82
Liste des figures
Figure 1: Importance de la restauration des corridors écologiques (Trocmé, 2017). ... 11
Figure 2: : Schéma de la démarche Via Fauna, pour identifier les secteurs à problème et proposer des aménagements ... 13
Figure 3: Carte de la zone d'étude du projet ainsi que les huit territoires sélectionnés ... 14
Figure 4: Diagramme du pourcentage de temps de travail pour chaque tâche... 17
Figure 5: Diagramme de Gantt des différentes missions du stage ... 17
Figure 6: Logo application ODK Collect ... 18
Figure 7: Interface de l'application ODK Collect ... 18
Figure 8: Schéma de classification de la franchissabilité théorique en fonction du type d'ouvrage pour l'espèce fictive des ongulés ... 20
Figure 9: Schéma de classification et de notation de la franchissabilité théorique en fonction du type d'ouvrage pour l'espèce fictive des mustélidés ... 20
Figure 10: Diagramme du pourcentage d'erreurs par champs de la BD ORFeH ... 22
Figure 11: Schéma de la méthode de priorisation des ouvrages ... 22
Figure 12 : Sortie de terrain dans le territoire test des Hautes-Pyrénées, rencontre avec le technicien référent Nicolas Thion. Présentation de la méthode et des outils Via Fauna. ... 26
Figure 13 : Manuel de terrain distribué lors des formations ... 27
Figure 14: Visualisation de l’interface ODK Aggregate, pour l’export des données. https://docs.opendatakit.org/aggregate-intro/ ... 29
Figure 15: Visualisation de l’interface d’export ODK aggregate, pour l’import des données. https://docs.opendatakit.org/aggregate-forms ... 29
Figure 16: Visualisation de l’outil permettant de convertir des données CSV en SHP ... 30
Figure 17: Aperçu du positionnement des points suite à l'import des données ... 30
Figure 18: Jointure des données acquises sur le terrain à la BDD ... 31
Figure 19: Schéma des différentes mesures prises dans la qualification de l'ouvrage ... 33
Figure 20: Calcul de l'indice d'ouverture (en m) ... 33
Figure 21: Graphique indiquant le taux d'usage par espèce en fonction de l'indice d'ouverture ... 34
Figure 22 : formule SQL qui permet de calculer l'indice sous Qgis ... 35
Figure 23 : Diagramme de classification des ouvrages à partir de l'indice d'ouverture ... 35
Figure 24: Carte de classification des ouvrages à partir de l'indice d'ouverture ... 36
Figure 25 : Piège photo Bushnell nature view cam HD utilisé pour le suivi. Source : Digixo.com ... 39
Figure 26 : Boitier de protection et de dissuasion utilisé ... 40
Figure 27 : Câble réglable de protection contre le vol. Source : Digixo.com ... 40
Figure 28 : Etiquette fournie par Vinci, à coller sur le piège photographie lors de la pose ... 41
Figure 29 : Schéma du champ d’action horizontal du détecteur infrarouge ... 41
Figure 30 : Exemple d’un piège photographique dans le Gers, bien dissimulé dans les arbres ... 42
Figure 31 : Arborescence à créer lors d’un suivi par piège photographique ... 43
Figure 32 : Schéma explicatif des différentes jointures de la base de données photographiques ... 44
83 Figure 34 : Fenêtre de visualisation de XnViewMP ... 46 Figure 35 : Placement du logiciel au même niveau de l’arborescence que le dossier que l’on veut extraire ... 47 Figure 36 : Console de l’invite de commande utilisée pour extraire les métadonnées ... 47 Figure 37 :Le fichier out.csv en sortie ... 47 Figure 38: Graphique du nombre de photographies traitées par département lors de la phase de suivi. L’Ariège en a zéro car les pièges ont été volés ... 48 Figure 39: Graphique du nombre de clichés pris pour les ongulés ... 48 Figure 40: Photographies d'ongulés de bonne qualités qui permettent l'identification des espèce. En haut : à gauche une biche, à droite un chevreuil. En bas : à gauche une compagnie de sanglier, à droite une chevrette et ses petits. ... 49 Figure 41: Photographies de mustélidés et léporidés, où les animaux sont identifiables jusqu'à l'espèce. De gauche à droite : une martre des pins, un lièvre d’Europe, une genette et un blaireau. ... 49 Figure 42 : Fiche d’un ouvrage suivi, qui permet de rassembler tous les éléments sur une même page, dans le but de garder une trace et pouvoir comparer les ouvrages suivis. ... 50 Figure 43: Comparaison des modélisations visant àévaluer la perméabilité de l’autoroute A20 pour les ongulés. Carte réalisé par Johan Roy... 53 Figure 44: Carte du flux de déplacement théoriques des ongulés sur le territoire test du Lot. 55 Figure 45 : Pont sur ILT aménagé avec une bande enherbée. Source : Setra : Faune et trafic, 2007.. ... 57 Figure 46 : Schéma d'un aménagement faunique d'un ouvrage inférieur. Source : SETRA, Faune et Trafic, 2009. ... 58 Figure 47: Photographie de l'ouvrage à aménager ... 59 Figure 48: Modèle 3D de la portion d'autoroute choisie pour l'aménagement de l'ouvrage .... 59 Figure 49: Plaquette de l'état initiale de l'ouvrage, remise en contexte du paysage bordant l'ouvrage, réalisée par Léa Pradines. ... 60 Figure 50: Plaquette de l'aménagement mixte proposé, avec la création de coulée, barrières, haies, réalisée par Léa Pradines. ... 61 Figure 51: Plaquette de l'aménagement proposé, vue de l'animal et vue de l'intérieur de
l'ouvrage, réalisée par Léa Pradines. ... 62 Figure 52 : Schéma de la nouvelle priorisation, uniquement les ouvrages pour lesquels il y a une incertitude change. ... 66 Figure 53 : Passage supérieur non utilisé par la faune, suivi sur un an, avec des aménagements réalisés (Trocmé, 2017) ... 68 Figure 54 : Vue des trois ouvrages, seul celui du milieu est franchissable. A gauche canal de St-Martory, au milieu et à droite canal de la Neste. ... 69 Figure 55 : Vue des trois ouvrages qui sont franchis par les ongulés. A Gauche sentier passant sous l’autoroute A20, Au milieu et à Gauche, sentier passant sous l’autoroute A20. ... 70 Figure 56 : Exemple de hautes herbes qui ont poussé devant l’appareil, et qui l’on fait
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Liste des tableaux
Tableau 1: Nombre d'ouvrages à visiter lors de la première phase de terrain ... 24
Tableau 2: Réattribution de la franchissabilité théorique de l'espèce fictive ongulé, à partir de l'indice d'ouverture ... 34
Tableau 3 : Tableau permettant de relier les coordonnées géographiques aux photographies récoltées ... 44
Tableau 4 : Extrait du tableau du référentiel INPN, il a été nettoyé, car il y a plus de champs à l’origine ... 45
Tableau 5: seuil de friction des types de milieu utilisé par le modèle. Source : Sentenac, 2018 ... 51
Tableau 6 : Coût de la réalisation de l'aménagement proposé ... 64
Tableau 7: Prix de l'entretien de l'aménagement suite à sa mise en place ... 64
Tableau 8 : Résultat des ouvrages à visiter à partir de la nouvelle priorisation ... 67
Liste des annxes
Annexe 1: Fiche de terrain à destination des agents techniques ... 79Annexe 2: Exemple d’une carte interactive des ouvrages à visiter créée sur My Maps ... 80
Annexe 3 : Liste des catégories utilisés lors de l’étiquetage des photographies ... 80
Annexe 4: Carte de friction des ongulés au regard de l’occupation du sol du territoire-test du Lot. ... 81
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Table des matières
Résumé ... 2
Remerciements ... 4
Liste des sigles ... 5
Introduction ... 7
Notion et concept de continuité écologique ... 7
Quel rôle des passages non dédiés dans la transparence écologoqie ? ... 8
La Fédération régionale des chasseurs et les fédérations départementales comme acteurs de l’environnement et des connaissances... 12
Le projet Via Fauna ... 13
Les missions du stage ... 16
I- Inventaire des ouvrages d’art dans l’ancienne région Midi-Pyrénees ... 18
Open Data Kit Collect (ODK) ... 18
Méthodologie de priorisation des ouvrages ... 20
Phase de terrain ... 23
Résultats ... 25
Le transfert de compétence : la formation ... 26
II- Traitement des données ... 29
Import ... 29
Indices ... 31
III- Le suivi par pièges photographiques ... 37
La sélection des ouvrages à suivre ... 37
Protocole d’installation et de suivi des pièges photographiques... 39
Elaboration d’une base de données photographique ... 43
Créé une arborescence claire ... 43
Géolocaliser les données et créer la trame de la base de données ... 44
L’étiquetage des photographies ... 45
Export des métadonnées grâce à ExifTool ... 47
Résultats ... 48
IV- Modèle de dispersion, aménagements et préconisations ... 51
Apport des travaux au modèle de dispersion ... 51
Aménager les ouvrages existants ... 56
Proposition d’un aménagement mixte d’un ouvrage inférieur... 58
V- Discussion ... 65
Inventaire des ouvrages d’art ... 65
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Le suivi pas pièges photographiques ... 69
Aménagement et préconisation ... 72
Conclusion ... 74
Bibliographie... 76
Annexes ... 79