résistance

✓ Caractérisation de QTL ou mutations grâce à des phénotypes + fins

✓ Recherche de prédicteurs précoces et indirects

(16)

Experimental design

Pour chaque race :

Procréation de 2 lignées à partir de taureaux ayant des index contrastés Résistante (RES) : +1 ≤ index

Contrôle (CTL) : -1.5 ≤ index ≤ -0.5

divergence

20 RES 20 CTL

20

RES

RES

CTL

CTL

100 vaches / lignée

écart attendu = 0,75 point de SCS

G0

G1

G2

Expé « Mammites »

Principe de création des lignées

(17)

Experimental measures

Mesure Méthode Fréquence

Production et cinétique Machine de traite 2/j

Poids Balance automatique 2/j

Composition du lait MIR 2/sem

Dosage Progestérone ELISA 1/sem

Etat corporel Notation visuelle 1/mois

Dosage métabolique 3/lact

Bactériologie Pathoproof™ (PCR) 3/lact

A chq MC

Enregistrement MC Description

standardisée

A chq MC

Frottis endocervical Cytobrosse 1 mois pp

Génotypage prédictions génomiques BovineLD BeadChip® 1

Expé « Mammites »

Mesures

4 campagnes

(2013-2016)

L1, L2, L3 finies

268 vaches

420 lactations

295 MC

(18)

Experimental measures Expé « Mammites »

Résultats

2,8

3,4

2,5

3,7

3,2

3,9

2,8

4,2

0 1 2 3 4 5

RES CTL gRES gCTL RES CTL gRES gCTL

Holstein Normande

***

*** ***

***

Score cellulaire somatique

RES / CTL:

lignée définie sur index du père gRES / gCTL : groupe défini sur index propre

Ecarts observés:

0,6 – 1,4 pt SCS

(19)

32

43

27

63

42

26

32

27

0 10 20 30 40 50 60 70

RES CTL gRES gCTL RES CTL gRES gCTL

Holstein Normande

% vaches atteintes

Experimental measures Expé « Mammites »

Résultats

Mammites Cliniques

Holstein

Résultat cohérent avec la sélection

RES: tendance à moins récidiver

Normande

Résultat inverse à la sélection

Retour à l’attendu en L2 (20 vs 38%)

* *

***

(20)

Une expérimentation de sélection divergente sur les mammites

Résultats

Bactériologies de lactation

18,5

24

16,5

26 27

42

22

48

0 10 20 30 40 50

RES CTL gRES gCTL RES CTL gRES gCTL

Holstein Normande

% échant positif

**

***

Dans les 2 races

Résultats cohérents avec l’attendu

- Effet du SCS et du stade

- S. species (46%) et S. uberis (40%)

- S. uberis = 86% MC

(21)

Une expérimentation de sélection divergente sur les mammites

La suite…

✓ Validation de l’efficacité de la sélection Confirmée pour les SCS

Tendances à confirmer pour MC et bactério avec lactations en cours

✓ Identification des mécanismes biologiques impliqués dans la résistance

✓ Recherche de prédicteurs précoces et indirects

Projets en cours: Ruminflame, Bovimune, LongHealth, Expé « EC »

(caractérisation moléculaire de la réponse immune, lien avec infections utérines, lien avec le métabolisme énergétique …)

✓ Caractérisation de QTL ou mutations grâce à des phénotypes + fins

Analyses d’association sur génome complet avec phénotypes enregistrés

(bactério, composition du lait, cinétique d’éjection, paramètres immunologiques, métaboliques…)

Références

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