Recherches en Agroécologie

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Submitted on 6 Jun 2020

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Recherches en Agroécologie

Philippe Lemanceau

To cite this version:

Philippe Lemanceau. Recherches en Agroécologie. Rencontres Chambre Régionale d’Agriculture de Bourgogne, Jun 2012, Dijon, France. �hal-02810268�

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Recherches en Agroécologie Dijon

Unité Expérimentale Domaine d’Epoisses

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Contexte et enjeux

 Fortes attentes de la Société

- Augmentation de la population mondiale : 2010=6,8 Md20509 Md

- Réduction des terres arables (désertification, salinisation, urbanisation,…) 10⁵ km²/an

- Augmentation de la consommation d’intrants

engrais avec des réserves finies (P) ou une production coûteuse en énergie (NO₃^-, NH₄⁺)

pesticides avec risques pour les produits agricoles, les sols et l’eau

eau renforçant les tensions géopolitiques

- Changements globaux auxquels est soumise et contribue l’agriculture

Contexte et enjeux

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 Un nécessaire changement de paradigme

- Enjeux agronomiques et environnementaux :

Assurer une production agricole de qualité en quantité suffisante

Réduire l’utilisation d’intrants

Préserver l’environnement (sols/eau/air)

- Réconcilier agronomie et écologie

Proposer des systèmes agricoles qui respectent et valorisent la biodiversité, les régulations et interactions au sein de communautés

Adapter la culture à l’environnement plutôt que l’environnement à la culture

Contexte et enjeux

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 Enjeux des recherches en Agroécologie

- Analyser, comprendre et agir sur les interactions et régulations au sein des communautés (microbiennes et végétales) à différentes échelles spatiales et temporelles

- Proposer des systèmes de cultures innovants permettant d’assurer une production agricole de qualité en quantité suffisante tout en respectant la qualité de l’environnement  conception & impact

Contexte et enjeux

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microbes végétaux

Fonctionnement de l’agro-

écosystème

Evolution des systèmes de culture Conception de systèmes

agricoles

Systèmes agricoles

auxiliaires, parasites & ravageurs

Objets et stratégies d’étude

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- les communautés végétales cultivées et sauvages (adventices), et leurs interactions

- les communautés microbiennes (bactériennes et fongiques) incluant :

les communautés mutualistes

les communautés pathogènes des plantes et de l’Homme

les communautés fonctionnelles impliquées dans les cycles biogéochimiques (C, N), la biorémédiation,….

- les interactions plantes-microorganismes

mutualistes (symbiotiques ou non)

parasites

- les légumineuses

génétique

écophysiologie

- l’agronomie systémique intégrant ces différents objets d’étude pour :

 la conception de systèmes agricoles

 l’analyse multicritère de ces systèmes

 Objets d’études

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 Différents niveaux d’organisation et échelles spatio-temporelles

- Différents niveaux d’organisation

- Différentes échelles spatiales

- Différentes échelles temporelles

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Ateliers Scientifiques Thématiques

Interactions entre modélisation et expérimentation /

observation

N. Colbach Relations

diversité-services écosystémiques à différentes échelles

d’organisation biologique

L. Philippot

Conception et évaluation d’idéotypes

optimisant les interactions

A.-S. Voisin

Conception de systèmes

agricoles

Ni. Munier-Jolain Déterminismes

génétiques et environnementaux

de l’adaptation des plantes à des systèmes

de cultures innovants (GEAPSI)

Ecologie des communautés

et durabilité des systèmes agricoles

(EcolDur)

Mécanismes et gestion des interactions

plantes- microorganismes

(IPM)

Pôles

Microbiologie Environnementale

et Risques Sanitaires

(MERS)

C. Mougel & S. Petit

C. Salon F. Simon-Plas A. Bonnin

Ensemble de Ressources Biologiques (ERB)

C. Steinberg GenoSol

L. Ranjard

Plateformes & Moyens Communs

Serres-PPHD

C. Salon & C. Bernard

Structuration

Soutien à la recherche

F. El Ghissassi

Logistique Gestion administrative et des ressources

Fonctions d’intérêt collectif

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 Effectif total (au 30 juin 2010)

- permanents = 254 - non permanents = 150

 3 Tutelles

- AgroSup = 28

- INRA EA (48), GAP (52), SPE (70) = 170 - Université de Bourgogne = 51

Total

Acteurs

ITA EC/C

 2 Institutions associées

- CNRS = 5

- CHU = 8 dont 6 rattachés à l’uB

INRA Université Bourgogne CNRS

AgroSup

Acteurs

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Invitro Microcosme Parcelle Paysage Territoire

EcolDur

DIMACELL

SSG PPHD ERB GenoSol

IPM

GEAPSI MERS

MERS

Interactions plantes-microorganismes

Ecologie des communautés

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• Procurer une flexibilité dans le contrôle des conditions environnementales

240 m² de serres 65 m² de chambre

de cultures climatisées

La plateforme de phénotypage haut débit

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 Centre de Ressources Génétiques : conservatoire de sols et ADNs de sites expérimentaux, réseaux de surveillance et observatoire (RMQS, OREs, Réseau PIC, Sites ateliers, sites de l’ADEME, ANDRA, OSV, LTO européens,…)

 Plateforme Technique : caractérisation de la diversité microbienne (qPCR, Fingerprint, Metaprotéomique, Pyroséquençage,…)

 Système d’Information

Environnementale (S.I.E.) : base de données

(gestion et traçabilité, confrontation données environnementales - microbiennes…) et outils mathématiques adéquats

(statistiques, géostatistiques, pipeline bio-informatique,…)

 Démarche qualité, veille technologique et formation

Mise à la disposition de la communauté scientifique Référentiel de la caractérisation microbienne des sols

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ERB : Ensemble des Ressources Biologiques

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Présentation de Thèmes Particuliers

•Recherches en cours sur les sols – Lionel Ranjard

•Biodégradation et transfert des pesticides – Marjorie Ubertosi

•Recherches en cours sur les protéagineux – Gégard Duc

•Régulation des bioagresseurs au travers des systèmes de culture – Nicolas Munier-Jolain

•Evolution du climat, enjeux et contrainte pour l’agriculture – Thierry Castel

Travail en ateliers

•Contribution de l’écologie à l’agriculture – Sandrine Petit

•Ecophyto – regards croisés recherche et développement – Nicolas Munier-Jolain

•Diagnostic et perspective de conseil en biologie des sols – Christophe Mougel

•Place des proétagineux dans les systèmes de culture – Gérard Duc