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L’influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance variétale : une étude de cas basée sur la rouille brune du blé.

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Academic year: 2021

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HAL Id: hal-02753665

https://hal.inrae.fr/hal-02753665

Submitted on 3 Jun 2020

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L’influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance variétale : une étude de cas basée sur la

rouille brune du blé.

Julien Papaix, Henriette Goyeau, P. Du Cheyron, Hervé Monod, Christian Lannou

To cite this version:

Julien Papaix, Henriette Goyeau, P. Du Cheyron, Hervé Monod, Christian Lannou. L’influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance variétale : une étude de cas basée sur la rouille brune du blé.. Ecologie 2010, Sep 2010, Montpellier, France. 27 p. �hal-02753665�

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

L’influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance variétale : une étude de cas basée sur la rouille

brune du blé

J. Papaïx(1,2),H. Goyeau(2), P. Du Cheyron(3), H. Monod(1), C.Lannou(2)

(1)UR 341 MIA, F-78352 Jouy-en-Josas

(2)UMR 1290 BIOGER, F-78850 Thiverval-Grignon

(3)Arvalis-Institut du végétal, F-78280 Guyancourt

Écologie 2010, Montpellier

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Plan

Introduction

Modélisation statistique

Résultats

Discussion

(4)

Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Contexte général

I Particularité desespaces agricoles: - forte homogénéité,

- possibilité de gérer l’organisation spatiale des cultures.

I Rôle desstructures spatialeset de lacomposition d’un environnement sur :

- son invasibilité,

- l’adaptation d’une population.

I Approches paysageen épidémiologie : - efficaces pour le contrôle des épidémies, - peu d’études sur la gestion des résistances

variétales.

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Problématique

Comment gérer les résistances variétales à l’échelle d’un paysage à des fins de durabilité ?

⇒Études des liens entre lacomposition du paysage variétalet leniveau de maladie exprimé par les variétés.

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Plan

Introduction

Modélisation statistique

Résultats

Discussion

(7)

Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Plan

Introduction

Modélisation statistique

Résultats

Discussion

(8)

Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Données

Analyse basée sur le pathosystème de larouille brune, maladie foliaire dublé(Triticum aestivum) causée par Puccinia triticina.

Données disponibles de 1999 à 2008 :

1. fréquences des variétésde blé les plus cultivées en France (f),

2. suivi des populationsdeP. triticinasur chacune de ces variétés par échantillonnage de pustules sur l’ensemble du territoire (Y),

3. notation des symptômesde rouille brune exprimés par ces variétés sur un réseau d’essai (X).

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Structure du modèle

,

f

v t

, , v t p

 

v t r, ,

e ,

v p ,

v p

v p, 0

a

v

a

1t

a

r2

,

b

v p

, , , v t r e , ,

X

v t p

Y

, , v t p

Z S

v t r, ,

Effet du paysage variétal sur la composition des populations de rouille

Effet de la composition des populations de rouille sur le niveau de maladie observé

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Plan

Introduction

Modélisation statistique

Résultats

Discussion

(11)

Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Paysage et populations pathogènes

E[Zv,t,p] = αv,p+PV

i=1δi,p·βi,p·fi,t

1999200020012002200320042005200620072008 a

year

0.00.20.40.60.81.0

+ + +

+ +

+ + +

+ +

0.00.10.20.30.40.50.6

b

0.00.20.40.60.81.0

+ + + +

+ +

+ + +

+ 0.00.10.20.30.40.50.6

c

0.00.20.40.60.81.0

+ + + + + + + +

+ +

0.00.10.20.30.40.50.6

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Populations pathogènes et symptômes

Résistance constante

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Populations pathogènes et symptômes

Résistance décroissante

(14)

Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Populations pathogènes et symptômes

Résistance croissante

(15)

Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Plan

Introduction

Modélisation statistique

Résultats

Discussion

(16)

Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Conclusions

I Le niveau de résistance des variétés est affecté par la composition du paysage variétal dû à des

changements dans la composition des populations pathogènes.

0.60.70.80.91.0

fréquence des pathotypes virulents sur Soissons

0.20.30.40.50.6fréquence du pathotype 73100 0.40.50.60.70.8 0.040.060.080.100.120.14 fréquence de la variété Soissonsniveau de résistance observée

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Conclusions

I Quantification et décomposition des interactions pathotypes-variétés en condition de production.

I Limites : variables corrélées ? Structuration spatiale des populations de rouille ? Émergence des

pathotypes?

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Structures spatiales

Variétés regroupées Variétés isolées

I souche 1 : généraliste,

I souche 2 : spécialiste de la variété 1

I souche 3 : spécialiste de la variété 2

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Dynamique de la surface saine

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Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

Dynamique des souches

Variétés regroupées Variétés isolées

(21)

Influence de la composition du paysage cultivé sur la résistance

variétale Papaïxet al.

Introduction

Contexte général Problématique

Modélisation statistique

Données Modèle

Résultats

Paysage et populations pathogènes Populations pathogènes et symptômes

Discussion

Conclusions Structures spatiales

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