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Biodiversité microbienne, une ressource pour la filière lait

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Academic year: 2021

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HAL Id: hal-01349182

https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01349182

Submitted on 5 Jun 2020

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Biodiversité microbienne, une ressource pour la filière lait

Yves Le Loir

To cite this version:

Yves Le Loir. Biodiversité microbienne, une ressource pour la filière lait. CFIA, Mar 2016, Rennes, France. �hal-01349182�

(2)

.01

Biodiversité microbienne,

une ressource pour la filière lait

Yves Le Loir

UMR STLO

Science et Technologie du Lait et de l’Œuf

www.rennes.inra.fr/stlo

(3)

• Aliments clés de notre diète

• Sources de molécules à haute valeur ajoutée

• Productions et transformations & Ouest

Le lait & l’œuf

19 % 49 %

11 % 43 %9 %

10 % 5 %

(4)

.03 .03

Des points communs / des questions de recherche partagées

• Composition d’une extrême richesse / croissance

• Sources d’ingrédients extraordinaires : protéines, mais aussi lipides

• Composants bioactifs encore très mal connus

• Questions nutritionnelles & implications allergie

• Une fragilité / contaminations microbiennes

Des différences

• Le poids et l’organisation des filières industrielles

• Pour le lait : tout le champ des aliments fermentés, de leur qualité, de leur sécurité

Le lait & l’œuf

(5)

Aliment fermenté Technologie

Matière première Microorganismes

La fermentation :

l’une des plus anciennes méthodes de conservation des aliments

Une des premières formes de biopréservation

(6)

.05

Les aliments fermentés, une histoire ancienne…

(7)

J Dunne et al. Nature 486, 390-394 (2012) doi:10.1038/nature11186

First dairying in green Saharan Africa in the fifth millennium bc

Représentation ancienne d’élevage, de traite de ruminants et de manipulation du lait…

Les aliments fermentés, une histoire ancienne…

(8)

.07 .07

Les aliments fermentés, une histoire ancienne…..

Earliest evidence for cheese making in the sixth millennium bc in northern Europe

Des traces de lipides laitiers montrent que ces poteries ont servie à égoutter du lait…

Rendre le lait moins périssable et plus digeste…

Salque et al., 2013. 493(7433):522-5. doi: 10.1038/nature11698.

Critical step in making milk less perishable, and more digestible for early prehistoric farmers

- 8000 years Pottery vessel

Lipids analysis

(9)

Aliment fermenté Microorganismes

Technologie

Matière

première

(10)

.09 .09

Aliment fermenté Microorganismes

Technologie

Matière

première

(11)

Aliment fermenté Microorganismes

Technologie

Matière première

?

(12)

.011 .011

Aliment fermenté Microorganismes

Technologie

Matière première

?

(13)

Tout vient des microorganismes…

Le bon : les bactéries lactiques et propioniques assurent la fermentation La brute : les pathogènes peuvent rendre l’aliment dangereux

Le truand : certains microorganismes ont une action délétère

… les problèmes et les solutions.

(14)

.013

Biodiversité et biopréservation

Exemple des contaminations fongiques

(15)

Contaminations fongiques des produits laitiers

Levures Champignons filamenteux

Yaourt

Crème fraîche

Fromages

Pertes économiques Insatisfaction des consommateurs

Image négative de la marque

(16)

.015 .015

Contaminations fongiques des produits laitiers:

des microorganismes adaptés à la matrice laitière

Croissance à basse T°C

Assimilation des nutriments disponibles

(lactose, lactate, protéines, lipides)

Résistance à des a

w

faibles, au NaCl

Croissance à pH acide

Résistance aux conservateurs chimiques (sorbate, benzoate), parfois à la natamycine (ex. P. discolor)

Challenge : trouver un moyen d’inhibition naturel

(17)

Qu'attend on d’une culture bioprotectrice antifongique ou de ses métabolites?

Prévenir les contaminations fongiques in situ

pendant la durée de vie du produit si possible allonger la durée de vie

Être active à basse concentration (↓ coût)

Pas d’impact des process technologiques sur son activité

Pas d’interaction avec la fonctionnalité des starters ou cultures secondaires bactériennes

Pas d’impact sur les propriétés organoleptiques du produit

(18)

.017 .017

Composés antifongiques produits par les bactéries lactiques

Peptides issus de la dégradation des protéines du lait

Acides gras Acides

organiques

Reutérine Acides

carboxyliques Dipeptides

cycliques Composés

antifongiques de BL

Adapté et modifié de Crowley et col., 2013

(19)

Développement de cultures bactériennes protectrices antifongiques pour améliorer la conservation des

produits laitiers fermentés 700 souches BIA

6 cibles fongiques

K. lactis M. plumbeus Cladosporium P. roqueforti G. candidum D. hansenii

Challenge tests avec partenaires industriels (producteurs &

utilisateurs de ferments) Levains antifongiques

Lb. Partenaire 2

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.019 .019

Aliment fermenté Microorganismes

Technologie

Matière première

La biodiversité microbienne : un trésor à exploiter

(21)

Biodiversité microbienne et biopréservation :

Un potentiel et des applications déclinables à l’envie Collections de souches (ex. CIRM-BIA, LUBEM) Capacités de criblage haut débit

Caractérisation / approches omiques

Exploration des écosystèmes microbiens (méta-omiques)

…Disponibles dans l’Ouest

Potentiel inhibiteur des bactéries lactiques & propioniques Production de molécules inhibitrices

Découverte de bactériophages

(22)

.021

Merci

UMR STLO

Science et Technologie du Lait et de l’Œuf

www.rennes.inra.fr/stlo

Références

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