Dans le domaine de l’ingénierie cristalline, les molécules basées sur un squelette tétraphénylméthane sont particulièrement intéressantes car elles ont la potentialité de former par auto-assemblage des réseaux cristallins tridimensionnels poreux pouvant incorporer des molécules hôtes. Une analyse de la base de données cristallographiques Cambridge (v.1.1.1) [82] nous a montré que quarante structures incorporant un squelette tétraphénylméthane et présentant une symétrie tétraédrique avaient été déposées. Ces molécules dérivées du tétraphénylméthane portent à leur périphérie un panel assez large de fonctions ou de groupements, comme par exemple des halogènes [83], des noyaux pyridines [84], des groupements triazine [85], des acides boroniques [86], des silanols [87] ou encore des acides
[82] F. H. Allen, Acta Crystallogr., 2002, B58, 380.
[83] G. R. Desiraju, R. Thaimattam, D. S. Reddy, F. Xue, T. C. W. Mak et A. Nangia, New J. Chem., 1998, 22, 143 ; D. S. Reddy, D. C. Craig et G. R. Desiraju, J. Am. Chem. Soc., 1996, 118, 4090.
[84] C. B. Caputo, V. N. Vukotic, N. M. Sirizzotti et S. J. Loeb, Chem. Commun., 2011, 47, 8545 ; I. Eryazici, O. K. Farha, O. C. Compton, C. Stern, J. T. Hupp et S. T. Nguyen, Dalton Trans., 2011, 40, 9189.
[85] D. Boils, M.-È. Perron, F. Monchamp, H. Duval, T. Maris et J. Wuest, Macromolecules, 2004, 37, 7351 ; P. Brunet, E. Demers, T. Maris, G. D. Enright et J. D. Wuest, Angew. Chem. Int. Ed., 2003, 43, 5303.
(a)
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carboxyliques [88]. Néanmoins, un seul exemple de composé incorporant ce cœur tétraédrique et portant à sa périphérie des groupements phénols a été décrit [89]. C’est pourquoi nous nous sommes intéressés à la caractérisation par DRX sur monocristal des composés 6’ et 6.
Des monocristaux du composé 6’ ont été obtenus par diffusion de vapeur de toluène dans une solution du ligand dissous dans du dichlorométhane. Toutefois, en raison de la présence de nombreuses molécules de solvant hautement désordonnées n’ayant pas pu être affinées correctement, la fonction SQUEEZE a été utilisée pour résoudre la structure. A l’état solide,
6’ cristallise dans le système cristallin orthorhombique appartenant au groupe d’espace Pbcn.
Chaque molécule de 6’ adopte une symétrie locale C2 avec deux groupements 1,3-diméthoxybenzène adoptant une conformation anti-anti tandis que les deux autres présentent une conformation syn-anti (Figure 39a). L’auto-assemblage de 6’ à plus longue distance génère un réseau tridimensionnel poreux présentant des canaux (Figure 39b) formés par l’association de quatre molécules de 6’ par l’intermédiaire d’interactions faibles de type CH•••π (distance mesurée = 2.649 Å) ou CH•••O (distance mesurée = 2.506 Å). Le volume libre accessible au solvant a pu être estimé à 20.9% [90]. Le diamètre interne de ces canaux varie entre 3.9 Å et 4.9 Å comme le montre le profil topographique (Figure 40) établi grâce au logiciel PACHA [91]
[86] J.-H. Fournier, T. Maris, J. D. Wuest, W. Guo et E. Galoppini, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 1002.
[87] Y. Kawakami, Y. Sakuma, T. Wakuda, T. Nakai, M. Shirasaka et Y. Kabe, Organometallics, 2010, 29, 3281. [88] N. Malek, T. Maris, M. Simard et J. D. Wuest, Acta Crystallogr. Sect. E: Struct. Rep. Online, 2005, 61, 518. [89] J.-H. Fournier, T. Maris, M. Simard et J. D. Wuest, Cryst. Growth Des., 2003, 3, 535.
[90] A. L. Spek, PLATON, A Multipurpose Crystallographic Tool, Université de Utrecht, Utrecht, 2001.
[91] M. Henry, ChemPhysChem, 2002, 3, 561 ; M. Henry, ChemPhysChem, 2002, 3, 607 ; D. R. Turner, M. Henry, C. Wilkinson, G. J. McIntyre, S. A. Mason, A. E. Goeta et J. W. Steed, J. Am. Chem. Soc., 2005, 127, 11063.
59 Figure 39 : (a) Structure moléculaire à l'état solide de 6'. (b) Vue le long de l'axe b du motif tétramérique associé par l’intermédiaire de contacts de type CH•••O et CH•••π conduisant à la formation des canaux 1D. (c) Représentation « spacefill » générée par l'auto-assemblage de 6'.
Figure 40 : Profil topographique des canaux 1D générés à l’état solide par l’auto-assemblage de 6’.
Concernant la caractérisation structurale du ligand 6, des monocristaux ont été obtenus par diffusion lente de vapeur de toluène dans une solution de ligand dissous dans de l’acétate
(a) (b)
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d’éthyle. A nouveau, la fonction SQUEEZE a été utilisée pour résoudre la structure en raison des nombreuses molécules de solvant hautement désordonnées présentes au sein du cristal.
Figure 41 : (a) Auto-assemblage de 6 à l'état solide par l'intermédiaire de liaisons hydrogènes. L'agrandissement représente le motif de reconnaissance entre les groupements résorcinols générant la structure tridimensionnelle. (b) Représentation en mode « spacefill » de la structure mettant en évidence la formation des canaux.
Le composé 6 cristallise dans le groupe d’espace C2/c appartenant au système cristallin monoclinique. L’analyse de la structure nous montre que l’auto-assemblage à l’état solide de
6 par l’intermédiaire d’un réseau de liaisons hydrogènes incorporant quatre groupements
résorcinols (Figure 41a) génère la formation d’un réseau tridimensionnel présentant à nouveau des canaux 1D (Figure 41b). Une analyse plus poussée à partir de la structure cristallographique grâce au logiciel PACHA nous a permis de mettre en évidence une diminution de l’homogénéité du diamètre des canaux. En effet, d’après le profil topographique tracé (Figure 42), le diamètre des canaux varient entre 2.54 Å et 4.30 Å, générant un volume libre accessible au solvant d’environ 28% similaire à celui déjà cité dans la littérature pour le ligand tétrakis(4-hydroxyphényle)méthane [89].
(a)
61 Figure 42 : Profil topographique des canaux 1D générés par l’auto-assemblage de 6.
En utilisant les mêmes conditions de cristallisation que celles décrites précédemment, nous avons pu obtenir des cristaux du composé 6 à une plus grande échelle et avec un degré de reproductibilité élevé, contrairement au précurseur 6’. La phase obtenue est identique à celle qui a été caractérisée sur monocristal et a été confirmée par diffraction des rayons X sur poudre. Grâce à cette possibilité d’obtenir des cristaux en plus grande quantité, nous avons pu étudier plus en détail les propriétés thermiques du réseau poreux formé par l’auto-assemblage de 6 à l’état solide. La présence de molécules de solvant au sein des canaux a été confirmée grâce à des analyses thermogravimétriques (ATG). En effet, une perte de masse de 18,5% est observée entre 30 °C et 250 °C. En étudiant plus précisément la courbe ATG obtenue, nous avons pu mettre en évidence trois zones d’inflexion reliées à trois endothermes mesurés à 80 °C, 120 °C et 160 °C par calorimétrie différentielle à balayage (Figure 43).
Figure 43 : (a) Zoom sur la courbe ATG du ligand 6 mettant en évidence les trois zones d’inflexion correspondant aux processus de désolvatation des molécules de solvant de cristallisation. (b) Courbe DSC obtenue pour le composé 6.
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Ces processus endothermiques sont clairement dus à des processus de désolvatation des molécules de solvants de cristallisation comme l’acétate d’éthyle (point d’ébullition = 77 °C) ou encore le toluène (110 °C). Au vu des températures mesurées, les deux premiers processus peuvent être attribués au départ de molécules libres tandis que le dernier endotherme, relevé à une température bien supérieure aux points d’ébullition des solvants de cristallisation utilisés, montre clairement le départ de molécules emprisonnées dans les canaux.
Afin d’évaluer la possibilité de retirer les molécules de solvants piégées dans les canaux par traitement thermique pour obtenir une phase cristalline poreuse, des analyses par diffraction des rayons X sur poudre à différentes températures ont été effectuées (Figure 44). Nous observons une très forte diminution de la cristallinité des poudres sans changement de phase cristalline et un élargissement des raies de diffraction avec l’augmentation de la température. Néanmoins, lorsque les diffractogrammes sont enregistrés juste après les deux premiers processus de désolvatation (avant 130 °C), les poudres conservent un certain degré de cristallinité. Lorsque tout le solvant est retiré de la structure (au-delà de 170 °C), nous obtenons une phase amorphe. Toutefois, la perte de cristallinité ne permet pas de conclure quant à la conservation ou non de la porosité de la structure.
Figure 44 : Diffractogrammes des poudres microcristallines de 6 enregistrés à différentes températures.
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