Écrire / Lire un Article Principes de Base
Laboratoire d’Enseignement et de Recherche
roch.giorgi@ap-hm.fr
Dr Roch Giorgi
Dr Roch Giorgi
Les Différents Types d’Articles
z
Article original
9 Travail de recherche fondamental, clinique,
épidémiologique, essai thérapeutique, étude descriptive, essai diagnostic, étude de causalité
z
Éditorial
z
Cas-clinique
z
Lettre à la rédaction
z
Mise au point
z
Revue générale structurée
z
Méta-analyses
Types de Revues Médicales
z
Revues à comité de lecture
9 Mode de relecture
9 Impact Factor : moyenne du nombre de citation, dans toutes les revues, au cours d’une certaines période
z
Revues sans comité de lecture
z
Document publicitaire
Processus de Recherche
Analyse des données de l’étude
Mise en place d’un schéma d’étude adapté
Diffusion des résultats de l’étude Recueil des données de l’étude
Formulation d’une hypothèse de recherche
Structure Générale d’un Article
Titre ~~~~~~~~~~
Auteurs ~~~~~~~~
Résumé ~~~~~~~~
I
ntroduction ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
M
éthodes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
R
ésultats ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
D
iscussion ~~~~~~9 Quelle est la question posée ?
9 Comment l’étude est conduite ?
9 Quels sont les résultats obtenus ?
9 Comment interpréter ces résultats ?
Titre d’un Article
z
Court
z
Explicatif, non indicatif, simple, complet
z
Comprend les mots clés
z
Dit l’essentiel
9 L’objet de l’étude 9 La question posée
9 La population étudiée
La Question Posée (1)
z
C’est l’objectif principal de l’étude
9 Il s’agit d’une action
Évaluer
Déterminer
…
9 Se rapportant à un but précis
Efficacité d’un médicament
Effet d’un facteur de risque
…
9 Intégrée dans un cadre bien spécifié
La Question Posée (2)
z
Type de question
Thérapeutique
Diagnostique
Pronostique Étiologique
Où Rechercher l’Information Pertinente
9 Quelle est la question posée ?
9 Comment l’étude est conduite ? 9 Quels sont les résultats obtenus ? 9 Comment interpréter ces résultats ? Titre ~~~~~~~~~~
Auteurs ~~~~~~~~
Résumé ~~~~~~~~
I
ntroduction ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
M
éthodes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
R
ésultats ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
D
iscussion ~~~~~~La Conduite de l’Étude (1)
1. Le schéma d’étude
Type de Question Schéma d’Étude
Thérapeutique Essai randomisé contrôlé Diagnostique Étude de cohorte
Étude cas-témoins Pronostique Étude de cohorte
Étude cas-témoins Étiologique Étude de cohorte
Étude cas-témoins Étude transversale
Schéma d’Études (1)
z
Étude de cohorte
9 Avant l’exposition au(x) facteur(s) 9 Après l’exposition au(x) facteur(s)
Exposés
Non Exposés
Malades Non Malades
Malades Non Malades Cohorte
Schéma d’Études (2)
z
Étude cas-témoins
9 Comparaison de malades et de non malades
« identiques »
9 Biais de classement
Malades
Non Malades Exposés
Non Exposés
Exposés Non Exposés
Détermination de la maladie Exposition ?
Schéma d’Études (3)
z
Étude transversale
9 Unique 9 Répétée
Temps
Malades
Non Malades Exposés
Non Exposés Malades Exposés
Non Malades
Non Exposés
Exposés Exposés Non Malades
Non Malades Non Exposés
Malades Exposés
Non Malades Non Exposés
Où Rechercher l’Information Pertinente
9 Quelle est la question posée ?
9 Comment l’étude est conduite ?
• Le schéma d’étude
9 Quels sont les résultats obtenus ? 9 Comment interpréter ces résultats ? Titre ~~~~~~~~~~
Auteurs ~~~~~~~~
Résumé ~~~~~~~~
I
ntroduction ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
M
éthodes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
R
ésultats ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
D
iscussion ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
Références
La Conduite de l’Étude (2)
2. La sélection de la population d’étude
9 Procédure d’échantillonnage en accord avec l’objectif de l’étude
9 Représentative de la population cible 9 Bien définie
Critères d’inclusion
Critères de non-inclusion
Critère d’exclusion
pour participer à l’étude en cours d’étude
Population – Échantillon (1)
z
Population
9 Ensemble d’objets ou d’individus ayant des caractéristiques qui leurs sont propres
9 Exemple : les individus de sexe masculin
z
Échantillon
9 Sous-ensemble d’une population
9 Exemple : un certain effectif d’individus de sexe masculin 9 Un bon échantillon (« sans biais de sélection ») doit être
représentatif de la population dont il est issu
Les études portent généralement sur un échantillon tiré d’une population
Population et Échantillon (2)
Population Échantillon 1
Échantillon 2
= 28 %
= 40 %
= 32 %
= 65 %
= 15 %
= 20 %
≠
Population et Échantillon (3)
Population
Échantillon 3
Biais de sélection
Population et Échantillon (4)
Population
Échantillon 4
= 28 %
= 40 %
= 32 %
= 25 %
= 40 %
= 35 %
≈
Échantillonnage
z
Tirage au sort
9 Aléatoire (random) : échantillon représentatif 9 Pas par commodité (biais de sélection, …)
z
Stratification
9 Subdivision de la population en strates 9 Tirage au sort au sein de la strate
9 Exemple
Essai thérapeutique multicentrique pour comparer l’effet des fraises tagada aux cachous sur l’ictère du nourrisson
Randomisation dans les groupes effectuée dans chacun des centres (strates) ≠ randomisation sur l’ensemble des patients
La Population d’Étude
z
Population cible
9 Motive au départ l’organisation de l’étude
9 Celle à laquelle on souhaite a priori pouvoir étendre les résultats
z
Population source
9 Celle d’où l’échantillon étudié est extrait
Possibilités de biais
!
z
Extrapolation des résultats obtenus sur l’échantillon
9 À la population source 9 À la population cible
Où Rechercher l’Information Pertinente
9 Quelle est la question posée ?
9 Comment l’étude est conduite ?
• La sélection de la population d’étude
9 Quels sont les résultats obtenus ? 9 Comment interpréter ces résultats ? Titre ~~~~~~~~~~
Auteurs ~~~~~~~~
Résumé ~~~~~~~~
I
ntroduction ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
M
éthodes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
R
ésultats ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
D
iscussion ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
Références
La Conduite de l’Étude (3)
3. Le recueil des informations pertinentes
9 Définition des variables importantes
Critère de jugement principal
Test évalué, test de référence
Facteurs pronostiques étudiés et effets prédits
Facteurs d’exposition et survenue de la maladie
9 Description des modalités pratiques de mesure
Méthodes standards, validées
Procédure d’insu
Critères de Jugement
z
Critère de jugement principal
9 Fonction de l’objectif principal 9 Étude bâti autour de lui
9 Permet de déterminer le nombre de sujets nécessaires 9 Analyse faite autour de lui
z
Critères de jugements secondaires
9 Apprécient d’autres effets, facteurs,…
9 Permettent d’exprimer les conclusions sous forme d’hypothèses
Î Seuls des critères de jugement bien définis et pertinents permettront de mettre en valeur des résultats cliniques
La Conduite de l’Étude (4)
3. Le recueil des informations pertinentes
Exactitude
Précision
Oui
Non
Oui Non
Où Rechercher l’Information Pertinente
9 Quelle est la question posée ?
9 Comment l’étude est conduite ?
• Le recueil des informations pertinentes
9 Quels sont les résultats obtenus ? 9 Comment interpréter ces résultats ? Titre ~~~~~~~~~~
Auteurs ~~~~~~~~
Résumé ~~~~~~~~
I
ntroduction ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
M
éthodes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
R
ésultats ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
D
iscussion ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
Références
La Conduite de l’Étude (5)
4. L’analyse statistique
9 Description des méthodes adaptées
À la question posée
Efficacité
Prédiction
Association
Aux données recueillies
Catégorielles / Continues
9 Indications concernant
Le calcul des effectifs nécessaires
Les tests statistiques utilisés Univariés / Multivariés
Taille des Effectifs Étudiés
Nombre de Sujets Nécessaire Bénéfice clinique minimal intéressant
Variabilité du critère de jugement
Risque de première espèce α
Puissance du test : 1 - β
C L I N I Q U E
S T A T I TS I Q U E
Où Rechercher l’Information Pertinente
9 Quelle est la question posée ?
9 Comment l’étude est conduite ?
• L’analyse statistique
9 Quels sont les résultats obtenus ? 9 Comment interpréter ces résultats ? Titre ~~~~~~~~~~
Auteurs ~~~~~~~~
Résumé ~~~~~~~~
I
ntroduction ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
M
éthodes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
R
ésultats ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
D
iscussion ~~~~~~Les Résultats Obtenus (1)
1. Description de la population étudiée
9 Effectifs & Caractéristiques
9 Pour toutes les phases de l’étude 9 Pour les variables pertinentes
9 Sur tous les groupes
Où Rechercher l’Information Pertinente
9 Quelle est la question posée ? 9 Comment l’étude est conduite ?
9 Quels sont les résultats obtenus ?
• Description de la population étudiée
9 Comment interpréter ces résultats ? Titre ~~~~~~~~~~
Auteurs ~~~~~~~~
Résumé ~~~~~~~~
I
ntroduction ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
M
éthodes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
R
ésultats ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
D
iscussion ~~~~~~Les Résultats Obtenus (2)
2. Réponse à l’objectif principal
9 Estimation de paramètres statistiques
Mesure Ponctuelle Mesure de Précision
Moyenne Écart-type ou
Intervalle de confiance Pourcentage Intervalle de confiance Risque relatif Intervalle de confiance
… …
Intervalle de Confiance
z
Intervalle des valeurs plausibles pour la vraie valeur du paramètre estimé
11/19 (58 %) 290/500
(58 %) 1740/3000
(58 %)
Nouveau traitement
Différence Traitement
Existant
14/23 (61 %) 305/500
(61 %) 1830/3000
(61 %)
3 %
3 %
3 %
IC95
-27 % à 32 %
-3 % à 9 %
1 % à 6 %
Scénario 1
Scénario 2
Scénario 3
Degré de Signification
z
Valeur permettant de conclure à une « réalité » ou significativité d’une différence
z
p < 0,05 ⇒ probabilité < 5% que la conclusion d’une différence entre deux traitements similaires soit fausse
9 Plus la valeur de p est faible plus le risque d’avoir une conclusion « fausse » est faible
! Ne quantifie l’importance de l’effet estimé
Les Résultats Obtenus (3)
2. Réponse à l’objectif principal
9 Résultats informatifs
Type de Question Résultats Informatifs Paramètre Statistique Thérapeutique Mesures d’efficacité
Mesures de prédiction
Mesures de prédiction Mesures d’association
Réduction absolue du risque Réduction relative du risque
Nombre de patients à traiter pour obtenir un succès
Diagnostique Sensibilité/Spécificité du test
Valeurs prédictives
Pronostique Sensibilité/Spécificité du marqueur
Valeurs prédictives Risque relatif
Où Rechercher l’Information Pertinente
9 Quelle est la question posée ? 9 Comment l’étude est conduite ?
9 Quels sont les résultats obtenus ?
• Réponse à l’objectif principal
9 Comment interpréter ces résultats ? Titre ~~~~~~~~~~
Auteurs ~~~~~~~~
Résumé ~~~~~~~~
I
ntroduction ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
M
éthodes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
R
ésultats ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
D
iscussion ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
Références
Les Résultats Obtenus (4)
3. Réponses aux objectifs secondaires éventuels
9 Estimation de paramètres statistiques
Mesure ponctuelle
Mesure de précision
Résultats informatifs
Présentation des Résultats
z
Dans le texte
z
Tableaux
9 Présente des données répétitives, des données utiles pour vérifier les résultats importants
9 Les données doivent apparaîtes clairement
9 Les nombres reportés dans les tableaux doivent être en concordance avec les nombres indiqués dans le texte
z
Figures et graphiques
9 Pour visualiser ou résumer une distributions ou un contraste
9 Différents types de graphiques
z
Titre bref mais informatif
z
Numérotés dans le texte dans leur ordre d’appel
L’Interprétation des Résultats
z
Résumé des faits
z
Limites éventuelles
9 Discussion objective
9 Justification de la crédibilité de l’étude
z
Mises en perspective
9 Analyse synthétique de la littérature récente
z
Implications pratiques
9 Découlent des résultats de l’étude et de l’état des connaissances
Biais et Limites
z
Biais de Sélection
9 Résultent de la façon dont l’échantillon est choisi au sein de la population
z
Biais de Classement
9 Résultent d’erreurs de mesure systématique
z
Biais de Confusion
9 Résultent de l’influence de tiers facteurs sur l’association entre un facteur étudié et la variable d’intérêt
Où Rechercher l’Information Pertinente
9 Quelle est la question posée ? 9 Comment l’étude est conduite ? 9 Quels sont les résultats obtenus ?
9 Comment interpréter ces résultats ?
• Résumé des faits
Titre ~~~~~~~~~~
Auteurs ~~~~~~~~
Résumé ~~~~~~~~
I
ntroduction ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
M
éthodes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
R
ésultats ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
D
iscussion ~~~~~~Aide à la Lecture Critique d’Articles
Médicaux
Niveau de Preuve
Niveau 1
Essais comparatifs randomisés avec résultats indiscutables Méta-analyse
Analyse de décision
Niveau 2 Essais comparatifs randomisés avec résultats incertains
Niveau 3 Études prospectives de cohorte
Niveau 4 Études rétrospective de cohorte (historique) Études cas-témoin
Niveau 5 Pas de groupe de sujets contrôles Séries de patients
Les Références Bibliographiques
z
Numérotées dans le texte dans leur ordre d’appel
z
Habituellement présentées selon les normes de Vancouver
9 Article de périodique
Nom Initiale du prénom
Titre de l’article
Titre du périodique en abrégé année; numéro de volume (numéro de fascicule):première-dernière page.
Exemple : Von Harsdof R, Poole-Wilson PA, Diete R.
Regenerative capacity of myocardium : implications for treatment of heart failure. Lancet 2004 ;363(9417):1306-13.
9 Différent si livre, chapitre de livre,…
Le Résumé – Contenu (1)
z
Doit être informatif
z
Permettre de comprendre
9 l’objectif de l’étude
9 les méthodes utilisées par les auteurs
z
Donner
9 les principaux résultats 9 la conclusion principale
z
Se retrouve dans l’article (texte, tableaux, figures)
z
Exprimé de la même manière
Le Résumé – Contenu (2)
z
Exprimé de la même manière
z
Ne contient ni référence, ni tableau, ni figure
z
Abréviations
9 Unités internationales ou établies (µg, ms, VS, BK,…) 9 Décrite en début de texte (« Des études suggèrent que
les anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS)… ») 9 En nombre limité
z
Longueur imposée par la revue (en général court)
Le Résumé – Structure
Introduction *
~~~~~~~~~~~~~~
Objectif
~~~~~~~~~~~~~~
Méthodes
~~~~~~~~~~~~~~
Résultats
~~~~~~~~~~~~~~
Conclusion
~~~~~~~~~~~~~~
Le Résumé – Éléments
z
Les 8 éléments à considérer
Élément I.*
Élément II.
Élément III.
Élément IV.
Élément V.
Élément VI.
Élément VII.
Élément VIII.
Justification de l’étude
Objectif principal de l’étude Schéma d’étude
Population prévue Mesures principales
Population sélectionnée Résultats principaux
Conclusion principale
* Optionnel
Références
z S’entraîner à la lecture critique d’un article médical.
Bouvenot G. Eds MED-LINE ; 2006.
z Lecture critique et rédaction médicale scientifique.
Comment lire, rédiger et publier une étude clinique ou épidémiologique. Salmi LR. Paris, Elsevier, 1998.