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Exposition des eaux souterraines peu profondes à Escherichia coli résistant aux antibiotiques : approche hydrochimique pour identifier les sources et les voies de transfert.

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Academic year: 2021

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Texte intégral

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HAL Id: hal-02801080

https://hal.inrae.fr/hal-02801080

Submitted on 5 Jun 2020

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Exposition des eaux souterraines peu profondes à Escherichia coli résistant aux antibiotiques : approche hydrochimique pour identifier les sources et les voies de

transfert.

Julie Lions, Alain Hartmann, Anne Togola, Guillaume Duyck, Monique Fabre

To cite this version:

Julie Lions, Alain Hartmann, Anne Togola, Guillaume Duyck, Monique Fabre. Exposition des eaux souterraines peu profondes à Escherichia coli résistant aux antibiotiques : approche hydrochimique pour identifier les sources et les voies de transfert.. Colloque organisé par la SHF et le BRGM : “Les polluants émergents : de nouveaux défis pour la gestion des eaux souterraines ? ”, May 2016, Orléans, France. 2016. �hal-02801080�

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Exposition des eaux souterraines peu profondes aux souches d’Escherichia coli résistantes aux antibiotiques

Approche hydrochimique pour identifier les sources et les voies de transfert Projet financé dans le cadre du PNR EST

Julie LIONS1, Alain HARTMANN2, Anne TOGOLA1, Guillaume DUYCK1, Monique FABRE3

1 BRGM

2 INRA Dijon UMR1347 Agroécologie

3 Laboratoire départemental de la Côte d'Or

SHF : «Les polluants émergents : de nouveaux défis pour la gestion des eaux souterraines ? 19-20 mai 2016, Orléans»

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Contexte

> L’émergence de souches résistantes aux

antibiotiques (ATB) est un phénomène mondial qui peut remettre en cause l’utilisation des

antibiotiques.

> De nombreuses données épidémiologiques sur la prévalence et la diversité des souches humaines d’E. coli productrices de BLSE de type CTX-M dont un portage digestif chez l’Homme en augmentation avec des chiffres parfois inquiétants dans certains pays (30 à 50% de la population).

> Il existe peu de données sur l’existence de

réservoirs environnementaux pour ces souches, leur capacité à survivre dans l’environnement et en particulier dans les eaux (rivières et eau

souterraine) et les sols.

> 2

(4)

Objectifs et démarche de l’étude

> Mettre en évidence le rôle des systèmes de traitement d’eaux usées (STEU) dans la dissémination de souches résistantes aux antibiotiques dans l’environnement et

identifier les voies de transferts.

> Utiliser des traceurs chimiques (Anomalie en Gadolinium, caféine, pharmaceutiques, composition chimique des eaux) pour

identifier et caractériser l’origine des eaux et des contaminations

> 3

(5)

Différents contextes hydrogéologiques étudiés

 Sources karstiques: STEU et vignobles

 Nappe de Dijon : contamination par des eaux usées (STEU) et des pollutions diffuses

 Nappe alluviale (Tart-le-Bas) en aval de STEU

> 4

1 campagne préparatoire

 2 campagnes :

• Hautes / basses eaux

• 20

points

d’eau

(6)

Campagne de terrain

Mesure in situ

Paramètres physico-chimiques par sonde multi- paramètres

Prélèvements et filtration

Analyses chimiques: filtration à 0.45 µm

Prélèvements de 5 L d’eau brute pour E. coli et filtration au labo sur banc stérile

Analyse Labo

Chimies des eaux

Cations : ICP-AES & anions : C. ionique

Terres rares après préconcentration (ICP-MS)

Analyse de composés pharmaceutiques par LC- MS/MS après extraction sur cartouche SPE.

> 5

E. coli BLSE de type CTX-M

Dénombrement E. coli (ISO 9308-1:2014)

Culture sur milieu TBX +/- cefotaxime + test de synergie

(7)

Nappe de Dijon: présence E. coli

> 6 E.coli R-

(sept 2015)

E.coli BLSE (mars-sept 2015)

E.coli BLSE (mars-sept 2015) E.coli <

E.coli <

E.coli <

E.coli R- (sept 2015) E.coli <

E.coli <

E. coli BLSE uniquement dans les ESU (Ouche, Suzon) en association avec le paracétamol.

STEU

(8)

Nappe Alluviale : presence d’E. coli

> 7 E. coli BLSE

(mars-sept 2015) E.coli R-

(mars-sept 2015) E.coli <

(9)

Nappe Alluviale

> 8

> Analyse des terres rares

Spectres des Terres Rares - Ratio La/Yb : marqueurs hautes eaux/basses

Anomalie Gd*: Anomalie en Gd sur les 2 puits et l’Ouche

> E. Coli BLSE

Uniquement dans l’Ouche

> E. coli – eaux souterraines TAR 1

Origine de l’eau n’est pas issue de l’Ouche

Pollution locale du puits

TAR 1

Hautes eaux

Basses eaux

(10)

Secteur Karstique: présence E. coli

> 9 E.coli BLSE

(sept 2015*)

E.coli R- (sept 2015) E.coli BLSE

(mars-sept 2015) E.coli BLSE

(mars-sept 2015*) E.coli <

E.coli < E.coli <

STEP

STEP

(11)

Secteur Karstique: traçage

> 10

(12)

Secteur Karstique: marqueurs des Eaux usées

> 11 E.coli R-

(sept 2015) Paracétamol + Gd*

(sept 2015) Paracétamol + Gd*

(sept 2015*)

E.coli <

STEU

STEU

Gd*

(sept 2015*)

Contamination en e. coli BLSE sur sources karstiques (VOU, BRE, MEU) connectées au même BV (traçages) et impactés par des Eaux usées

Co-présence de Paracétamol et Gd* pour les sources impactées par e. coli (VOU et MEU)

(13)

Conclusions

> E. coli BLSE présentent une large

dissémination dans les eaux contaminées (60%).

> Utilisation de marqueurs hydrochimiques

Bore, NO3, PO4, REE marqueurs anthropiques et naturels

CBZ, Gd* fonction de la signature des EU et des bassins versants

Paracétamol persistance faible en association avec E.coli

> Dissémination E. coli dans les sources

karstiques ou les eaux de surface impactés par les eaux usées.

> A priori pas d’indicateurs d’une contamination d’origine agricole ou de l’épandage de boues de STEU.

> 12

(14)

Merci pour votre attention

> 13

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