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L’

OBJECTIF PRINCIPAL DE CE TRAVAIL DE THESE ETAIT D

EVALUER L

APTITUDE D

ISOLATS DE

S.

AUREUS A PRODUIRE DES ENTEROTOXINES DANS DES CONDITIONS CONTROLEES DE

FABRICATION FROMAGERE EN FONCTION DE LEUR DIVERSITE PHENOTYPIQUE ET GENETIQUE

.

P

OUR MENER A BIEN CE TRAVAIL

,

IL NOUS A SEMBLE IMPORTANT DANS UN PREMIER TEMPS

,

DE COLLECTER DES ISOLATS ISSUS DE LAITS ET DE FROMAGES AU LAIT CRU A PATE PRESSEE NON CUITE

(

FROMAGES LES PLUS SENSIBLES AU

«

RISQUE

S.

AUREUS

»)

DE DEUX REGIONS DE

F

RANCE

(R

HONE

-A

LPES ET

M

ASSIF

C

ENTRAL

),

ET NON DE TRAVAILLER UNIQUEMENT AVEC DES SOUCHES DE COLLECTION

,

PAS NECESSAIREMENT REPRESENTATIVES DES PRODUITS LAITIERS EN GENERAL ET DES FROMAGES AU LAIT CRU PLUS SPECIFIQUEMENT

.

C

ETTE PREMIERE ETAPE NOUS A PERMIS EGALEMENT D

AVOIR UNE IMAGE ACTUALISEE DES ISOLATS DE

S.

AUREUS PRESENTS DANS CE TYPE DE FABRICATIONS

. A

INSI

,1036

ISOLATS DE STAPHYLOCOQUES A COAGULASE POSITIVE ONT ETE COLLECTES AU COURS DE CETTE

ETUDE

: 82,2%

APPARTENAIENT A L

ESPECE

S.

AUREUS

, 13,3%

A L

ESPECE

S.

INTERMEDIUS ET

4,5%

ETAIENT DES STAPHYLOCOQUES A COAGULASE NEGATIVE

. L

ES STAPHYLOCOQUES A COAGULASE POSITIVE RETROUVES APPARTENAIENT DONC

MAJORITAIREMENT A L

ESPECE S. AUREUS

,

ET DANS UNE MOINDRE MESURE

,

EGALEMENT A L

ESPECE S. INTERMEDIUS

.

A

FIN DE PERMETTRE UN CHOIX RAISONNE DES ISOLATS DE

S.

AUREUS A TESTER EN

FABRICATION FROMAGERE CONTROLEE

,

NOUS AVONS ENGAGE DANS UN DEUXIEME TEMPS

,

UN ENSEMBLE DE TECHNIQUES PHENOTYPIQUES ET GENETIQUES PERMETTANT DE CARACTERISER LA DIVERSITE RENCONTREE DANS CES ISOLATS

.

A

INSI

, L

E BIOTYPE LE PLUS REPANDU DANS NOTRE COLLECTION ET EGALEMENT LE PLUS SOUVENT RETROUVE DANS LE LAIT CRU DE VACHE

,

ETAIT LE BIOTYPE

C

BOVIN

. L

E BIOTYPE INCONNU

,

TRES PROCHE DU BIOTYPE

C

BOVIN

,

ETAIT AUSSI TRES REPANDU

. D

E PLUS

,

IL EST IMPORTANT DE NOTER QUE LE BIOTYPE

A

HUMAIN ETAIT FAIBLEMENT RENCONTRE

,

IL

REPRESENTAIT MOINS DE

3%

DES ISOLATS

. C

E RESULTAT DENOTE DE BONNES PRATIQUES D

HYGIENES RENCONTREES CHEZ LES PRODUCTEURS DONT LES FROMAGES AU LAIT CRU ONT ETE ANALYSES AU COURS DE CETTE ETUDE

.

P

UIS

, 821

ISOLATS DE

S.

AUREUS DE LA COLLECTION

AQS-S

A ONT ETE ANALYSES POUR LEUR PRODUCTION DE

SEA

A

SEE

IN VITRO

. S

EULEMENT

6%

DES

821

ISOLATS TESTES ETAIENT PRODUCTEURS IN VITRO ; CE CHIFFRE EST REDUIT A

4,9%

SI ON NE PREND EN COMPTE QUE LES ISOLATS PRODUCTEURS DE

SEA

OU

SED,

ENTEROTOXINES LE PLUS SOUVENT IMPLIQUEES DANS LES TOXI

-

INFECTIONS ALIMENTAIRES COLLECTIVES

. E

N

GENERAL

,

LES BIOTYPES

A

HUMAIN ET

D

LIEVRE ETAIENT LE PLUS ENTEROTOXINOGENES ET CEUX DE BIOTYPES

C

BOVIN LE MOINS ENTEROTOXINOGENES

. N

OS RESULTATS ONT

CONFIRME QU

UN TRES FAIBLE POURCENTAGE DES ISOLATS RENCONTRES DANS LE LAIT ET LES FROMAGES AU LAIT CRU EST ENTEROTOXINOGENE

. N

EANMOINS

,

SUITE A LA RECHERCHE DES GENES CODANT POUR DE

«

NOUVELLES

»

ENTEROTOXINES

(G

A

J)

D

UNE PARTIE

REDUITE DE NOTRE COLLECTION

(90

ISOLATS PRODUCTEURS DE

A

A

E

IN VITRO ET

90

NON PRODUCTEURS

),

LES ISOLATS DE

S.

AUREUS ONT UN POUVOIR POTENTIELLEMENT

ENTEROTOXINOGENE PLUS IMPORTANT

,

CONFIRMANT LES RESULTATS OBTENUS PAR

R

OSEC ET

G

IGAUD

(2002). E

N EFFET

,

UN TOTAL DE

92% (166/180)

ONT LE POTENTIEL DE

PRODUIRE DES ENTEROTOXINES

.

L’

ANALYSE DE CETTE MEME SELECTION DE

180

ISOLATS DE LA COLLECTION

AQS-S

A PAR ELECTROPHORESE EN CHAMP PULSE

,

A MIS EN AVANT LES RELATIONS GENETIQUES TRES

PROCHES DES ISOLATS PRODUCTEURS DE

SED

IN VITRO

,

COLLECTES DE FROMAGES PROVENANT DES DEUX REGIONS

,

ET LA DIVERSITE DES AUTRES ISOLATS

,

PRODUCTEURS ET NON PRODUCTEURS

,

QUI SE TROUVAIENT DANS DES PULSOTYPES VARIES

(

CORRESPONDANT

A DES EMPREINTES GENETIQUES DIFFERENTES

). L

A REP

-PCR,

UTILISEE AFIN D

AFFINER LA CARACTERISATION DES ISOLATS PRODUCTEURS DE

SED,

A MIS EN EVIDENCE LA PRESENCE D

AU MOINS TROIS SOUCHES

,

FORTEMENT LIEES GENETIQUEMENT

.

L

A SPECTROSCOPIE

IRTF

S

EST AVEREE ETRE

,

COMME DEJA DEMONTRE AVEC D

AUTRES ESPECES BACTERIENNES

(B

EATTIE ET AL

., 1998 ; K

ÜMMERLE ET AL

., 1998 ; L

EFIER ET AL

.,

2000),

UNE METHODE INTERESSANTE POUR LA DISCRIMINATION ET L

IDENTIFICATION DE S. AUREUS

,

PARTICULIEREMENT POUR LES ISOLATS COLLECTES DE PRODUITS LAITIERS

. D

E PLUS

,

CETTE TECHNIQUE A EGALEMENT MONTRE QUE L

INFORMATION SPECTRALE PERMET UNE CARACTERISATION DES ISOLATS PRODUCTEURS DE

SED

IN VITRO

. N

EANMOINS

,

L

INFORMATION SPECTRALE N

A PAS PERMIS DE DISCRIMINER LES ISOLATS

«

POTENTIELLEMENT

»

PRODUCTEURS D

ENTEROTOXINES

,

DES ISOLATS NON PRODUCTEURS

.

A

L

ISSUE DE CETTE CARACTERISATION PHENOTYPIQUE ET GENETIQUE

,

UNE SELECTION D

ISOLATS A ETE RETENUE AFIN D

EVALUER LEUR APTITUDE A SE DEVELOPPER ET A

PRODUIRE DES ENTEROTOXINES DANS UN FROMAGE MODELE A PATE PRESSEE NON CUITE

,

COMPORTANT UN DELACTOSAGE

. L’

OBJECTIF DE CETTE PARTIE DU TRAVAIL ETAIT DE

SELECTIONNER TROIS ISOLATS PRODUCTEURS D

ENTEROTOXINES EN CONDITION FROMAGERE AFIN D

ETRE EVALUES IN FINE DANS DES FABRICATIONS SIMULANT TROIS TECHNOLOGIES TRADITIONNELLES

. L

ES CRITERES RETENUS POUR LA SELECTION DES ISOLATS ETAIENT

:

LA NATURE DE L

ENTEROTOXINE PRODUITE IN VITRO

,

LE PULSOTYPE

,

LE BIOTYPE ET LA SOURCE D

ISOLEMENT

.

L

E FAIT QUE LES ISOLATS AIENT ETE COLLECTES DE LAITS ET DE FROMAGES N

IMPLIQUE PAS NECESSAIREMENT UNE CAPACITE A PROLIFERER DANS LE FROMAGE

. C’

EST POURQUOI

,

NOUS AVONS EVALUE LA CAPACITE DE

29

ISOLATS

,

POUR N

EN RETENIR QUE

23,

A SE DEVELOPPER DANS DU LAIT

. N

OUS AVONS PU AINSI METTRE EN EVIDENCE DES DIFFERENCES DE

CROISSANCE DANS LE LAIT ENTRE ISOLATS DE S. AUREUS EN FONCTION DU BIOTYPE ET DU TYPE D

ENTEROTOXINE PRODUITE IN VITRO

,

RESULTAT QUI

,

A NOTRE CONNAISSANCE

,

N

AVAIT JAMAIS ETE OBSERVE AUPARAVANT

.

A

FIN DE FAVORISER LA PRODUCTION D

ENTEROTOXINES DANS LE FROMAGE

,

LES

23

ISOLATS ONT ETE ENSEMENCES A UN NIVEAU AVOISINANT

10

5

UFC

/

ML DE LAIT

,

POUR ATTEINDRE DES POPULATIONS MAXIMUMS COMPRISES ENTRE

10

7 ET

10

8 UFC

/

G EN DEBUT D

AFFINAGE

.

L’

ETUDE SUR FROMAGE MODELE A PERMIS DE METTRE EN EVIDENCE UN POINT CLE

:

STADE MOULAGE

+ 3

HEURES

(

ENVIRON

5

HEURES APRES INOCULATION DE S. AUREUS

)

OU LE P

H

INFLUENÇAIT LA CROISSANCE GLOBALE DE S. AUREUS

. U

N P

H

PLUS ELEVE A CE STADE ETAIT GENERALEMENT LIE A UNE POPULATION DE

S.

AUREUS PLUS ELEVEE

. L

ES

PARAMETRES PHYSICO

-

CHIMIQUES DU CAILLE

/

FROMAGE NE SEMBLENT PAS ETRE LES SEULS FACTEURS INFLUENÇANT LA CROISSANCE DE

S.

AUREUS CAR NOS RESULTATS ONT

EGALEMENT MIS EN EVIDENCE UN EFFET LIE AU BIOTYPE DE

S.

AUREUS SUR LA CINETIQUE DE

CROISSANCE

. U

N DES RESULTATS MARQUANTS OBTENUS AU COURS DE CE TRAVAIL EST QUE

SEULES

SEA

ET

SED

ONT ETE PRODUITES A DES NIVEAUX DETECTABLES DANS LE

FROMAGE MODELE DE TYPE PATE PRESSEE NON CUITE

. A

UCUNE PRODUCTION DE

SEB

OU DE

SEC

N

A ETE DETECTEE AVEC LES METHODES D

EXTRACTION ET DE DETECTION UTILISEES AU LABORATOIRE

,

MEME AVEC DES POPULATIONS DE

S.

AUREUS ATTEIGNANT

10

7

– 10

8 UFC

/

G EN DEBUT D

AFFINAGE

. P

AR CONSEQUENT

,

NOUS POUVONS ESTIMER QUE LES SOUCHES DE

S.

AUREUS POTENTIELLEMENT PRODUCTRICES DE

SEA

ET

/

OU

SED

REPRESENTENT UN RISQUE HYGIENIQUE PLUS IMPORTANT POUR DES FROMAGES A PATE PRESSEE NON CUITE QUE LES SOUCHES POTENTIELLEMENT PRODUCTRICES DE

SEB

OU

SEC. P

AR AILLEURS

,

CETTE ETAPE DU TRAVAIL NOUS A PERMIS DE METTRE AU POINT UN

MODELE FROMAGE A PATE PRESSEE NON CUITE POUVANT ETRE UTILISE POUR TESTER LA

ESPECES DE STAPHYLOCOQUES

,

TELLES QUE L

ESPECE

S.

INTERMEDIUS RENCONTREE DANS

LE LAIT ET LE FROMAGE ET QUI EST POTENTIELLEMENT PRODUCTRICE D

ENTEROTOXINES

.

L

ES FABRICATIONS EXPERIMENTALES SIMULANT TROIS FABRICATIONS TRADITIONNELLES

,

C

ANTAL

, T

OMME DE

S

AVOIE ET

R

EBLOCHON

,

NOUS ONT PERMIS D

APPRECIER LE

COMPORTEMENT DE TROIS ISOLATS DE

S.

AUREUS PARMI LES

17

PRODUCTEURS DE

A, D

OU

A

ET

D

DANS DES TECHNOLOGIES AYANT

,

EN AUTRES

,

DES CINETIQUES D

ACIDIFICATION DIFFERENTES JUSQU

AU LENDEMAIN DE LA FABRICATION

(J+1). L

ES ISOLATS AVAIENT ETE ENSEMENCES A DEUX NIVEAUX

:≈100

UFC

/

ML

(

NIVEAU BAS

)

ET

1500-2000

UFC

/

ML

(

NIVEAU HAUT

),

POUVANT ETRE RETROUVES DANS LE LAIT CRU DESTINE A LA FABRICATION DES

FROMAGES

. L

E PLAN EXPERIMENTAL COMPORTANT DEUX SITES DE FABRICATION

,

DONC ENTRE AUTRES

,

DEUX ORIGINES DE LAIT DIFFERENTES

,

NE NOUS PERMET DE CONCLURE DE MANIERE SATISFAISANTE SUR LES NIVEAUX ATTEINTS PAR

S.

AUREUS DANS TELLE OU TELLE

TECHNOLOGIE

. E

N REVANCHE

,

NOUS AVONS PU CONSTATER UN EFFET LIE A L

INDIVIDU

(

ISOLAT

)

EN FONCTION DES TECHNOLOGIES

. A

INSI

,

L

ISOLAT PRODUCTEUR DE

SEA

ET

SED

(

ISOLAT

A)

S

EST MIEUX DEVELOPPE DANS LE FROMAGE EXPERIMENTAL TYPE

C

ANTAL ALORS QUE L

ISOLAT PRODUCTEUR DE

SED (

ISOLAT

C)

S

EST MIEUX DEVELOPPE DANS LE

FROMAGES EXPERIMENTAUX TYPES

T

OMME DE

S

AVOIE ET

R

EBLOCHON

,

L

ISOLAT PRODUCTEUR DE

SEA (

ISOLAT

B)

AYANT UN COMPORTEMENT INTERMEDIAIRE

.

P

AR AILLEURS

,

COMME DANS LE FROMAGE MODELE

,

L

INFLUENCE DU P

H

SUR LA

CROISSANCE DE

S.

AUREUS A ETE MISE EN EVIDENCE

. D

ANS LE FROMAGE MODELE

T

OMME DE

S

AVOIE

,

LE POINT CLE SE SITUAIT AU STADE MOULAGE

+ 4

HEURES ALORS QU

IL NE SE TROUVAIT QU

A

J+1

DANS LE FROMAGE MODELE

R

EBLOCHON

. A

INSI

,

PLUS LE P

H

EST ELEVE A CE POINT CLE

,

PLUS LA POPULATION DE

S.

AUREUS EST IMPORTANTE

. C

ET EFFET TARDIF DU P

H

DANS LE FROMAGE EXPERIMENTAL TYPE

R

EBLOCHON

,

LIE A UNE CINETIQUE

D

ACIDIFICATION LENTE

,

PEUT ETRE UNE CAUSE DE LA PRODUCTION D

ENTEROTOXINES DETECTEE EN DEBUT D

AFFINAGE A DES NIVEAUX FAIBLES

(

TRACES DE

SEA

ET

0,2

NG

/

G DE

SED);

AUCUNE PRODUCTION D

ENTEROTOXINE N

AYANT ETE DETECTEE DANS LES DEUX

AUTRES FROMAGES EXPERIMENTAUX

. L

ES POPULATIONS DE

S.

AUREUS SE TROUVAIENT

DANS LES FROMAGES INCRIMINES EN MOYENNE A UN NIVEAU DE

2 10

4 UFC

/

G

.

A

LA LUMIERE DE CES RESULTATS

,

NOUS POUVONS ESTIMER QUE LE MODELE

R

EBLOCHON AVEC UNE ACIDIFICATION LENTE PEUT PRESENTER UN RISQUE

«

ENTEROTOXINE DE

S.

AUREUS

»

DANS LA MESURE OU DES SOUCHES DE

S.

AUREUS POTENTIELLEMENT

PRODUCTRICES DE

SEA

E

/

OU

SED

SONT PRESENTES DANS LE LAIT DE FABRICATION

,

EVENEMENT QUI

,

COMME NOUS L

AVONS VU PRECEDEMMENT

,

EST MALGRE TOUT RELATIVEMENT RARE

.

E

NFIN

,

LE TRAVAIL EXPLORATOIRE SUR LE POTENTIEL D

OXYDO

-

REDUCTION A MIS EN EVIDENCE LA POSSIBILITE QUE DIFFERENTES CONDITIONS REDOX PEUVENT INTERVENIR SUR LA PRODUCTION D

ENTEROTOXINES IN VITRO

.

P

OUR CONCLURE

,

CE TRAVAIL A APPORTE UNE IMAGE ACTUALISEE DE LA DIVERSITE DE

S.

AUREUS ISOLE DE LAIT CRU ET DE FROMAGES AU LAIT CRU PRINCIPALEMENT

. I

L A MIS EN AVANT L

EFFET DE L

INDIVIDU

(

ISOLAT

/

SOUCHE DE

S.

AUREUS

),

DE LA NATURE DE

L

ENTEROTOXINE ET DE LA TECHNOLOGIE

,

EN PARTICULIER DU P

H,

SUR LA CROISSANCE ET L

ENTEROTOXINOGENESE DE

S.

AUREUS

. E

NFIN CE TRAVAIL A SOULIGNE LE RISQUE TRES FAIBLE DE PRODUCTION D

ENTEROTOXINES DANS LES FROMAGES A PATE PRESSEE NON CUITE

.

Perspectives

Suite à ce travail de thèse, des travaux complémentaires seraient à réaliser afin