Parties III : Super Résolution et expériences de validation
Chapitre 5. Séquence accélérée
Suite à un projet de collaboration entre notre laboratoire IADI et SIEMENS, en octobre 2018,
SIEMENS a installé une nouvelle séquence de recherche : SMS-rs-EPI (simultaneous
multi-slice rs-EPI développée par : Wei Liu, Siemens Healthineers, Shenzen, China) (132). Cette
séquence a toutes les caractéristiques d’une rs-EPI, mais grâce à sa capacité d’acquérir
plusieurs coupes en même temps, la SMS-rs-EPI est plus rapide qu’une rs-EPI traditionnelle.
Pour valider les performances de cette séquence, les même acquisitions et calculs ont été faits
en utilisant SMS-rs-EPI et rs-EPI.
Méthodologie
Trois séries d'images axiales SMS-rs-EPI ont été acquises séquentiellement avec décalage de
1 mm à chaque répétition (chaque série couvre entièrement les seins avec une résolution de
1x1x3 mm
3, et trois valeurs de b = 0, 200 et 800 s / mm
2dans la direction diagonale 3D avec
un facteur d’accélération =2, NEX = 1, 3 et 5 respectivement, TR / TE = 5440 / 60ms (il
fallait raccourcir TR par rapport à la séquence rs-EPI car le nombre de tranches excitées était
divisé par deux avec SMS), FOV = 320 x 162 mm
2, 50 coupes, temps d'acquisition total de
9,36 minutes, nombre des segments de lecture: 5, une lecture partielle Fourier: 5/8, une
suppression de graisse : SPAIR, une accélération GRAPPA: 2, et une Bande passante: 781
Hz/Px). Seule la régularisation Beltrami a été utilisée pour la reconstruction des images
1x1x1x mm
3. Pour faire une comparaison entre les deux séquences rs-EPI accélérée et
non-accélérée, les même séries ont été acquises avec la séquence rs-EPI en utilisant les mêmes
paramètres à l’exception de TR/TE=10410/56ms, et FOV 320x160mm
2. Elles ont été
appliquées sur un sujet sain et un fantôme commercial de diffusion mammaire (133).
Evaluation de la séquence accélérée
Pour évaluer la séquence SMS-rs-EPI, une comparaison a été faite en calculant le SNR et les
différentes valeurs d’ADC. De plus, la résolution spatiale a été évaluée visuellement pour des
cylindres avec des rayons variables.
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Pour le sujet sain, les valeurs ADC ont été obtenues à partir de ROI soigneusement dessinés
dans les seins gauche et droit, en sélectionnant une région sans graisse et présentant une
texture caractéristique des tissus fibroglandulaires normaux.
1. Les valeurs ADC pour les ROI
Le fantôme commercial utilisé contient 6 valeurs théoriques différentes d’ADC. La figure
suivante montre une coupe coronale du côté de diffusion du fantôme avec 6 différentes
valeurs d’ADC : les différents pourcentages de concentration de Polyvinylpyrrolidone (PVP)
indiqués pour chaque tube déterminent les valeurs théoriques d’ADC.
Figure 51 : Coupe coronale du fantôme avec différentes concentrations de PVP.
Six régions d'intérêt ont été dessinées pour extraire les différents compartiments avec l'ADC
connu, les valeurs d’ADC ont été calculées à l'aide des 3 valeurs de b, avec un ajustement
linéaire du log d'intensité relative par rapport à b0.
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2. Calcul SNR par méthode de double acquisition
Le SNR a été calculé en utilisant la méthode de la double acquisition (en utilisant la somme et
la soustraction de deux images SRR), avec une ROI établie dans une zone homogène
(c’est-à-dire avec une faible variation du niveau de bruit, voir chapitre 3, partie II).
Résultats sur le fantôme:
La figure suivante montre les données fantômes reconstituées des séquences SMS-rs-EPI et
rs-EPI, y compris les modèles de résolution spatiale :
Figure 52 : une coupe axiale du fantôme qui contient des cylindres avec des diamètres de : 10, 8, 6, 4, 2 et 1 mm d’une image reconstruite avec accélération SMS-rs-EPI (a) et sans rs-EPI (b).
Tous les cylindres sont clairement visibles, à part le sixième qui a un diamètre de 1mm, et
n’est pas toujours bien visible.
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Figure 53 : Une coupe coronale du fantôme qui contient des cylindres avec différentes valeurs d’ADC des images reconstruites avec SMS-rs-EPI (a) et sans rs-EPI (b).
NB : le fantôme n’est pas de forme cylindrique car la paroi extérieure est flexible, il se
déforme selon l’antenne utilisée et sa position.
Chaque quadrant contient un cylindre de graisse et trois autres valeurs d’ADC (l’eau est
incluse parmi ces valeurs). Les différentes valeurs d’ADC calculées sont présentées dans le
tableau suivant :
Tableau 13 : Ce tableau montre les valeurs ADC théoriques des 6 ROI, les ADC des images
reconstruites avec rs-EPI et SMS-rs-EPI de chaque ROI, suivis par l’erreur entre rs-EPI et les
valeurs théorique d’ADC, SMS-rs-EPI et les valeurs théorique d’ADC.
Valeur théorique d’ADC (*10-3) SRR avec rs-EPI ADC (*10-3) SRR avec SMS ADC (*10-3) Erreur (rs-EPI/Théorique) % Erreur (SMS/Théorique) % Erreur (SMS/rs-EPI) %
1 2,17 2,2 2,1 1,4 3,2 4,5
2 1,75 1,7 1,7 2,9 2,9 0
3 1,59 1,5 1,5 5,7 5,7 0
4 1,42 1,4 1,3 1,4 8,5 7,1
5 1,15 1,1 1,1 4,3 4,3 0
6 0,724 0,599 0,599 17,3 17,3 0
Moyenne 5,5% 7% 1,9%
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La différence entre les valeurs ADC était de 1,9% entre le protocole SRR non accéléré et sa
version accélérée par SMS. Les valeurs ADC calculées pour la séquence rs-EPI sont proches
des valeurs théoriques à un pourcentage de 5,5%, et la séquence SMS-rs-EPI à 7%.
Le tableau suivant montre les valeurs des signaux, bruit et SNR pour les deux séquences, une
réduction mineure du SNR est obtenue avec SMS-rs-EPI :
Tableau 14 : Ce tableau présente le signal, le bruit et le SNR de la ROI établie par la SR de
rs-EPI et de SMS-rs-rs-EPI du fantôme avec les 3 valeurs de b et la moyenne de chaque facteur.
SRR rs-EPI SRR SMS-rs-EPI
Signal bruit SNR Signal bruit SNR
b=0 s/mm
24578 46 99,5 5285 49 107,9
b=200 s/mm
23326 25,4 131,1 3913 36 108,2
b=800 s/mm
21198 15,8 76 1399 18,6 75,4
moyenne 3034 29,1 102,2 3532 34,5 97,2
Résultats sur un sujet sain
La figure suivante montre un exemple de carte ADC des images isotropes 1x1x1 mm
3pour un
sujet, avec / sans SMS :
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Figure 54 : a,b) montrent une coupe axiale et c,d) une coupe coronale pour des reconstructions des séquences SMS-rs-EPI et rs-SMS-rs-EPI.