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Etude de l'effet d'une sécheresse sur l'expression des gènes dans les stomates de 4 génotypes de peuplier

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Academic year: 2021

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HAL Id: hal-02787043

https://hal.inrae.fr/hal-02787043

Submitted on 5 Jun 2020

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Etude de l’effet d’une sécheresse sur l’expression des

gènes dans les stomates de 4 génotypes de peuplier

Clément Rieux

To cite this version:

Clément Rieux. Etude de l’effet d’une sécheresse sur l’expression des gènes dans les stomates de 4 génotypes de peuplier. Sciences du Vivant [q-bio]. 2017. �hal-02787043�

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Etude de l'effet d'une sécheresse sur

l'expression des gènes dans les stomates

de 4

génotypes de peuplier

Clément RIEUX, encadré par Didier LE THIEC, Nathalie AUBRY et David COHEN. INRA Nancy Grand-Est, UMR EEF

Chaque année le réchauffement climatique s’accroît et les différents scenarii prévoient de plus en plus de sécheresse. Cela pourrait avoir de graves conséquences sur les forêts. Il est important de sélectionner des arbres qui allieront productivité et tolérance aux contraintes hydriques. Un des moyens pour la plante d’économiser son eau est de réguler sa transpiration par les stomates. Cette étude s’inscrit dans le projet Uptrans qui a pour objectif d’étudier l’effet de la sécheresse sur 4 génotypes de peupliers.

Matériels et méthodes

Traitements : -Témoins 30 % HV (capacité au champs) -sécheresse 1 mois à 17 % humidité volumique du sol. -Feuilles récoltées matin et après midi -Espèce

amphistomatique : 2 faces étudiées

Traitements des échantillons: Matériels biologiques :

Quatre génotypes dont deux variétés de peuplier noir (Populus nigra N38 et Populus nigra 6J29) et deux peupliers hybrides euraméricains (Carpaccio et I214) issus du croisement entre Populus nigra et Populus deltoïdes ont été plantés en pots et installés en serre.

qPCR : analyse de l’expression des gènes codant pour des transporteurs d’eau et d’éléments minéraux participant aux phénomènes d’ouverture et fermeture des stomates.

Résultats, conclusions et perspectives

Cycles Fl uo re sc en ce Fl uo re sc en ce Températures

-Retrotranscription de 8 échantillons sur

128.

-Purifications et quantification des ADNc, deux fois (purification 70 échantillons sur

256 (128*2)).

-Extraction d’ADN génomique pour les 4 génotypes pour les tests d’amorces.

-Test de 24 amorces sur 60.

-Envoi de 70 échantillons au séquençage. -Observation de toutes les étapes du protocole sauf qPCR finale (microdissection, design amorce, etc) . Manipulations futures : Vérification amorces par séquençage, puis qPCR des différents gènes.

Illustration de la validation des couples d’amorces :

Courbe d’amplification Courbe de fusion

Figure

Illustration de la validation des couples d’amorces : Courbe d’amplification Courbe de fusion

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