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[PDF] Top 20 Algorithmes pour la reconstruction de génomes ancestraux

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Algorithmes pour la reconstruction de génomes ancestraux

Algorithmes pour la reconstruction de génomes ancestraux

... de génomes ancestraux basée sur les α-adjacences et permettant des génomes aux contenus en gènes inégaux de même qu’une évolution par ...de reconstruction basées sur les distances génomiques ... Voir le document complet

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en
                                                                    fr

en fr Reconstruction of ancestral vertebrate genomes Reconstruction de génomes ancestraux chez les vertébrés

... de reconstruction que nous allons mettre en place (la figure se place dans le contexte des deux duplica- tions complètes de génome chez les ...de reconstruction doit remonter le temps tout d’abord (E) en ... Voir le document complet

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Comment la reconstruction de génomes ancestraux peut aider à l'assemblage de génomes actuels

Comment la reconstruction de génomes ancestraux peut aider à l'assemblage de génomes actuels

... les génomes actuels. Une grande proportion des génomes actuels sont fortement fragmentés, dont le génome du wallaby (Macropus eugenii) composé de 12 704 ... Voir le document complet

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Pépite | Algorithmes pour la comparaison de génomes et la recherche de signaux cis-régulateurs

Pépite | Algorithmes pour la comparaison de génomes et la recherche de signaux cis-régulateurs

... Si autant de sc´ enarios sont possibles, il est l´ egitime de se poser la question de la pertinence biologique de tel ou tel sc´ enario. C’est partant de ce constat que nous avons essay´ e, comme d’autres, d’introduire ... Voir le document complet

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Pépite | Algorithmes pour la reconstruction de séquences de marqueurs conservés dans des données de métagénomique

Pépite | Algorithmes pour la reconstruction de séquences de marqueurs conservés dans des données de métagénomique

... 2.1.4 Les formats d’alignements : SAM/BLAST De nombreux formats de fichier existent pour représenter des alignements de séquences. Nous présentons ici deux formats très largement utilisés et complémentaires. Le format ... Voir le document complet

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Algorithmes pour la reconstruction de séquences de marqueurs conservés dans des données de métagénomique

Algorithmes pour la reconstruction de séquences de marqueurs conservés dans des données de métagénomique

... Les méthodes Le paradigme OLC a été rendu populaire par les travaux de Gene Myers, et plus particulièrement l’assembleur Celera [ 62 ] qui a dominé le domaine de l’assemblage jusqu’à l’émergence des technologies de ... Voir le document complet

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Combinaison de modèles phylogénétiques et longitudinaux pour l'analyse des séquences biologiques : reconstruction de HMM profils ancestraux

Combinaison de modèles phylogénétiques et longitudinaux pour l'analyse des séquences biologiques : reconstruction de HMM profils ancestraux

... J’ai démarré ma thèse sous la direction d’Olivier Gascuel en octobre 2007. Après avoir suivi une formation de premier et second cycle en mathématiques et informatique, j’ai souhaité me tourner vers un domaine me ... Voir le document complet

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Comparaisons de génomes avec gènes dupliqués : étude théorique et algorithmes

Comparaisons de génomes avec gènes dupliqués : étude théorique et algorithmes

... plusieurs génomes d’espèces ou de souches différentes, et comporte de nombreuses ...deux génomes, ceci en considérant diverses opérations élémentaires (transposition, suppression, insertion, fusion, ...de ... Voir le document complet

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Méthodes et algorithmes pour l’amélioration de l’inférence de l’histoire évolutive des génomes

Méthodes et algorithmes pour l’amélioration de l’inférence de l’histoire évolutive des génomes

... Continuous effort is also made for developing fast probabilistic frameworks capturing HGT events (see [ 252 ] for a review of these models). Integrative methods report gene trees with better accuracy compared with ... Voir le document complet

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Algorithmes pour la comparaison de génomes et la recherche de signaux cis-régulateurs

Algorithmes pour la comparaison de génomes et la recherche de signaux cis-régulateurs

... Si autant de sc´ enarios sont possibles, il est l´ egitime de se poser la question de la pertinence biologique de tel ou tel sc´ enario. C’est partant de ce constat que nous avons essay´ e, comme d’autres, d’introduire ... Voir le document complet

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Quand les gènes s’éclatent - Les génomes mitochondriaux des diplonémidés

Quand les gènes s’éclatent - Les génomes mitochondriaux des diplonémidés

... les génomes mitochondriaux : nombre de gènes, nom- bre et forme de chromosomes et surtout la façon dont l’information génétique est transformée en protéine [1] ... Voir le document complet

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FouDanGA : Fouille de données pour l'annotation de génomes d'actinomycètes

FouDanGA : Fouille de données pour l'annotation de génomes d'actinomycètes

... SIGffRid [4] Extraction par des méthodes de fouille de données de motifs d’ADN (SFFT comme Site de Fixation de Facteur Transcriptionnel). impliqués dans la régulation de l’expression génique chez les bactéries du groupe ... Voir le document complet

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Recherche d'éléments structurés dans les génomes par modèles logiques

Recherche d'éléments structurés dans les génomes par modèles logiques

... C'est la zone intercalée entre la fenêtre glissante et la structure initiatrice du décalage du cadre de lecture. Sa limite de taille supérieure se situe, selon les modèles défi[r] ... Voir le document complet

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Caractérisation des populations microbiennes dans les aliments : du phénotype aux génomes

Caractérisation des populations microbiennes dans les aliments : du phénotype aux génomes

... Paris, 31 mars 2014 25 Etude de la fonctionnalité de la microflore des aliments Fonctionnalité+ microbienne8 Métaprotéomique,+ métabolomique8 Les+nouvelles+approches+de+maîtrise++ de+[r] ... Voir le document complet

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Développement d'outils moléculaires pour faciliter l'ingénierie des génomes

Développement d'outils moléculaires pour faciliter l'ingénierie des génomes

... menant à de potentiels clivages hors cible. À gauche, schéma d'hétérodimérisation obligatoire entre deux nucléases dont les interfaces de dimérisation sont complément[r] ... Voir le document complet

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Étude de l’évolution des génomes par duplications, pertes et réarrangements

Étude de l’évolution des génomes par duplications, pertes et réarrangements

... L’heuristique proposée pour l’inférence d’histoires évolutives de groupes de GRT, Multi-DILTAG, permet d’étudier l’évolution de plusieurs groupes de GRT orthologues chez plusieurs espèce[r] ... Voir le document complet

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Asymétrie des génomes parentaux - Implications en pathologie

Asymétrie des génomes parentaux - Implications en pathologie

... M/S n° 8-9, vol. 24, août-septembre 2008 749 SYNTHÈSE REVUES sus de déméthylation de l’ADN [16] . L’incorporation de variants d’histones tels que H3.3 pourrait aussi jouer un rôle important pour différencier les deux ... Voir le document complet

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Points chauds de sélection positive dans les génomes de primates

Points chauds de sélection positive dans les génomes de primates

... aux génomes de Craig Venter et James Watson, nous avons d’abord pu vérifier que les gènes candidats trouvés recoupent ceux déjà publiés à partir des données ... Voir le document complet

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Origines des séquences microsatellites dans les génomes eucaryotes

Origines des séquences microsatellites dans les génomes eucaryotes

... cet algorithme travaille uniquement avec des périodes répétées et non des motifs, les microsatellites composés (comme CACACACATATATA) seront considérés comme très peu divergents (1 seule er- reur, le passage de CA à ... Voir le document complet

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Un, deux, trois… mille génomes ?

Un, deux, trois… mille génomes ?

... mille génomes ? Bertrand Jordan > Un nouveau consortium international annonce le projet de séquençage de l’ADN de mille personnes choisie parmi l’ensemble de la population ... Voir le document complet

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