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Cours pour Etudiants de Licence de Biochimie. Matière: Enzymologie Appliquée Chapitre Rappel: Eléments de cinétique chimique

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Academic year: 2022

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(1)

Matière: Enzymologie Appliquée

Chapitre Rappel: Eléments de cinétique chimique Cours pour Etudiants de Licence de Biochimie

Département de Biologie Physico-Chimique, Faculté des sciences de la Nature et de la vie SNV, Université de Bejaia

Responsable de la matière et chargée de cours:

Pr. KHETTAL Bachra

Email: khettalbachra@gmail.com

Laboratoire de Biotechnologie Végétale et Ethnobotanique Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie

Université de Bejaia

(2)

La cinétique est l'étude des vitesses des réactions chimiques.

La vitesse d'une réaction et ses variations en fonction de différentes conditions sont directement liées à la voie suivie par la réaction, et nous renseignent donc sur

son mécanisme réactionnel

I. Les éléments de cinétique chimique

Définition et terminologies

Dr Khettal Bachra , LBVE, FSNV, U. de Bejaia

(3)

Réaction: A P

Notion de vitesse instantanée

Vitesse dune réaction = variation de la concentration des réactifs ou des produits par unité de temps

[A] = fct t

Temps t

[A]0

[A]1

t1

[P] = fct t

Temps t

t1 [P]1

k Où k: constante de vitesse

I. Les éléments de cinétique chimique

La vitesse instantanée au temps correspond à la tangente de la courbe [A] =

fct t ou [P] = fct t au point de coordonnée t:

v = -d[A]/dt = d [P]/dt

Réaction : aA + bB cC + dD

v = -

d[A] d[B] d[C] d [D]

= - = =

adt bdt c dt d dt k

A, b, c, d coefficients stœchiométriques de la réaction

Dr Khettal Bachra , LBVE, FSNV, U. de Bejaia

(4)

La molécularité d’une réaction correspond au nombre de molécules qui interagissent.

I. Les éléments de cinétique chimique

Notion de molécularité et d’ordre

les réactions mono moléculaires (réactions assez courantes)

A P

les réactions bimoléculaires ( réactions courantes)

2 A P

A + B P

les réactions trimoléculaires sont rares

les réactions de molécularité supérieur sont inconnues.

L’ordre est une notion d’origine purement expérimentale. C’est l’exposant affecté aux concentrations des réactifs interagissant dans l’équation de vitesse d’une réaction

chimique. Il peut être nul ou positif, entier ou fractionna

Ordre ≠ molécularité

Considérons la réaction: A + B  P

L’équation de vitesse s’écrit : v = k[A]

p

[B]

q

k : constante de vitesse

p et q : ordres partiaux de la réaction

k

Dr Khettal Bachra , LBVE, FSNV, U. de Bejaia

(5)

Réaction: aA + bB  P

Réaction élémentaire: simple

Ne se décompose pas en réaction intermédiaire plus simple « d’intermédiaire stable

 Ordre et molécularité s’exprime par le même nombre: p + q = a + b

L’Ordre partiel /à un réactif est égal à son coefficient stœchiométrique

L’ordre est toujours entier

Sa constante de vitesse satisfait la loi d'Arrhénius

Equation de vitesse : v= k[A]p[B]q

Réaction complexe:

Se décompose en plusieurs réactions élémentaires

Ordre et molécularité ont des valeurs différentes p + q ≠ a + b

I. Les éléments de cinétique chimique

Réaction élémentaire, réaction complexe

k

I2 + H2 2HI, v = k [I2] [H2] ordre: 1+1 = 2 Molécularité 1+1=2 2NO + O2 2NO2, v = k [NO]2[O2] ordre = 3

molécularité = 3

Réaction de pyrolyse de l’éthanal:

CH3CHO  CH4 + CO v= k [CH3CHO]3/2

ordre = 3/2 ; molécularité = 1 Réaction de dissociation du N2O5:

N2O5 (s) N2O4 (g) + 1/2O2 (g) v= k;

Ordre = zéro; Molécularité

Dr Khettal Bachra , LBVE, FSNV, U. de Bejaia

(6)

Cas d’une réaction d’Ordre 1:

la réaction: A  P

La vitesse v s’écrit: (1) Après réarrangement et intégration,

l’expression (1) donne:

Relation linéaire entre le Ln de la

concentration du réactif initial et le temps de déroulement de la réaction.

I. Les éléments de cinétique chimique

Etude de l’ordre par méthode d’Intégration

Détermination de l’ordre en fonction du temps:

relation entre la concentration du réactif initial et le temps de la réaction

[A]

[A]0

[A]0/2

t1/2 temps t

Ln [A]

Ln[A]0

pente = -k

temps tn

(7)

Relation linéaire entre l’inverse de la concentration du réactif initiale et le temps de déroulement de la

réaction

I. Les éléments de cinétique chimique

Etude de l’ordre d’une réaction par méthode d’Intégration

Cas d’une réaction d’Ordre 2:

la réaction: A  P

La vitesse v s’écrit: (1) Après réarrangement et intégration,

l’expression (1) donne:

1/[A]

pente = k

1/[A]0

temps n

Cas d’une réaction d’Ordre 0:

la réaction: A  P

La vitesse v s’écrit: (1) Après réarrangement et intégration,

l’expression (1) donne:

= k0

[A] = - k t + [A]0

[A]

[A]0

pente = - k

temps t n

(8)

log v

pente = n log k

log [A]

L’expression de l’équation global de la réaction d’ordre n où n≥ v s’écrit :

v = k[A]

n

on obtient:

log v = n log [A] + log k

I. Les éléments de cinétique chimique

Etude de l’ordre par méthode differentielle

Dr Khettal Bachra , LBVE, FSNV, U. de Bejaia

k

Soit la réaction: A  P

Représentation graphique log v en fonction de log [A]

Ln v = n Ln [A] + Ln k Ou bien

(9)

Le temps de demi réaction est le temps au bout du quel a disparu la moitié du réactif initial à t = t1/2 on a [A] = [A]1/2 = [A]0 / 2

I. Les éléments de cinétique chimique

Etude de l’ordre par méthode des temps de demi-réactions

Ordre Equation de vitesse t1/2 Commentaire

0 le temps de demi-réaction

évolue de manière proportionnelle avec la concentration initial du réactif

1

le temps de demi réaction est indépendant de la

concentration initiale du réactif

2

le temps de demi-réaction évolue de manière inversement

proportionnelle avec la concentration initial du réactif. n

n≠1

t1/2 =[A]0 /k [A] = - k t + [A]0

t1/2 =1/k[A]0

1/[A]n-1 = (n-1) k t + 1/[A]0(n-1)

(10)

Notions d’ENERGIE LIBRE et ENERGIE D’ACTIVATION

Considérant la réaction: A P K

eq

A

P

Energie

DG° < 0 Ea

A**

P

DG°> 0

Déroulement de la réaction

Variation d’énergie

libre Energie d’activation

Dr Khettal Bachra , LBVE, FSNV, U. de Bejaia

I. Les éléments de cinétique chimique

(11)

C’est quoi une réaction thermodynamiquement favorable?

Réaction exergonique qui évolue spontanément vers l’équilibre

Considérant la réaction: A P K

eq

A

P

Energie

DG A**

P DG

Déroulement de la réaction

DG<0  exergonique = Thermodynaniquement favorable

DG>0  endergonique = Themodynamiquement non favorable

Variation d’énergie libre

(12)

Soit la réaction: A P K

eq

Energie libre :

DG=DG°+RT ln [P]/[A] <0 À l’équilibre

DG =0 et K

eq

= [P]

eq

/[A]

eq

 D G° = - RTln K

eq

R: constante des gaz parfait R=8,314j/mol.K e

T: température en kelvin T = θ° + 273

Energie libre standard

I. Les éléments de cinétique chimique

Notions d’ energie libre standart DG°

Dr Khettal Bachra , LBVE, FSNV, U. de Bejaia

(13)

Le catalyseur accélère la vitesse de la réaction en diminuant l'énergie d'activation

C’est en abaissant l’énergie d’activation (enthalpie libre d'activation) DG nécessaire à la réaction que l’enzyme agit.

L’energie libre réactionnelle DG reste inchangée en présence du catalyseur

DGnc = Eanc: Energie d’activation en absence de catalyseur

D G

c

< D G

nc

Energie

Sans catalyseur DGnc

DGc Présence d’un catalyseur

Substrat S

Produit P

DGc = Eac: présence de catalyseur

I. Les éléments de cinétique chimique

Catalyseur et énergie d’activation

Dr Khettal Bachra , LBVE, FSNV, U. de Bejaia

(14)

Relation entre l’énergie d’activation et la constante de vitesse?

• Relation d’Arrheinus: ou

* A est une constante

• A température constante:

D G => k

k = A exp

-DG‡ /RT

D G

c

< D G

nc

=> k

c

>> k

nc

I. Les éléments de cinétique chimique

Energie d’activation: relation d’Arrheinus

k = A e

–Ea/RT

Log k= Log A - Ea/RT log k = log A - Ea/2,3RT

Effet de la température:

application de la loi d’Arrhenius

ln k

1/T

Pente = - Ea/R

Dr Khettal Bachra , LBVE, FSNV, U. de Bejaia

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