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.ETUD~DES PônY~CCHARIDES
l .. DE G rac~ ar~a sp~ 01 0 ... '1, PAR Lise Auger-Loiselle,
"MEMOIRE PRESENTE A LA FACULTE DES ETUDES SUPERIEUR~S
,', } EN
VUE
DE L'OBTENTION DU GRADE DE.
,
MAITRE ES SCIENCES (M.Sc.)
.'
1
Département de Microbiologie et d'Immunologie
, Université McGill l Janvi,er.1978
.
\ OUse Auger-Loi~elle 1978 ,I~ ,,' 1 , l ' ---li; , 1 , 'j i• , , J,. "
1
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<J • RESUME.Une méthode d'extraction de l'agar. de Gracilaria"sp ••
'. 1
originaire des côtes de l'Ile-du-Prirce-Edouard. est,présentfte. Cette méthode permet la récupération de pO,lysaccharides
carac-~érisés par~ fort
cation. L'étude de
poarce~tage de sulfate et la
non-gélifi-\
-l'agar
t\
des polysaccharides :chargésest"effectuée sur divers échantillons •
. Les plants gamétophytes: ~haploides) et
tétrasporo-phytes (diploides) de Gracilaria présentent des polysaccha~
rides quantitativement et qualitativement similaires. 'La
, '
,co~paraison d'échantillons de culture en environnement
c'ontrôlé et d'algues du milieu naturel'montre une diminution
/
du pourcentage de polymèr9s sulfatés lors de la culture. '''~s,
.
variations lors de l',analyse chimique des 'deux groupes de polysaccharides sont remarquées en fonction de la croissance de l'algue et de l'environnement.
L'élution par étapes des polysaccharides chargés
échangeur d'ions mo~tre la substitution graduelle de ces
1
molécules et complète le spectre des polysaccharides de
,l'agar. La présence de néoagaroligosaccharides neu~re~ dans,
, ces pOlymè,es e"st révélée par analyse en~ymatique·.
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" '" \{ , bA method for extraction of agar, trom Gracilaria SP~.
"
oollected in Prince Edwarq Island, ls presented. Non-gellin~
• f'
polysaccharides' wit~ a high sulfate content were preparèd.
Agars and charged
galact~s ~rom.diff~~ent
samples werestudied.
,
The two stages of, grow-th. ~aploid gameto,phyte and
- l '
diploid tetrasporO,phyte, show equ~valent amounts of
poly-, 1
saccharides having similar comp~sition, Algae that had
been cultur~d had less charged gal~ctans than samples'from
the natural environment. The/chemical analysis of the two
1/
groups of polys.accharides vary according to algal growth '.
;
and the environment.
F
Stepwise elution
,bf
the charged polysaccharides from~
an ion exchanger shows graduaI ~ubstitution of charge on
these molecules and completes the spectrum of polysacchapides of agar. Neutral neoagaro-oligosacpharides were isolated
l '
from the hydrolysate of sulfated galactans. , /.
1 1 1 / ;' ) , J: {I - .
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,~ .'\ .... )< , . ~~ .,~~~ . . ~-~ . . , . . _ ... _ _ &~ -~- ~~- --~.~.-REMERCIEMEN~S ~ " 1 '. ___ ,. ~." , __ • .L~._." " ..•
Je~d~is une grande part de ce que j'ai aècompli aux:
, ,
personnes de mon entour~ge. Je désire exprimer ici ma
,
gratitude à quelques-unes de ces personnes.
Le
Dr. 'W. Yaphe, directeur de recherche! pour sacompréhension et son aide au cours de ces années •.
Le Dr. S.I. Vas, directeur du départemept de
Micro-biologie et d'Immunologie, pour avoir permis la poursui te de,
ce travail dans ce département.
..
~ Dr. M. Goldstein, du département de Biologie de
1'Université McGill,' et le Dr. J. McLachlan du C.N.R: à
Halifax N.~E. pour les échantillons' d'algues.
,
'"
Robert, mon epoux, pour sa patience, son"aide et ses
critiques constructives lors de la rédaction~e ce mémo~re.
Mes parents, pour leur appui moral et les cOllègues
du départem~nt de leur amitié.
Le Conseil Nati'onal de' là Recherche du Canada, pour le support financier et le Ministère de l'Education du Québec pour les bourses accordées.
l
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TABLE DES MATIERES
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TABLE DES MATIERES ••
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LISTE DES TABLEAUX •••••
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LISTE DES FIGURES •••••• ' "
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1. INTRODUCTION. "" ... ....
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II. REVUE DE LITTERATURE •••
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~ - L'AGAR .••••••••••
. .
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...
..
.
.
.
..
,..
"...
'... .
1. Défini tian ....
...
,.
. ...
2 . Méthode d'extraction,) ••.•
....
. ...
Structure des
a) T~éorie de l'agarase et de l'ag
'- b) Agar: spectre de polysaccharides .•••..•.•.
4. Caractéristiques physiques de 1 t agar •••••.•.• "
B - POLYSACCHARIDES CF_~RGES.
.
. .
.
.
.
...
• t • • • • • • • • • •1. , Méthode d'élimination •.•• ' •••.••••...
.
... .
2.- Les ga1actans chargés du type de l' agar •....•.
J.
Les ga1actans chargés du type de la ~arraghé~nane ... * ••• 1- • • • • • • • •
..
. . .
..
,... . .
... ..
Page i vi ix 1 3 3 J 4 5 6 8 1214
15
17
19
: 'DEGRADATION ENZYr<1ATIQUE •••••• • . . .
---<""-Io'---,!I-'f-1. Historique .•.•• ' ••.•••.••.• , _ " . ~,J t {, a' , NU 't W t5-*;' !êit~;;:7lt7- ;-it
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'Phi mHsa bl t , t ' 0' t r 5 , t l "th'" air
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D E III. A Bc
1 2.-ii-Système hydrolysant de P~eudomQnas atlantica.
ALGUES ET POLYSACCHARIDES',
·
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.
. .
.. ..
.
.
.
. .
.
....
1., Phyc ologie •••••••• •• J' . , •• "....
.,., ... .
2. Locaiisation et fonction des poly.saccharides.,
J, Biosynthèse, , ..
.. ..
.
,..
·
... .
Gracilaria sp".V ~.
.
..
..
.. ..
.
...
,..
...
1. «,.., .Cyè,le vital. • • • • • • • • • • • • • • • ft • • • • • • •...
. .
..
. .
.
2. Ecologie ..•.... , . . . , ... ,t., •••J.
Mariculture. -". . .
.
. · ...
..
..
.. ..
.
... .
4.
Sçurce d'agar", I f I l I l t t • • t f , . f t • • • ~. I l • • • • • • • • MATERIEL ET ME}'HODES . . . , ... ; •••••••••• ORIGINE \ DES ~CHANœILLONS.·
... .
METHOnk D'EXTRACTION.. .
.
,.
.. .. ...
,
...
1. Le gel .•..
..
. .
..
..
·
.
• • • • • • • • • • • :ft . . . • • 2. Le non-gel •..•••• • 1: • •..
.
.
....
...
, ]. Agar commercial ••..
.. ..
..
.. .. . ...
,.... .
4.
Calcul de rendement..
.
.
.
...
.
, .'... .
ANALYSES CHIMIQUES ••••••••...
1. 2.J.
4.
Hydr~tes de carbone..
"...
' Anhydrogalactose •••••••• Sulfates •• ~.
,...
,....
.... ....
.
...
• • • • • • • • • t.
... . . ... .
.
...
. .
..
IJL-'---~'\::~C~H;-;R~O;r.1;:A-;TOGRAPIUE
. ••• ,...
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• •.
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2.·
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Sur couche minC\,
Sur colonne •••••••••
· ... .
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't 1 H r 'Œ 1f * et b • tÔt Hf' ftt l 'H e23
24 24 27 27 29 29JO
l' 3233
37
37
39
41
41 42 4J44
45
Sr! ,*'6 t t . . . . . • 1, ,"
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~E F -IV. A -, , '>J.
rF-iii-a) ~r,atrices échangeuses· dt ions.
...
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b)' . 'Gels de Sephadex •••••.
. R~cup~ration .••••••••.•••.
... .
·
, ~. 11>' • • • • • • • • • • • • • • • • t MESURes PHYSIQUES ••.
. .
.
.
.
.
...
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...
1. 2. Force du. g~l .•••••••••• ' ••••• .-:....
Viscosi té ••••.. ..
..
..
"...
: • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • 1 \ ENZYMOLOGIE ••.
... .
1. Enzyme.. .
. ..
,...
.
.
...
·
...
2. Essai enzymat~que • • • • " • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • l RESULTATS..
... .
.
.
.. . .
..
..
..
.. ..
.
.
..
. .
.
.
.
.
ETUDES DES RÊNDEMENTS .. • • • • • a • • • 1J' • • • • • • • • • • • • • • • •
1. Le gamétophyte et le tétrasporophyte .•••.• , )
· ...
2. Croissance en nature et en culture ••••.• 1
.
...
·46 47 47, 48 48 49 , 49 49
50
53" 53 54 .56~----.
-: 1-r,\ ---____ ~J~~'~{aaxI1i~artt~iuo~n~s mensuelles •• _ _ - - - L - - - -.
.
. .
.. ..
"... .
.57 63 .1 1 i B C -.
ANALYSES CHIMIQUES.. . .
. .
. .
..
..
..
..
...
"
..
. ....
1. Contenu en anhydrogalactO'Se ••••••.•••••••••••• 2. a) le gamétophyte etle
tétrasporophyte, •••• '. ,b) Croissance en natur~ et en culture •.
c) " yariations locales et mensuelles ••••••
__ . . . a
..-Contenu en sulfate. • ••
• •• • •••. ... .
a) Le gamétophyte et le tétrasporophyte. ,·
...
.
....
Croissance en culture et en nature ••••••••
Variations mensuelles ••••••••••••••••••
. J
ANALYSE PHySIQUE •••••••••••••••••••••••••••••••• f
1. Force du gel .••• • • • • • • • • ,.. • • • • • • • • • JI • • • • • Il' •
6;)
64 64 66 72'75
75
1 -- .~ 1'"" ,..
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J.
-iv-- ,.
Viscosité .. -1" ... ... CI' . . . " . . . • ~ . . . .. , ~Di'Spersion des charges •••••••. " •.• ", , •••
..
te •• , . . . .D - ANALYSES ENZYMOLOGIQVES. ~ . . . .. 76 79 83 84 1. 2.
J.
Mesure de l' hyd.rolys~ •• -••••.•.•.•.•••• : .•• ' .••• a) b) -J sucres réducteurs •• ~ 0 • • • • • * • • • 0 0 •C' ' ... · · ..
.
..
.
~ ~ v~seoslte ... , , .. t . . . à • • • • ' • • • \ " Pourcentage d' hydrolyse, ••••••• o. "0 • • 0 o • • 0 0 • • • • 1 Résultat de,)l'hydrolyse •••••••• ',' o • • • • • • • • • 0 • •ar Chromatographie sur colonne. 0 0 0 • • • • • • • • • • •
b) Chromatographie sur couche~mince •• o • • • • • o.
ci) Variation de, poids moléculai're ••••• * • • • 0 •
d) Variatton 84 8
5
85
90
9€r91
93 aprè s ?ydrolyse ••••••• ~ ••••••••••••••• : • ' •• -. 954. Analyse, des. ·Ol.igosaccha~ides. • • • •• •• •• •• •• •• • •. 97
., ,
a) Chromatographie en deux dimensions ••••••.• 97
99
101
b)
c)
~Chromat0&raphie sur échange~r dt ions .' •••• 0
,<'i'
Oligosaccharides neutres •••••• , •••••••• ;-••
1) Chromatographie sur couche mince ... -. 101
t
2 ) Chromatographie en deux dimens,i. ons ',' • 0 • 102
J) Chtomatographie
à
angle •.•••.•• Of • • • • • • 1024)
5)
Chromatographie' sur 3ephadex G-25 • .- •••••
,..,
-
.
Etudes enzymatiques ••.•.••• :-••••••••••• • '104 104 d) 01igosaccharides chargés ••••••••••••••• ,.. 105 1) Dessalage ... . c-e • • ' • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • 1052) Chromatographie sur couche mince ••••••• 105
. 3)
Chromatographi~ en deux dimensions ••••• 106,.., 1. \
/
f ' 1 1 1 1 , , . ... - -.""'V"'~-' ~'7 ~-".t""".~!~"""f'\".~~lr~~""'. ; .... " . . , _ _ _ .... , ""1401114 . . . t4 .. flll~~-.. _ _ ~_~_~-"MII!IIilIlœ_iIIIII1ImaI_IIIII.-,...-ri"~; '.~ .. ~ ~ H.'~_L" ,t' ~ , A , t _,i, ... ~~.t.k., '( ,~ ~ ( ~ ~' ~l 1,' ' ~. ~ "
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V. B C D E F G '1 ••
-v-
.-4)
Chromatographie à angle •• •••••••••••••• ! "DISCUSSION. '. • • •• •• ••••
•• • • •• • • • ••••••••••••••••••• ETUDES DE RENDEMENTS.... •• •• • ... . LEr~TOPHYTE
ET LE TETRASPOROPHYTE •• ,.: ••••••••• '.-CROISSANCE EN NATUR~ ET EN CULTURE ~ ••••••••••••• ' ••
•
CUEILLETTES MENSUEL~~ ••••••••...
CARACTERISTIQUE6 PHYSIQUES •• ~ •••• ~ . . . • 1 . . . . 1. Le gel. •·
.
• • • al • • • • • • • • •• • • • • n • • • • "••
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t • • ••••••• ANALYSES ENZYMOLO(UQUES ••••• ...lb,. ••••
~•••••
' . 0 • 0 ; • • • 1. 1 • ~ ~ .. .,..ANALYSES DES OLIGOSACCHARIDES: ••• ry • •••••••••••••••
1. Les .oligosaccharides
n v ,
,"
chargés ••••••••••••••••••
, 2. Le~ oligosacchar~des neutres ••
• •••••••••••••••
VI.
CONCLUSION.·
....
•• •• •• ••..
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:~\'~BIBLIOGRAPHIE "'~
0' • • • • • • • /J. 1 ...
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LISTE DES TABLEAUX
Num~ro
du
tableau 'L'itre' l "-' II. . ...III> IV. "j ,'Comparaison des méthodes de préparation de
1
l' ~garo se.. .. ... •• •• .• .' •• .,' f • • • . . . • • • • • ~ t • • • • • • •
Listè ~es _ éChftillons: ••....• ~,. ••••••••• ' ..•.
Rendement en polysacch~:cides: g,'amétophyte,
tétrasporophyte, . croissance en culture et
,
.
en nature ... .
Extraction des polysaccharide~; cueillettes
" { l '" ) Page
17
~;6
55
r mensuelles .•... ;. ".~ .. 11' . . . ' • • • • •59
V. VI. • r -VII.Rèndement en pOlysaccharides: cueillettes
\ - ' V
mensuelles ... " , .... ' ...• , .. , ... . \
~'~ontenu en anhydrogalactose, (gel et non-gel):
gamétophyte, tétras,porophy,te, croissance en
naturè et, en culture ••.•..•••..• , 0 • • • • • • • • • • • •
.
Co~tenu e~ anhydrogal~ctose (gel et non-gel?:
, .
cueillettes ~ensuelles 0 0 0 ""'0 • 0 o' . . . .
o
-. VIII.: Conténu en sulfate (gel et nOR-gel):
.gaméto-,
-J ~
):X. " p
phyte, tétraspC»:'ophyte, croIssance en nature
'It'
et en culture .... " .. J. I l , • • • I t . , . . . t • • • / • • • •
'~.""-,. ~ , ~ t _
Contenu en
sul~ate
(gel 'et non-gel):. cSe,il:'"f -1'- " • letteS mensuelles ••.•••••••••••••••. .' •••••• ~...,. I~ 60 l " : ?J ...::..-._...-. '~w .... ~"Irj.-•
J
[ ,\ ",r-j . " i
,
t -vii- '-, Numérd' du Titre ,/"-': tableau X.,
Forq;é du ge,l de l'agar de "Gracilaria sp.: \ 'il
cu,eillettes mensuelles •••••••••••• ' ••••• ,. •••• 1
ç-XI. ~ Vi~cosité relative des polysacchari~rs ,du gel:
creillettes mensuelles. t • • • • • • • • • • • ~I
...••.•..
XII. Contenu en arlhydrogalactose, en sulfate,for-ce/du gel, viscosité (gel): cueillsttes
men-Page
77
80 suelles. . . . . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .• .. .. .. . . 81 ,-XIII. Elution des
poly~aCéharides
chargés sur échan-~.
(
.
XIV.xy.
, : XVI. XVII. XVIII". . XIX.geur d'ions DEAE-Sephadex A-25
(C1-)...
82Liô~ration des sucres réducteurs en fonction 1
\ ,
du te~ps: hydrolys~ des polysaccharides
char-• 1 >
gés par la {3 -agarase " •• l" ~ 1 " ' " • • • • • • • • • • • •
Diminution de'l~<viscosité en'fonctio~ du
temps: hydr;o)'y§e des p_olysaccharid,es. chargés
, '
par'" la {3 ... agarase ... I.e, • I f ' • • • • • • • • • • • • • •
Pourcentage d'hydrolyse par la
P
-agarase(gel et- non-gel): c~rillettes mensuélles ••••• ,
Rgal des
oligosacc~rides lïb~rés
lors del'hydrolyse des polysaccharid~s ~hargés p~
la {j -agarase ... , ~ .. .
Pourcentage:, d' anhydrogalactosy des
pol:ysac-charides ~argés'avant et après hy,drolyse
par la
B
-é\garase ... ~ ...•.. " . ' .... .Elution d'un hydrolysat de polysaccharides
chargés par"la 'P--::"agara~e sur échangeur d' i~ns
DEAE- ladex' A-25 (Cl -) .•.• -: • " ... .
86
87
100..
".
1 ~ '. 1 1 1 , ,, ., t 1 , ' , ; ,r.
(
' .•
\ -viii-Numéro du j;ab~eau' Titre " Pagè XX'. XXI. XXII. XXII~. XXIV.1
Rgal'des olig~saccharides chargés
(0.5
M NaCl) 106Caractéristiques des polysaccharides des
gamétophytes et. tétrasporophyte~ de
Gracila-ru
sp... .. .. .. . .. .. .. .. .. .. .. .. . . . . .... . . . 116Caractéristiques des polysaccharides de 0. •
Graci1aria SP, en eroissaneeJen nature et
-en culture ... " ... . 119 '
(Rendements en. polysaccharides totaux des cueil-lettes mensuelles.. •• •• •• •• •• .• •• •• • • .• •• •. . 123
Caracté:ç-istiques d,u gel et du non-gel pour 1
le s eue i lle tte s mensue 11e s •••••.•••••.•.••••
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" LISTE'DES FIGURES,
Numéro de la Figure 41 Titre Page 1. 2.3.
4.
5.
6. ,7. 8. 9. 10 • Il. "st
ruc ure e t d l , agaro b' ~ose ••. " " " " " ••.•••.•.•••. ,Structure de 1" agarose : ~ .••.•••.•••.•
...
Structure du
4,6-0-(1-carboxyéthylidène)-D-ga-lactopyranosy~ .••.•.••. ; ... ..
Mécanisme de la gélation (selon Rees, 1969) .•• ~
~
Disaccharides de base des
1\, "- ,
A. eti
-carraghé-7 10
10 13
nane s. • . . . • •. •• . ~ •• . ~ •. •. ., •• • If • • • • • • • • • • • • • • • • 21
Dégradati~n de l'agarose par Pseudomonas
atlan-tica ...•..•... 1 • • • • • • • • • • ~ • • • • • • • • • • • • • • • •
Dégradatioq du néoagaroctaose et du
néoagarohe-xose par la (3 ~néoÇ.garotétraose hydrola~e de Ps.
25
a tlantica .•.••••.•• , ..••.•••.••••••.•••. ' • . • . • •• 26
Cycle vital de Graci1aria ,sp. (sel~n Dong, 1970)'31
Lieux de cueillettes des échantillons,
11e-du-Prince-Edouard .••.•..••••. ~ •.•••••••••. "' ••••••• "
35
Pro'cédure d'extraction des polysacc:harides ..••• Procédure d'hydrolyse des polysaccharides du
38
gel et du non-gel .•••..•••••••••••.••••••..•••••. , 52
1
Courbe de la variation des rendements en poly-sacchàrides totaux en fonqtion de la date de
cueillette ••••.
...
• ~"""I..> ~4'.>' ~~, ... 1IIt.o 4",",(:"'-41~"""""""'~""'-''''. ",. ... P_ .. lW"~,#~~" ... - . " .. , -l ~ _ r ". 4 1"_ " _~ _,~ ~_w_" __ ..Jo.DJ.iliI..J... N.J< .!I.E _ , , , : , ( f ' f i ' . . el kr l u " t ri bPd8'M 1 rl * 1 1 r ( , 61'.
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-x- .Numéro dê la , Titre Page
figure,
13. Courbe de la variation du rendement des po1y-/
saccharides du gel et du non-gel en fonction
'~e:- la date de cueillette ','. •• .. •• •• •• •• • • •• • • • . 62
"14. Courbe de la variation du pourcentage
d'anhy-drogalactose des polysaccharides du ~el et du
non-gel en fonction- de la date de cue~llette.. 68
15. Courbe de variation du des polysaccharides du fonction de la date de pourcentage de sulfate gel et du non-ge~~ • ";10 cuelilette .•••••••.••.• , 74
~6. Force du gel de l'agar en fonction de la
60n-17.
,18. r 19. 20. '. • p 21. 1 centration ... a • •I1 ... ;" .... Il...
78Chromatographie sur cou~he de cellulose d'un
hydrolysat de polysaccharides Chargés •••.•••.• "
Chromatographie en deux dimensions s'ûr èouche
de cellul~se d'un hydrolysat de
polysacchari-92
o '
des chargés." ... , ... \'. l i . • • • .. • • • • • • • • 98
Chromatograpnie à anglé des oligosaccharides
. ne~tres libérés par lt~ydrolyse des
polysac-charides chargés •••• o • • • " , " .'~ • • • • • • • • , • • • • • • • • 10J
/
Chromatographie sur couche mince des oligosac-charides chargés obtenus par l'hydrolyse
enzy-C"matique des polysaccharides ,chargés. • • •• •• • • . • 107
ChTomatographie en deux dimensions des oligo-saccharides chargés libérés lors de
l'hydro-"
lyse des polysaccharides chargés ... ',\) ••
, 1
(-
\ "') (" Numéro figure 22. 2). , - -xi-de la Titre ~ ~ 1Comparaison des méthodes Qe récupération ••••• ~
1
'Variation des températures pour les deux sites
de cueillettes ... ~ ",' ... · .. " j
r
~5
,.
J ' . , ., .. 1, , " , Page 112 :'" ,~,
i 1 " , .) 1" ,
.'
(,
r 1 l. INTRODUCTION.
< /Diverses espèces ~'algues ~ouges (Rhodophytes) ,
synthétisent i'agar. Un gél stable ~ faible concentration
explique sa'vaste utiiisation. L'agar est un pOlymère de galactose.
~
"j' L' alternance du D-galactose et "'du
3.6-anhydro-L-galactose constitue la structure'de l'agaros~-neutre. De
, 'nombreuses substitutions par des résidus acides (sulfates
et pyruvates) se retrouvent sur les molécules ~·agar.
L'ensemble de pOlymères présentant de nombreuses substitu~
tions sur la chaine de galactose forme le spectre des
polysaccharides de l'agar. L'absence de géli~ication chez
..certaines molécules s'explique ,par leur haute charge." Peu d'études concernent ces polysaccharides chargés. ,
,
La mét'Q.ode d' extraction utilisée permet. de.' récupeirer.'
'~' _ : • 1
les polysaccharides chargés èn plus de l'·aga~. A partir
d'échantillons de'Graèilaria sp., récoltés
à
l'Ile-du-Prince-, Edouardl'Ile-du-Prince-, nous étudierons les polysaccharides extra1~s en por~
/
tan~#une attention_partiéulière aux pOlysaccharides chargés.
\ ' / / 1 1 / ,
,
/ i... ",~~_".h ... r",_. _ _ ._r~_~~~
.... ", ...
_~",~__ .
__ ...
"w " ... "' ... ~ ... ,"" ... '_.,-..,J..nW,~ • ... - :Ii' ;itaL ' ; l~ Ipt, .
f
.
-
-2-La plante SyntJétise les deux types de
polysacch&-rides au- c'Ours de sa croissance. LI ~tude des molécu~es
extraites de divers Pfants de Gracilaria nous fournira des indicati ons intéressantes ,.
Cette ,algue étant diplobionte, nous analyserons les pOlymères du gamétophyte haploide et du tétrasporophyte
di-•
ploide. Les changements-occasionnés par la culture de
ltal-A '
gue en bassin seront notés. Le cycle vital de la plante se
déroule durant la saison est~vale. ,Deux séries de
cueillet-tes mensuelles ~erviront de bas.e à l'étude des v'ariations
subies par les polysaccharides.
'Les analyses d'anhyd~ogalactose et de sulfate seront
faites sur Chaque échantillon. La 'fraction gel sera testée
" ~
pour la force du gel et la. viscosité. Les pOlysaccharides
Chargés seront soumis
à
une chromatographie sur échangeurd'ions.
Une étude enzymatique partielle des polysaccharides ~nargés sera. effectuée. Lt hydrolyse par ,la ~ -agaraS9.
prOduite par la bactérie marine Pseudomonas atlantica,
nous ap~orte quelques précisions sur ces molécules ayant un
fort pourcentage de sulfate.
/
. "
l 1 , \ ,> 1 ~ 1 ," -, _. ~ _ ...
_---\II. REVUE DE LITTERATURE
)
A L'AGAR,
1. Défin,i tion
En 1957. l'agar est décrit comme un phycocolloide
extrait des Rhodop~ytes, formant ~ gél entre
33
~t 390 C etfondant à un minimum de 700 C (Society
~f
American'Bacterio-~
logists, 1957). L'agar est aussi un comp~sé colloidal
hydrophile extrait de Gelidium cartilagineum (Linné) Gaillon,
# 1
(Fam. Gelid~aceae). Gracilaria confervoides (~inné) Greville
(Fam~ Sphaerococcaceae) t d'autres algues appartenant aux
Rhodophytes 1967). 'Une autre
défini-tion est en ces solide obtenu en
concen-trant une décoction de diverses espèces de Ge'lidium (Martindale. 1972).
.
Ces définitions concernent les caractéristiques phy-siques de l'agar. Araki (1966) précise la nature chimique
1 de l'agarose, forme parf~ite (sans sUbstitutions) de l'agar:
une molécule neutre et linéaire composée de" l'alternance de
/
1,3-1iés- (0 -D-galactopyranose et 1.~4-11iés-3,6-anhydro-
0<-L-galactopyrano~e.
5 f U
r ; I
n,
r S ); 5 • qgg '5' li ' ri'; l I t 7•
(
l ' • l " t, , ~ : S' . ~ .. 1 • , ~~
, ~1~,
·t
l r. i' ~ fu(
1;, \ ~ \ ~[
~t
li , , 2. Méthode d',extraction oLes· polysaccharides de l'agar peuvent être extraits de plusieurs algues telLes: Gelidium spp., Pterocladia sp.,
Aèanthopeltls sp., Gracilaria spp. et Ceramium spp. ( Brid-,
, .
li J
son et'Brecker, 1970). Plusieurs ~spèces de Ahnfeltia,
"'b
bampylaephora et Phyllophora peuvent aussi être utilisées
)- ,
(Percival et McDowell,) 1967),. Toutes ces algues sont
re-. ~'
groupées sous le nom d'agarophytes. Le terme agarophyte
s',applique ~ plusieurs familles des Rhodophytes et ne forme
!
pas -une division phycologique •
, ./
L'algue est récoltée et débarrassées du sable et des détritus qui la couvrent. Après séchage, l'algue est
pulvé-risée et J:e's pOlysaccharides extr,ai ts à 11' eau bouillante .
. Un trai.tement alcalin effeçtué .avant l'extrac{ion' permet
dtam~liorer le rendèment et la qualité.de·l'agar. Une fil~. ~
tration à, chaud sépare les polysaccharidés des fragme~ts ,~
d'algues .', Le filtrat, agar
n~~.:.
raffiné, déversé dans des.coni--tenants,
form~ U~gel
à la température' ambiante.- Le geldé-' · 0 0
,,(1'
d.oupé est mis à congeler (14 Ft -10 C). Lors ,de la
dé-congélation, l'eau de dégel contenant des sels, des pigments et certains pé>lysa'ccharides est éliminae (Duckworth et Yaphe,
197J"b). ',1' agar séché ,à l'air chaud est ensui te blanchi par
une solution à 1% dt hypôcnlori te (Bridson et\Brecker, 1970).
Les" polysaccharides peuven_t être précipités à l'éthanol
(Gu,iseley. 1968) mais ce processus dispend~eux n'est pas
, ' .. .1" __
-1 ; l ' " ,.
, a . ~."i...L, ... .tI5J.I~4at."'jo.lII""_._"._M _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _~, ... i" 1. f' " t ; ~ f; '. i, r\ ~
f
li " " ~ r ~~ ( " ~ l ( ( 10 ,1 1 1 \ (-\ " -5-, (...;.effectvé en industrie. Certaines marques d'agar sont plus raffinées et subissènt des traitements élaborés.
Le rendement en agar est'· de 10 à 20% (poids de
poly-1
saccharides obtenus par poid~d'algu~ utilisée) selon
l'e5-.
/-pèce d'algue et le stade de croissance de la plante (Young, , ,
• 1
r i 1974. Applied -Marine R~sea!ch. 1976). Le volume optimal
d'eau pour l'extr~ction est de
50
ml pa~ gramme de poudred'al'gue et ':ID pH alcalin rermet. d' au,gment:r ~e rendement en
polysaécharides ( ~awson. 1954~1
.
Il est donc important de considérer les conditions de l'ex·traction,. les originel? et 'l'espèce:' d'algue, dans une
,
étude de rendement en polysaccharides'.
). Structure des polysaccharides de l'agar
L'agar depui6~longtèmps utilisé en micrèbiGlogie
est "demeuré un mystère quant à sa structure ,jusqu'aux aimées
cinquant~s.L~ premières recherches ont rév~lé_ que l'agar
.
,est un pOlymère de galact~se (Araki. 1957).
Deux grandes , , étapes'm~quent les-étude~ de la
struc-ture chiulÏque' de ce pOlymère. Les études dn groupe de, Araki.
• ' 1
ont perrrlis ;de" faire la grande division agarose et agaropec-1 ,
, '
tine. Les résultats obtenus par Duckworth m~ttent en
évi-dence la théorie ~u spectre des polysaccharides composant
l'agar. / \ . \
~
. '~
---,-_
... _-~ ... ~. -,.
,(
i ' l'b ~i~
fi ; 1 ) , ; i • ~ , ! ~-6-a) Théorie de l'agarose et de ltagaropectine
Le groupe de chercheurs japonais~étudia, !par des
analyses chimiques, l'agar commercial japonais qui est ex-trait principalement de Gelidium amansii (Araki et Hirase.
1953).
Araki(1957)
isola, après une acétylation de mêmequ'après une méthylation, deux composés de solubilité
dif-férente dans le chloFoforme. '.Le composé sO-luble (70% du
,
.
matériel orig,inal) formant :un gel fut appelé "agarose" et
<Il ,
mérita la plus grande attention. Le 'composé insoluble (JO%
du matérfel original) est U Il polysaccharide contenant des
1 -.
rési'dus; 's~fate et uronique; on le désigne sous le nom
"d'agaropectine".
Araki et,Hirase (195J) isolèrent un dérivé de
),6-anhydro-L-galac~ose. Ce composé. en quantité équivalente au D-galactose fut reconnu comme unité de base de l'agar. L'agar commercial et le mucilage extrait de Gelidium amansii contiennent donc en proportion égale les deux sucres
D-ga-, ,
lactose-et ),6-anhydro-L-galactose.
r
Les deux même auteurs (Hirase et Araki,
1954),
cristallisèrent un disaccharide , résultant di une hyc!r;.olyse --'
'--"--Î:-~
acide -partielle. Par 'anaryse~~ce--dissaccharide s' av.éra
être composé de D-galactose et de J,6-anhydro-L-galactose unis par un lien glycosidique 1-4 de configuration
(com-.
.
me le suggère la rotat~on opt,ique) (Âraki,
1957).
La,--répé'tition de ce disaccharide uni par la position I-J
1 ~ ) .
.. _,._-:--' '"II
, " " __ .h.~~,~, .... , ' ... ' - ... - - - -... nt' h: ;J .... <te n'MIr \' f ' . . ri _!dt ""'---._~...:.-_ 5 , . .... " "_-... -..:.-... --~=' "1=-:-1
( th/.*,,. t r 1 d H' ! d WC ' k' ft t wa..,. ,:; , , ~ . ", . : 1 , ri L 1 ~ r ;.) il
{
i
-7-forme la molécule q'agar~se (Araki et Hirase, 1960). Ce
sucre est schématisé de la ,façon suivante:
<J
HO
'Fig.
1.
Structure de l'agarobiose.t
Une enzyme, extraite de
.
~seudomonas kyotoensis,,
-hydrolyse l'agar et accumule principalement un sucre.
i
~ude
de cetoligosacc~aride
a permi: d'élucider la structure de l' agarose (va ir Fig •.. 2) dont la compositionchimique est [C12 H14 0,5 (OH)4l n
(~r~~ir.
19661 .•(
o •
La nomenclature suivante fut donnée aux
oligosaccha-rides: . le préfixe aga,!o- sera utilisé lorsque l' extrémi té
non-réductrice est D-gatact~se. et 'le préfixe
néoagaro-lorsque l'extrémité non-r~ductrice est
J,6~anhydro-L-galac-1.
~ 1 ~. - - - -tose" (Araki et Arai.
1950.
L' hydrolyse acide ,partiellepermet donc d'isoler' l'ag~obiose. ~'~ydrolyse enzymatique
!i(
,. f 10 1 • {; 1 ~ f ~L~
"1du lien (!> nous donne la série des néoagarooligosaccharides.
~,
,
1 • , ' . l' , . ... ,,--~._'""._~~ ... ""-'.M-.. ' _ ... ~ ... _,~,..,,~.~.u,"_ -:j
.... ,.. -- ~~ ...1 ; r ,\ .,' .'
"
-8-nantLa stru.(~ture de r - . , ' base étant précis~e, ( ,voy6ns mainte-' ,
les déviations observées.
L'ag~ose ~st ~ pOlymère'd~
lien l-J, '13 -D-galactopyranose' e:t de lien ,1-4,
3'.
6-~ydro ..1 • ,
..
, ~-L-galactopyrano~e se répétant de f,açan alternée. Hiras~
, • ~ \1 1 • (
'et Araki (1961) ont aussi noté la présence de,
'6-0:'méthyl-~1. .. ".
D-galactose dans la molécule d'~garose et_de 4-0-méthyl~ ,
".
9
'L-ga,~ctose (Araki,et ~,1967). Le degré de mé~hy~ation
~ ~ 1 • ~. ~ .. ~... ..J
varie selon l'espèce' d'agarophyte utilisé 9 ..
(Arakl,
19,66). 'l ~.'
Le L-galactose et la D-xylose •. isolê~ en faible quantité,
, '
sont. considérés comme çontaminants.
l
,
L'agaropectine est présente chez les divers agaro-·. phytes.' Celle de G.-amansii . semble avoir la même structure
- ) ' , u
-4e bâ.se que l"agarose. substituée par 'de nom1?reux rés.i~usl
~ '"
acid~s, ~ tels .l'acide D-glucuronique, l*ester sulfate et
.
l'ac1da ~yru~iqu& (Araki, 1957).
b) L'agàr: .spectre
d~ P01YSaCChari~e(D
..1
La définft~~n de l'agar cODllllel mélange de deux
compo-e
sés, lt,agaroseq et 1.' agaropectine, fut conservée parce
qu'
l , . ' ~
elle semblait satisfaisante ,et que peu, de chercheurs se sont
.
~ ) }penchés sur 11 étude de sa structur,e fine. Puis "deux , grouP~8
'
pUblièrent une nouveile nomen~lature de Itagar.
" Par- des é~udé~ de solub~lité
à
diverses 'températures.J , . .
,
(Ji
Duckworth et ~aphe (1970) ont pu i~oler deux complexes def ' ) '
t
. _.
0 0pol~saccharides ~h~gés, so~ubles à 20 et à
Sr,
C. Unepréparation commercia~e d'agar. (Difco Bacto-agar) lavée à
: t ' ~ '; , f' "1
__
~.-....____
~_~_____
r~_...
...,.._~ _~_ , -.
l'
7 - ... ... .. _,~.. v _ _ _ _ ~__ _ _ _ _ _ _tldO~'·!: :~~'t :~
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tS''\
(
1 [.
• 1 (.
\ /' ,....-....,-... ~ . . . - ~ . , . . _ _ ... " _ ... of. ~ -9- '*'
Peau -distillée - 1 à diverses températures donne des fractions
,-,..
,.contenant des pourcentages variés de sulfate ou d'acide
\7 ,.
pyruvique. La vari~tion de température de lavage affecte
t
les caractéri~tiques d~s polysaccharides Chargés ••
En' 19~+. Duckworth et Yaphe propos~re~t la théorie
, \
qu'un spèctre,de polysaccharides formen{ le complexe de
, l"agar.. ris étud:\,.êrent l'élution d'une ,préparation
cODune~-~ '"
"ciaie dtagar, (sùr colonne de DEAE-Séphadex A-50, sous'forme
\\
chlorura) jar un gradient continu de chlorure de sodium •
Les' polysaccharides élués ~ 'l'eau distillée rorment un gel·
- ~.
, ferme et l~ur contenu ~h groupes ,argés est f~bl~. Le
'gradient
d~Lchlorure
de' sodiumperm~t d'~uer
unsp~ct~e
depo~ysacchar~des ~on~ la charge augmente,avec la force
ioni-u
que de l'éluant. ~ne partie du matériel original demeure
• - > \
cependant llé à la ma~rice.
\ .
I,
Une substitution gra~~elle de la molécule d'agarose
par diveri groupes chargés. sulfates ~t p~v~tes~e~t
obser-. " "----. "
v;ée. -L'acide pyruvique "préseht est lié aux ,càrbones 4..,-et 6
f-'? -","k~ , t J ' ' , , , ,
.. Q.u D'-galactose f~On~è''''~~''-insi4::'; 4.<1
,,~,tJ.~bO~-" • ' '. " """''''-''tl t-6'~~~ ." ,(V\-~, '"il
éthylid~e)~D-galactopyranosyl (voir Fig.
3).
Cettesub~ti-, d
tution du V-galactose est commune à l'agar extrait 'de divers
groupes d'·a1gues (Young et al, 1971a).
,
.
1 " 6' ':. ,-,.-...". _ ... ..,·,,~-.;.,..~ ... -f'-. ~- ~ I~ H w :,ZIi'éi il' -~...,._~,~ -1 ~ .,.f'; ... ~~~ ~ .. - ... "" .... '!.J ... -. .... ,'~ ~'~,-.
.
Çlr
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, l ' l, 'néoagarobiose ! , ' r ) "!(
---,-1 \
# .F~g. 2. Structure de l'~garose. (A):.
~t6-anhYdro-...
....
) 1 -!? , L-galac'tose: (G):,
D-galactosa. .,' l'r
...
.
~ ,1 <:l l,' G 0,,-..
,ri~.
3.- Structure du4.6~o-(1~carboXY
éthylid~ne)-D-galactopyranosyl.
..
o\
?"~.II • l " .. ~) • : -: ' , , J' 1 ~ ,1 1 .,
" . , ,', 1'*"
/
:(
/
-11-~
Ces travaux sur résine échangeuse~d'ions et les'
,/ : études dé solubilité amenèrent ~ définir l'agar comme un
" t ,-~ J
'\
j, , ?.'
t~
, , ,,' " \. ,.'
~ ~ ,.J,:- spectre cont~nant trois,extrèmess
1
0
L'.aF0se
nfi<ltre' qui illustre~;::i:Je
'
.
,! , , .. 1
.
idéale proposée par Araki.(voir Fig. 2). L'agarose qui contient du pyruvate et peu de "" ,
~
sulfate (le
masquag~
de lastructure'de'bas~
"
..
"-~ les groupements ~hargés, .augmentet. Le '
b-galact~se
est substitué par4~
6-0-(1-carboxy-éthylidène)-D-galactose et mdntre un début de , . ...
substitution du J,6-anhydro-L-gàlactose par le
'galactose-sulfate. ' '~
JO Les gaiactàns
ch~g~~
qui contiennent peu ou pasde ),6-anhydro-L-galactose et de 4,
6-0-{l-carboxy-éthylidène)-D-galactose •
..
,
Les groupements pyruvate sur le,D-galactose
n'appa-tIP
rtiSsent jamais à proximité d'un galactose-sulfate. La
,1 <1 1 •
prés.ence d' un ga~ctose .. 6;"sulfate non subst~ tué en position
:3 peut, par' trai:tement alcalin.\ former le
~,6-anhydro-,
.
1 •
L-galactose (Rees, 1961b).
- "
, Une autre étude 'faite sur l'agar extrai~de Gracila~
ria verrucosa fut publiée peu de temps après (Izumi,
1972).
,
1
L'auteur y sugg~re que l'agar est une famille de polysaccha~
rides ayant toutes les variations intermédiaires entre les
~-""
- - : - '"
deux types extrêmes de ~acr,omolécules qui sont: oÜO polymère
\
•
""
" ~ oJ' _ ... ~~ <~ ... ' ,\ ... ,j.~~;(1 . . ~ .t.li,tiIooir 'f _.~ .. ~-,,~,.. I~""~-"-'-''''---_ _ _ ...,..._-..---..~ ... -..., •• ",... -... l--~~~"'- -~ -/ .. !r .... .... , "'" ... 'r." •• .:., +1. Hi~' {/O# l é l · t " . ' 'MèNen' h h t , J i1 1 1 , 1 l '
'.1
, 1 1 1i
·1 " 1 " 1 !;'(
1 • 1 1 , : 1 • 1 .' .' " -12": ')de galactose' non sulfaté et,hautément méthylé formé par la,
répé~ition d'agârobiose et un galactan non méthylé avec' un
haut contenù én sulfate dont" la
prop~Ftion
d' anhydrogalac-.tose 'est rédui~. Le-fractionnement a aussi été fâit sur
échangeur d'ions (Dowex l x 2 sous "la forme formate).
4.
Caractéristiques physiques .de-l'agarL~agar, , matériel inerte. est ajouté'lors de . l~
fabri-cation des milieux bactériologiques solides. L'industrie,
e
alimentaire l'utilise dans la fabrication des gelées et· pour lit
la mise er(conserve de certaines viandes. Depuis longtemps empl,oyé en immunologie et . 'dans les techniques
d'électropho-r~se. l'agar, sous forme de bille, 'permet maintenant la
chro~ato~aphie de macromolécules (Guisely, 1968) •.
\ -, 1
~
L'extraction de diverses esp~ces dtagarop~ytes donne
" .
.. ~ #,.,
un gel f~~e et friable recherc~é par les bactériologistes
ou un gel élastique réclamé par l~ industrie"'étlimen:taire'.
Une bonne qualité dtagar forme'ùn gel ferme à
une'concentra-tion aussi Jaible que 1% (C?11ins et LYne. 1970). Le
pro-~essus "sol-gel" est thermoréversib1e et peut être répété.
1
La théorie de la gélification a été étudiée par Ree~
f
(1969) et on propose le mécanisme illustré en. figure
4.
l
l'état de sol, les molécules sont dispersées.L~rsque
latempérature décroit, les molécules adopte~t la structure de
1
t*
..
double hé~ice qui est pl~s stable. Un réseau tridimentibnnel
~. 1 ! 1 l' f M'
,
.
IV.-
- -
-.
", L --p. "
(
\.
c , \ ..
" , -..J .... ___ ~~ ___ ,,_.I.<,4~' l ' --1)-'J
des doubles hélices forme le GEL l. L'agrégation des'dou-blés hélices forme un gel ferme (GEL II). La double hélice est maintenue par ,des liaisons hydrogène entre deux
groupe-mentsthydroxyles. Cette théorie du gel ~xplique le
Phéno-mène de "synérésie" (soit l'expUlSion de l'eau lors de l'
agrégatie~ des doubles hélices).
>
---
SOL GEL 1 . GEL II,"
t. Fig.
4.
Mécanisme de gélification (selon Rees, 1969)."
"
Un changement d~s la,structure fine de l'agar
pcca-sionne un changement' dans la formation du ge~ et en affecte
1
les propriétés. Lorsque le c9ntenu en sulfate ~e l'agar
augmente, le gel devient plus élastique et perd de 'sa
fria-}
. , " l
!bilité. La présence de galactose-6-sulfatè provoque une déformation dans la double héli.ce causant une perte de ré-sistance du gel. Le sulfate sur le carbone 2 du sucre lié
. ,
,
.
j
,/~ ~, ~ 7 J~::_~.~~~-!:~:
.. :-::
r~,::~=~~!:: ~ :~rv_-
-f~J=~~~""''''.. -. -" __ .. ___ ...
d ...,0 , " • ! -l <, t,
.(
\
(
! -..14-.
'1 - ) (soit le D-galactose) n'affecte pas la formation des
e
doubles hélices mais en empêche l'assemblage par répulsion électrostatique. d'où non formation dë gel (NG Ying Kin et
Yaphe, 1972). L'~cide pyruvique en position
4,6
sur leD-galactose ne cause aucun changement à la formation du
GEL l mais peut empêcher le GEL II par~épul~ion
électro-,statiq~e. Le groupe méthoxyle de l'agarose en ~ugmente la
température de gélification (Guiseley. '1970). Un groupe
, ,
méthoxyle sur le carbone 6 n'a aucun effet 'mais le second,
en fixant plus fermement .. la conformation d~s. moléc'ules,
-occasionne la formation des doubles hélices à des temp~rà~
?
tures plus élevées (Yaphe et Duckworth, 1972).'Les caractéristiques physiques et,chimiques de l'agar varient selon 1'algue utilisée pour l'extraction.
Les température,s ,de fusion et de gélification. 1a force,
la,viscosité et la transparence du gel sont également modifiées.
B. - PqLYSACCHARIDES CHARGES
Comme nous l'avons constaté. l'agaropectine décrite
,par Araki n'est que l'éventail des molécules plus ou moins
.
.substituées qui forment l'agar.
cés
polymères chargésodca-sionnent des chan~ements de la qualité physique et chimique
de l'agar qui le~ contient.
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"
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,. 1 " ! \>
..
f 1 1 \ .-15-,Perciva1 (1967) remarque que les polysaccharides des
Rhodophytes contie~ent des prbportions. variables .dé L- et
,
D-galactose, dè 3. 6-anhyd-ro- D- et L-galactose. de
galac-tose monométhyle et d'ester sulfate, Ces polymères de
galactose (unis par des liens l - ) et I-J'" 4), subissant
quel-ques'variations dan~ leurs structures fines, forment une
famille de pOlymères.
..
Nous examinerons ici les méthodes qui furent utili-sées pour'débarrasser l'agar des polysaccharides, chargés. causant certaines interférences. Les deux principales
classes de polysaccharides charg~s (du type de l'agar. du
type de la carraghénane) seront passées en revue.
1. Les méthodes' d', é liminat~on < .
\
, \
L'agar commercial contient de '10 à, -15% d' agarose
neu-tre,.
40%
d'a,garose chargé et de 40 à 50% de mOlécu,les d'agar ,sul~até (Yaphe et Duckworth, 1972). La présence de
molé-cules chargées dans une prépar~tion cause des interférénceà
1 1
dans' les. diverses techniques où l'agar est utilisé l essais 1
, l ' 1
d'antibiotiques (Kokoskine, 1975), d'immunoélectropnorèse, d'électrophorèse sur gel d'agar (Duckworth .et Yaphe. 1971b)
et la formation de plaques virales (Borden ~~. 1970).
La charge négative qe lt agar amène une rétention des molé· ,
'cules positivement chargées qui sont étudiées par ces
métho-.des~
, 1
i
1
(
-16-Saris en-connaître la structure mais sachant leurs,
désavantages, les chercheurs ont mis
au
point diversestech-niques pour éliminer les molécules Chargées de l'agar co~er
cial qU'ils utilisaient.
La méthode d'acétylation utilisée par Araki (1957)
est irréalisable sur une grande,échelle. Les méthodes de
1
iavage
h
l'eau disttllée de la poudre d'agar ou du'gelfurent utilisées avec quelque succès (Kendall, 1928. Grabar et Williams, 1955). La méthode de Hjerten (1962) utilisant
un sel d'ammoni~ quaternaire lch10rure de cétylpyridinium)
pour précipiter les polysaccharides chargés permit de
dimi-nuer le contenu en pu1fate de
0:83%
initial, ~ 0.14% (g/g).jOn utilisa aussi les différentes techniques d'adsorption sur
DEAE-cellul~se (Zabin, 1969).
.
, La précipitation de l'agarosepar du pOlyéthylène glycol semble la .plus efficace (Russell et al, 1964).
Ces techniques se basaient sur la théorie d'Arakia
l' ag~ formé de deux types de molécules, neutres 'et chargées.
On imputait ~ un mauvais 'fractionnement les quantités
rési-duelles de sulfate. Sachant que les groupements pyruvate se situent dans les régions éloignées des groupes sulfate, la
diminution du contenu en' sulfate n'indique donc pas né~es
sairement un produit neutre. Par une comparaison.de trois
méthodes (vo~ Tableau I). Duckworth et Yaphe {197la} mirent
en évidence les qualités d'agarose obtenu.
P f' , t
'1
1 i , 1-
~ ;,
.
-17-TABLEAU l
COMPARAISON \DES
METHODE~
DE
PRE~~TION
D'AGAROSE
1
Récupération
Sulfate
- Pyruvate
•
' (%) (~) (,,) Agar1-
1 1002.96
0.96
Agar lavé6)
0.95
0.21 (20et
sooe)
.oJ Agarose (PEG)JI
0'.60 0.05 DEAE-séphadex15
0 0.05 0 .. 01 ~ (élution)---PÈd-agar0
se+DEAE 100.02
n.d.
' 21Tiré de
Duckworthet
Yaphe,1971a.
2n.d. : non-détectable.
La
sépar-ation sur résine éChangeuse d'ions donne .,
les
.
' ,/ ;>meilleurs résultats. Une bonne qualité dt agarose commercial
est l'ensemble des poly'saccharides ayant moins de 0 ..
6"
desulfate et 0.0.5% de pyr,uvate (Duckworth et Yaphe. 1.97lb).
2. Les
galactans
chargésdu
type del'agar
Ltagar
estle
po1ym~re degalactose ob s'a1ternent
les Lsoml!res D
et
L. Ces deux uni tés de base peuvent subirde
nombreusessubstitutions. Voici
,quelques polym~res du~
1 1
·f
1 1•
. o ' . 1 'Il; ,-18-A partir de Po1ysiphonia lanosa. on a pu isoler un
'.
polymère de galaqtose sulfaté formé des deux sucres de base:
D-galactose et J,6-anhydro-L-galactose. De ce même polysac-1
f \1 1
charide, on a trouvé plusieurs dérivés de D~~alactose
(6-0-méthyl-, 6-su1fate- et
6-0-méthYl-nlgalactose-4-sUlfate) et de L-ga1actose
(6-sul~ate- e~ ~-o-méthYl-L
galactose-6-sulfate) (Batey et Turvey, 1975). 'Ces dérivés
')
peu communs résultent d'un contrele enzymatique spécifique
A 1'algue. r
."
Rhodomela
~arix; ~rodui
t un polysaccharide agaroidecontenant un haut pourcentage de 2-0-méthyl-),6-anhydro-L-galactose (Usov et al, 1971). L'isolation d'une
macro-molécule
du
type de l'agar chez Ceramium rubrum estparticu-1
lièrement intéressante (~urvey et Williams, 1976). Ce
pply-1
mère de galactose m~ntre une composition élevée en
'~alac-tose non substl tué en plus des dérivés méthylés
~sulfatés
•de D-'et L-galactose. Ce polysaccharide
o~ l'~ternance
deD-galactopyranose et de L-galactop~anose f1e la majeure
'\ partie de la molécule. est du type de l' agar
Le funoran est un pOlysaccharide hautement chargé (18.5% sulfate) extrait de Gloiopeltis furcata (Hirase et al. 1958; Izumi, 1971). Par l'étude des sucres de base, on
l'apparente maintenant
A
l'agar puisque la molécule pré~entel'altetn~ce deJ isomères D et L.
o
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.
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'j-~, ~ t~ '( , r:(
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:t \ \ - 1 , _..-_
... ---.... ... ~ ... ....-~ . .._ .. - ' - ~- -~ , .f-19-Le porphyran, extrait des genres'Porphyra et
Laurentia. contien~ un haut pourcentage de groupement méth~l
sur le carbone 6 du 'D-galactose. Le L-galactose est présent sous :t'orme de ),6-anhydro et -de 6-sulfate. (Anderson.et Rees,
1965) •
Par un trai tement ~ l' S:lcali ou par une enzymeex-tralte de l'algue. le L-galactose-6-sulfate est transformé
e~ J,6-anhydro-galactose et le pplym~re est alors identique
~ de l'agarose méthylé (Percival. 1967).
Les différences résul~t du fait qu'une esp~ce
par-ticuli~re se développe dans un enviro'rmement particulier
(Anderson et al,
1965).
Ceci soul~ve de nombreusesques-tions concernant leur
b~osynth~se, ~eurs'
propriétés et leur'fonction dalls l'algue. '
3. Galactans chargée du type de la carraghénane
--- Contrairement li.
i'
agar, les carraghénanes necon-tiennent que l'isom~r~ D du galactose. Le contenu en
sul-fate de ces polym~res est de l'ordre de 20% et on retrouve
le 3,6-anhydro-D~galactose. Ces polysaccharides sont
ex-,traits des eBp~ces de Chondrus. Gigartina. Eucheuma.
Furcellaria et de plusi~urs autres genres (Yaphe et Baxter.
1955).
Comme dans le cas de l'agar, on les extraità
l'eaubouillante •. La purificatioa se fait habituellement
p~
une.'
précipitation à l'alcool (Yaphe. 1959).
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---"'-~~-20-Les -de,ux- ~andes classes de earraghénane sont
obte-nues
par
l' addi tian d'une solution de chlorure de p'otassium.Le. précipité est la J( -carraghénane- (kappa), la  -carraghé-,
nane (lambda) demeure en so~ution. En plùs de ees deux
,~,
grandes familles de polysaccharides, on retrouve des
po1y-m~res
de
structure chi~ique différente. Ceux-ci furentclassés sous les noms de
~
- (iota)et
JI. - (mu) . carraghé-,nana (voir~Fig. 5)(Rees, 19691 Yaphe, 1971; Anderson et al,
1968). Selon l'esp~ce, le stade d~ croissance de la plante
et les conditions de l'environnement, une même algue peut
conténir des proportions variab~es de K~ et de
1 -
carra-ghénane . (Perci val et MeDowell, 1967).
, ,
.
-\ \
Pseudomonas'carrageenovora produit une enzyme
hyd~o-lysant les liens ~ de :La
K
-carraghénane • Elle est utiliséepour l'étude de la stru~ture fine de la'carraghénane
(Yaphe, 1959).'
C - DEGRADATION ENZYMATIQuE
~ï
La mise à jour ~e nombre~x ~icrobrganismes pouvant
causer des dépressions
à
la surface de ltagar ~ milieu deculture fut
à
la base de ce qui est maintenant un des ,.
m~i1-leurs outils dans l'étude des polysaccharides. Les méthodes enzymologiques ont l'avantage d'être spécifiques et moins
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