Exemples d’agents pathogènes identifiés et/ou de maladies infectieuses nouvellement reconnues ou nouvelles depuis les années 1950 chez l’homme.
La littérature peut différencier date de découverte et investigations génétiques plus poussées. Ces données sont variables selon les auteurs. L’interrogation des bases de données permet parfois de retrouver les articles originaux, s’ils sont parus après 1950. Plus de 30 virus pathogènes pour l’homme ont été découverts ces trente dernières années.
Pour les mycoses, la liste des champignons opportunistes en cause en pathologie humaine ne cesse d’augmenter (dus à l’immunodéficience, comme Cryptococcus neoformans, connu depuis 100 ans, très fréquent dans ce contexte pathologique). Elles ne sont pas répertoriées ici (sauf les « microsporidioses » qui étaient considérées comme des protozooses jusqu’à une date récente). Pour en savoir plus, l’article consultable en ligne de Dominique Chabasse et de ses collaborateurs propose en 2009 une revue générale des maladies fongiques émergentes[280] : Le nombre de
champignons incriminés en pathologie humaine est passé de moins d’une trentaine d’espèces dans les années 1950 à plus de 400 aujourd’hui. Il propose un tableau des grandes étapes de
l’émergence des infections fongiques (montrant l’accélération des risques de les retrouver depuis 1990 : échanges intercontinentaux, diagnostic moléculaire, diversification des activités sportives et mucoviscidose (terrain particulier)).
Les étapes antérieures décrites sont les suivantes :
- 1950 : l’avènement des antibiotiques, corticoïdes et premiers anticancéreux ; - 1960 : chimiothérapies, cathéters, voies veineuses centrales ;
- 1970 : transplantation d’organes, immunosuppresseurs ;
- 1980 : sida/VIH, greffes de moelle osseuse, hospitalisations prolongées.
Les auteurs décrivent ainsi l’émergence de nouvelles familles de champignons au fur et à mesure des années.
La colonne « Type » ci-dessous comprend les virus (V), les bactéries (B), les parasites (P), ou agent transmissible non conventionnel ou prion (ATNC), fungi (F).
Année Microorganisme
Type Maladie
1951 Virus Murray Valley V Encéphalite Murray Valley (bénigne)
1952 Virus Mapucho Virus Zika
V V
Fièvre hémorragique de Bolivie Fièvre type dengue
1957 Virus Kyasanur V Syndrome myalgique et hémorragique
1958 Virus Junin Virus Monkeypox
V V
Fièvre hémorragique d’Argentine Variole du singe
1959 ?? Babesia microti
Influenzavirus A H5N1 chez le poulet
?? P
V
Fièvre hémorragique de Lassa (Nigeria) Babésiose américaine
Peste aviaire hautement pathogène
Année Microorganisme
Type Maladie
1961 Virus Chikungunya Souche Vibrio cholerae 01
Staphylococcus aureus (connu) résistant à la méticilline V B B Le Chikungunya Choléra épidémique
Staphylocccie nosocomiale MRSA
1964 Virus d’Epstein-Barr V Lymphome de Burkitt
1965 Virus de l’encéphalite japonaise V Encéphalite japonaise
1966 Virus Congo-Crimée V Fièvre hémorragique du Congo
1967 Virus Marburg V Fièvre hémorragique de Marburg
1969 Virus Lassa V Etiologie de la fièvre de Lassa
1970 Virus Monkeypox V Variole du singe chez l’homme
1971 Virus Ross River V Fièvre, arthralgies (bénignes)
1972 Virus de l’hépatite B Campylobacter jejuni (connu)
V B
Hépatite virale B Entérites
1973 Rotavirus V Diarrhées aiguës et gastroentérites infantiles (cause majeure)
1974 Babesia divergens (connu) P Premier cas humain décrit
1975 Parvovirus B19 V Exanthème subit, arthrite, anémie aplasique (sujets prédisposés)
1976 Cryptosporidium parvum (connu) Virus Hantaan Virus Ebola Virus Séoul P V V V
Cryptosporidioses chez l’homme (diarrhées) Fièvre hémorragique avec syndrome rénal Fièvre hémorragique à virus Ebola Fièvre hémorragique de Séoul
1977 Legionella (pneumophila) Virus de la fièvre de la vallée du Rift Cyclospora cayetanensis
B V P
Maladie des Légionnaires
Fièvre hémorragique de la vallée du Rift Cyclosporidiose (diarrhées)
1980 Virus HTLV-1 V Hémopathies malignes, myélopathie (paralysie)
1981 Toxine TSST-1, Staphylococcus aureus (connu) B Choc toxique staphylococcique (décrit dès 1978)
1982 Escherichia coli 0157:H7 Borrelia burgdorferi Virus HTLV-2
Acanthamoeba (plusieurs espèces)
B B V P
Syndrome hémolytique et urémique Maladie de Lyme
Myéloneuropathies (rares)
Kératites amibiennes chez les porteurs de lentilles
1983 HIV (HIV-1) Helicobacter pylori Virus Puumala V B V Sida Gastrite/ulcère gastroduodénal Fièvre hémorragique (Europe)
1985 HIV-2
Salmonella enterica sérotype typhimurium DT104 Enterocytozoon bieneusi
V B F
Sida
Salmonellose multirésistante aux antibiotiques Microsporidioses chez l’immunodéprimé (diarrhées)
Microrganisme en cause considéré antérieurement comme protozoaire
Année Microorganisme Type Maladie 1988 Virus de l’hépatite E Human Herpesvirus 6 (HHV6) V V Hépatite virale E
Etiologie de la roséole et autres formes cliniques
1989 Virus de l’hépatite C ??
V ??
Hépatite virale C
Fièvre hémorragique du Venezuela
1990 ?? ?? Fièvre hémorragique du Brésil
1991 Nouvelles espèces de Babesia Encephalitozoon hellem Ehrlichia chaffeensis Virus Guanarito P F B V Babésioses atypiques
Kératoconjonctivites (microsporidiose chez l’immunodéprimé)
Ehrlichiose monocytique humaine
Agent de la fièvre hémorragique du Venezuela
1992 Vibrio cholerae 0139 Bartonella henselae
B B
Choléra épidémique, nouvelle souche
Maladies des griffes du chat, angiomatose bacillaire
1993 Virus Sin nombre (Hantavirus) Virus de l’hépatite delta Encephalitozoon cuniculi
V V F
Syndrome cardiopulmonaire à Hantavirus Hépatite virale D Infection systémique 1994 Virus Hendra Virus Sabia Virus de l’hépatite F V V V
Paramyxovirose équine et encéphalite humaine Fièvre hémorragique du Brésil
Hépatite virale F 1995 Human Herpesvirus 8 (HHV8) Virus Belgrade/Dobrava Virus Alkhurma V V V Maladie de Kaposi Fièvre hémorragique
Fièvre hémorragique à virus Alkhurma
1996 Australian bat lyssavirus Hypothèse lien ESB et vMCJ88
V ??
Encéphalite
Nouvelle variante de la maladie de Creutzfeldt-Jakob
1997 Tropherima whipplei Virus de l’hépatite TT B V Maladie de Whipple Hépatite virale TT 1999 Virus Nipah
Virus West Nile Virus de l’hépatite G
Lien entre ESB et vMCJ : prion PrP mutée
V
V V ATNC
Paramyxovirose porcine et encéphalites chez l’homme
Encéphalite à virus du Nil occidental Hépatite virale G
Etiologie de la nouvelle variante de la maladie de Creutzfeldt-Jakob
2001 Human Metapneumovirus V Bronchiolites (enfants)
2003 Coronavirus du SRAS : SARS-CoV Mimivirus
V V
Syndrome respiratoire aigu sévère Pneumonies
2004 HcoV-NL63 Human metapneumovirus
V V
Syndrome respiratoire sans grande gravité Bronchiolites, encéphalites (nourrisson)
2005 Virus HTLV-3 et HTLV-4 Human bocavirus (HboV) Coronavirus HKU1
V V V
??
Infections respiratoires basses Infections respiratoires basses
2007 Virus Melaka V Insuffisance respiratoire
Première description d’une maladie symptomatique à
orthoreovirus
88 ESB : encéphalopathie spongiforme bovine.
Année Microorganisme
Type Maladie
2008 Pour information : premier Virophage (parasite viral appelé Spoutnik dans un virus géant nommé Mamavirus (type de Mimivirus))
V Découverte de possibilité de transfert de gènes…
2009 Virus Lujo V Fièvre hémorragique de type Fièvre d’Ebola
2009 Pour information : le virus de la grippe A/H1N1v qui est responsable d’une pandémie est un variant non détecté jusqu’alors, ce n’est pas un nouveau virus.