HAL Id: hal-02746296
https://hal.inrae.fr/hal-02746296
Submitted on 3 Jun 2020
HAL is a multi-disciplinary open access archive for the deposit and dissemination of sci- entific research documents, whether they are pub- lished or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers.
L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d’enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés.
Performances de la PCR multiplex Fast-Track Diagnostics Urethritis basic® pour la détection simultanée de Chlamydia trachomatis, Mycoplasma
genitalium et Neisseria gonorrhoeae
C. Le Brun, L. Yzon, Laurent Mereghetti, Philippe Lanotte
To cite this version:
C. Le Brun, L. Yzon, Laurent Mereghetti, Philippe Lanotte. Performances de la PCR multiplex
Fast-Track Diagnostics Urethritis basic® pour la détection simultanée de Chlamydia trachomatis,
Mycoplasma genitalium et Neisseria gonorrhoeae. 33. Réunion Interdisciplinaire de Chimiothérapie
Anti-Infectieuse (RICAI 2013), Nov 2013, Paris, France. 2013. �hal-02746296�
C. Le Brun1, L. Yzon1, L. Mereghetti,1,2 P. Lanotte1,2
1
Service de Bactériologie-Virologie, Hôpital Bretonneau CHRU TOURS,
2
UMR 1282 Université de Tours- INRA, Infectiologie et Santé Publique
Introduction
Dans un contexte de recrudescence des infections sexuellement transmissibles (IST), de nombreux industriels proposent des tests de détection simultanée de Chlamydia trachomatis (CT) et Neisseria gonorrhoeae (NG) qui sont les bactéries les plus fréquemment retrouvées dans les IST. Cependant, un nouvel agent responsable d’IST suscite un intérêt croissant : Mycoplasma genitalium (MG) dont la prévalence et le rôle pathogène restent encore à étudier.
Objectifs
Evaluer les performances de la trousse Fast- Track Diagnostics Urethritis basic® pour la détection de Chlamydia trachomatis (CT), Mycoplasma genitalium (MG) et Neisseria gonorrhoeae (NG) dans des prélèvements uro- génitaux.
Méthodes
- Etude réalisée au CHRU de Tours de mai 2013 à août 2013.
Prélèvements de patients en consultation ou hospitalisation. Sélection d’échantillons positifs pour CT ou NG puis réalisation des 2 techniques en prospectif sur séries de routine.
- 91 échantillons (13 urines, 66 endocols, 5 spermes, 5 écouvillons urétraux, 1 liquide péritonéal, 1 vagin) (23 hommes, 68 femmes) - extraction automatisée sur la plateforme M2000sp (Abbott)
- PCR triplex Trousse FTD Urethritis basic : adhésine mgpB pour MG, ADN plasmidique cryptique (ORF1) de CT et gène pta de NG.
Amplification sur Smart CyclerI I (Cepheid).
Résultats
- Sensibilité 86,7%, 100% et 100%, spécificité de 100, 100 et 100 % respectivement pour CT, MG et NG par rapport à notre méthode de routine utilisée comme référence.
- Ct proches pour les 2 techniques pour CT et NG, meilleurs pour MG avec la trousse Fast-track par rapport à notre PCR maison.
- Les 4 Chamydiae non retrouvées par Fast-track avaient des Ct > 36,9 avec Abbott. Nous n’avons pas vérifié par une deuxième méthode.
Faibles ou faux positifs?
- Aucune différence de sensibilité ou spécificité qu’il s’agisse d’écouvillons d’endocol, d’urètre ou d’urines mais notre échantillonnage est faible pour les 2 derniers types de prélèvements.
- Parmi les 4 MG retrouvés, 3 étaient co-infectés avec CT. C’est plus que ce qui est décrit dans la littérature. Devrait-on systématiquement rechercher MG en cas d’infection à CT?
Conclusion
Le test Fast-Track Diagnostics Urethritis basic® est un test sensible et spécifique, marqué CE-IVD. Il apparaît adapté au diagnostic et au dépistage des infections urogénitales à partir d’échantillons biologiques tels que l’urine, les écouvillons endocervicaux, urétraux ainsi que le sperme et les liquides péritonéaux.
Performances de la PCR multiplex Fast-Track Diagnostics Urethritis basic® pour la détection simultanée de Chlamydia trachomatis, Mycoplasma
genitalium et Neisseria gonorrhoeae.
Diagnostic des infections génitales bactériennes et épidémiologie
N°553
Neisseria gonorrhoeae Chlamydia trachoma3s Mycoplasma genitalium posi%fs néga%fs posi%fs néga%fs posi%fs néga%fs Fast Track
[Ct min ‐ Ct max]
13 [22,4‐38,8]
78 26
[21‐37,6]
65 4
[25,3‐35,2]
87
Abbo5 [Ct min ‐ Ct max]
13 [23,2‐38,9]
75 30
[21,9‐37,5]
61 NR NR
PCR maison
[Ct min ‐ Ct max] 13
[27,7‐37,3]
3 NR NR 4
[257,1‐39,7] 24*
NR = non réalisé *PCR maison MG effectuée sur 28 échan%llons
Techniques de routine utilisées comme référence:
• PCR duplex RealTime CT/NG® (Abbott): gène opa de N. gonorrhoeae et 2 sondes distinctes pour ADN plasmidique cryptique de CT.
• PCR « maison » MG : gène mgpA sur le Smart Cycler II (Cepheid).
• PCR « maison » gène porA de NG pour confirmation des positifs sur le Smart Cycler II (Cepheid).
Ct : cycle seuil de détection de positivité
Remerciements à la société Fast-track Diagnostics pour la fourniture du kit.
91 patients : 13 positifs pour NG (14,3%); 30 positifs pour CT (33%); 4 positifs pour MG (4,4%) 39 patients avec au moins un des 3 pathogènes. Les associations dans le tableau ci-dessous :
CT seul 22
NG seul 8
MG seul 1
CT + NG 5
CT + MG 3
NG + MG 0
CT + NG + MG 0
