HDR Sciences du vivant
Gestion agroécologique des bioagresseurs:
« Concilier pratiques et régulations naturelles »
Thierry Brévault UPR AIDA
« Agroécologie et Intensification Durable des Cultures annuelles »
Plan de la présentation
Curriculum vitae
Zoom sur quelques résultats de recherche
Projet de recherche
Perspectives
Parcours professionnel Publications Activités de formation Expertise et animation scientifique Adaptation des populations d’insectes ravageurs : la résistance aux insecticides
Implications pour l’action Contexte
Cadre d’analyse et d’action Cas d’étude
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 2
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 3
Parcours professionnel
1993
Mémoire de fin d’études Ecologie de la pollinisation
Montfavet
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 4
Parcours professionnel
1994-95
Coopérant du Service National Diagnostic agronomique
Bambey
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 5
Parcours professionnel
1996-99
DEA et Doctorat Développement d’un système de piégeage
Saint- Pierre Montpellier
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 6
Parcours professionnel
2001-07
Epidémiologie, génétique et biologie de la résistance aux insecticides
Garoua
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 7
Parcours professionnel
2008-10
Adaptation des insectes aux cultures transgéniques insecticides
Tucson, AZ
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 8
Parcours professionnel
2011-12
Animation scientifique Ecologie chimique
Montpellier
Gestion agroécologique des bioagresseurs en
Afrique de l’Ouest
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 9
Parcours professionnel
depuis 2013
Régulation écologique des insectes ravageurs
Gestion des insectes
d’intérêt agricole
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 10
Expertise et champ disciplinaire
L’écologie appliquée pour la gestion intégrée des bioagresseurs
Ecologie des insectes
Action
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 11
Publications h-index = 16
52 publications dans des revues à IF (WoS)
Synthèse
bibliométrique
170 publications (Agritrop)
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 12
Activités de formation 5 thèses 32 Master
Encadrement d’étudiants
Formation à et par la recherche
Enseignement et transfert de compétences (> 200 h):
Master 2 UCAD Dakar, Montpellier SupAgro, ENSA Thiès Chercheurs, agents techniques (DPV, Sodécoton) et producteurs (OP)
Curriculum vitae
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 13
Expertise et animation scientifique
Membre de Comité scientifique
Vie collective
Organisation d’ateliers et conférences (8)
Stratégies de protection des cultures:
du modèle biologique au territoire (2015)
Organisation d’ateliers et conférences (8) Groupes de travail et réseaux de recherche
Plan de la présentation
Curriculum vitae
Zoom sur quelques résultats de recherche
Projet de recherche
Conclusion et perspectives
Parcours professionnel Publications Activités de formation Expertise et animation scientifique Adaptation des populations d’insectes ravageurs : la résistance aux insecticides
Implications pour l’action Contexte
Cadre d’analyse et d’action Cas d’étude
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 14
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 15
Contexte
Enjeu Sécurité alimentaire
Les ravageurs : contrainte majeure à l’intensification des systèmes de production agricole
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 16
Contexte
Rupture des équilibres biologiques
Les limites du recours aux pesticides
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 17
Contexte
Résistance des cibles
Les limites du recours aux pesticides
0 500 1000 1500 2000 2500 3000
1960 1970 1980 1990 2000 2010
carbamates organophosphates cyclodienes pyrethroids DDT neonicotinoids spinosyns Bt
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 18
Problématique et approche
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Mieux comprendre les processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Perturbations environnementales
Insectes ravageurs
Evolution de résistances
• Traitements insecticides
• Cultures transgéniques insecticides
• Durabilité des systèmes de production Stratégies de prévention et de gestion
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 19
Problématique et approche
Diminution héréditaire de la sensibilité à un insecticide
Evolution de la résistance
RS SS SS
SS
SS SS
SS
SS
SS SS
SS
SS SS
SS SS
SS SS
SS
SS SS
SS
SS
SS
SS SS
SS SS SS SS
SS SS
SS
SS
SS SS
RS
SS SS
SS SS SS
SS
RS
RS SS
SS RS
RS SS
SS RS
RR RR
RS
RS RS
SS
SS SS
SS
SS RS
RR RR
RS SS
RS SS
RS RR RR
RS
RS RS
SS SS RR SS
RR RR
RR
RR
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 20
Problématique et approche
Des mécanismes à la gestion
Bases génétiques
de la résistance
• fréquence initiale des allèles de résistance
• nombre de gènes impliqués
• dominance
• coût associé aux gènes de résistance
Vitesse d’apparition de la résistance
Système de vie du ravageur
• traits de vie (mode de reproduction, temps de génération, gamme d’hôtes, mobilité, etc.)
• conditions biotiques et abiotiques du milieu (ressources, ennemis naturels, etc.)
Degré d’exposition aux insecticides
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 21
Systèmes biologiques
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Milieu hétérogène et instabilité des ressources
Déplacement des insectes sur de grandes distances ou localement selon une séquence de plante hôtes
Garoua, Nord Cameroun
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 22
Systèmes biologiques
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Le puceron du coton, Aphis gossypii (Hemiptera, Aphididae)
A B
C D
E
Grande polyphagie Reproduction clonale Résistance
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 23
Puceron du coton
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Diversité génétique et spécialisation écologique
gombo oseille
aubergine morelle noire
11 génotypes multilocus – races d’hôte
poivronCucurbitaceae
coton 1600 indvidus
génotypés (microsatellites)
Kodek Maroua Dakar Meskine
GaschigaPitoa Garoua
DjalingoBabla Boklé
coton maraîchage
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 24
Puceron du coton
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Populations sympatriques génétiquement
différenciées (races d’hôte)
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 25
Puceron du coton
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Carte de résistance aux insecticides
1 10 100 1000
C9 PsP4 Auber Burk Ivo C9 PsP4 Auber Burk Ivo C9 PsP4 Auber Burk Ivo C9 PsP4 Auber Burk Ivo C9 PsP4 Auber Burk Ivo
NéonicotinoïdeCarbamateOP/profenofosOP/dimethoatePyréthrinoïde
CR (log) Matières
actives Modification cible (A302S)
Modification cible (S431F) Modification cible (super-kdr) Détoxification enzymatique
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 26
Puceron du coton
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Traitements insecticides et compétition
-1.0 -0.5 0.0 0.5 1.0
Fréquence des génotypes 14 jours après inoculation
Ivo Burk
Plants inoculés Traité
Non traité Plants voisins
**
**
Plants voisins **
Plants inoculés
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 27
Puceron du coton
Prévalence d’un génotype multi- résistant
Implications pour la gestion des pucerons en culture cotonnière
Orientation des programmes de lutte vers des interventions sur seuil.
Utilisation d’insecticides en adéquation avec la carte de résistance et sélectifs.
Prise en compte du rôle des plantes-hôtes alternatives dans la dynamique du ravageur (plantes réservoirs vs banques).
(Lepidoptera, Noctuidae)
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 28
Systèmes biologiques
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
La noctuelle du coton, Helicoverpa armigera
Grande polyphagie
Reproduction sexuée
Résistance
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 29
Noctuelle du coton
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Epidémiologie de la résistance
, Cleome; , maïs ;, coton; , Hyptis; , tomate
Echecs traitement
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 30
Noctuelle du coton
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Mécanismes de résistance
Détoxification par une augmentation de la production d’estérases
Metabolic resistance
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 31
Noctuelle du coton
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Héritabilité et coût de la résistance
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 32
Noctuelle du coton
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Implications pour la gestion de la résistance
Exclusion temporelle des pyréthrinoïdes dans les programmes de traitement en culture cotonnière.
Orientation des programmes de lutte vers l’utilisation de seuils d’intervention (LOIC).
Prise en compte des plantes-hôtes alternatives dans la gestion du ravageur (refuges naturels).
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Date
Nb chenilles sur 100 plants
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%
80%
90%
100%
Parcelles au stade sensible
chenilles sur coton chenilles sur maïs stade sensible coton stade sensible maïs
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 33
Gestion de la résistance au coton GM insecticide
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Les cultures GM dans le monde
Zoom sur résultats de recherche
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 34
Gestion de la résistance au coton GM insecticide
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
La stratégie « refuges » Coton Bt
RR RR
RS
SS SS SS SS SS SS
SS SS
SS SS SS
SS
SS SS SS SS
SS
SS
SS
Refuge
Problème: planter des refuges!
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 35
Gestion de la résistance au coton GM
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Les refuges naturels
Cameroun 300 km Burkina N
13C/12C
plante C3 plante C4 gossypol coton autre plante
C3
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 36
Gestion de la résistance au coton GM insecticide
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Rôle des refuges naturels?
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 37
Gestion de la résistance au coton GM insecticide
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Rôle des refuges naturels?
p0Cry2Ab = 0.0033
DLC Cry2Ab=0.5 DLC Cry2Ab=0.1
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 38
Gestion de la résistance au coton GM insecticide
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
L’empilage: limites du coton Bt à deux toxines
Redundant killing factor
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 39
Gestion de la résistance au coton GM insecticide
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Des refuges dans les semences?
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 40
Gestion de la résistance au coton GM insecticide
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Leçons du terrain : les refuges
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 41
Gestion de la résistance au coton GM insecticide
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Implications pour la gestion de la résistance
Evaluer le besoin de refuges structurés avant même l’implantation de cultures GM.
S’assurer d’une production soutenue des toxines par la plante tout au long du cycle de culture.
Séparer les refuges de la culture GM.
S’assurer de la pureté variétale de la culture GM.
Zoom sur résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 42
Organisation du paysage et flux
Processus d’adaptation des populations d’insectes ravageurs
Le paysage comme mosaïque d’habitats
Plan de la présentation
Curriculum vitae
Zoom sur quelques résultats de recherche
Projet de recherche La biodiversité au service de la régulation des bioagresseurs
Conclusion et perspectives
Parcours professionnel Publications Activités de formation Expertise et animation scientifique Adaptation des populations d’insectes ravageurs : la résistance aux insecticides
Implications pour l’action Contexte
Cadre d’analyse et d’action Cas d’étude: la MEM
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 43
Le projet
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 44
Contexte
Perte d’habitats pour la biodiversité fonctionnelle
La simplification des paysages agricoles La biodiversité au service de la
régulation des bioagresseurs
Des écosystèmes cultivés
plus sensibles aux ravageurs
Le projet
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 45
Contexte
Modification des interactions entre espèces
Les invasions biologiques
La biodiversité au service de la
régulation des bioagresseurs Le projet
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 46
Problématique
Sensibilité des agroécosystèmes aux ravageurs
Mieux comprendre les processus écologiques et évolutifs au sein des agroécosystèmes
… pour en prévenir ou en gérer l’évolution dans des systèmes de production agricole adaptés.
Agroécosystèmes
• Erosion de la biodiversité et rupture des équilibres
• Evolution de résistance des cibles vis-à-vis des pesticides
• Emergence de nouveaux ravageurs Perturbations
environnementales
• Pratiques agricoles
• Invasions biologiques
• Changement climatique
Stratégies de gestion
• des ravageurs
• de la biodiversité fonctionnelle
La biodiversité au service de la régulation des bioagresseurs
Le projet
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 47
Enjeu
Produire autrement
Produire plus, produire mieux
La biodiversité au service de la
régulation des bioagresseurs Observer autrement
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 48
L’écosystème
Du modèle biologique au système écologique
Les régulations naturelles
Ennemis naturels
Ravageurs
Ressources
Diagnostic moléculaire (barcoding, NGS)
Observer autrement
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 49
Le paysage
Une approche systémique
Les habitats et les flux
Ennemis naturels
Ravageurs
Ressources Paysage
Télédétection, SIG, biotracking
Observer autrement
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 50
Le paysage
Une approche systémique
Les habitats et les flux
Observer autrement
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 51
Le socio- agroéco- système
Une démarche participative pour rendre visible les services
Les acteurs du territoire
Ennemis naturels
Ravageurs
Ressources Paysage
Pratiques
Plateformes de modélisation
Agir autrement
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 52
Du champ au territoire
Des paysages fonctionnels localement co-conçus
Vers une gestion territoriale des ravageurs et des services de régulation écologique (biodiversité)
Pratiques
Paysage
Action
Régulations naturelles Solutions de
biocontrôle
Aménagement des habitats
Cas d’étude: la MEM
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 53
Contexte
Le mil:
céréale de base dans le bassin arachidier du Sénégal
Cas d’étude: la MEM
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 54
Contexte
Une forte variabilité des dégâts entre parcelles
La mineuse de la chandelle de mil Heliocheilus albipunctella (Lepidoptera, Noctuidae)
B
Monophage, univoltine
30-95% d’épis infestés - 2-20% de perte en grain
larve (23-29 j) diapause
dans le sol adulte (400 w)
œufs (3-4 j) saison
sèche saison des pluies
Cas d’étude: la MEM
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 55
Hypothèse 1
Impact, diversité et structure des communautés d’ennemis naturels
Les ennemis naturels
Cas d’étude: la MEM
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 56
Hypothèse 2
Champs de case vs champs de brousse Date de levée Densité
Le milieu (ou l’état du peuplement) modulo les
pratiques
Cas d’étude: la MEM
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 57
Hypothèse 2
Complexité du paysage et ennemis naturels Concentration des ressources
Le paysage: habitats semi-naturels et ressources
Cas d’étude: la MEM
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 58
Hypothèse 3
Rendre les services écosystémiques
« visibles »
L’utilisation des ressources par les acteurs interagit avec les propriétés du paysage recherchées
1.
Trajectoire des paysages et mode de gestion des ressources
Ressources
Acteurs
Cas d’étude: la MEM
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 59
Approche
Vers la conception de paysages multifonctionnels
Stratégies
4.
Co-conception de paysages multifonctionnels
3.
Structure des réseaux trophiques et contrôle biologique
•analyse d’images
•enquêtes
•plan d’échantillonnage
(réseau de parcelles )
2.
Déterminants de l’incidence du ravageur et de la régulation naturelle
Ennemis naturels
Ravageurs •observations in situ
•BSI: plantes sentinelles
•enquêtes sur les pratiques
•montage d’une base de référence
•diagnostic moléculaire (prédation
et parasitisme)
•analyse de motifs
•modèle multi-agent
spatialement explicite
•jeux de rôles
agriculteur / parcelle Exemples d’interactions
parcelle / ravageur arbres / ennemis naturels climat (eg pluie) / ravageur
Premiers résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 60
La régulation écologique
Biodiversité et régulation écologique des ravageurs
•
augmente avec la diversité du paysage et l'abondance des arbres.
•
plus importante dans les champs de case.
Effect of landscape diversity and crop management on the control of the millet head miner, Heliocheilus albipunctella (Lepidoptera: Noctuidae) by natural enemies Valérie Soti, Ibrahima Thiaw,, Ahmadou Sow, …, Thierry Brévault
BSI
Premiers résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 61
Les ennemis naturels
Des candidats pour le contrôle biologique
•
Base de données de référence (séquences et mini-codes-barres).
•
Reconstitution du réseau trophique à partir du diagnostic moléculaire (metabarcoding) du parasitisme et de la prédation.
Copidosoma primulum Schoelandella sahelensis
Trichogrammatoidea armigera
Premiers résultats
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 62
Les oiseaux et chauves- souris
Du rôle des vertébrés insectivores
•
Prédation des papillons (effet sur l’infestation des épis en œufs)
•
Prédation des larves (effet non significatif sur les dégâts)
•
Importance des arbres dans le paysage
Premières difficultés
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 63
Un temps d’avance
Financements en interne
•
Financement des projets de recherche
lourdeur des dispositifs
temporalité processus vs projet de recherche
« peu de chances de résultats spectaculaires » Complexité vs variabilité vs généricité des résultats?
Premières difficultés
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 64
Quels bénéfices?
Re-conception des systèmes de cultures et des paysages
•
Opérationnalisation des résultats
perception et représentation des acteurs reconception des systèmes de culture et des paysages gestion territoriale et collective
Seignobos (2017)
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 65
Composer l’action
Entre substitution et convergence avec l’approche systémique
Pratiques
Paysage
Action
Régulations naturelles Solutions de
biocontrôle
Aménagement des habitats
Solutions de biocontrôle
(Aulagnier et al. 2017)
Solutions de biocontrôle
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 66
De nouveaux chantiers
Interactions plante-insecte
L’induction de défenses naturelles des plantes
Solutions de biocontrôle
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 67
De nouveaux chantiers
Interactions plante-insectes
Dissuasion de ponte chez Helicoverpa armigera
* * * *
-1.0 -0.8 -0.6 -0.4 -0.2 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
0 4 8 12 16 32
Ai
Days post topping
Solutions de biocontrôle
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 68
De nouveaux chantiers
Interactions plante-insecte
Recrutement d’ennemis naturels
0 0.05 0.1 0.15 0.2 0.25 0.3
Non écimé non traité
Ecimé non traité
Non écimé traité
Ecimé traité Taux de
prédation
Solutions de biocontrôle
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 69
De nouveaux chantiers
Interactions plante-insecte
Réponse à des COVs typiques de l’écimage
Solutions de biocontrôle
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 70
De nouveaux chantiers
Interactions plante-plante
Surproduction de gossypol
Et communication plante-plante…
(Grandi et al., non publié)
Solutions de biocontrôle
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 71
De nouveaux chantiers
Interactions insecte-insecte
L’entomovection
Technologie de contrôle de maladies ou de ravageurs basées sur la transmission de biocides par des insectes
Pest-free fruit
Auto-dissémination de biopesticides Transmission par mouches stériles (3 en 1)
Abeille: sentinelle de l’environnement
31/05/2018 HDR Sciences du vivant, Université de Montpellier 72
De nouveaux chantiers
Des ouvrières agricoles à protéger
DE Gestion et ressources apicoles
HDR Sciences du vivant
Merci pour votre attention
Thierry Brévault UPR AIDA
« Agroécologie et Intensification Durable des Cultures annuelles »