Sommaire Session 4 - Blanche

Conférencier invité – Session 4... 143

Progrès et contraintes pour le développement de la métagénomique phytovirale ... 143

Thierry Candresse^1,2, A. Marais^1,2, C. Faure^1,2 , L. Svanella-Dumas^1,2,S. Carrère^3,4, B. Bergey^1,2,

and Yec’Han Laizet^1,2 143

Communications orales – Session 4 ... 144

O19 - Analyse phosphoprotéomique des voies de réponse au fludioxonil des champignons filamenteux

Alternaria brassicicola et Botrytis cinerea ... 145

Jérôme Dumur², Marlène Davanture¹, Benoît Valot¹, Claire Campion², Nelly Bataille², Michel Zivy¹,

Philippe Simoneau², & Sabine Fillinger³ 145

O20 - Prophage-crosstalk and prophage-associated cytotoxicity in Enterococcus faecalis v583 ... 146

Renata Cruz de Matos¹²³, Naima Cortes-Perez¹², Nicolas Lapaque¹², Albertas Navickas¹², Thierry

Meylheuc¹², Francis Repoila¹², Lionel Rigottier-Gois¹², Bruno Gonzalez-Zorn⁴, Maria de Fatima Lopes³, Pascale Serror¹² 146

O21 - Genomics and physiology to investigate the lipid metabolism of 9 oleaginous yeasts... 147

Stéphanie Michely¹, Claude Gaillardin², Jean-Marc Nicaud³, Cécile Neuvéglise¹ 147

O22 - La recombinaison homologue atypique des bactériophages ... 148

Geoffrey Hutinet, Jihane Amarir-Bouhram, Elisabeth Moncaut, Marie-Agnès Petit 148

O23 - Dynamique de mise en œuvre des hémicellulases de Thermobacillus xylanilyticus pour le

fractionnement des parois végétales ... 149

Pierre-Vincent Revol, Harivony Rakotoarivonina, Caroline Rémond 149

O24 - The Group B antigen of Streptococcus agalactiae: a peptidoglycan-anchored polysaccharide

involved in cell wall biogenesis ... 150 Élise Caliot^a, Shaynoor Dramsi^a, Marie-Pierre Chapot-Chartier^c,d, Pascal Courtin^c,d,Saulius

Kulakauskas^c,d, Christine Péchoux^e, Patrick Trieu-Cuot^ab, Michel-Yves Mistou^c,d 150

Posters – Session 4 ... 151

P79 - Effet de l’oxygène sur la sporulation de Bacillus cereus ... 152

Amina Abbas¹, Michel Jobin¹, Philippe Schmitt¹ 152

P80 - La flore microbienne fromagère est-elle capable de survivre aux stress digestifs ? ... 153

Nadège Adouard¹ , Pascal Bonnarme¹, Marielle Bouix¹, Daniel Picque¹, Benoît Foligne² 153

P81 - Effect of ramR mutations on efflux genes expression and on fluoroquinolone susceptibility in

Salmonella enterica serotype Kentucky ST198 ... 154

Sylvie Baucheron-Monnier^1,2, S. Le Hello³, B. Doublet^1,2, E. Giraud^1,2, F.X. Weill³, A. Cloeckaert^1,2

154

P82 - L5P a specific lipopeptide of Mycobacterium avium subp. paratuberculosis: feature and innovative diagnosis applications ... 155

140 Journées des microbiologistes de l’Inra, 13-15 novembre 2012, L’Isle-sur-la-Sorgue

P83 - Inter- and Intra-subtype genotypic differences that differentiate Mycobacterium avium subspecies

paratuberculosis strains ... 156

Franck Biet¹, Iker A. Sevilla², Thierry Cochard¹, Louise H. Lefrançois¹, Joseba M. Garrido², Ian

Heron³, Ramón A. Juste², Joyce McLuckie³, Virginie C. Thibault¹,Philip Supply⁴, Desmond M. Collins⁵, Marcel A. Behr⁶, Karen Stevenson³ 156

P84 - Rôle de KuA dans la réponse aux agents génotoxiques chez Streptomyces ambofaciens ... 157

Ludovic Chipot¹, Lingli Zhang¹, Emilie Piotrowski¹, Claire Bertrand¹, Fabrice Confalonieri²,

Annabelle Thibessard¹ and Pierre Leblond¹ 157

P85 - Lipopolysaccharide heterogeneity in the atypical group of novel emerging Brucella species ... 158 Michel S. Zygmunt^a,b* Isabelle Jacques^a,b,c Nelly Bernardet^a,b & Axel Cloeckaert^a,b 158

P86 – Horizontal gene transfer mediated by bacteriophages in the mouse gut ... 159

Marianne De Paepe, Marie-Agnès Petit 159

P87 - Réponse physiologique de Bacillus cereus, au froid en absence d'oxygène. ... 160

Benoît de Sarrau^1,2, Thierry Clavel^1,2, Christophe Nguyen-thé^1,2 160

P88 - Caractérisation du gène cyp684 responsable de la résistance au fenhexamid chez l'espèce

Botrytis pseudocinerea ... 161 Saad Azeddine & Alexis Billard, Pauline Solignac, Jocelyne Bach, Catherine Lanen, Anne-Sophie Walker, Sabine Fillinger & Danièle Debieu 161

P89 - Adaptation de Bacillus cereus au froid : mécanismes moléculaires impliqués et exploitation de la diversité génétique du groupe Bacillus cereus ... 162

Sara Esther Diomande ^1,2, Véronique Broussole ^1,2, Julien Brillard ^1,2. 162

P90 - Salmonella genomic island 1 : a successful antimicrobial resistance genes vehicle ... 163

Benoît Doublet, Gregory Douard, and Axel Cloeckaert 163

P91 - Évolution des populations aériennes de Botrytis cinerea : un exemple d’aéromicrobiologie ... 164 Christel Leyronas¹, Fabien Halkett², Magali Duffaud¹, Philippe Nicot¹ 164

P92 - Des indicateurs moléculaires permettent-ils d’étudier la dispersion des bioaérosols? Exemple des plateformes de compostage industriel. ... 165

Amandine Galès¹, Valérie Bru-Adan¹, Hélène Bacheley², Jean-Jacques Godon¹ et Nathalie Wéry¹

165

P93 - La vie extracellulaire du peptide ComS déclenchant la compétence chez Streptococcus

thermophilus ... 166

Rozenn Gardan^1,2, Colette Besset^1,2, Christophe Gitton^1,2, Alain Guillot^1,2 & Véronique Monnet^1,2

166

P94 - Rgg-associated signaling peptides mediate cross-talk in streptococci ... 167 Betty Fleuchot^{1, 2}, Pierre Nicolas³, Alain Guillot^{1, 2}, Véronique Monnet^{1, 2}, Rozenn Gardan^{1, 2}

167

P95 - FILTREX: un logiciel convivial pour la microbiologie prévisionnelle ... 168

Jean-Pierre Gauchi¹, J.P. Vila ², C. Bidot ¹, E. Atlijani ¹, A. Bouvier ¹,L. Coroller ³, J.-C. Augustin ⁴ & P. Del Moral ⁵ 168

P96 - Inactivation atmosphérique des virus présents dans les eaux usées utilisées en irrigation : suivi en enceinte climatique dédiée ... 169

Guillaume Girardin^1,2, F. Bon³, D. Courault^1,2, P. Renault^1,2, H. Wortham⁴, L. Capowiez^1,2, F.

P97 - Le profilage métabolique : potentialités d’une nouvelle approche analytique globale pour la

détection de la présence de Campylobacter dans la viande de porc ... 170

Sandrine Guillou^1,3, Sami Ellouze^2,3, Frédérique Courant^2,3, Albert Rossero^1,3, Gaud

Dervilly-Pinel^2,3, Bruno Le Bizec^2,3, Catherine Magras^1,3 170

P98 - Étude in silico, in vitro et in vivo de la virulence de souches de Mycobacterium bovis à l’origine de foyers de tuberculose bovine. ... 171

Amandine Hauer¹, Thierry Cochard ², Krystel DeCruz ³, Nathalie Winter ², Maria Laura Boschiroli

3& Franck Biet ² 171

P99 - Étude de la résistance au stress acide de Bacillus cereus en conditions d'oxydo-réduction

contrôlées ... 172

Julien Le Lay¹, Michel Jobin¹, Philippe Schmitt¹ 172

P100 - Prévalence et diversité des éléments intégratifs conjugatifs (ICE) chez les streptocoques ... 173 Gérard Guedon ^1,2, Marie-Dominique Devignes ³, Florence Charron-Bourgoin ^1,2, Virginie Libante ^1,2, NicolasPons ⁴, Christine Delorme ⁴, Nathalie Leblond^1,2 et Sophie Payot ^1,2 173

P101 - Diversity and adaptation of flor yeast : new data for an old question ... 174

Jean-Luc Legras^1,2,3, Frederic Bigey^1,2,3, Anna Lisa Coi⁴, Virginie Galeote¹, Claudine Charpentier⁵,

Sylvie Dequin^1,2,3 174

P102 - CIRM-Filamentous Fungi collection is a unique reservoir of functional diversity toward

biotechnological applications ... 175

Laurence Lesage-Meessen^1,2,3, Jean-Guy Berrin^1,2, Marie Couturier^1,2, Isabelle Gimbert^2,1, Sacha

Grisel^1,2, Mireille Haon^1,2,3, Anthony Levasseur^1,2, Anne Lomascolo^2,1, David Navarro^1,2,3, François Piumi^1,2, Jean-Claude Sigoillot^2,1, Sabine Taussac^1,2,3, Eva Uzan^2,1, Anne Favel^2,1 175

P103 - Quantification of viable Photobacterium phosphoreum in salmon (Salmo salar) steaks by real-time PCR ... 176

Sabrina Macé^1,2,3,*, Kelthoum Mamlouk^1,3, Stoyka Chipchakova^1,3, .Jean-Jacques Joffraud², Paw

Dalgaard ⁴, Marie-France Pilet^1,3 and Xavier Dousset ^1,3 176

P104 - Rôle des transferts horizontaux dans l'adaptation des levures œnologiques à leur environnement177

Souhir Marsit¹, Virginie Galeote¹ et Sylvie Dequin¹. 177

P105 - Knr4/Smi1 family: Conserved fungal chaperones of puzzling origin. ... 178

Hélène Martin-Yken¹, Mathias L. Richard² & Jean-Marie François.¹ 178

P106 - Stochastic gene expression, phenotypic variability and adaptation of budding yeast to

environmental stresses ... 179

Hélène Martin-Yken¹, Marlène Vuillemin¹, Frédéric Bigey², Sylvie Dequin², Jean-Marie François¹ &

Jean-Pascal Capp¹ 179

P107 - Une nouvelle stratégie d'étude de la communication bactérienne : l'identification du peptidome exocellulaire de Lactococcus lactis... 180

Alain Guillot¹, Christophe Gitton², Mylène Boulay², Véronique Monnet^1,2 & Vincent Juillard² 180

P108 - Caractérisation des TAG lipases associées aux corps lipidiques chez la levure Yarrowia lipolytica181 T. Dulermo ^1,2,*, B. Tréton ¹, A. Beopoulos ^{1, 2}, A.P. Kabran Gnankon ^1,**, R. Haddouche ^1,*** &

Jean-Marc Nicaud² 181

P109 - Stratégies pour la caractérisation du mécanisme de résistance aux fongicides de type MDR

(MutiDrug Resistance) chez des isolats de Mycosphaerella graminicola fortement résistants aux IDM .... 182

Selim Omrane¹, Anne-Sophie Walker¹, Catherine Lanen¹, Lamia Aouini², Gert H.J. Kema² &

142 Journées des microbiologistes de l’Inra, 13-15 novembre 2012, L’Isle-sur-la-Sorgue

Sabine Fillinger¹ 182

P110 - A peptide-based cell cell communication mechanism in Streptococcus agalactiae ... 183

David Pérez-Pascual ^{1, 2}, Philippe Gaudu^{1, 2}, Véronique Monnet^{1, 2} & Rozenn Gardan^{1, 2} 183

P111 - Authentification taxonomique des Xanthomonas du CIRM-CFBP ... 184 Martial Briand, Nadia Mhedbi-Hajri, Céline Fricot, Sophie Bonneau, Géraldine Taghouti, Perrine

Portier, Marion Fischer-Le Saux 184

P112 - Amélioration de la méthode MicroRespTM de caractérisation rapide de la production microbienne de CO2 avec/sans apport de substrats. ... 185

Pierre Renault¹, Meriem Ben Sassi^1,2, Annette Bérard¹ 185

P113 - Impact des déséquilibres nutritionnels sur les fermentations alcooliques : un excès d’azote

augmente la mort cellulaire des levures en conditions de limitation en lipides. ... 186

Catherine Tesniere^1,2,3, Pierre Delobel^1,2,3, Martine Pradal^1,2,3, Bruno Blondin^1,2,3, 186

P114 - Campylobacter sous hautes pressions ... 187 Clémence Bièche^a,b,d, Marie de Lamballerie^a,b, Didier Chevret^c & Odile Tresse^b,d 187

P115 - Proteomic approach for bacteria of food interest identification: on-plate trypsinolysis followed by MALDI-MS/MS ... 188

M. Bourgeois, V. Chuat, S. Lortal, Florence Valence-Bertel, J. Jardin 188

P116 - Identification d’états physiologiques améliorant la résistance à la lyophilisation de Lactococcus lactis par la modulation de paramètres de fermentation ... 189

Hélène Velly¹, M. Bouix¹, F. Fonseca¹ 189

P117 - SdiA régule positivement l’opéron pefI-srgC de Salmonella Typhimurium en se liant à une des deux régions promotrices situées en amont de pefI ... 190

Olivier Grépinet^1,2,*, Nadia Abed^1,2,*, Sylvie Canepa³, Philippe Velge^1,2, Isabelle

Dans le document Diversité des réponses immunitaires de la glande mammaire lors de mammites induites par différentes souches d’ <em>Escherichia coli</em> (Page 142-146)