HAL Id: hal-02787043
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Submitted on 5 Jun 2020
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Etude de l’effet d’une sécheresse sur l’expression des
gènes dans les stomates de 4 génotypes de peuplier
Clément Rieux
To cite this version:
Clément Rieux. Etude de l’effet d’une sécheresse sur l’expression des gènes dans les stomates de 4 génotypes de peuplier. Sciences du Vivant [q-bio]. 2017. �hal-02787043�
Etude de l'effet d'une sécheresse sur
l'expression des gènes dans les stomates
de 4
génotypes de peuplier
Clément RIEUX, encadré par Didier LE THIEC, Nathalie AUBRY et David COHEN. INRA Nancy Grand-Est, UMR EEF
Chaque année le réchauffement climatique s’accroît et les différents scenarii prévoient de plus en plus de sécheresse. Cela pourrait avoir de graves conséquences sur les forêts. Il est important de sélectionner des arbres qui allieront productivité et tolérance aux contraintes hydriques. Un des moyens pour la plante d’économiser son eau est de réguler sa transpiration par les stomates. Cette étude s’inscrit dans le projet Uptrans qui a pour objectif d’étudier l’effet de la sécheresse sur 4 génotypes de peupliers.
Matériels et méthodes
Traitements : -Témoins 30 % HV (capacité au champs) -sécheresse 1 mois à 17 % humidité volumique du sol. -Feuilles récoltées matin et après midi -Espèceamphistomatique : 2 faces étudiées
Traitements des échantillons: Matériels biologiques :
Quatre génotypes dont deux variétés de peuplier noir (Populus nigra N38 et Populus nigra 6J29) et deux peupliers hybrides euraméricains (Carpaccio et I214) issus du croisement entre Populus nigra et Populus deltoïdes ont été plantés en pots et installés en serre.
qPCR : analyse de l’expression des gènes codant pour des transporteurs d’eau et d’éléments minéraux participant aux phénomènes d’ouverture et fermeture des stomates.
Résultats, conclusions et perspectives
Cycles Fl uo re sc en ce Fl uo re sc en ce Températures
-Retrotranscription de 8 échantillons sur
128.
-Purifications et quantification des ADNc, deux fois (purification 70 échantillons sur
256 (128*2)).
-Extraction d’ADN génomique pour les 4 génotypes pour les tests d’amorces.
-Test de 24 amorces sur 60.
-Envoi de 70 échantillons au séquençage. -Observation de toutes les étapes du protocole sauf qPCR finale (microdissection, design amorce, etc) . Manipulations futures : Vérification amorces par séquençage, puis qPCR des différents gènes.
Illustration de la validation des couples d’amorces :
Courbe d’amplification Courbe de fusion