TELMA (Télephonie à l’usage des malentendants, Projet RNTS de 2006 à 2009)
Net-work Of Excellence proposant l’étude d’interfaces hommes-machines multimodales. Il finança durant ma collaboration de thèse avec l’Université Boğaziçi d’Istanbul.
Rev-TV (2010-2013) est un projet FUI sur le développement d’émissions de
télévi-sion interactives. Il est le cadre du stage et du CDD de Mohamed Ikbel Boulabiar, ainsi que du post-doctorat de Mathieu Simonet.
4 Encadrement d’activités de recherche
Les noms soulignés correspondent à des personnels permanents, ou à des contrats en cours. Les autres correspondent à des contrats terminées.
1. Olga Permiakova (Doctorante à l’UGA) : Scalable computational methods for big proteomics data : application to demultiplexing of mass spectrometry si-gnals (3 ans à partir d’octobre 2016, co-encadré avec Thomas Fortin).
2. Iban Fouad Djama (Stagiaire de M2) : Visualisation et traitement de signaux de spectrométrie de masse pour le séquençage de protéines (3 mois en 2016, co-encadré avec Thomas Fortin).
3. Hugo Fortin (Stagiaire de L3) : Développement d’une librairie JAVA pour la parallélisation des opérateurs de base en algèbre linéaire (1.5 mois en 2015, co-encadré avec Thomas Fortin).
4. Alexia Dorffer (Stagiaire de L3) : Développement et diffusion du logiciel de statistique pour la protéomique ProStaR (6 mois en 2015, co-encadré avec Samuel Wieczorek).
5. Shivani Shah (Stagiaire de M2, au LIG) : Visual analytics for peptide-based proteins inference (6 mois en 2015, co-encadré avec Renaud Blanch et Jean-Philippe Menetrey).
6. Quentin Giai Gianetto (post-doctorant, INSERM) : Test d’hypothèse et cor-rection pour tests multiples en proteomique quantitative (2 ans, à partir d’Oc-tobre 2014 - co-encadré avec Yohann Couté).
7. Thomas Fortin (Ingénieur-Chercheur en CDI au CEA) : groupe KDPD (depuis Aout 2014).
8. Hatem Loukil (Doctorant à l’université de Sfax) : Modèles graphiques pour l’identification automatique de peptides à partir de spectrogrammes de frag-mentation (3 ans, à partir d’Octobre 2013 - co-encadré avec Yousri Kessentini). 9. Jimmy Vandel (post-doctorant, CEA) : Extraction du signal de quantification des peptides à partir de données de spectrométrie label free pour la sélection de protéines différentiellement exprimées (18 mois à partir d’Octobre 2013 -co-encadré avec Yohann Coute).
10. Florence Combes (Ingénieur-Chercheur en CDI au CEA) : groupe KDPD (de-puis Janvier 2014).
11. Cosmin Lazar (post-doctorant, CEA) : Apprentissage et prediction de la loca-lisation subplastidiale de protéines à partir de données de protéomiques quan-titative différentielle (18 mois en 2013 - co-encadré avec Myriam Ferro). 12. Samuel Wieczorek (Ingénieur-Chercheur en CDI au CEA) : groupe KDPD
13. Khawla Seddiki (stagiaire de M2) : Application de méthodes de sélection de variables pénalisée à des quantifications de protéines pour la découverte de bio-marqueurs (6 mois en 2013).
14. Van Sang Dao (stagiaire de M2) : Définition de co-similarités à partir de marches aléatoires sur les graphes bipartis sur des données "omics" (6 mois en 2013 - co-encadré avec Gilles Bisson).
15. Valère Alibert (Doctorant à l’UBS) : DyDom : Gestion intelligente et dyna-mique de la consommation énergétique d’un habitat domotisé (3 ans, à partir de la rentrée 2012 - co-encadré avec Pascal Berruet et Mounir Lallali).
16. Mathieu Simonet (Post-Doctorant à Télécom Bretagne) : Reconnaissance de gestes pour émissions de télévision interactives (10 mois à partir de mars 2011). 17. Johann-Dan Laurent (Stagiaire en Master 2 ISD à l’UBS) : Apprentissage actif pour l’annotation de fichiers multi-modaux : application à la Langue Parlée Complétée ou à la Langue des Signes Française (6 mois en 2011).
18. Mohamed-Ikbel Boulabiar (CDD ingénieur à Telecom Bretagne) : Interfaces Homme-Machine mixtes tactiles et gestuelles (15 mois, à partir de septembre 2010 - co-encadré avec Gilles Coppin).
19. Wilfried Despagne (Post-Doctorant à l’UBS et intervenant pour MGDIS) : Mise en correspondance d’ontologies pour les métadonnées statistiques (18 mois à partir de juillet 2010).
20. Willy Allègre (Doctorant à l’UBS) : Approche composant pour la gestion in-telligente d’un habitat domotisé (d’octobre 2009 à octobre 2012 - co-encadré avec Pascal Berruet). Prix IFRATH (Institut Fédératif de Recherche sur les Aides Techniques pour personnes Handicapées) de la meilleure thèse.
21. Mohamed-Ikbel Boulabiar (Stagiaire de M2) : Reconnaissance de gestes pour interaction TV 3D (4 mois en 2010 - co-encadré avec Gilles Coppin).
22. Adyl Kenouche (Prestataire de service en informatique) : Intégration logicielle du prototype du projet TELMA (4 mois en 2008).
23. Pierre Lemaire (Stagiaire de M2) : Etude de la pertinence topologique des descripteurs d’images utilisés dans les algorithmes de détection de visages par apprentissage (5 mois en 2008 - co-encadré avec Alice Caplier).
24. Pierre Lemaire (Stagiaire de M2) : Développement d’une application de recon-naissance gestuelle pour malentendants (5 mois en 2007).
25. Alexandra Urankar (Stagiaire de M2) : Développement et optimisation d’une application de traitements d’images temps réel pour une application de télé-phonie à l’usage des malentendants (6 mois en 2006).
Cela correspond à un total de 3 ingénieurs-chercheurs permanents, 5
post-doctorants, 4 post-doctorants, 2 Ingénieurs contractuels et 11 stagiaires. Du-rant ma thèse, j’ai co-supervisé avec ma directrice, les stages de fin d’étude
d’Alexandra Urankar (2006), et de Pierre Lemaire (2007), ainsi que le mémoire de recherche de ce dernier en 2008 ; en même temps qu’un ingénieur en CDD, Adyl Kenouche. Toutes ces personnes ont travaillé sur des sujets connexes à ma thèse.
À l’université de Bretagne Sud, j’ai co-encadré avec Gilles Coppin, de Telecom
post-doctorat de Mathieu Simonet (2011), qui portaient sur de la reconnaissance de gestes pour interfaces homme-machine (IHM) gestuelles. Il y a eu aussi le stage de Johann-Dan Laurent (2011), résultant d’une collaboration avec Jean-Yves Antoine, de l’université de Tours : Sur un sujet initiale très proche des IHM gestuelles, le tra-vail a évolué vers l’apprentissage automatique, en collaboration avec Nicolas Courty. Notons aussi Wilfried Despagne, post-doctorant (2010-2011), qui travaillait sur la mise en place d’ontologie pour une PME (MGDIS). Enfin, j’ai co-encadré avec Pascal Berruet les thèses de Willy Allègre (2009-2012) puis de Valère Alibert (2012-2015) en domotique. Un peu moins d’un an et demi après être arrivé à EDyP (à la fin de l’hiver 2013), la direction m’a proposé de prendre en charge l’animation d’une des huit thématiques scientifiques du laboratoire. La thématique en question, KDPD, a pris vie grâce à la participation de trois ingénieurs-chercheurs permanents (en CDI au CEA) : Samuel Wieczorek, Florence Combes et Thomas Fortin. Ensemble, nous avons suivi les travaux de de Van Sang Dao (M2) et de Khawla Seddiki (M2) en 2013, suivi en 2015 de Shivani Sha (M2) d’Alexia Dorffer (L3) et d’Hugo Fortin (L3), puis en 2016, d’Iban Fouad Djama (M2). De plus, 3 post-doctorants participent ou ont participé aux travaux décrits dans ce document : Cosmin Lazar en 2013-2014, Jimmy Vandel en 2014-2015 et Quentin Giai Gianetto en 2015-2016. Enfin, les doctorants : j’ai participé à la supervision d’un étudiant de l’université de Sfax, Hatem Loukil (2013-2016) ; enfin, je suis le directeur de thèse d’Olga Permiakova (2016-2019).