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[86] H. Wertheim, D. Melles, M. Vos, W. van Leeuwen, A. van Belkum et al. :

The role of nasal carriage in staphylococcus aureus infections. The Lancet Infectious

Diseases, 5:751–762, 2005.

[87] D. B. West : Introduction to graph theory. Prentice Hall, Inc., Upper Saddle River,

1.1 Agencement de l’hôpital de Berk-sur-Mer. . . 17

1.2 Écouvillon nasal. . . 18

1.3 Règle de modélisation des contacts d’un réseau de proximité. . . 19

1.4 Présence quotidienne des individus. . . 20

1.5 Exemple d’une liste de contacts à trois nœuds. . . 23

1.6 Construction d’un réseau dynamique. . . 23

1.7 Exemple d’agrégation par groupe d’un réseau simple. . . 27

1.8 Distribution des durées de contacts au cours de la période juillet/août . . . 28

1.9 Distribution des quantités quotidiennes par individu. . . 29

1.10 Corrélations entre les différentes quantités. . . 30

2.1 Nombre quotidien de personnes présentes en moyenne dans chaque service. . 32

2.2 Moyenne des quantités d’activité de contacts entre les services. . . 34

2.3 Moyenne par personne des quantités d’activité de contacts entre les services. 35

2.4 Corrélation entre les quantités d’activité. . . 36

2.5 Exemple simple de graphe dynamique. . . 39

2.6 Distribution cumulative des quantités quotidiennes par personne. . . 40

2.7 Moyenne par personne des quantités d’activité de contacts entre les services. 42

2.8 Introversion des services. . . 44

2.9 Exemple simple de l’utilisation des modèles de configuration. . . 46

2.10 Déviation d’introvertion selon le modèle de configuration simple. . . 48

2.11 Déviation d’introversion selon le modèle de configuration fin. . . 50

2.12 Nombre de personnes interagissant quotidiennement entre les services. . . . 53

2.13 Exemple de répartition des contacts entre les services. . . 54

2.14 Matrice d’activité quotidienne entre les services. . . 55

2.15 Matrice d’activité quotidienne par personne entre les services. . . 56

2.16 Pourcentage d’occupation des services. . . 58

2.17 Matrices de déviation d’activité des services. . . 60

2.18 Matrice de déviation des contacts externes aux services. . . 61

2.19 Nombre de patients et de personnels interagissant entre les services. . . 63

2.20 Pourcentage de patients et de personnels interagissant entre les services. . . 64

2.21 Matrices d’activité entre les services selon les degrés quotidiens par personnes. 65

2.22 Matrices d’activité entre les services selon le nombre de contacts quotidiens

par personnes. . . 67

2.23 Matrices d’activité entre les services selon les durées de contact quotidiennes

par personnes. . . 68

TABLE DES FIGURES

2.25 Valeurs moyennes des catégories socioprofessionnelles par jour des différentes

quantités. . . 71

2.26 Valeurs moyennes par personnes organisées en catégories

socioprofession-nelles par jour des différentes quantités. . . 72

2.27 Corrélation des différents types d’activité par catégories socio-professionnelles,

n’impliquant que les personnels de l’hôpital. . . 73

2.28 Introversion des différentes catégories selon les 3 quantités habituelles. . . . 75

2.29 Déviation d’introversion des différentes catégories selon les 3 quantités habituelles. 76

2.30 Nombre de personnes interagissant quotidiennement entre les différentes

catégories socio-professionnelles. . . 78

2.31 Matrices d’activité entre les catégories par personne jour, selon les degrés

quotidiens, le nombre de contacts et la durée des contacts. . . 79

2.32 Exemple de sélection d’activité. . . 80

2.33 Taux d’occupation des différentes catégories selon le degré des individus. . . 80

2.34 Taux d’occupation des différentes catégories selon le nombre de contacts des

individus. . . 81

2.35 Taux d’occupation des différentes catégories selon la durée de contact des

individus. . . 82

2.36 Matrices de déviation des degrés des catégories. . . 83

2.37 Matrice de déviation du nombre de contacts des catégories. . . 84

2.38 Matrices de déviation de l’activité entre les catégories, basé sur la durée

cumulée des contacts. . . 86

3.1 Évolution de la population au cours du temps. . . 90

3.2 Composantes connexes et diamètres journaliers. . . 91

3.3 Corrélation entre le nombre de composantes connexes et la taille de la

pop-ulation. . . 92

3.4 Corrélation entre le diamètre et journalier et la taille chacune des composantes. 93

3.5 Nombre de personnes actives au cours du temps. . . 94

3.6 Evolution des quantités d’activité moyenne par individu. . . 95

3.7 Evolution et corrélation entre le degré des personnes et la durée moyenne de

contacts. . . 96

3.8 Taux de conservation des paires entre jours consécutifs (équation 3.1) . . . . 103

3.9 Différence symétrique sur les paires. . . 103

3.10 Indice de Jaccard sur les paires. . . 104

3.11 Similarité cosinus sur les paires. . . 105

3.12 Différence d’activité des paires moyennées sur l’ensemble des personnes présentes

le jour 1 (eq. 3.9). . . 106

3.13 Similarité cosinus renormé sur les paires. . . 106

3.14 Différence asymétrique appliqué aux nombres et aux durées de contact. . . . 109

3.15 Indice de Jaccard appliqué aux nombres et aux durées de contact. . . 109

3.16 Similarité cosinus appliquée aux nombres et aux durées de contact. . . 109

3.17 Différence d’activité appliquée aux nombres et aux durées de contact. . . 110

3.18 Similarité cosinus renormé sur les paires. . . 110

3.19 Agrégation des données à l’heure. . . 111

3.20 Évolution à l’heure de la quantité d’individus actifs. . . 111

3.21 Évolution à l’heure du nombre de contacts et de leur durée au cours d’une

semaine. . . . 113

3.22 Comparaison de l’évolution à l’heure du degré des personnes et de la durée

de contacts des personnes. . . 114

4.1 Evolution de la taille de la population prise en compte pour les simulations. 119

4.2 Nombre de simulations ayant au moins un transfert durant l’heure. . . 120

4.3 Taux de simulations actives par pas de temps. . . 122

4.4 Distribution du maximum de transmetteurs. . . 124

4.5 Date d’atteinte de la valeur maximale du nombre de transmetteurs pour

chaque simulation. . . 125

4.6 Distribution du maximum de récepteurs. . . 126

4.7 Date d’atteinte de la valeur maximale du nombre de récepteurs pour chaque

simulation. . . 126

4.8 Nombre et taux de personnes infectées à la fin de chaque simulation,

ordon-nées par heure de départ. . . 127

4.9 Distribution du taux d’infection. . . 128

4.10 Temps de terminaison de chacune des simulations en fonction de leur temps

de départ. . . 129

4.11 Proportion de temps nécessaire pour atteindre la largeur maximale du DAG

de diffusion. . . 129

4.12 Nombre d’arêtes utilisées par simulation. . . 130

4.13 Répartition des feuilles selon les simulations. . . 131

4.14 Assignation du poids des arêtes. . . 132

4.15 Distribution de la valeur des arrêtes au cours des simulations. . . 132

4.16 Distribution du nombre moyen d’arêtes entrantes par personne pour chaque

simulation, soit le nombre moyen de transmetteurs par récepteur. . . 133

4.17 Distribution du nombre d’arêtes sortantes, soit le nombre de récepteurs par

transmetteur. . . 133

4.18 Distribution (cumulative) du nombre d’occurrences des arêtes. . . 134

4.19 Corrélation entre le maximum de transmetteurs simultanés et le maximum

de récepteurs simultanés, en terme de pourcentage de population. . . 134

4.20 Comparaison du taux maximal de transmetteurs et récepteurs avec le taux

de feuilles. . . 135

4.21 Largeur de DAG issus de la première période stable au cours du temps. . . 137

4.22 Largeur de DAG issus de la première période stable au cours du temps : zoom.138

4.23 Nombre de personnes touchées au cours du temps de toutes les simulations

débutant aux pas de temps 81 et 86. . . 139

4.24 Nombre de personnes touchées au cours du temps de toutes les simulations

débutant aux pas de temps 81 et 86. . . 140

4.25 Largeur de DAG issus de la deuxième période stable au cours du temps. . . 141

4.26 Largeur de DAG issus de la deuxième période stable au cours du temps :

zoom. . . 142

4.27 Largeur de DAG probabilistes au cours du temps. . . 144

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