CHAPITRE IV : RESULTATS ET DISCUSSIONS
II. Discussions
Les résultats précédent ont également montre que l’inhibiteur 3-Methylellagic acid 2- (4-galactosylglucoside) possède une énergie d’interaction qu’est égale à -9,8 kcal /mol moindre que le médicament de référence de la maladie de la goutte qu’est l’allopurinol dont son énergie est égale à -5,1 kcal/mol.
A B
Figure 38: Comparaison entre l’inhibiteur 3-Methylellagic acid 2-(4-galactosylglucoside) (A) et l’allopurinol (B) dans le site actif de la Xanthine Oxydase.
42
Conclusion
La découverte de nouveaux médicaments «in-silico» est l'une des stratégies les plus prometteuses visant à accélérer le processus de développement de médicaments. Le criblage virtuel «Virtual Screening», est l'une des premières étapes du processus de découverte de médicaments, il repose sur la sélection «in-silico» des meilleurs médicaments potentiels qui agissent sur une protéine cible donnée, il peut se faire «in-vitro», mais il est très onéreux. Le criblage virtuel nécessite une analyse complexe avec plusieurs étapes telles que le docking. L'un des principaux avantages conférés par le docking est qu'il permet aux chercheurs de trier (screen) rapidement les grandes bases de données de médicaments potentiels qui nécessiteraient autrement un travail fastidieux et de longue durée dans le laboratoire selon les méthodes traditionnelles de découverte de médicaments.
Les résultats de docking basé sur l’énergie de liaison entre les 64 inhibiteurs et le XO ; montrent que les composés A38, A49, A51, A52, A61 sont les cinq meilleures inhibiteurs de la XO et que l’inhibiteur 3-Methylellagic acid 2-(4-galactosylglucoside) qui porte le code A38 présente la moindre énergie des liaisons qui égale à -9,8 kcal/mole par rapport aux autres inhibiteurs.
A l’avenir et comme perspectives, il conviendrait de consacré de cette étude, de tester l’activité biologique du l’inhibiteur 3-Methylellagic acid 2-(4-galactosylglucoside) nouvellement proposé par une étude expérimentale in vitro et/ou in vivo pour confirmer les résultats théoriques réalisés in silico.
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REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
1. I'OMS Gsd. Maladies rhumatismales. 2 ed 1992. 66 p.
2. SCHLIENGER J. L’histoire des tourments de la podagre (goutte). Médecine des Maladies Métaboliques. 2014;8(2):230-4.
3. FLORKIN M. Rôle de la recherche biochimique fondamentale en médecine, illustré par l'exemple de la goutte. Bulletin of the World Health Organization. 1969;41(6):961.
4. ASHTIYANI S, GOLESTANPOUR A, SHAMSI M, TABATABAEI S, RAMAZANI M. Rhazes' prescriptions in treatment of gout. Iranian Red Crescent Medical Journal. 2012;14(2):108.
5. KAYSER F. Etude descriptive de la prise en charge de la goutte en pratique de
médecine générale dans le bassin annécien [thèse du doctorat]: universite JosephFourier;
2015.
6. SADERNE S. L’acide urique : une molécule physiologique pouvant être pathologique [thèse pour le diplome d'état de docteur en pharmacie]: universite de limoges; 2013.
7. JOYEUX H. l'alimentation ou la troisième médecine. 5ème ed2004. 617 p.
8. LOIT F. Epidémiologie de la goutte RéfleXions N°132 - Tome 14 octobre 2010. 9. FERRARI A, SGOBBA M, GAMBERINI M, RASTELLI G. Relationship between quantum-chemical descriptors of proton dissociation and experimental acidity constants of various hydroxylated coumarins. Identification of the biologically active species for xanthine oxidase inhibition. European journal of medicinal chemistry. 2007;42(7):1028-31. Epub 2007/02/24.
10. LECLERCQ P, MALAISE M. La goutte. Revue Médicale de Liège. 2004;59(5):274- 80.
11. CHALES G. De l’hyperuricémie à la goutte : épidémiologie de la goutte. Revue du Rhumatisme. 2011;78:S109-S15.
44
12. RICHETTE P, BARDIN T. Épidémiologie de la goutte. La Lettre du rhumatologue. 2012(384):6-9.
13. BOILEAU J. Le traitement de la goutte. Québec Pharmacie 2007 54 (11) 27-34. 14. DESCAMPS E, GELE P, BORDET R, VAMECQ J. Modulation pharmacologique du stress oxydatif. La Lettre du pharmacologue. 2006;20(4):107-18.
15. PHAM T. Goutte et hyperuricémie. La Lettre du rhumatologue. 2010(358):50-4. 16. CHALES G, RICHETTE P. Obésité, hyperuricémie et goutte. Revue du Rhumatisme monographies. 2016;83(1):44-9.
17. BOUTRY N, CHASTANET P, COTTEN A, DELFAUT E, DEMONDION X, FLIPO R M, et al. Goutte. Encycl Méd Chir (Editions scientifiques et médicales Elsevier SAS, Paris, tous droits réservés). 2001:10p.
18. VALEIX N, GUILLOT X. La goutte, une complication des hyperuricémies. Actualités Pharmaceutiques. 2013;52(524):18-20.
19. BERTHELEMY S. Un patient se plaignant d’une crise de goutte. Actualités Pharmaceutiques. 2014;53(532):44-7.
20. BATTU C. L’accompagnement nutritionnel d’un patient présentant une goutte. Actualités Pharmaceutiques. 2017;56(563):53-6.
21. ASKALI B. La goutte et le rôle du pharmacien d’officine dans sa prise en charge [these pour l'obtention du doctorat en pharmacie]: université mohammed v-rabat; 2016.
22. CHAFIK A. Enquete sur la prise en charge de la goutte par le medecin generaliste [these du doctorat en medecine]: universite cadi ayyad faculte de medecine et de pharmacie marrakech; 2011.
23. PASCART T, FLIPO R. La goutte: présentations cliniques et diagnostic. Revue du Rhumatisme. 2011;78:S116-S21.
45
24. PACHER P, NIVOROZHKIN A, SZABO C. Therapeutic effects of xanthine oxidase inhibitors: renaissance half a century after the discovery of allopurinol. Pharmacological reviews. 2006;58(1):87-114. Epub 2006/03/02.
25. LE GALLOU T, COIFFIER G. La goutte: mise au point 2015. Seconde partie: traitement. Médecine. 2015;11(7):298-303.
26. GERSON M. La prescription de galantamine est-elle encore justifiée dans la maladie d'Alzheimer? Médecine. 2006;2(1):19-.
27. LIOTÉ F, BARDIN T. Treatment of gout. Rev Rhum. 2007;74:160-7.
28. LE BELLEC M, de la Gastine B, Mosquet B, Godde F, Ze Bekolo R, Gloro R, et al. [Colchicine intoxication in four elderly patients: how to prevent it?]. La Revue de medecine interne. 2009;30(9):783-8. Epub 2009/04/14. Risque d'intoxication a la colchicine chez les personnes agees et moyens de prevention: a propos de quatre observations.
29. ZIMNER-RAPUCH S, JANUS N, AMET S, DERAYG, LAUNAY-VACHERV. Les traitements de l’hyperuricémie et du syndrome de lyse tumorale. Journal de Pharmacie Clinique. 2013;32(1):49-56.
30. SAVIUC P, PULCE C,
de
$ C. Intoxications sévères par la colchicine d’après les données issues des Centres antipoison et de toxicovigilance français janvier 2000–juin 2011. 2014.31. PEREZ-RUIZ F. Les nouveaux traitements de la goutte. Revue du Rhumatisme. 2007;74(7):624-6.
32. KLINENBERG JR, GOLDFINGER SE, SEEGMILLER JE. The effectiveness of the xanthine oxidase inhibitor allopurinol in the treatment of gout. Annals of internal medicine. 1965;62(4):639-47.
33. BOUCHERIT M. Chronobiologie : Mise en place d’une base de données sur
l’optimisation de prise des médicaments[thèse pour le diplôme d'état de docteur en
46
34. GAUDIN P, El MAGHRAOUI A, ALLOUCHERY M. al. Goutte: rôles du clinicien et du biologiste en 2013. Rev Mar Rhum. 2013;24:26-31.
35. CHOUCHANA L. Optimisation de la réponse aux thiopurines par la
pharmacogénétique : approches in vitro et cliniques[these de doctorat de pharmacologie]:
universite paris descartes; 2014.
36. BOCQUET H, ROUJEAU J. Les réactions cutanées sévères induites par les médicaments. Revue française d'allergologie et d'immunologie clinique. 1997;37(5):651-9. 37. ROUJEAU J. Toxidermies médicamenteuses: quelques nouveautés. Revue française d'allergologie et d'immunologie clinique. 2002;42(1):71-4.
38. RICHETTE P. Goutte : mise en place et suivi du traitement hypo-uricémiant. Revue du Rhumatisme. 2011;78:S142-S7.
39. MIRIC D, KISIC B, ZORIC L, MITIC R, MIRIC BM, DRAGOJEVIC I. Xanthine oxidase and lens oxidative stress markers in diabetic and senile cataract patients. Journal of diabetes and its complications. 2013;27(2):171-6. Epub 2012/11/13.
40. RICHETTE P. [Gout: an overview of available urate lowering therapies]. Annales pharmaceutiques francaises. 2012;70(3):133-8. Epub 2012/06/05. Les traitements hypo- uricemiants disponibles dans la goutte.
41. EPOTE EWANE J. Analyse pharmaceutique de la prescription des antibiotiques a la
pharmacie hospitaliere du chu point. G[thèse de pharmacie]: université des sciences , des
techniques, et des technologies de bamako; 2014.
42. TORRE ADL. Synthèses totales de neurofuranes et dihomo-isofuranes [THESE POUR OBTENIR LE GRADE DU DOCTEUR ]: l’Université Montpellier 1; 2014.
43. GARAT A. Pharmacogenetique des medicaments thiopuriniques Implication des
enzymes TPMT et IMPDH2 et de la RhoGTPase RAC1 [Thèse pour l’obtention du grade de
docteur de l'universite de lille 2 ]: UNIVERSITE de LILLE 2 - DROIT ET SANTE; 2009. 44. ADJADJ M. proprietes antioxydantes et activite inhibitrice de la xanthine oxydase des extraits de la plante medicinale Ajuga iva (L.) Schreber. 2009. p. 96.
47
45. BERRY C, HARE J. Xanthine oxidoreductase and cardiovascular disease: molecular mechanisms and pathophysiological implications. The Journal of physiology. 2004;555(Pt 3):589-606. Epub 2003/12/25.
46. OKAMOTO K, KUSANO T, NISHINO T. Chemical nature and reaction mechanisms of the molybdenum cofactor of xanthine oxidoreductase. Current pharmaceutical design. 2013;19(14):2606-14.
47. ICHIDA K, AMAYA Y, KAMATANI N, NISHINO T, HOSOYA T, SAKAI O. Identification of two mutations in human xanthine dehydrogenase gene responsible for classical type I xanthinuria. Journal of Clinical Investigation. 1997;99(10):2391.
48. KESKAS N. Effet scavenger des radicaux oxygénés et inhibiteur de la xanthine
Oxydoreductase des extraits de Cachrys libanotis .L [memoire de master]: Université Ferhat
ABBAS-Setif; 2011.
49. HARRISON R. Structure and function of xanthine oxidoreductase: where are we now? Free Radical Biology and Medicine. 2002;33(6):774-97.
50. POWELL D, BENBOUBETRA M, NEWEY S, HARRISON R. Xanthine oxidase activity and subcellular localisation in human mammary epithelial cells. Portland Press Limited; 1995.
51. MARCEL J. Les troubles de la reperfusion.perspectives therapeutique:les lazaroides [these pour obtenir le grade de docteur veterinaire ]: universire claude-bernarde-lyon 1; 2002. 52. KOSTIC D, DIMITRIJEVIC D, STOJANOVIC G, PALIC I, ĐORDEVIC A, ICKOVSKI J. Xanthine Oxidase: Isolation, Assays of Activity, and Inhibition. Journal of Chemistry. 2015;2015:1-8.
53. HAMLAOUI I. Etude théorique des réactions enzymatiques : Cas de l’inhibition de la
xanthine oxydase par de nouvelles chalcones [THЀSE DU Doctorat en Sciences]: Université
Constantine1; 2014.
54. HILLE R, Anderson RF. Electron transfer in milk xanthine oxidase as studied by pulse radiolysis. Journal of Biological Chemistry. 1991;266(9):5608-15.
48
55. DALTON H, LOWE D, PAWLIK R, BRAY R. Studies by electron-paramagnetic- resonance spectroscopy on the mechanism of action of xanthine dehydrogenase from Veillonella alcalescens. Biochemical Journal. 1976;153(2):287-95.
56. TRABSA H. Activité antioxydante et anti-inflammatoire des fractions des plantes
médicinales : Sedum sediforme et Lycium arabicum [ these pour l’obtention du diplôme de
Doctorat en Sciences]: Université Ferhat Abbas Sétif 1; 2015.
57. BILAMI Y, BOUKAHIL M. Etude in silico de l'inhibition de la butyrylcholinesterase[Mémoire présenté en vue de l’obtention du Diplôme de Master]:
Université des Frères Mentouri Constantine; 2015.
58. YANG B. Analyses bioinformatiques et classements consensus pour les données
biologiques à haut débit [THÈSE DE DOCTORAT INFORMATIQUE]: UNIVERSITÉ
PARIS-SUD; 2014.
59. VERT J, editor. Les applications industrielles de la bioinformatique. Annales des Mines-Réalités industrielles; 2013: ESKA.
60. IMBS D, Hassan S. Travail d'étude.
61. DELGRANGE O. Bioinformatique: Un domaine pluridisciplinaire. Element: le Magazine de l'Université de Mons. 2009(03):27-30.
62. DOAN T, BRETON V, NGUYEN H, PHAM Q, Le M, editors. Criblage virtuel sur grille de composés isolés au Vietnam. Rencontres Scientifiques France Grilles 2011; 2011. 63. PARIDA P, YADAV R, SHANKAR B, CHAKRABORTY D, DAS A, SINGH N. In- silico protein ligand interaction study of typical antipsychotic drugs against dopaminergic D2 receptor. Int J Pharm and pharmceusci. 2012;5:183-9.
64. GALLEZOT G. La recherche in silico. Editions du cercle de la librairie; 2002.
65. FEREY N, BOUYER G, MARTIN C, DRIF A, BOURDOT P, AMMI M, et al. Docking de protéines en réalité virtuelle Une approche hybride et multimodale. Technique et science informatiques. 2009;28(8):983-1015.
49
66. FRANÇOIS M. Développement d’une nouvelle méthode de docking basée sur les
mécanismes enzymatiques et guidée par des groupes prosthétiques [these de doctorat de
l’universite paris sud]: l’universite paris sud; 2012.
67. MERZOUG A. Étude in silico de l’inhibition de la peptide déformylase [ MAGISTERE EN BIOCHIMIE]: Université Mentouri Constantine; 2012.
68. CHIKHI A. Calculs et modelisations des interactions peptide deformylase –
substances antibacteriennes a l’aide de techniques de ‘’docking’’(arrimage) moleculaire
[these en vue de l’obtention du doplôme dedoctorat d’etat en microbiologie]: universiteMentouri Constantine; 2007.
69. ROGNAN D. Criblage virtuel par docking moléculaire.
70. SUSSMAN JL, LIN D, JIANG J, MANNING NO, PRILUSKY J, RITTER O, et al. Protein Data Bank (PDB): database of three-dimensional structural information of biological macromolecules. Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography. 1998;54(6):1078-84.
71. AWALE M, REYMOND J. A multi-fingerprint browser for the ZINC database. Nucleic acids research. 2014;42(Web Server issue):W234-9. Epub 2014/05/02.
72. SCHRODINGER LTPMGS, Version 1.3r1. August 2010.
73. Open Babel: An open chemical toolbox NM O'Boyle MB, CA James, C Morley, T Vandermeersch, Journal of cheminformatics 3 (1), 33.
74. BOUTRIF C, MERDASSI A. Etude in silico de la 5-lipoxygénase en tant qu'enzyme
impliquée dans les maladies inflamatoires [mémoire ]: constantine 1; 2014.
75. PANSANEL J, PLESSY C. Logiciels libres pour le criblage moléculaire.
76. LOUACHENI F. Développement d'un portail web pour le criblage virtuel sur la grille de calcul 2014.
50
77.Disponiblesurhttp://www.hmdb.ca/unearth/q?utf8=%E2%9C%93&query=3-
Methylellagic+acid+2-%284galactosylglucoside%29&searcher=metabolites&button=. (Consulté le18/06/2017)
LES SITES WEB
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1fiq http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do http://www.rcsb.org/pdb/statistics/contentGrowthChart.do?content=total&seqid=100 http://zinc.docking.org/ http://www.pymol.org http://openbabel.org/wiki/Main_Page
Annexe 1
Tableau I : Résultats des énergies d’interactions des 64 inhibiteurs avec le site actif de la
xanthine oxydase.
Codes Inhibiteurs Structure des ligands
Energies des liaisons kcal/mole
Les acides aminés
A1 1 methyl, 2, 3, 4 tetrahydro B carboline -3 carboxylicacid CID_73530 -7,2 2 (ASN1149, SER1234) A2 1,3,6,7- tetrahydroxyxanthone CID_5479774 -7,2 1 (ASN1149)
A3 5-7-dimethoxycoumarin zinc_57754 -5,9 4 (ILE1230, PRO1224, TRY1227, LYS1202)
A4 1,3-
dimethoxybenzo[c]isochro men-6-one
zinc_134016 -6,8 1 (SER1226)
A5 7-Methoxycoumarin zinc_391177 -5,6 4 (ILE1230, PRO1224, TYR1227, LYS1202)
A6 CHEBI:1993 zinc_898345 -5,8 3 (ASN1173, HIS1171,
GLY1233)
A7 5,7-DIETHOXY COUMARIN
zinc_2573884 -6,0 3 (ASN1173, HIS1171, GLY1233)
A8 5-methoxychromen-2-one zinc_14443532 -5,5 3 (ASN1173, HIS1171, GLY1233) A9 5- hydroxymethylfurfural zinc_900788 -4,5 4 (GLE1210, LEU1208, GLU1210, THR122)
A10 Allopurinol zinc_11592630 -5 ,1 3 (LYS1228, ARG426,
THR1226)
A11 1,5-Dihydro-4H-
pyrazolo(3,4-d)pyrimidin- 4-one, monosodium salt
zinc_13298313 -5,4 4 (ASN830, HIS1219, HIS1217,GLU45, ASP28429)
A12 QA-3064 zinc_13518519 -5,2 2 (LEU1208,
GLU1210)
A13 1,5-Dihydro-pyrazolo[3,4- d]pyrimidin-4-one
zinc_13545810 -5,4 3 (LEU1208,
GLU1210, GLU1210)
A14 Apigeninderivatives zinc_57652 -7,4 4 (GLN144, ILE1229, ALA338, TYR1227)
GLY1233)
A16 5-Hydroxyflavone zinc_57676 -7,2 1 (GLY1233)
A17 5-Hydroxy-4'- methoxyflavone
zinc_57686 -7,4 3 (GLN144, HIS1171, GLY1233)
A18 Cryptochrysin zinc_338216 -7,7 2 (SER425, LYS1202)
A19 Caulerpenyne (CYN) CID_5311436 -6,9 6 (GLN144, ALA338, ALA1231, SER1226, GLN144, ILE1229)
A20 Caffeicacid zinc_58172 -5,6 2 (ALA424, THR1226)
A21 Methyl 3-(3,4- dihydroxyphenyl)acrylate zinc_58222 -6,4 3 (GLU1210, LYS1228, GLU1210) A22 3- HYDROXYCINNAMIC ACID zinc_155996 -5,8 2 (GLU1210, LYS1228) A23 3-(3,4,5- trihydroxyphenyl)acrylic acid zinc_1564653 -5,8 4 (GLU1210, LYS1228, GLU1210, THR1226) A24 (2Z)-3-(3,4- dihydroxyphenyl)acrylate zinc_4482687 -5,5 4 (THR1227, GLY47, LYS1202) A25 3-(3-hydroxyphenyl)prop- 2-enoic acid zinc_12410372 -5,0 1(GLY1233)
A26 Methyl caffeate zinc_13549916 -5,4 2 (GLY47, LYS1202)
A27 Catechin zinc_119978 -7,5 2 (HIS1171, ASP1166)
A28 2-(3,4-Dihydroxyphenyl)- 3,5,7-chromantriol
zinc_119983 -7,5 6 (SER425, ARG426, GLN144, GLN423, LYS433, LYS1202) A29 2-(3,4- Dihydroxyphenyl)chroman -3,5,7-triol zinc_119985 -7,5 1 (GLN144)
A30 Epicatechin zinc_119988 -7,4 2 (GLY46, LYS433)
A31 DNC013887 zinc_28974985 -7,7 2 (HIS1171, ASP1166)
A32 Coumarin zinc_74709 -5,2 1 (SER1234)
A33 BLAHone zinc_6118510 -6,9 2 (GLN144, ALA338)
A34 Ellagicacid zinc_1280637 -7,4 3 (TRP336, ALA424,
GLY1233) A35 2,3,7,8- Tetrahydroxy(1)benzopyra no(5,4,3- cde)(1)benzopyran-5,10- dione; zinc_3872446 -7,6 3 (GLN144, TRP336, ALA338)
A36 2-hydroxy-4-nitro-benzoic zinc_5784243 -7,8 5 (GLN144, TRP336, PHE337, ALA338, LYS1202)
A37 3-Methylellagic acid 2-(4- galactosylglucoside)
zinc_85664748 -8,7 5 (TRP336,
PHE337,ALA3398, PRO1224, LYS1202)
A38 3-Methylellagic acid 2-(4- galactosylglucoside)
zinc_85664752 -9,8 5 (ARG426, ALA338, HIS1171, LYS433, ASP1166)
A39 3-Methylellagic acid 2-(4- galactosylglucoside)
zinc_85664755 -9,1 8 (ALA338, GLY1233, ARG426, TRP336, ALA338, ALA424, SER1225, LYS1202)
A40 Febuxostat zinc_5423 -7,1 3 (LYS422, LYS433,
ASP360)
A41 Gallicacid zinc_1504 -5,7 3 (ASN830, ARG1222,
HIS1219) A42 1,2-Dihydroxybenzene-4- carboxylic Acid zinc_13246 -5,0 6 (SER425, GLN423, SER425, SER1225, LYS433, LYS1202)
A43 α -resorcylic acid zinc_388546 -5,1 4 (ASN830, ARG1222, SER1225, GLU45)
A44 Kaempferol zinc_39111 -7,5 4 (GLN 144, ASN
1173, GLY 1233, GLY 1233)
A45 3,5-Dihydroxyflavone [6665-69-6]
zinc_57647 -7,2 2 (GLN144, ALA338)
A46 3,6,4'-Trihydroxyflavone zinc_57752 -7,3 2 (GLN144, LYS1202)
A47 Galangin zinc_120273 -6,7 3 (ILE1229, GLN144,
ALA338)
A48 Quercetin zinc_3869685 -7,7 6 (SER425, ARG426,
SER425, LYS433, LYS1202, ASP360)
A49 Lithospermicacid zinc_4097772 -9,4 5 (GLN144, ASN1149, TRP336, PHE337, ILE1229)
A50 28831-65-4 zinc_4097773 -9,1 5 (ALA338, TRP336,
SER1225, ILE1229, LYS1202)
A51 DNC014243 zinc_4097774 -9,3 3 (ALA 338, ILE 1229,
ALA 338)
A52 C08745 zinc_4097775 -9,3 6 (ILE1229, TRP336,
ILE1229, GLY46, GLY47, LYS433)
A53 Myo-inositol zinc_1530357 -5,4 4 (ASN1149,
ASP1166)
A54 I-Inositol zinc_9970293 -5,7 4 (TRP336, SER425,
LYS433, LYS1202)
A55 Myricetin zinc_3874317 -7,7 3 (GLY1233, ALA424,
SER1226) A56 3,5,7-Trihydroxy-2-(3,4,5- trihydroxyphenyl)- MFCD00006827 zinc_14436449 -7,8 3 (SER425, GLN144, ALA338, LYS433)
A57 Oxypurinol zinc_13542567 -5,4 3 (ALA424, SER1226,
ASP1166)
A58 1H-Pyrazolo[3,4- d]pyrimidine-4,6-diol
zinc_84462581 -6,2 5 (GLY797, PHE798, MET1038, GLY1039, GLN1188)
A59 Phyticacid zinc_98230514 -6,8 3 (GLN144, TRP336,
ALA338, LYS1202)
A60 Polyhydroxylated CID_825 -4,6 5 (GLU1210,
LEU1208, GLU1210, LYS1224, GLU1210)
A61 Proanthocyanidins CID_21881649 -9,6 6 (GLN144, ALA338, ALA338, PRO1224, SER1226, ASP1266)
A62 Quercetin zinc_8662 -7,4 5 (SER425, AEG426,
LYS433, LYS1202, ASP360)
A63 3,3',4'-Trihydroxyflavone zinc_39321 -7,2 3 (GLN144, GLN144, SER1226)
A64 Isorhamnetin zinc_517261 -7,5 4 (SER425, GLN423,
Annexe 2
Tableau II : Les 64 ligands représentés avec le style lines et stick dans le site actif de XO
réalisé par Pymol.
Style lines Style stick Style lines Style stick
A1 : CID_73530 A2 : CID_5479774
A3 : zinc_57754 A4 : zinc_134016
A5 : zinc_391177 A6 : zinc_898345
A9 : zinc_900788 A10 : zinc_11592630
A11 : zinc_13298313 A12 : zinc_13518519
A13 : zinc_13545810 A14 : zinc_57652
A15 : zinc_57658 A16 : zinc_57676
A19 : zinc_5311436 A20 : CID_58172
A21 : zinc_58222 A22 : zinc_155996
A23 :zinc_1564653 A24 :zinc_4482687
A25 : zinc_12410372 A26 : zinc_13549916
A29 : zinc_119985 A30 : zinc_119988
A31 : zinc_28974985 A32 : zinc_74709
A33 : zinc_6118510 A34 : zinc_1280637
A35 : zinc_3872446 A36 : zinc_5784243
A39 : zinc_85664755 A40 : zinc_5423
A41 : zinc_1504 A42 : zinc_13246
A43 : zinc_388546 A44 : zinc_39111
A45 : zinc_57647 A46 : zinc_57752
A49 : zinc_4097772 A50 : zinc_4097773
A51 : zinc_4097774 A52 : zinc_4097775
A53 : zinc_1530357 A54 : zinc_9970293
A55 : zinc_3874317 A56 : zinc_14436449
A59 : zinc_98230514 A60 : CID_825
A61 : CID_21881649 A62 : zinc_8662
Notre travail, qui entre dans le cadre du mémoire de master, s’inscrit dans le courant de la recherche de nouveaux inhibiteurs de la Xanthine Oxydase; cible thérapeutique validée pour le traitement de la maladie de la goutte. Pour ce faire, nous avons fait appel aux approches par criblage virtuel «in silico» avec AutoDock vina. En effet, une collection de 64 molécules issues de la Zinc DATABASE a été testée envers le site actif de XO. A l’issu de ce criblage, le composé A38 (zinc_85664752) 3-Methylellagic acid 2-(4-galactosylglucoside) avec la plus faible valeur de leur énergied’interaction soit -9,8 Kcal/mol, se présent comme nouveau inhibiteur théoriquement plus sélectif et affin envers XO.
Mots clés : Goutte, xanthine oxydase, criblage virtuel, AutoDock Vina, Energie d’interaction. صخلملا نيتنوزكلا ميزنلإ ةديدج ةيعيبط تاطبثم داجيإ هفده رتساملا ةحورطأ وه يذلا انلمع .سرقنلا ضرم جلاع ةيغب كلذو ،زاديسكوأ ،كلاذب مايقلل تائيزجلا ةلبرغ ةقيرط لامعتساب انمق ايرظن «in silico» اجتا ه نلإا سوردملا ميز لامعتساب AutoDock vina . حمس ت ةلبرغب انل 64 :حارتقاب ميزنلإا اذه هاجتا بكرم بكرملا A38 (zinc_85664752)
3-Methylellagic acid 2-(4-galactosylglucoside زاديسكوا نيتنزك ميزنلإ لمتحم ديدج طبثمك ةقاط ليجست عم . :ب ردقت طابترا -9,8 .لوم/لاك ك تاملكلا ةيحاتفملا : ،ةيضارتفا ةلبرغ ،زاديسكوا نيتنزك ،سرقنلا AutoDock vina .طبرلا ةقاط ، Abstract
Our work, which is part of the master's thesis, is part of the search for new xanthine oxidase inhibitors; Validated therapeutic target for the treatment of gout disease. To do this, we have used "In silico" virtual screening with AutoDock vina. Indeed, a collection of 64 molecules from Zinc DATABASE was tested against the active site of XO. At the end of this screening, compound A38 (zinc-85664752) 3-Methylellagic acid 2-(4-galactosylglucoside) with the lowest value of their interaction energy is -9.8 Kcal / mol, presents itself as a new inhibitor theoretically more selective and affinity with XO.