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BCPST2: programme de colle n°2 de SVT du 4 au 15 Octobre.
REVISION BCPST1
Dans le cours de génétique, revoir juste la partie concernant la structure de la double hélice d’ADN et ses propriétés pour des sujets plus généraux de biochimie.
I-A-1 L’eau, les petites molécules organiques Les acides alpha-aminés ont un état d’ionisation qui dépend du pH. Leur diversité repose sur les
caractéristiques de leurs radicaux. La liaison peptidique unit deux acides aminés selon une géométrie qui conditionne les structures d’ordre supérieur.
- citer les groupes d’acides aminés et leurs principales propriétés associées ;
- identifier sur une formule le type de radical, le rattacher à un groupe d’acide aminé ;
- décrire et commenter la liaison peptidique ;
Seules l'alanine, la cystéine et la sérine sont à mémoriser.
I-A-2 Les macromolécules : les protéines
Les protéines sont des polymères d'acides aminés.
Les propriétés physico-chimiques de la liaison peptidique et des radicaux des acides aminés permettent aux protéines de s'organiser en structures tridimensionnelles secondaires, tertiaires et
quaternaires. La fonction des protéines dépend des propriétés chimiques et mécaniques de ses différents domaines fonctionnels.
Les macromolécules protéiques sont des structures dynamiques, dont les radicaux sont en permanente agitation. Leur fonction dépend de leur organisation tridimensionnelle qui repose sur des liaisons de faible énergie qui contribuent à contenir l’agitation thermique des radicaux.
Elles peuvent s’associer de façon spécifique à d’autres molécules au niveau de sites. Les propriétés de ces relations protéines-ligands sont semblables ; les conséquences fonctionnelles qu’entraine la fixation dépendent de la protéine.
Certaines protéines sont glycosylées.
Les lipoprotéines sont des édifices complexes de protéines et de lipides.
- présenter les niveaux structuraux des protéines ; - présenter la diversité des relations entre radicaux ; - interpréter un profil d’hydropathie ;
-
présenter un modèle d’interaction spécifique entre une protéine et un ligand ;- relier les caractéristiques de l’interaction, ses propriétés (spécificité, stabilité...) et ses fonctions ; On construit l’argumentation sur un exemple de mécanisme de catalyse enzymatique, qui permet entre autres de montrer l’importance du site actif, avec la stabilisation d’une forme de transition a priori instable sans l’enzyme.
- présenter le principe d’une O-glycosylation sur sérine ;
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BCPST2
TP: Respira,on en milieu aqua,que Néréis; Arénicole; Moule; Poison téléostéen TP: Respira,on en milieu aérien
Trachées d’insectes, lame de poumon parenchymateux de mammifère
GEOLOGIE A REVOIR POUR QUESTIONS DE COURS et DOCUMENTS proches du cours:
Roches magmatiques: péridotite, granite, gabbro, basalte, andésite, ryolithe, granodiorite, trachyte.
Lecture et utilisation d’un diagramme binaire et d’un diagramme ternaire Utilisation du diagramme de Streckeisen
Méthode de tomographie sismique
Commentaire des diagrammes d’éléments traces (terres rares)
Les caractéristiques de molécules à fonction de transport conditionnent les capacités d’échange au niveau de l’échangeur et au niveau des tissus.
- relier les conditions locales de la fixation et du relargage du dioxygène aux propriétés de l’hémoglobine et au fonctionnement de l’hématie.
L’hémoglobine humaine de l’adulte sera le seul exemple abordé ;
La quantité de transporteurs limite aussi la quantité de dioxygène transportée et l’activité de l’organisme.
La modulation de la quantité de gaz échangés passe essentiellement par des variations contrôlées de la convection. Le paramètre limitant de la respiration dépend de la solubilité différentielle de l'O2 et du CO2 en milieu aquatique et aérien ; le stimulus du contrôle de la respiration est différent dans l'air et dans l'eau.
Les mécanismes de l’érythropoïèse et de son contrôle sont hors programme.
Les mécanismes de contrôle de la ventilation ne sont pas au programme.
II-B Exemple d’une fonction en interaction directe avec l’environnement : la respiration
L’argumentation est mémorisée sur un nombre réduit d’exemples : mammifère, poisson téléostéen, crustacé, insecte et s’appuie sur les observations faites en travaux pratiques.
Les échanges respiratoires reposent exclusivement sur une diffusion des gaz et par conséquent suivent la loi de Fick. L’organisation des surfaces d’échange
respiratoires tout comme les dispositifs de renouvellement des fluides dans lesquelles elles s’intègrent contribuent à l’efficacité des échanges.
- relier les dispositifs observés aux différentes échelles : o aux contraintes fonctionnelles (diffusion–loi de Fick) ; o aux contraintes du milieu de vie(densité, viscosité, richesse en eau, en dioxygène).
Selon les plans d'organisation, des dispositifs différents réalisent la même fonction.
Dans le même milieu, pour des plans d’organisation différents, des convergences fonctionnelles peuvent être détectées et reliées aux contraintes physico-chimiques du milieu de vie (aquatique ou aérien).
- identifier et énoncer des convergences anatomiques ou fonctionnelles ;
